BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-062A04
Chromosome10 (Build37)
Map Location 81,465,564 - 81,587,174
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666790, LOC666571, AL117821, BC062115, 4933439G19Rik, BC024063
Upstream geneGng7, Diras1, Slc39a3, Sgta, Thop1, Creb3l3, Map2k2, Zbtb7a, Pias4, Eef2, Dapk3, Itgb1bp3, Atcay, 9130206N08Rik, Matk, Mrpl54, Apba3, Tjp3, Pip5k1c, 2510012J08Rik, Tbxa2r, Gipc3, Hmg20b, F630110N24Rik, 4930404N11Rik, Fzr1, Dohh, 2210404O07Rik, Nfic, Brunol5, Ncln, Edg6, Gna15, Gna11, Aes, Tle2, Tle6, BC025920, Sirt6, Ankrd24, LOC100040916, EG666448, EG666458, LOC666711, LOC382388, LOC100040944, EG210583, EG666738, EG666501, 1700123A16Rik, LOC666753, EG666537, BC062127, EG666542, EG666548
Downstream geneAU041133, LOC100042712, B230315N10Rik, LOC100042718, EG237412, LOC666611, Gm1553, LOC544716, 1190007I07Rik, Tdg, Glt8d2, Hcfc2, Nfyb, 1700028I16Rik, Txnrd1, Eid3, EG216185, Chst11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-062A04.bB6Ng01-062A04.g
ACCDH882532DH882533
length1,171750
definitionDH882532|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062A04, 5' end.DH882533|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-062A04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,585,984 - 81,587,174)(81,465,564 - 81,466,205)
sequence
gaattctgcactaaaaccatgataactttttcttactggcatgaggcata
aaaaaattaacaagtaaatttatcaggtgatccacttttttgatatatga
atggatacttgtattctcctccttttcattggagaccaaggagaagaaag
tatgtttggtgtctccatatttaaagatgtgactctggaatacttttgac
ctcactgaattctccttgtatttttgtctgtctgactttaacctgtctgt
gcttgaacttcatgtaggcaaacttctggaatgtatatataaaacttcac
attccaacaagacaagtaagcttttagtgggtgtgcattagagagtgttt
ggctacctcgaaagataaccttcaaatagtccctttgaacatttccttaa
tgccaggtagtggtggtgaacacatttaatcccagcacaagagaggcaga
ggcaggaagatctctatgaattcaagggcagcctggtctacagagtgagt
tctagcacagccaggtctatatagaaaacccctgtctccaaacaaaacat
atttaattgaccctcttctccaattttgtaatccatcaaccttggttaca
atcttcaaattaaatacaagtagaatatgaacaacctcggacttaatcct
gccctgtgagatatctttcattaaatcaggctgcctaagttaaaaaagat
aaagtcggattaagtacccactcatagtttagggaccagaggacacagaa
aacatctaagttaactgaggagactatattagaatgttctctgtagtttc
tttatgtccaagcaactaaaaaatgaaaatgaaatcacagttcccagggc
atgcttgggcagacacaagaatggtcatcaccaggggaagagaggagtca
tgagtgtcttgggaaaaacaggcaatggagattacagtggggtctaaagt
gtgagagaagcagtaagactcagtgtcactgtatctgagcctcagctgta
tagctgctcatagcagcagcttgctagcatccagcatctattcgttcgta
tcttgggatgtgtgctattccaaaaatggctctcgaggctgcggcaagcc
actgagtcatcaatctgaacattgcatggataggagttgttatatctggg
atatctgttggagccaatagt
gaattccaggcgcttgctgggcgtgtcctcagggagagaggaagctaaat
gtgcaatttggtctccaggctatgtagctatctcagggtggcagagggtt
ggggttgtagagcctatgtgcactagaacatgcagactcgaaggagggaa
cagtcctacctcctggtggtctcaggacaagatttttgggatttggacat
gtttcagcctcattcttgctccagattggcttcctgaaattgcacaactt
tctggccttaacagtggctcaacagatgcaaaggtgaaaaaagcagcccg
acgtgagtagaatgctatgtccctgaggccacggtgaagtcctggcctgt
gcagctgctgaggctcatgtccgggtcagagggcttgcagcagcaggtgt
ccatgtagatgtccatggcctgtattactaccaaaagccatcagacatcc
ctggtctgtgctggtcctgcccctccttgttgtttggagggagagactac
ccccgccccagcccttgccacctatatcaagcaggagagctggccttgcc
actcagtggctgcagcacttgggagggcttggcctatgccttgcttaagc
aggacagtaaagctggccctggtggtatgggtgtgggtgagcaaatgaag
tctaatagcttagagggtagctatctgcccagctctagcgcattcaaggc
ttattataaatataaaggttgtgtgtttttcatctgggaactgaatgatc

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_81585984_81587174
seq2: B6Ng01-062A04.b_46_1216 (reverse)

seq1  ACTATTTGCCTCCAACAGATAT-CCAGATATTAAACAAAGGTCCTAATCC  49
      |||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||   |||| ||||
seq2  ACTA-TTGGCTCCAACAGATATCCCAGATAT--AACAA--CTCCT-ATCC  44

seq1  ACTACAATTGTTAGATTTGAAGACTCATGTGGTTTGCACCAGCCTAGAGA  99
      | | ||||  | ||| |||| |||||| |||| ||||  |||||| ||||
seq2  A-TGCAATGTTCAGA-TTGATGACTCA-GTGGCTTGCCGCAGCCTCGAGA  91

seq1  GCCATTCTTGGGATAGCACACATCCCAAGATTACCGAAAGAATAGATTGC  149
      |||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||
seq2  GCCATTTTTGGAATAGCACACATCCCAAGAT--ACGAACGAATAGA-TGC  138

seq1  TGGGTGCTAGGCAAGCTGCTGCTAGTGAGCAGCTATAACAGCTGGAGGCT  199
      ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| 
seq2  TGGATGCTA-GCAAGCTGCTGCTA-TGAGCAGCTAT-ACAGCT-GAGGC-  183

seq1  TCAGATACAGTGTACACTGAGTCTTACTGCTTCTCCTCACACCTTTAGAC  249
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  TCAGATACAGTG-ACACTGAGTCTTACTGCTTCT-CTCACA-CTTTAGAC  230

seq1  CCCACTGGTAATCTCCATTGCCTGTTTTTCCCAAGACACTCATGACTCCT  299
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACT-GTAATCTCCATTGCCTGTTTTTCCCAAGACACTCATGACTCCT  279

seq1  CTCTTCCCCTGGTGATGACCATTCTTGTGTCTGCCCAAGCATGCCCTGGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCCCTGGTGATGACCATTCTTGTGTCTGCCCAAGCATGCCCTGGG  329

seq1  AACTGTGATTTCATTTTCATTTTTTAGTTGCTTGGACATAAAGAAACTAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTGATTTCATTTTCATTTTTTAGTTGCTTGGACATAAAGAAACTAC  379

seq1  AGAGAACATTCTAATATAGTCTCCTCAGTTAACTTAGATGTTTTCTGTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACATTCTAATATAGTCTCCTCAGTTAACTTAGATGTTTTCTGTGT  429

seq1  CCTCTGGTCCCTAAACTATGAGTGGGTACTTAATCCGACTTTATCTTTTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGTCCCTAAACTATGAGTGGGTACTTAATCCGACTTTATCTTTTT  479

seq1  TAACTTAGGCAGCCTGATTTAATGAAAGATATCTCACAGGGCAGGATTAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTAGGCAGCCTGATTTAATGAAAGATATCTCACAGGGCAGGATTAA  529

seq1  GTCCGAGGTTGTTCATATTCTACTTGTATTTAATTTGAAGATTGTAACCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCGAGGTTGTTCATATTCTACTTGTATTTAATTTGAAGATTGTAACCA  579

seq1  AGGTTGATGGATTACAAAATTGGAGAAGAGGGTCAATTAAATATGTTTTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGATGGATTACAAAATTGGAGAAGAGGGTCAATTAAATATGTTTTG  629

seq1  TTTGGAGACAGGGGTTTTCTATATAGACCTGGCTGTGCTAGAACTCACTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGACAGGGGTTTTCTATATAGACCTGGCTGTGCTAGAACTCACTC  679

seq1  TGTAGACCAGGCTGCCCTTGAATTCATAGAGATCTTCCTGCCTCTGCCTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGACCAGGCTGCCCTTGAATTCATAGAGATCTTCCTGCCTCTGCCTC  729

seq1  TCTTGTGCTGGGATTAAATGTGTTCACCACCACTACCTGGCATTAAGGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGCTGGGATTAAATGTGTTCACCACCACTACCTGGCATTAAGGAA  779

seq1  ATGTTCAAAGGGACTATTTGAAGGTTATCTTTCGAGGTAGCCAAACACTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCAAAGGGACTATTTGAAGGTTATCTTTCGAGGTAGCCAAACACTC  829

seq1  TCTAATGCACACCCACTAAAAGCTTACTTGTCTTGTTGGAATGTGAAGTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGCACACCCACTAAAAGCTTACTTGTCTTGTTGGAATGTGAAGTT  879

seq1  TTATATATACATTCCAGAAGTTTGCCTACATGAAGTTCAAGCACAGACAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATATACATTCCAGAAGTTTGCCTACATGAAGTTCAAGCACAGACAG  929

seq1  GTTAAAGTCAGACAGACAAAAATACAAGGAGAATTCAGTGAGGTCAAAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAGTCAGACAGACAAAAATACAAGGAGAATTCAGTGAGGTCAAAAG  979

seq1  TATTCCAGAGTCACATCTTTAAATATGGAGACACCAAACATACTTTCTTC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCAGAGTCACATCTTTAAATATGGAGACACCAAACATACTTTCTTC  1029

seq1  TCCTTGGTCTCCAATGAAAAGGAGGAGAATACAAGTATCCATTCATATAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGTCTCCAATGAAAAGGAGGAGAATACAAGTATCCATTCATATAT  1079

seq1  CAAAAAAGTGGATCACCTGATAAATTTACTTGTTAATTTTTTTATGCCTC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAGTGGATCACCTGATAAATTTACTTGTTAATTTTTTTATGCCTC  1129

seq1  ATGCCAGTAAGAAAAAGTTATCATGGTTTTAGTGCAGAATTC  1191
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGTAAGAAAAAGTTATCATGGTTTTAGTGCAGAATTC  1171

seq1: chr10_81465564_81466205
seq2: B6Ng01-062A04.g_66_707

seq1  GAATTCCAGGCGCTTGCTGGGCGTGTCCTCAGGGAGAGAGGAAGCTAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCGCTTGCTGGGCGTGTCCTCAGGGAGAGAGGAAGCTAAAT  50

seq1  GTGCAATTTGGTCTCCAGGCTATGTAGCTATCTCAGGGTGGCAGAGGGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAATTTGGTCTCCAGGCTATGTAGCTATCTCAGGGTGGCAGAGGGTT  100

seq1  GGGGTTGTAGAGCCTATGTGCACTAGAACATGCAGACTCGAAGGAGGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTGTAGAGCCTATGTGCACTAGAACATGCAGACTCGAAGGAGGGAA  150

seq1  CAGTCCTACCTCCTGGTGGTCTCAGGACAAGATTTTTGGGATTTGGACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTACCTCCTGGTGGTCTCAGGACAAGATTTTTGGGATTTGGACAT  200

seq1  GTTTCAGCCTCATTCTTGCTCCAGATTGGCTTCCTGAAATTGCACAACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGCCTCATTCTTGCTCCAGATTGGCTTCCTGAAATTGCACAACTT  250

seq1  TCTGGCCTTAACAGTGGCTCAACAGATGCAAAGGTGAAAAAAGCAGCCCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCCTTAACAGTGGCTCAACAGATGCAAAGGTGAAAAAAGCAGCCCG  300

seq1  ACGTGAGTAGAATGCTATGTCCCTGAGGCCACGGTGAAGTCCTGGCCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGAGTAGAATGCTATGTCCCTGAGGCCACGGTGAAGTCCTGGCCTGT  350

seq1  GCAGCTGCTGAGGCTCATGTCCGGGTCAGAGGGCTTGCAGCAGCAGGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGCTGAGGCTCATGTCCGGGTCAGAGGGCTTGCAGCAGCAGGTGT  400

seq1  CCATGTAGATGTCCATGGCCTGTATTACTACCAAAAGCCATCAGACATCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTAGATGTCCATGGCCTGTATTACTACCAAAAGCCATCAGACATCC  450

seq1  CTGGTCTGTGCTGGTCCTGCCCCTCCTTGTTGTTTGGAGGGAGAGACTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTGTGCTGGTCCTGCCCCTCCTTGTTGTTTGGAGGGAGAGACTAC  500

seq1  CCCCGCCCCAGCCCTTGCCACCTATATCAAGCAGGAGAGCTGGCCTTGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGCCCCAGCCCTTGCCACCTATATCAAGCAGGAGAGCTGGCCTTGCC  550

seq1  ACTCAGTGGCTGCAGCACTTGGGAGGGCTTGGCCTATGCCTTGCTTAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTGGCTGCAGCACTTGGGAGGGCTTGGCCTATGCCTTGCTTAAGC  600

seq1  AGGACAGTAAAGCTGGCCCTGGTGGTATGGGTGTGGGTGAGC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGTAAAGCTGGCCCTGGTGGTATGGGTGTGGGTGAGC  642