Query= MSMg01no529_o15.b1 MSMg01no529_o15.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no529_o15.b1 PHD_FILE: MSMg01no529_o15.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 21:06:03 2005
(603 letters)
>mm_chr1_61870204_61871206
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Strand = Plus / Minus
Query: 16 tttcttcctcaccaatacacacacatataca------tgtgtgtgtgtatatatatatat 69
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Sbjct: 1003 tttcttcctcaccaatacacacacatatacatgtgtgtgtgtgtgtgtatatatatatat 944
Query: 70 atatatat------ata--tat--------atatatatatatatatatgtacaaatat-t 112
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Sbjct: 943 atatatatgtacaaatatttatacacacaaatatatatatacatatatatacaaatatat 884
Query: 113 -tatacacacaa------------------------atatatatatacatatatacaaat 147
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Sbjct: 883 atatacacacaaatatatatatatatgtgtgtatatatatatatatatatatatatatat 824
Query: 148 atatatatatatatatatatttcccacttattcagctactaactctttatactacaatat 207
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Sbjct: 823 atatatatatatatatatatttcccacttattcagctactaactctttatactacaatat 764
Query: 208 catctggttttaaatacagcattttactttgtgttattttcagagaaaaaaattaaagac 267
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Sbjct: 763 catctggttttaaatacagcattttactttgtgttattttcagagaaaaaaattaaagac 704
Query: 268 tagtatacatgaatggagtattagcaatccccttagctgaatgcttattttacaaatgag 327
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Sbjct: 703 tagtatacatgaatggagtattagcaatccccttagctgaatgcttattttacaaatgag 644
Query: 328 aaaatcaagtaatggagtggttaacacctttgtgcaacaatcatagagtcaggcctgtgc 387
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Sbjct: 643 aaaatcaagtaatggagtggttaacacctttgtgcaacaatcatagagtcaggcctgtgc 584
Query: 388 tgtagaaggggcttctatgccaatatcagtaacagatctgtgggttttatataactgcag 447
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Sbjct: 583 tgtagaaggggcttctataccaatatcagtaacagatctgtgggttttatataactgcag 524
Query: 448 cacccctggacagcaccaataccttggagagataagggatgctacagtgtagacataatt 507
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Sbjct: 523 cacccctggacagcaccaataccttggagagataagggatgctacagtgtagacataatt 464
Query: 508 ttttcctaatgacctcgtatactattatcagctggagtttcatagaacttttgtactttc 567
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Sbjct: 463 ttttcctaatgacctcgtatactattatcagctggagtttcatagaacttttgtactttc 404
Query: 568 aattcatgaataatcatgcacaataccacacactgg 603
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Sbjct: 403 aattcatgaataatcatgcacaataccacacactgg 368
Score = 97.4 bits (50), Expect = 3e-24
Identities = 94/120 (78%), Gaps = 22/120 (18%)
Strand = Plus / Plus
Query: 64 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtacaaatatttatacacacaa 123
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Sbjct: 804 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatata----tatatatacacacat 859
Query: 124 atatatatatac--------atatatacaaatat----atatatat--atatatatattt 169
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Sbjct: 860 atatatatatatttgtgtgtatatata----tatttgtatatatatgtatatatatattt 915
Score = 85.8 bits (44), Expect = 9e-21
Identities = 44/44 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 100
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Sbjct: 809 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 852
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 45/51 (88%), Gaps = 6/51 (11%)
Strand = Plus / Plus
Query: 57 tatatatatatatatatatatatatatatata------tatatatatatat 101
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Sbjct: 821 tatatatatatatatatatatatatatatatacacacatatatatatatat 871
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 317
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Number of sequences better than 10.0: 1
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Effective search space: 588849
Effective search space used: 588849
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
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