BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-045G18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 30,004,363 - 30,138,665
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC212815
Upstream geneEchdc1, Rnf146, Rspo3, EG630389, Rpl12, LOC623064, LOC674389, Gm232, LOC667696, LOC100040542, 2610036L11Rik
Downstream geneTrmt11, Hint3, Ncoa7, LOC382354, Hey2, LOC654431, EG432448, Hddc2, Tpd52l1, LOC100041294
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-045G18.bB6Ng01-045G18.g
ACCDH870881DH870882
length1,172695
definitionDH870881|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045G18, 5' end.DH870882|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,004,363 - 30,005,559)(30,137,972 - 30,138,665)
sequence
gaattctatcagatctttaaagaggagttaataccaatagtcttcaaact
attccacaaaatagaaactgaaggtacactattcaattcgttctatgaag
ccacaattacactgtgtattcttcctcagggatggaatggttgctgtcta
atcaggaacccgtcacaactgcctttcatagaggacttcataatagattt
tattctacttctatcaattttagtgttccaaatatattttaaaaactgaa
ataaaaaagactaaaaccatgatatatccaaataagcaaaactatattgc
ataataaaaattaacaatcatgatttattcacactgctccctttttctag
ctcattctcctgaatgtacttgtgattccatcttatcttcacaagtaaag
gataaagagaacaaatagaggaggtcttcagtgtttgattgattgtctgt
gcttctacaaagttaactcagagtataaggaagccacttagatataaaag
aaaagtataaaacaacttctagaaacagcagataagaaaacattcacctc
agtggatacagttgattattatgccagttaaattcaaaatgtataaaaat
atcaacatatagtttaaatgaatattaagcataagagtcagagaactggt
gtttcatttgtgctacaacttaggacagagatgcagaagatattaatata
ttttgcaagaagaaaaccctacaaagcaatcaacttcacaataaagaatt
gatccctaggtcaggcatggtggctcacacctgcaaccccaatagtcaag
ccaacagatgatggactgcagagcaacatctattatagtgttctctgaaa
atagaggaattggtttctaaaggccgcttaacataaaacctgaattacaa
cgctttgcataaacacaaagtacagaatttatggaatgtccaaattcaca
gtaccttaaatgtttgaattacaagaacacatcaattactgttgaactct
aaaaccttaaatgagagcctcacagccttgtttggagcactttgtgttga
ttgggaccatgattgttggtctccatttcagtgaacccaaatctcatctg
gattttcaaacttctgactcttatcagatattggagatgtactatgaatg
atacaaccagagcctaatgacc
gaattcagtccagcagtgactaagggagtgagagtcagatgtcgcttgtg
agattagggtagcactgacaacatagatcatgatccttacattaaaagat
gacagtcacaatggctctggatatataggatcatgatgggaagaagagat
gtggaggatgctccccacatccatgcctttatgtttgtggtctgctgcaa
ttgtgtggaggacttatgggtagttataaaaatagacagaaaatttcgtt
ctgtttttagttttaccacttactagaaatattgtgtcaggaaaaacacc
aacctttctgatcttacttccttcatgcagggggagcattatagaacctg
ctcactctaataatctttgactttactaaattgagaggctcccaccttct
atgtttttaatctcttacttttccactgcttgcaatgtgtacaatttcaa
acaagtaatgcaatctttgtgtggctcagcttcctaacttagaaaacgag
agatacctatttcattgggttgtgttcagtattaaatacttatgtagtgt
tagagcagggttggaataagcattggtaaaaaatgttaactcatttattt
ggttaccttgctgaaaatatagtagtctatcttccattaaaatttcaaac
agttcttggcatatacctggtgtaggttatgcattcgatataggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_30004363_30005559
seq2: B6Ng01-045G18.b_41_1212

seq1  GAATTCTATCAGATCTTTAAAGAGGAGTTAATACCAATAGTCTTCAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATCAGATCTTTAAAGAGGAGTTAATACCAATAGTCTTCAAACT  50

seq1  ATTCCACAAAATAGAAACTGAAGGTACACTATTCAATTCGTTCTATGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCACAAAATAGAAACTGAAGGTACACTATTCAATTCGTTCTATGAAG  100

seq1  CCACAATTACACTGTGTATTCTTCCTCAGGGATGGAATGGTTGCTGTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAATTACACTGTGTATTCTTCCTCAGGGATGGAATGGTTGCTGTCTA  150

seq1  ATCAGGAACCCGTCACAACTGCCTTTCATAGAGGACTTCATAATAGATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGAACCCGTCACAACTGCCTTTCATAGAGGACTTCATAATAGATTT  200

seq1  TATTCTACTTCTATCAATTTTAGTGTTCCAAATATATTTTAAAAACTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTACTTCTATCAATTTTAGTGTTCCAAATATATTTTAAAAACTGAA  250

seq1  ATAAAAAAGACTAAAACCATGATATATCCAAATAAGCAAAACTATATTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAAAGACTAAAACCATGATATATCCAAATAAGCAAAACTATATTGC  300

seq1  ATAATAAAAATTAACAATCATGATTTATTCACACTGCTCCCTTTTTCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAAAATTAACAATCATGATTTATTCACACTGCTCCCTTTTTCTAG  350

seq1  CTCATTCTCCTGAATGTACTTGTGATTCCATCTTATCTTCACAAGTAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTCTCCTGAATGTACTTGTGATTCCATCTTATCTTCACAAGTAAAG  400

seq1  GATAAAGAGAACAAATAGAGGAGGTCTTCAGTGTTTGATTGATTGTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGAGAACAAATAGAGGAGGTCTTCAGTGTTTGATTGATTGTCTGT  450

seq1  GCTTCTACAAAGTTAACTCAGAGTATAAGGAAGCCACTTAGATATAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTACAAAGTTAACTCAGAGTATAAGGAAGCCACTTAGATATAAAAG  500

seq1  AAAAGTATAAAACAACTTCTAGAAACAGCAGATAAGAAAACATTCACCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTATAAAACAACTTCTAGAAACAGCAGATAAGAAAACATTCACCTC  550

seq1  AGTGGATACAGTTGATTATTATGCCAGTTAAATTCAAAATGTATAAAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGATACAGTTGATTATTATGCCAGTTAAATTCAAAATGTATAAAAAT  600

seq1  ATCAACATATAGTTTAAATGAATATTAAGCATAAGAGTCAGAGAACTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACATATAGTTTAAATGAATATTAAGCATAAGAGTCAGAGAACTGGT  650

seq1  GTTTCATTTGTGCTACAACTTAGGACAGAGATGCAGAAGATATTAATATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCATTTGTGCTACAACTTAGGACAGAGATGCAGAAGATATTAATATA  700

seq1  TTTTGCAAGAAGAAAACCCTACAAAGCAATCAACTTCACAATAAAGAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCAAGAAGAAAACCCTACAAAGCAATCAACTTCACAATAAAGAATT  750

seq1  GATCCCTAGGTCAGGCATGGTGGCTCACACCTGCAACCCCAATAGTCAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCCTAGGTCAGGCATGGTGGCTCACACCTGCAACCCCAATAGTCAAG  800

seq1  CCAACAGATGATGGACTGCAGAGCAACATCTATTATAGTGTTCTCTGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CCAACAGATGATGGACTGCAGAGCAACATCTATTATAGTGTTCTCTG-AA  849

seq1  AATAGAGGAATTGGTTTCTAAAGGCCGCTTAACATAAAACCTGAATTACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAGGAATTGGTTTCTAAAGGCCGCTTAACATAAAACCTGAATTACA  899

seq1  AGGCTTTGCATAAACACAAAAGTACAGAATTTATGGAATGTCCAAATTCA  950
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCTTTGCATAAACAC-AAAGTACAGAATTTATGGAATGTCCAAATTCA  948

seq1  CAGTACCTTAAAATGTTTGAAATTACAAAGAAAACACATCAATTTACTGT  1000
      ||||||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||| |||||||
seq2  CAGTACCTT-AAATGTTTG-AATTACA---AGAACACATCAA-TTACTGT  992

seq1  TGAACTCTAAAACCTTAAAATGAGAGCCTCACAAGCCTTGTTTGGAGCAC  1050
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGAACTCTAAAACCTT-AAATGAGAGCCTCAC-AGCCTTGTTTGGAGCAC  1040

seq1  TTTGGTGTTGAATGGGACCATGATTGTTGCTCACATTCTAAGTG-ACCCA  1099
      ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |  | | |||| |||||
seq2  TTT-GTGTTGATTGGGACCATGATTGTTGGTCTCCATTTCAGTGAACCCA  1089

seq1  AATACTCATCTTGATTTTCAAACTTCTTGACTCTATTCAGGATTATTGTA  1149
      ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||   ||||| |
seq2  AAT-CTCATCTGGATTTTCAAACTTC-TGACTCTTATCAG--ATATTGGA  1135

seq1  GTATGTAACTATGAATGAATAACATACAATAGGAGCCATATAATGACC  1197
      | |||| ||||||||||      ||||||   |||||   ||||||||
seq2  G-ATGT-ACTATGAATG------ATACAACCAGAGCC---TAATGACC  1172

seq1: chr10_30137972_30138665
seq2: B6Ng01-045G18.g_68_761 (reverse)

seq1  CCTATATCGAATGCATTACCTACACCAGGTACTATGCCAAGAACTGTTTG  50
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CCTATATCGAATGCATAACCTACACCAGGTA-TATGCCAAGAACTGTTTG  49

seq1  AAATTTTAATTGGAGATGGACTACTATATTTTCAGCAAGGTAACCAAATA  100
      |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTAATGGAAGATAGACTACTATATTTTCAGCAAGGTAACCAAATA  99

seq1  AATGAGTTAACA-TTTTTACCAATGCTTATTCCAACCCTGCTCTAACACT  149
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGTTAACATTTTTTACCAATGCTTATTCCAACCCTGCTCTAACACT  149

seq1  ACATAAGTATTTAATACTGAACACAACCCAATGAAATAGGTATCTCTCGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGTATTTAATACTGAACACAACCCAATGAAATAGGTATCTCTCGT  199

seq1  TTTCTAAGTTAGGAAGCTGAGCCACACAAAGATTGCATTACTTGTTTGAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAAGTTAGGAAGCTGAGCCACACAAAGATTGCATTACTTGTTTGAA  249

seq1  ATTGTACACATTGCAAGCAGTGGAAAAGTAAGAGATTAAAAACATAGAAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTACACATTGCAAGCAGTGGAAAAGTAAGAGATTAAAAACATAGAAG  299

seq1  GTGGGAGCCTCTCAATTTAGTAAAGTCAAAGATTATTAGAGTGAGCAGGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGCCTCTCAATTTAGTAAAGTCAAAGATTATTAGAGTGAGCAGGT  349

seq1  TCTATAATGCTCCCCCTGCATGAAGGAAGTAAGATCAGAAAGGTTGGTGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAATGCTCCCCCTGCATGAAGGAAGTAAGATCAGAAAGGTTGGTGT  399

seq1  TTTTCCTGACACAATATTTCTAGTAAGTGGTAAAACTAAAAACAGAACGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTGACACAATATTTCTAGTAAGTGGTAAAACTAAAAACAGAACGA  449

seq1  AATTTTCTGTCTATTTTTATAACTACCCATAAGTCCTCCACACAATTGCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCTGTCTATTTTTATAACTACCCATAAGTCCTCCACACAATTGCA  499

seq1  GCAGACCACAAACATAAAGGCATGGATGTGGGGAGCATCCTCCACATCTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACCACAAACATAAAGGCATGGATGTGGGGAGCATCCTCCACATCTC  549

seq1  TTCTTCCCATCATGATCCTATATATCCAGAGCCATTGTGACTGTCATCTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCCATCATGATCCTATATATCCAGAGCCATTGTGACTGTCATCTT  599

seq1  TTAATGTAAGGATCATGATCTATGTTGTCAGTGCTACCCTAATCTCACAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGTAAGGATCATGATCTATGTTGTCAGTGCTACCCTAATCTCACAA  649

seq1  GCGACATCTGACTCTCACTCCCTTAGTCACTGCTGGACTGAATTC  694
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGACATCTGACTCTCACTCCCTTAGTCACTGCTGGACTGAATTC  694