BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-472N14.T7 (MSMg01no472_n14.b1) | MSMg01-472N14.TJ (MSMg01no472_n14.g1) |
ACC | AG555286 | AG555287 |
length | 775 | 770 |
length of high quality (start - end) | 468 (71 - 538) | 524 (77 - 600) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no472_n14.b1 PHD_FILE: MSMg01no472_n14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no472_n14.g1 PHD_FILE: MSMg01no472_n14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:37 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NTTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCAGAACTCTCCAGCTGGGGAACAGGGTACCCGTAAGTATAGCTTT
ACAAGGTAAGTCTGGTCTTGAACTTTCTAACGAAATTCAAGACAGTCTAT
CAGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTTACAAGGTACGTCTGGCCTTGAACTT
TCTAATGAAATTCAAGACAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGGAAATAGCTTT
ACAAGGTATGTTTGGCCTTGAACTTTCTCTAGTGTTAGGAGCCTTTTTGT
TCCTTTTCACATGTTATCTTGTTTTTAAGGCAGGGCTGAAAATTCTGGAT
GAAATTCAGGGCAATCTATCAGAAGTAAAGCGGGGAGAGAGAGTAGGAGC
AAAGAGGAAATATGGTACACAAAATAAGTATACAGGCCTTTCCACGGGTC
TTGAACCCGAGGAAAAGTTTAGGTCAGGTAAGAATACCTGGGGAGAGATT
AGAAGGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGATCATTTAGCGGAGGT
CTCTAGGAGAAGGAGCCTATACTCATCACTAGATGAGCTCAAGAAGCCAG
TTCTTAGTAGTTCTGATTCAGATGAAAAGCTATTAAGGCCTGGGAAGCGC
TCTTCCGAGCATGTGAAACCACTGGACCACTAAAAAAAATCGTCCAGGGA
CCTCCGGAGGCTTTCTTAAAATTTGGGGCCCGAAGGACCAAGGCCCCAAA
AATATTTTTGTGAAACCCCAACAAN
| CGATTGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACCACAGCCAAATGAAGCATTAGC
CAAAGAGATCTGGCAAAATAATCAGTAAGCTCAAGAGGTCAGAGTCAAGA
AAGGAGGCTCTGTTCTTCGGTACATTGACTTTATATTCACAGTCTGATTC
CAAAAAGATTCCTCTTGATGAAAGGAAACCGTGGAGGATTGATGGCAAAA
TTAAATAGCAGAAATGAAGAAATTAATGTTAGTAGTTCCTGTGGACTGAA
TTGAGTCCCCTAAACATGTATTTTGTAACCACTCCCATGTGGACCTCAGA
ATATGACCTGATTTGAAATTGGTCATAAATGCTAACTAGCTGAGGTAAGG
TCTCACTGGAGGAGGTGGCCTCCAAACCAGTGTAATGATTCTATAGGAAG
GCAGTCATCTGAAAAGAGAAACAGACAGAACTGCAGGTCAGGATGGAAGG
AGACAGTAGTTAATGCAGCCATGTGCTTGGGATCCATCCCATATACAGTC
ACCAAACCCAGACACAACTGCGGATGTCAAGAAGTGCTTGCTGACAGGAA
CCTGATATAGCTGTCTCCTGAGAGGCTTTGCCAGAGTCTGACAAATACAG
AGGCAGATGCTTGGCACGAAACATTGGTCTGAACACAAGGTCCCCGGATA
AGAGAATTAAAGAAGGATTAAAGGAGTTGAAGGGTTTGCAACCCCTAGGA
AGAAGAACAATATTCTCCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 9 9 14 31 39 39 39 37 31 31 37 23 24 23 28 28 28 41 47 28 25 27 18 18 7 9 9 14 11 11 11 15 18 16 16 16 21 19 21 29 34 47 48
31 31 31 31 31 30 21 21 10 9 9 9 9 9 17 9 9 9 12 16 19 23 31 32 37 41 47 53 53 53 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 53 53 53 68 68 68 68 42
42 41 41 41 42 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 44
36 28 28 28 40 42 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 53 53 50 50 50 50 59 31 22 14 10 8 8 8 10 12 12 21 25 30 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57
57 57 68 59 59 59 48 43 43 43 43 43 43 43 59 59 59 57 57 57 48 48 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57
57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 57 57 57 59 59 54 54 54 54 54 54 59 59 48 48 42 42 42 43 47 59 48 48
59 59 57 48 48 48 48 37 37 25 25 25 36 41 57 48 48 48 43 41 39 36 36 37 37 37 31 31 37 41 43 39 35 34 39 39 39 39 40 40 47 44 48 48 48 37 37 37 32 29
19 20 32 32 31 28 39 35 36 31 35 41 41 43 41 37 37 43 43 47 41 35 31 26 31 39 27 24 24 23 23 23 30 30 23 18 8 8 8 8 8 10 11 19 16 15 13 13 13 21
14 24 21 24 12 12 12 11 11 11 16 16 16 13 13 11 11 12 18 23 23 21 18 12 12 12 15 15 12 19 11 12 12 22 21 18 18 20 28 23 19 18 21 18 15 15 14 12 12 11
12 11 16 12 11 9 9 9 8 7 9 9 13 13 17 9 9 7 8 7 8 8 10 16 22 28 26 24 11 11 11 13 17 19 11 11 16 16 16 10 11 11 11 14 9 12 9 9 9 10
10 12 12 10 10 10 10 12 6 8 6 6 8 10 10 12 10 11 11 6 6 6 8 6 7 10 11 10 8 8 8 10 9 8 8 8 17 10 9 9 9 10 10 10 10 10 11 10 9 10
8 8 9 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 8 12 9 9 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 6 9 9 12 17 15 9 9 8 9
6 8 6 6 6 7 19 9 9 9 9 9 12 10 10 8 6 6 6 6 7 8 9 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 9 9 19 21 28 30 32 41 37 29 41 39 34 34 31 31 36 39 36 39 44 27 27 11 12 11 9 8 8 7 8 8 11 17 18 25 19 24 15 24 34 37 53
47 41 41 39 37 47 43 27 23 9 9 7 7 7 7 8 15 18 18 14 9 10 19 22 31 32 33 36 36 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 57 68 68 68 68 51 51
42 42 42 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 47 47 54 57 57 59 57 51 50 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 68 68 57 57
68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 57 68 68 51 51 51 51 51 50 68 57 57 57 68 68 68 68 44
44 36 28 28 27 31 34 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 59 59 59 57 68 68 53 53 53 53 53 53 53
53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 47 41 23 25 12 12 11 12 12 12 11 11 11 16 23 36 59 59 59 50 50 53 53 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 54 54 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 54 59 54 54 54 42 48 48 48 48 53 53 50 50 50
50 57 59 57 50 50 50 50 48 48 48 46 46 41 39 39 39 39 36 31 41 41 41 41 41 47 43 43 37 30 32 30 37 37 41 46 46 59 59 48 48 48 48 47 47 47 47 41 37 37
32 29 29 32 41 41 36 36 39 37 37 30 28 28 37 37 37 37 30 35 35 37 37 28 32 23 31 28 28 28 39 32 26 31 31 32 34 34 37 30 30 30 34 28 25 25 29 20 24 21
23 19 21 31 24 24 17 28 18 28 28 28 26 28 28 32 24 28 25 24 14 14 12 16 12 18 9 12 12 17 13 18 24 17 9 9 9 9 15 13 10 8 8 10 9 16 12 18 12 16
11 12 10 10 10 9 9 9 11 12 9 9 8 8 8 10 13 12 11 10 10 9 9 14 12 14 9 9 9 11 8 9 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 9 12 14 12 12 11 10 9
9 8 8 8 9 11 11 11 8 8 8 8 8 11 12 14 12 16 16 14 14 16 19 11 11 11 12 9 10 9 10 9 12 13 25 17 18 12 11 11 11 9 10 9 8 10 8 8 15 13
10 10 10 9 9 9 15 10 10 10 10 8 6 7 7 12 9 14 14 14 |