BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075E07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,787,635 - 24,922,823
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAkap7
Upstream geneTaar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399
Downstream geneLOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075E07.bB6Ng01-075E07.g
ACCDH891871DH891872
length2071,108
definitionDH891871|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075E07, 5' end.DH891872|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075E07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,787,635 - 24,787,841)(24,921,712 - 24,922,823)
sequence
ctcctgtatgcattacttatgtgttgctggaataacccttctcttcatgt
aataactcccaaatacttatctaaatatctgaactctctccaaagagtta
atactacatttccaacaccagtgaagcatttgatatatatatatcatata
tcacacacatagatatgtgtgtgtatgtatatgtgtgtatatgtatgtgt
atgtgta
gaattctttgtttagctctgagccccatttttaatggggttatttgattt
tctggagtcaagcacctaccttaagttactccgtggggttttatcttttt
tttttttttattttgtggtttattcaccatttcttttatcactttagctt
tttgtttgttgtgatggtgtctacctatgttgcccaggcttctctaaatt
caagatcctcttgcctcagcttttgaagcactcagatcctagacctgtgc
caccatattcagccagcttagctcactctgggtgtctgtggagatgcctg
taaggtcatataaccctttgtagaacattcttacagatactagtccttag
ccatagacacattttcagtgctgtactcataattagaaactcacagggtt
ttggaagcagtgggggtatttaataaagtcgagctggtgacattcaccat
aaagctgtccccctctggatagtgatttttgagttaaggggccttgtatt
tggagatagggctcaacctgagaaaactgtcagaggggcaggcaggattg
ctagctgatcctacaaactctgaggtacatatagacagtcattctgttct
cttcttccttactcccctgcactttctactttgcaatgatatttttagaa
cttgaaaataaatttatcagtgaagctactcagattctgacaggttaatc
tttcatggttgtaaacacccaacagatcttgcattcaaacttacagcttt
atgattctaaaggtcatgtcgggtctggggggtgactcagttgttaaagt
gcagtgtgttgtgcagtgtgaggctcagattcttagaactcagcacggtc
tgcttactagtcatctgaggtcaggggctgaagagataactgagtggtat
ctgctcttccagaggtcctgagttcaagtcccaacaccacatggtggcta
caaccatctgtaatgggatcggatggcctcttctggcatgtaggtacaca
tgcaattaaaataaaagaagttttctatatagtactactttaaagagtat
ttaacaatttacacaccacaattcttatttctagttaaagttttggctca
tgcattga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24787635_24787841
seq2: B6Ng01-075E07.b_52_258

seq1  CTCCTGTATGCATTACTTATGTGTTGCTGGAATAACCCTTCTCTTCATGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTATGCATTACTTATGTGTTGCTGGAATAACCCTTCTCTTCATGT  50

seq1  AATAACTCCCAAATACTTATCTAAATATCTGAACTCTCTCCAAAGAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACTCCCAAATACTTATCTAAATATCTGAACTCTCTCCAAAGAGTTA  100

seq1  ATACTACATTTCCAACACCAGTGAAGCATTTGATATATATATATCATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTACATTTCCAACACCAGTGAAGCATTTGATATATATATATCATATA  150

seq1  TCACACACATAGATATGTGTGTGTATGTATATGTGTGTATATGTATGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACACATAGATATGTGTGTGTATGTATATGTGTGTATATGTATGTGT  200

seq1  ATGTGTA  207
      |||||||
seq2  ATGTGTA  207

seq1: chr10_24921712_24922823
seq2: B6Ng01-075E07.g_68_1175 (reverse)

seq1  TCAATGCATGAGGCAAAACTTTAAACTAAGAAATAAG-ATTGTTGTGTGT  49
      |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||
seq2  TCAATGCATGAGCCAAAACTTT-AACT-AGAAATAAGAATTGTGGTGTGT  48

seq1  -AATTGTAAAATACTCTTTAAAGTAGTACTATATAGAAAACTCTTTTTAT  98
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  AAATTGTTAAATACTCTTTAAAGTAGTACTATATAGAAAACTTCTTTTAT  98

seq1  TTTAATTGCATGTGTACCTACATGCCAGAAGAGGCCATCCGATCCCATTA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTGCATGTGTACCTACATGCCAGAAGAGGCCATCCGATCCCATTA  148

seq1  CAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGACTTGAACTCAGGACCT  198
      ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGTTGT-AGCCACCATGTGG-TGTTGGGACTTGAACTCAGGACCT  196

seq1  CTGGAAGAGCAGATAACCACTCAGTTATCTCTTCAGCCCCTGGACCTCAG  248
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGGAAGAGCAGAT-ACCACTCAGTTATCTCTTCAGCCCCT-GACCTCAG  244

seq1  ATGACTAGTAAGCAGACCGTGCTGAGTTCTAAGAATCTGAGCCTCACACT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTAGTAAGCAGACCGTGCTGAGTTCTAAGAATCTGAGCCTCACACT  294

seq1  GCACAACACACTGCACTTTAACAACTGAGTCACCCCCCAGACCCGACATG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAACACACTGCACTTTAACAACTGAGTCACCCCCCAGACCCGACATG  344

seq1  ACCTTTAGAATCATAAAGCTGTAAGTTTGAATGCAAGATCTGTTGGGTGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTAGAATCATAAAGCTGTAAGTTTGAATGCAAGATCTGTTGGGTGT  394

seq1  TTACAACCATGAAAGATTAACCTGTCAGAATCTGAGTAGCTTCACTGATA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAACCATGAAAGATTAACCTGTCAGAATCTGAGTAGCTTCACTGATA  444

seq1  AATTTATTTTCAAGTTCTAAAAATATCATTGCAAAGTAGAAAGTGCAGGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATTTTCAAGTTCTAAAAATATCATTGCAAAGTAGAAAGTGCAGGG  494

seq1  GAGTAAGGAAGAAGAGAACAGAATGACTGTCTATATGTACCTCAGAGTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAGGAAGAAGAGAACAGAATGACTGTCTATATGTACCTCAGAGTTT  544

seq1  GTAGGATCAGCTAGCAATCCTGCCTGCCCCTCTGACAGTTTTCTCAGGTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGATCAGCTAGCAATCCTGCCTGCCCCTCTGACAGTTTTCTCAGGTT  594

seq1  GAGCCCTATCTCCAAATACAAGGCCCCTTAACTCAAAAATCACTATCCAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCTATCTCCAAATACAAGGCCCCTTAACTCAAAAATCACTATCCAG  644

seq1  AGGGGGACAGCTTTATGGTGAATGTCACCAGCTCGACTTTATTAAATACC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGACAGCTTTATGGTGAATGTCACCAGCTCGACTTTATTAAATACC  694

seq1  CCCACTGCTTCCAAAACCCTGTGAGTTTCTAATTATGAGTACAGCACTGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTGCTTCCAAAACCCTGTGAGTTTCTAATTATGAGTACAGCACTGA  744

seq1  AAATGTGTCTATGGCTAAGGACTAGTATCTGTAAGAATGTTCTACAAAGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGTCTATGGCTAAGGACTAGTATCTGTAAGAATGTTCTACAAAGG  794

seq1  GTTATATGACCTTACAGGCATCTCCACAGACACCCAGAGTGAGCTAAGCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATATGACCTTACAGGCATCTCCACAGACACCCAGAGTGAGCTAAGCT  844

seq1  GGCTGAATATGGTGGCACAGGTCTAGGATCTGAGTGCTTCAAAAGCTGAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAATATGGTGGCACAGGTCTAGGATCTGAGTGCTTCAAAAGCTGAG  894

seq1  GCAAGAGGATCTTGAATTTAGAGAAGCCTGGGCAACATAGGTAGACACCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGGATCTTGAATTTAGAGAAGCCTGGGCAACATAGGTAGACACCA  944

seq1  TCACAACAAACAAAAAGCTAAAGTGATAAAAGAAATGGTGAATAAACCAC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACAAACAAAAAGCTAAAGTGATAAAAGAAATGGTGAATAAACCAC  994

seq1  AAAATAAAAAAAAAAAAAAGATAAAACCCCACGGAGTAACTTAAGGTAGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAAAAAAAAAAAGATAAAACCCCACGGAGTAACTTAAGGTAGG  1044

seq1  TGCTTGACTCCAGAAAATCAAATAACCCCATTAAAAATGGGGCTCAGAGC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGACTCCAGAAAATCAAATAACCCCATTAAAAATGGGGCTCAGAGC  1094

seq1  TAAACAAAGAATTC  1112
      ||||||||||||||
seq2  TAAACAAAGAATTC  1108