BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-541M05.T7 (MSMg01no541_m05.b1) | MSMg01-541M05.TJ (MSMg01no541_m05.g1) |
ACC | AG607701 | AG607702 |
length | 749 | 746 |
length of high quality (start - end) | 546 (77 - 622) | 332 (335 - 666) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no541_m05.b1 PHD_FILE: MSMg01no541_m05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:21:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no541_m05.g1 PHD_FILE: MSMg01no541_m05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:21:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTTATTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAAAAGATGCG
CGGATTCAGACCCTCTTCCCTCAGAATACTAATGAGCAGTAGACCAGGTG
TTGAATCCTGCTTTGATTTCTGGAGAAATGCCCTGCCTCGTGTGGCACAT
GCATGTCACAGTGTGTGTGTGTAAAGAAGGCAAGGCACTGGGTAAGGGCC
ACTTTCTTAGATTGTCTTTCATTTCCTGATCATACCCAAGTCTTCTGGTC
TAGATATAAGAGTGGGAACAGGAGCCATTCAATCATGACCATATGGTACT
AGCCAGAAACATGACCTTAGAGCAGCAGTTCTCAACCTTTCTCATGCTGC
AACTCTTTGTTCCTCATGTTGTGGTGAACCCCACCATGAAATTATTTCAT
TGCTACTTCATAACTGTAATTTTACTACTGTGATTAGTAATAATGTAAAT
ATCTGACCTGTGAGCCCTCTGGGGGTCAGAACCAACAGGTTGACAACTGA
AAAAAACAAAACATTTTCTACCTTAGAGGAAGGTAGAAAATTGGGAGGTC
TTTCCATACAGTTGATCCTGGGCCTCTGGAATGGCTCAGCCAGGTAAAGA
CACTTGCTGCTAAGTGTGGTGACCCAGGTTAGATCCCTAGAACCCAGTGG
AGGAAAGAACCAGTTCCCAAAAGCTGATCTCTGATCTCCACCGTGAACTA
TGGTGTACATATGTATATTCATATGTACCTGTACTGACACATCACACAT
| TTTCTCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGGAGACGCACCCAAACCA
TAGCCCCAGGAAGGACTGTACAGCCTAGAATTTCAATTAGGATAGAAAGT
GGATCTAATTCAATGCTCTAGTGTAAAAGCCCCATAGGCTCAGCAATCCC
AGCCACTCACTGCAGGCTCTCCAAGGAGCTTTTGTGGTGGCAAGCATTTA
GATAAACTTGAAATCTGGACACCTGGGACTGAAGATCTCATGTTCTGATT
TCTGAGTGGGGCAGGGACACAATCAGTTCTTTTTCTTATTGATTTGCCCA
AGGTGATAGATTGCCACATGTGGATTGTGGCGTTGCTGTCATCTCAGGGT
TACTATTACTGTGGTGAAACACCATGACCAAAAGGTACCTGGGGAGGAAA
GGGTTCAAATGGCTTATACTTCCACATCACAAATCATCATCAAAGGAAGT
CAGGACAGGAACTCAAGCCAGGCAGGAGCCTAGAGGCAGTTGCTGCTGCA
GAAGCCATGGAGGGATGCTGCTTACTGGCTTGCTCCTCATGGCTTGCTCG
GCCTGCTTTCCTATAGAACCCAGGACCACCATGCATGATGAGCAGGACCC
TCTTACATCAATCACTAATTAAGAAAATGCCCTACAGCTGGATCTTTCAG
GGGCATTTTCTCAATTGAGGTTCCCTTCTCTAAGATGACTCTCGAT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 6 9 11 11 11 12 12 16 15 10 9 9 9 11 11 10 8 10 7 6 6 8 12 12 30 28 33 33 33 21 19 10 8 9 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 12
23 18 11 11 11 19 13 10 10 11 27 22 13 6 6 6 10 8 12 12 18 18 9 9 9 9 17 17 37 39 30 30 30 37 37 37 32 37 25 25 17 17 15 26 26 21 16 14 19 19
27 30 43 43 43 43 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 36 36 23 36 26 48 36 41 41 41 43 47 57 48 54 57 57 59 59 59 59 44 43 43 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 48 48 44 50 50 59 59 68 59 59 43 43 43 44 44 54 52 52 57 52 50 50 35 35 35 44 44 52 52 52 52 52 57 59 52 52 52 57 59 52 52 52 52 59 59
59 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 62 62 62
62 62 45 45 62 62 44 43 35 35 43 43 43 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62
52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 39 39 13 13 12 13 13 16 38 41 62 62 52 52 52 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 62 62 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57
57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54 44 44 52 52 52 52 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68
68 57 57 50 50 50 50 57 44 43 18 18 14 14 14 32 34 59 57 47 43 41 41 43 43 34 32 13 13 12 26 19 20 20 24 32 37 48 37 44 36 39 39 42 42 44 48 46 47 43
47 47 48 47 47 47 47 47 43 46 48 48 57 57 48 48 48 57 57 50 50 50 48 48 32 35 15 28 23 33 26 31 23 15 11 11 18 27 32 37 37 37 37 30 31 31 31 31 37 36
39 39 37 37 37 37 37 31 22 19 15 30 30 34 30 40 40 39 39 32 30 32 27 29 39 39 39 41 41 39 37 35 25 31 39 28 28 13 13 19 28 19 13 11 11 20 24 24 32 30
33 33 28 23 10 9 9 16 22 42 26 26 15 24 24 29 29 28 23 18 22 28 28 20 19 11 12 12 19 25 28 12 12 20 20 30 21 25 12 12 11 22 22 22 19 11 11 11 12 12
16 14 18 19 29 20 19 16 16 15 14 14 18 18 15 21 24 23 23 19 24 15 19 23 26 26 33 24 21 16 16 13 18 24 30 30 15 7 7 6 6 6 8 12 10 11 17 20 27 25
16 14 10 10 10 21 15 22 22 24 29 17 12 12 8 8 9 12 12 11 12 12 13 15 8 8 8 6 6 12 16 15 16 12 13 13 12 10 8 8 8 9 14 12 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 6 6 8 8 10 6 6 6 6 6 7 15 8 9 9 9 9 21 20 19 21 16 19 20 34 34 47 44 29 19 10 8 6 6 6 7 7 6 6 9 6 8 6 6 6 6
11 22 23 37 37 37 37 44 39 50 42 41 27 27 9 9 9 9 7 7 6 6 6 6 9 11 11 9 11 11 11 10 13 26 30 31 31 53 53 57 57 53 53 47 47 47 43 37 40 37
37 37 48 48 48 48 54 43 43 43 50 48 48 57 57 57 68 68 68 46 43 39 14 14 9 9 9 12 15 32 32 42 48 48 50 50 50 68 57 50 47 50 50 50 50 59 68 57 57 57
47 47 47 50 50 50 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 59 59 59 54 54 54 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 43 52 52 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 57 52 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 59 59 68 68 44 44 28 28 23 23 25 36 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 48 48 48 50 57 59 54 54 54 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 47 44 44 39 37 47 36 33 20 8 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 10 15 27 37 59 50 50 50 50 53 53 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 42 42 30 30 32 32 39 41 42 42 54 57 57 54 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 48 59 59 59 59
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 42 42 33 44 44 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 50 57 57 52 42 42 29 29 29 43 43 52 52 57 52 52 52 52 57 57 68 57 59 59
57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 48 48 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 44 44 27 29 27 36 36 43 59 59 37 37 37 59 44 44 43 43 57 44 42 42 42 37 39 37
37 35 44 44 57 48 48 48 48 48 48 46 43 43 41 39 35 35 35 37 37 40 37 33 28 28 28 29 39 34 43 43 43 43 59 59 43 37 28 28 28 28 33 48 43 43 35 26 24 24
28 35 34 34 26 31 35 39 39 37 30 25 25 32 37 37 37 37 46 47 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 47 47 41 41 41 41 37 29 25 30 37 37 43 46 41 37 37
31 27 18 32 28 47 47 59 47 41 48 39 32 30 34 34 25 25 17 17 19 15 14 14 19 26 33 34 24 20 20 17 22 17 20 20 32 28 37 37 47 34 34 25 15 15 21 17 20 29
37 36 36 33 34 37 47 47 43 31 31 19 19 15 15 12 15 15 17 20 16 12 15 14 21 13 15 15 14 18 20 27 30 28 22 28 28 34 30 28 28 25 28 28 34 27 26 23 13 9
8 8 8 15 17 37 37 37 34 19 13 10 8 8 8 11 19 13 13 10 15 18 11 11 11 17 29 25 25 18 16 17 12 11 9 9 10 10 15 15 17 17 26 26 24 20 |