BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-481F06.T7 (MSMg01no481_f06.b1) | MSMg01-481F06.TJ (MSMg01no481_f06.g1) |
ACC | AG561760 | AG561761 |
length | 776 | 1,199 |
length of high quality (start - end) | 460 (38 - 497) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no481_f06.b1 PHD_FILE: MSMg01no481_f06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no481_f06.g1 PHD_FILE: MSMg01no481_f06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:01:56 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAGT
TAGTATTGTGGTTCTCCAAGCATAGAGACATATCACATAATTACAGACAG
TGTTTTCTATTTCATAAGTCAAGATTTTTATGGAGCTGCAATGTCTACAC
AGAGTCTATTAAGTGAATGACTATGGTATAGTCATGGGTCCCTATTTGTC
CTCCTCTATGTAATTCCCTCTTCTGTACATGTCTTGTGACAGTGTGTTTC
TTATACCAAAAGAAAAATTATACATAAAGTGTAAAGAGAACACACAGCCC
AATTCAAGTCTTTGAACCACTGTTATTATTATGATAATGTCAGCTGAAAA
GCACTGTCAGCTTGCAAGTGTGTATGAATGTGTGTGAATGTACGTGTGTA
TGTGTATGTGTGTGCAAATAAATGTGTGTGTGTGTGAATGCATGTGTGAA
TGTGTGTGTATGGGTGTGTGAATGTAAGTATGTATGTAAATGTATGTGTG
GTATGTGTATGTGCGNGAGAAAAAATGTGTGCAGGTCACATACACGGGAA
AAGCCATCAGAATAACAGCTGACTTCTCAATGGAAACTTTGAAAGCCAGA
ACAGCCTAGAGAAAAGCATTCCAAGTCGTCAAAGACTATGACAGTCAACT
TAATATATTCCGCAAAACCATGTGCCATGATTGAAAGGAAAAGAAAAATG
TATTAGGACATAAACAGCCTAAATAATTGTTCCCAGTAAACAAACCCAAC
CGAGAAAATACTGGAAGCTTTATTTG
| ATAGAGTAGCGCTGGCCAGAACAGCTGAGCGCTCTTCTCGCACGCATCAG
GAGTGTCTCCGCGCGCGTCTTCCCCTCACTTCTCCTTCCCTCCCTCTATC
CACCTATCACCCTCATTACGCCCCTCTCTATATCACGGCATTTGATCCTC
TCTAGCCACCTCGCAGCCGCGTACTCGCGTAATTATTCAAATGTAGCATA
CCACAATATATACACTGCAATAGGAGTATATTCCTCTTCGTCTCGATGAC
ATTAGACTCTATGGGTGTTTGATTGGCCCCGGTTGCAGTGTCTTCGCGAC
CAGTCCTAGTCAGTCACATAGCTCACTATCCCCTCTCACTGTCACATACT
CCCTCACTCTTCCATCGTTTTCCCTTCTCACCTGATCCCTTACAGCGCCG
GCTGCATACCGCCACATCCTCCGTCGTGCTCTACCTGCATGTCCGGCCCC
TCTGTATGCGTCGGGTGCTCCCTGGGCGTGTGATCACGTCGCTTTGTGCC
GGTCTCTGTCTGCGGTTCAGTTGACGCGCTCGGGGTGCGGGGTGGGTGGT
AAATAGTCTTATCATCCTATAGACTTACAATCACGATTCGCTCATACTGT
TACGTAAGACTATGCGAGTCGTAGACGCGGTGTGTTGATAGTAGGTGTAT
GTCGGTATCGGCATCTTCTAGTTACATCGTAGCTGCGACGCATGAGGTGA
CTAAAGTGACGTCGAAACCCCAGTATACTCGTTACGTGTACGCTATGAAC
CGTGTAGCATTACACGTTACTCGCGAAGCATAAGATCGATGCGAACGAAC
GAGACCCGATCAAGATTTCAGTAACCCATCGACTGTCGACCTGTCCGTGA
CTCGCACAGTTCTGTGTTGTCTCTTGTTGTCCTTGTCTCTCGATGTGATC
ACCTTAACCGCACGATTGTTGCACCCCCGTTTATTTCGCTACTCGACTCA
TTCAATATCACACCATCCAACCAATTATTCATGGTATATGTGGTACGTGC
TTGTGTTTCGTTCCCCGACTGTGTGATCATCAGTCGTCTAGTACCTGAGT
CGACGTGCACGTCAGTCGCTCATCTGTTCGTCTTTCTCACGCGTGGGTCG
TGTATGGATGATGATCGGTGTGGGCGGCGTAGATTTCGCGTATTATAATC
AGGCAGTAATGATATTGATATATGCAGCGCGATNGTATATGTACTGCGG
|
quality values | Open.Hide.28 32 32 33 32 32 28 17 19 10 10 10 19 22 39 44 48 30 28 28 28 25 25 27 16 9 9 9 12 11 11 23 15 20 24 28 28 28 48 48 47 36 36 35 35 36 31 31 31 31
42 34 33 21 11 11 11 14 18 22 28 34 43 47 33 33 33 36 36 38 57 50 53 50 57 57 53 53 53 57 43 47 57 50 50 53 54 54 54 54 54 42 41 41 41 41 41 47 47 50
47 48 48 59 57 57 57 57 57 57 51 50 50 50 47 48 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 57 59 59 57 57 57 68 57 57 57
57 57 59 59 59 68 68 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 54 54 54 57
59 57 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 48 50 50 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59
59 54 54 54 54 54 57 57 57 57 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 68 59 57 50 50 50 53 53 57 59 59 48 48 48 57 57 57 48 48 36 32 20 14 14 14 22 28 29 18 9
9 9 17 22 13 13 13 28 23 34 19 13 13 10 3 0 3 9 9 14 17 24 22 19 10 9 9 9 10 10 11 8 7 7 8 8 11 11 15 15 30 30 20 16 12 12 12 13 22 22
21 28 18 16 16 23 23 24 19 14 14 18 21 23 25 24 24 24 28 28 37 22 22 11 11 11 23 18 30 30 37 32 25 30 37 39 41 34 34 37 35 32 32 32 33 33 37 37 37 19
15 7 7 8 10 14 23 12 12 12 22 22 32 32 15 13 9 9 12 12 23 21 25 10 13 9 9 9 13 18 19 23 30 30 17 18 18 41 32 41 39 24 20 20 12 12 14 16 21 23
19 16 16 16 24 28 21 21 21 15 15 23 19 19 13 17 15 22 15 17 9 10 10 16 19 37 33 33 33 33 33 33 32 32 28 28 28 32 31 15 15 10 10 8 10 8 8 8 13 12
8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13 13 11 11 15 11 11 9 8 13 8 8 8 10 10 15 11 11 10 10 12 17 13 12 9 9 9 15 10 10 10 8 8
8 8 8 8 9 15 17 13 8 8 6 6 6 7 13 11 14 9 9 12 11 8 8 10 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 13 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 11 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 10 10 14 17 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8
10 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 7 7 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 6 11 11 8
8 8 8 8 8 8 9 11 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 11 11 11 11 16
11 11 11 11 10 10 10 10 8 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 11 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 13 10 9 9 9 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 12 11 11 11 11 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 11 12 13 13 12 12 6 6 6 6 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8
9 11 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 8 6 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 8 8 6
7 8 8 8 8 8 7 10 7 8 8 8 6 8 9 10 8 9 9 13 13 8 6 6 6 8 10 9 9 10 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9
9 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 7 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 8 6 6 7 8 8 11 10 8 8 8 6 6 8 10 10 8 6 6 7 6 8 8 8 10 10 8 8 6 6 10 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 10 9 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 6 7 10 6 6 6 6 8 8 11 12 8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 13 19 13 11 8 8 6 6 8 8 10 10
10 13 9 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 10 10 13 8 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 6 6 6 7 10 8 12 12 13 13 6 6 6 6 10 6 6 8 6 8 6 6 7 6 8 6 8 10 10 8 8
8 8 8 8 9 9 6 8 6 6 8 8 9 14 14 14 10 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 13 11 9
10 9 9 9 10 10 7 6 7 6 8 8 6 6 6 6 8 6 8 9 8 10 6 9 12 12 14 15 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 16 16 21 10 8 8 8 8 6 6 6
6 8 8 8 9 9 9 12 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 13 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 6 8 6 6 10 8 8 10 8 10 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6
8 8 10 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 6 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 11 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 10 9 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 7 8 8 9 10 10 10 13 10 9 9 |