BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056A01
Chromosome10 (Build37)
Map Location 114,579,061 - 114,676,437
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTph2, Tbc1d15
Upstream geneTrhde, 4930473D10Rik
Downstream geneLOC668041, Rab21, Tmem19, Thap2, Ccdc131, Lgr5, A930009A15Rik, LOC668071, EG668073, Tspan8, Ptprr, 4933416C03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056A01.bB6Ng01-056A01.g
ACCDH878297DH878298
length1,148784
definitionDH878297|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056A01, 5' end.DH878298|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056A01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,675,275 - 114,676,437)(114,579,061 - 114,579,843)
sequence
gaattctaaataaatttcctgatttccttctgtaggatgctgaagtaata
gtggactggagaccattggatgatgcattagattcttccagtattctgtg
tgctggaaaggtatttataaactatcgcctagagaatgatatatgttttc
tttttatgtgtgtatatgtaagtatgtaggcatgcatgtgtcttatgtac
caccttgctctagtaccttcacctgtgtaggcttaagttttttaaaacct
acttttattttaataagggttcttaaacactttaccctgccttctagccc
accacccaccagagggagtgggaaagagcagttattaggatgccggaaag
ttctttggagctaacgtagcctgcactgtcgggctatatgccatcagttc
agtagtgtcaggacagcaaacgcagagcagcagcagaggcctgccccagc
agaaccagccagacctcaatctgcaagtcagcaggtcaaccaggaaggac
cagcagggatgcctggagttctctgctgtgcctttctcaactcagtgaag
atgagagaccaacaagttgcaaggctagctacacaagcccccatcactgt
ccgttgggtcttatttatactctctccaaacatcacctgtccataacagg
tcttgcctcagcaaaacaccatttgagtctgcaccagctgataccactct
gtccgtcagcctgagtctgcaaaaacggcaagaagccatcagaccaccac
aggaagttttttggtgtgttttttttttctatgaagccatgacaaaggat
gaacataaatgaatggcaaggcatacaaataccatccagtgtcatcctcc
atctgttgggtcttcttagtatcatgtgattgctttagcaaaacatcctt
tacttgtgtctgctttagtgaaatgttccttctcaagtctttgtgaactt
gacctatttgtctactgcagcaaagcatgccttgacataactttttacag
cccatcttccttgccccttcgtgctggcctcttctcctacagtagatcgt
ttctgtggggtcacttagttttccctccttttctaccactagattcatgc
cacaccacatgcatgccatgcaacgcccataaatggttggtgtatgtt
gaattcactgtttaagcacaccctttgatttccaagccctgtatgtgcat
cagttttttatgagataataactttaaacaaataaatattattaaaatta
aaggagatggcataatccctaaagccttgccacacaaacattaggatcct
aaggtagataacacctaatacagaataacactcaaggtcacccttatcac
ggatacacctacacataattacaaacatacatgcatacatacatacatac
atacatatatatatacatacatacatacatacatacatacatagagagag
actacacaatcaaaaacggagctgataagaacagatttgtgaatctcaca
tttctctactgtgactcagtacatgtgtccacaggagtcatgtgatactc
ctgtacatgtgtccacaggagtcatgtgatactcctgtaatttaaaagga
aggttctccaaaagtcaggaaagacagaagtgaaatagcatcttctggac
atgccagaagagctgcacacatgagctcacagcaactgtggttatgggca
caaaggcaagccaatcagcatcctcacattgagggagaaagagttcatga
atcatcttcagtgatgggtcagggagacactgttgtctttaagggtgtat
cattcatgctctgggggacagccaccagacctaggaatatctgggcagca
ccaattggacttaataggttataaagacagagaagaaaacaaagttaggg
tagcagaggggtgggaatggatttggggaaaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_114675275_114676437
seq2: B6Ng01-056A01.b_32_1179 (reverse)

seq1  AACATTACACCAA-CATTTATTGGCGTGTGCATGTGCATGCATGTGTGTG  49
      |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||
seq2  AACA-TACACCAACCATTTATGGGCGT-TGCATG-GCATGCATGTG-GTG  46

seq1  TGTGCATGAATCTTAGGTGGTAGAAAGGAGGGGAAAACTAAGTGACCCCC  99
      || ||||||||||   |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||
seq2  TG-GCATGAATCT--AGTGGTAGAAAAGGAGGGAAAACTAAGTGA-CCCC  92

seq1  ACAGAAAACGGATCTACTGTAGGGAGGAAGAGTGCCAGCACGAAGGGGGC  149
      |||||||   |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  
seq2  ACAGAAA--CGATCTACTGTAGG--AGAAGAG-GCCAGCACGAAGGGGCA  137

seq1  AGGGAGATGGGGCTTGTAGAAAGTTATGTCAAGGCATGCTTTGCTGCAGT  199
      ||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGATGGG--CTGTAAAAAGTTATGTCAAGGCATGCTTTGCTGCAGT  185

seq1  AGACAAATAGGTCAAGTTCACAAAGACTTGAGAAGGAACATTTCACTAAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAATAGGTCAAGTTCACAAAGACTTGAGAAGGAACATTTCACTAAA  235

seq1  GCAGACACAGGTAAAGGATGTTTTGCTAAAGCAATCACATGATACTAAGA  299
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCAGACACAAGTAAAGGATGTTTTGCTAAAGCAATCACATGATACTAAG-  284

seq1  AAGACCCAACAGATGGAGGATGACACTGGATGGTATTTGTATGCCTTGCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCCAACAGATGGAGGATGACACTGGATGGTATTTGTATGCCTTGCC  334

seq1  ATTCATTTATGTTCATCCTTTGTCATGGCTTCATAGAAAAAAAAAACACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTATGTTCATCCTTTGTCATGGCTTCATAGAAAAAAAAAACACA  384

seq1  CCAAAAAACTTCCTGTGGTGGTCTGATGGCTTCTTGCCGTTTTTGCAGAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAAACTTCCTGTGGTGGTCTGATGGCTTCTTGCCGTTTTTGCAGAC  434

seq1  TCAGGCTGACGGACAGAGTGGTATCAGCTGGTGCAGACTCAAATGGTGTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCTGACGGACAGAGTGGTATCAGCTGGTGCAGACTCAAATGGTGTT  484

seq1  TTGCTGAGGCAAGACCTGTTATGGACAGGTGATGTTTGGAGAGAGTATAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGAGGCAAGACCTGTTATGGACAGGTGATGTTTGGAGAGAGTATAA  534

seq1  ATAAGACCCAACGGACAGTGATGGGGGCTTGTGTAGCTAGCCTTGCAACT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACCCAACGGACAGTGATGGGGGCTTGTGTAGCTAGCCTTGCAACT  584

seq1  TGTTGGTCTCTCATCTTCACTGAGTTGAGAAAGGCACAGCAGAGAACTCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGTCTCTCATCTTCACTGAGTTGAGAAAGGCACAGCAGAGAACTCC  634

seq1  AGGCATCCCTGCTGGTCCTTCCTGGTTGACCTGCTGACTTGCAGATTGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCCCTGCTGGTCCTTCCTGGTTGACCTGCTGACTTGCAGATTGAG  684

seq1  GTCTGGCTGGTTCTGCTGGGGCAGGCCTCTGCTGCTGCTCTGCGTTTGCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGCTGGTTCTGCTGGGGCAGGCCTCTGCTGCTGCTCTGCGTTTGCT  734

seq1  GTCCTGACACTACTGAACTGATGGCATATAGCCCGACAGTGCAGGCTACG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGACACTACTGAACTGATGGCATATAGCCCGACAGTGCAGGCTACG  784

seq1  TTAGCTCCAAAGAACTTTCCGGCATCCTAATAACTGCTCTTTCCCACTCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTCCAAAGAACTTTCCGGCATCCTAATAACTGCTCTTTCCCACTCC  834

seq1  CTCTGGTGGGTGGTGGGCTAGAAGGCAGGGTAAAGTGTTTAAGAACCCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTGGGTGGTGGGCTAGAAGGCAGGGTAAAGTGTTTAAGAACCCTT  884

seq1  ATTAAAATAAAAGTAGGTTTTAAAAAACTTAAGCCTACACAGGTGAAGGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATAAAAGTAGGTTTTAAAAAACTTAAGCCTACACAGGTGAAGGT  934

seq1  ACTAGAGCAAGGTGGTACATAAGACACATGCATGCCTACATACTTACATA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGAGCAAGGTGGTACATAAGACACATGCATGCCTACATACTTACATA  984

seq1  TACACACATAAAAAGAAAACATATATCATTCTCTAGGCGATAGTTTATAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACATAAAAAGAAAACATATATCATTCTCTAGGCGATAGTTTATAA  1034

seq1  ATACCTTTCCAGCACACAGAATACTGGAAGAATCTAATGCATCATCCAAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTTTCCAGCACACAGAATACTGGAAGAATCTAATGCATCATCCAAT  1084

seq1  GGTCTCCAGTCCACTATTACTTCAGCATCCTACAGAAGGAAATCAGGAAA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCCAGTCCACTATTACTTCAGCATCCTACAGAAGGAAATCAGGAAA  1134

seq1  TTTATTTAGAATTC  1163
      ||||||||||||||
seq2  TTTATTTAGAATTC  1148

seq1: chr10_114579061_114579843
seq2: B6Ng01-056A01.g_67_850

seq1  GAATTCACTGTTTAAGCACACCCTTTGATTTCCAAGCCCTGTATGTGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGTTTAAGCACACCCTTTGATTTCCAAGCCCTGTATGTGCAT  50

seq1  CAGTTTTTTATGAGATAATAACTTTAAACAAATAAATATTATTAAAATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTTTTATGAGATAATAACTTTAAACAAATAAATATTATTAAAATTA  100

seq1  AAGGAGATGGCATAATCCCTAAAGCCTTGCCACACAAACATTAGGATCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGATGGCATAATCCCTAAAGCCTTGCCACACAAACATTAGGATCCT  150

seq1  AAGGTAGATAACACCTAATACAGAATAACACTCAAGGTCACCCTTATCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGATAACACCTAATACAGAATAACACTCAAGGTCACCCTTATCAC  200

seq1  GGATACACCTACACATAATTACAAACATACATGCATACATACATACATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACACCTACACATAATTACAAACATACATGCATACATACATACATAC  250

seq1  ATACATATATATATACATACATACATACATACATACATACATAGAGAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATATATATACATACATACATACATACATACATACATAGAGAGAG  300

seq1  ACTACACAATCAAAAACGGAGCTGATAAGAACAGATTTGTGAATCTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACACAATCAAAAACGGAGCTGATAAGAACAGATTTGTGAATCTCACA  350

seq1  TTTCTCTACTGTGACTCAGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTACTGTGACTCAGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTC  400

seq1  CTGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTCCTGTAATTTAAAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACATGTGTCCACAGGAGTCATGTGATACTCCTGTAATTTAAAAGGA  450

seq1  AGGTTCTCCAAAAGTCAGGAAAGACAGAAGTGAAATAGCATCTTCTGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTCTCCAAAAGTCAGGAAAGACAGAAGTGAAATAGCATCTTCTGGAC  500

seq1  ATGCCAGAAGAGCTGCACACATGAGCTCACAGCAACTGTGGTTATGGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGAAGAGCTGCACACATGAGCTCACAGCAACTGTGGTTATGGGCA  550

seq1  CAAAGGCAAGCCAATCAGCATCCTCACATTGAGGGAGAAAGAGTTCATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGCAAGCCAATCAGCATCCTCACATTGAGGGAGAAAGAGTTCATGA  600

seq1  ATCATCTTCAGTGATGGGTCAGGGAGACACTGTTGTCTTTAAGGGTGTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTTCAGTGATGGGTCAGGGAGACACTGTTGTCTTTAAGGGTGTAT  650

seq1  CATTCATGCTCTGGGGGACAGCCACCAGACCTAGGAATATCTGGGCAGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATGCTCTGGGGGACAGCCACCAGACCTAGGAATATCTGGGCAGCA  700

seq1  CCAATTGGACTTAATAGGTTATAAAGACAGAGAAG-AAACAAAGTTAGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CCAATTGGACTTAATAGGTTATAAAGACAGAGAAGAAAACAAAGTTAGGG  750

seq1  TAGCAGAGGGGTGGGAATGGATTTGGGGAAAAAT  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGAGGGGTGGGAATGGATTTGGGGAAAAAT  784