BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-077H01
Chromosome10 (Build37)
Map Location 103,837,385 - 103,958,807
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSlc6a15, EG667697, LOC667701, EG627488, EG667692, EG667695, LOC100043292
Downstream geneLOC100042383, Tmtc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-077H01.bB6Ng01-077H01.g
ACCDH893414DH893415
length9591,072
definitionDH893414|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077H01, 5' end.DH893415|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077H01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,957,852 - 103,958,807)(103,837,385 - 103,838,456)
sequence
gaattcatgaaattcttaggcaaatggatgcacctggaggatagcatcct
gagtgaggtaacccaatattgatacatttcttaaccttcatgcatagaac
tataaaatatcattctgagtgaggtaatccaatagtgaaagaaaacacat
ggtatgcactcactgataagtggatactagccccagtgctacaaataacc
aggatacaattcacagaccacatgaagctcaagaataaggaagaccaaag
tgtgggtgctctgatcctttttagaagaacaaaatactcacaggagcaaa
tatggagataagtgtagagcagagactgaaggaaaggccacccagagact
gtcccacctggggattcaaccaatatacagttattgattgcattactaag
ctggtctttagctgtctggttgctcctggagttgactagcctggtggtcc
ctgatctcagcagggctctgggattgcaattaggggtggtagtccgaatt
ggcaacaggcctcttggaatgcaggcagagttggtagtccctgatggtag
caggccactggcattgcaggtaggacctctgggattgtgtggggcaggct
tccagggaaagaggcagagctcacattccctgatggcttcaggcctctga
ttattccagctggcagtaaacttccagggatgcaggcaaaggtgatgatc
cctgatggctgcagtccttcaacactgcaggtagaggtgtggcctggacg
atggaggggatgggtagacctcatgtctcctgggcttgccagggatcaag
caggaagatttttgggttgtgggatctcacctgggttggtcccaggtggg
aggtcgcctctaggtatccaggcagagcttctgccctgggaaattggagc
tcaattgtgcacgaaaatactagctctcatccttttctggtgattgcctg
gagggtctc
gaattcactaaactcctcttaatgaagtattacttagcaaaaacatgtaa
aaaatatttacggttacacacattcttcttttatacccatgactatttgt
tagaattttttataatgtataaatagcaataaatataaaatacaatgtac
atgtgtttgaggttgcatgccttatttatttaaatgactctggaattcta
attcttttctctttccactctacaggatgccaagctactatcaggctttc
ccagtgaagacatgggtatgtcccaaggcagttgacaatgtggaaagcag
agtctacattcaaatttgtccaaaatcttaaaatgaaaatagagttgaca
ttgagatccccaaagagagcttgataaaggccaacatcaattgtaataaa
catctcactcataaacccaagccctgcccgctataatttggtacataaaa
caaggtacccagagctcatggaaatgtttcttttaaaatgtttcctccag
ggagacatttcttgtcagcaaattatttttatttgagagcgattgatttt
taactaagaaaattaaaaaaaaaaacatttttgttggagtttaattgata
tgcatataattagtatatttactacctgtagtttgatgatttgggtatat
acaaacagttctataactataataaatacaaggcagtaattccagtgttt
ctcctaagcaccttagttcctttgcttttaagtgttttatttttgtgata
ataccacaagatctacatttcagtaaaatttgagatattgcaatattaat
cataacaacagacttgcaagtctattggagagttatatgagttctttaaa
gattagacttgtaggataattgtaattgtgtactcactgacaattgctct
ccgtagtcttcatgtctgtcatcttggtaaccacaagtgcttgcttctga
aaatcttttctatacagatacctcacagaaatggagtcttgtagcatccg
tccttctctgcactcttgagttcacttagcacaatgtaaagttgtcacaa
atggagaatattccttgcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_103957852_103958807
seq2: B6Ng01-077H01.b_44_1002 (reverse)

seq1  GAGACCCCTCCAGGCAATC-CCAGAAAAGG-TGAGAGCTAGTATTTTCCT  48
      |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  GAGA-CCCTCCAGGCAATCACCAGAAAAGGATGAGAGCTAGTATTTTCGT  49

seq1  GCCCAATCTGCGCTCC-ATTTCCCAGGCCAG-AGCTCTGCCTGGATCCCT  96
      || |||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||
seq2  GCACAAT-TGAGCTCCAATTTCCCAGGGCAGAAGCTCTGCCTGGATACCT  98

seq1  AGAGGCTGGCTTCCACCTGGG-CCAA-CCAGGTGAGATTCCCACAACCCA  144
      ||||||   || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  AGAGGCGACCTCCCACCTGGGACCAACCCAGGTGAGA-TCCCACAACCCA  147

seq1  ATATCCTTCCTGCTTGATCCCTGGCAAGCCCAGGAGACATGAGGTCTGCC  194
      | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAAATCTTCCTGCTTGATCCCTGGCAAGCCCAGGAGACATGAGGTCTACC  197

seq1  CATCCCCTCCATCGTCCAGGCCACACCTCTACCTGCAGTGTTGAAGGACT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCTCCATCGTCCAGGCCACACCTCTACCTGCAGTGTTGAAGGACT  247

seq1  GCAGCCATCAGGGATCATCACCTTTGCCTGCATCCCTGGAAGTTTACTGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCATCAGGGATCATCACCTTTGCCTGCATCCCTGGAAGTTTACTGC  297

seq1  CAGCTGGAATAATCAGAGGCCTGAAGCCATCAGGGAATGTGAGCTCTGCC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGAATAATCAGAGGCCTGAAGCCATCAGGGAATGTGAGCTCTGCC  347

seq1  TCTTTCCCTGGAAGCCTGCCCCACACAATCCCAGAGGTCCTACCTGCAAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCCTGGAAGCCTGCCCCACACAATCCCAGAGGTCCTACCTGCAAT  397

seq1  GCCAGTGGCCTGCTACCATCAGGGACTACCAACTCTGCCTGCATTCCAAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTGGCCTGCTACCATCAGGGACTACCAACTCTGCCTGCATTCCAAG  447

seq1  AGGCCTGTTGCCAATTCGGACTACCACCCCTAATTGCAATCCCAGAGCCC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGTTGCCAATTCGGACTACCACCCCTAATTGCAATCCCAGAGCCC  497

seq1  TGCTGAGATCAGGGACCACCAGGCTAGTCAACTCCAGGAGCAACCAGACA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAGATCAGGGACCACCAGGCTAGTCAACTCCAGGAGCAACCAGACA  547

seq1  GCTAAAGACCAGCTTAGTAATGCAATCAATAACTGTATATTGGTTGAATC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGACCAGCTTAGTAATGCAATCAATAACTGTATATTGGTTGAATC  597

seq1  CCCAGGTGGGACAGTCTCTGGGTGGCCTTTCCTTCAGTCTCTGCTCTACA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTGGGACAGTCTCTGGGTGGCCTTTCCTTCAGTCTCTGCTCTACA  647

seq1  CTTATCTCCATATTTGCTCCTGTGAGTATTTTGTTCTTCTAAAAAGGATC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCTCCATATTTGCTCCTGTGAGTATTTTGTTCTTCTAAAAAGGATC  697

seq1  AGAGCACCCACACTTTGGTCTTCCTTATTCTTGAGCTTCATGTGGTCTGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACCCACACTTTGGTCTTCCTTATTCTTGAGCTTCATGTGGTCTGT  747

seq1  GAATTGTATCCTGGTTATTTGTAGCACTGGGGCTAGTATCCACTTATCAG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTATCCTGGTTATTTGTAGCACTGGGGCTAGTATCCACTTATCAG  797

seq1  TGAGTGCATACCATGTGTTTTCTTTCACTATTGGATTACCTCACTCAGAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGCATACCATGTGTTTTCTTTCACTATTGGATTACCTCACTCAGAA  847

seq1  TGATATTTTATAGTTCTATGCATGAAGGTTAAGAAATGTATCAATATTGG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATTTTATAGTTCTATGCATGAAGGTTAAGAAATGTATCAATATTGG  897

seq1  GTTACCTCACTCAGGATGCTATCCTCCAGGTGCATCCATTTGCCTAAGAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTCACTCAGGATGCTATCCTCCAGGTGCATCCATTTGCCTAAGAA  947

seq1  TTTCATGAATTC  956
      ||||||||||||
seq2  TTTCATGAATTC  959

seq1: chr10_103837385_103838456
seq2: B6Ng01-077H01.g_63_1134

seq1  GAATTCACTAAACTCCTCTTAATGAAGTATTACTTAGCAAAAACATGTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAAACTCCTCTTAATGAAGTATTACTTAGCAAAAACATGTAA  50

seq1  AAAATATTTACGGTTACACACATTCTTCTTTTATACCCATGACTATTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATTTACGGTTACACACATTCTTCTTTTATACCCATGACTATTTGT  100

seq1  TAGAATTTTTTATAATGTATAAATAGCAATAAATATAAAATACAATGTAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTTTTTATAATGTATAAATAGCAATAAATATAAAATACAATGTAC  150

seq1  ATGTGTTTGAGGTTGCATGCCTTATTTATTTAAATGACTCTGGAATTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTGAGGTTGCATGCCTTATTTATTTAAATGACTCTGGAATTCTA  200

seq1  ATTCTTTTCTCTTTCCACTCTACAGGATGCCAAGCTACTATCAGGCTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTTCTCTTTCCACTCTACAGGATGCCAAGCTACTATCAGGCTTTC  250

seq1  CCAGTGAAGACATGGGTATGTCCCAAGGCAGTTGACAATGTGGAAAGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGAAGACATGGGTATGTCCCAAGGCAGTTGACAATGTGGAAAGCAG  300

seq1  AGTCTACATTCAAATTTGTCCAAAATCTTAAAATGAAAATAGAGTTGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTACATTCAAATTTGTCCAAAATCTTAAAATGAAAATAGAGTTGACA  350

seq1  TTGAGATCCCCAAAGAGAGCTTGATAAAGGCCAACATCAATTGTAATAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATCCCCAAAGAGAGCTTGATAAAGGCCAACATCAATTGTAATAAA  400

seq1  CATCTCACTCATAAACCCAAGCCCTGCCCGCTATAATTTGGTACATAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCACTCATAAACCCAAGCCCTGCCCGCTATAATTTGGTACATAAAA  450

seq1  CAAGGTACCCAGAGCTCATGGAAATGTTTCTTTTAAAATGTTTCCTCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTACCCAGAGCTCATGGAAATGTTTCTTTTAAAATGTTTCCTCCAG  500

seq1  GGAGACATTTCTTGTCAGCAAATTATTTTTATTTGAGAGCGATTGATTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACATTTCTTGTCAGCAAATTATTTTTATTTGAGAGCGATTGATTTT  550

seq1  TAACTAAGAAAATTAAAAAAAAAAACATTTTTGTTGGAGTTTAATTGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAAGAAAATTAAAAAAAAAAACATTTTTGTTGGAGTTTAATTGATA  600

seq1  TGCATATAATTAGTATATTTACTACCTGTAGTTTGATGATTTGGGTATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATATAATTAGTATATTTACTACCTGTAGTTTGATGATTTGGGTATAT  650

seq1  ACAAACAGTTCTATAACTATAATAAATACAAGGCAGTAATTCCAGTGTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAGTTCTATAACTATAATAAATACAAGGCAGTAATTCCAGTGTTT  700

seq1  CTCCTAAGCACCTTAGTTCCTTTGCTTTTAAGTGTTTTATTTTTGTGATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAAGCACCTTAGTTCCTTTGCTTTTAAGTGTTTTATTTTTGTGATA  750

seq1  ATACCACAAGATCTACATTTCAGTAAAATTTGAGATATTGCAATATTAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCACAAGATCTACATTTCAGTAAAATTTGAGATATTGCAATATTAAT  800

seq1  CATAACAACAGACTTGCAAGTCTATTGGAGAGTTATATGAGTTCTTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACAACAGACTTGCAAGTCTATTGGAGAGTTATATGAGTTCTTTAAA  850

seq1  GATTAGACTTGTAGGATAATTGTAATTGTGTACTCACTGACAATTGCTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGACTTGTAGGATAATTGTAATTGTGTACTCACTGACAATTGCTCT  900

seq1  CCGTAGTCTTCATGTCTGTCATCTTGGTAACCACAAGTGCTTGCTTCTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTAGTCTTCATGTCTGTCATCTTGGTAACCACAAGTGCTTGCTTCTGA  950

seq1  AAATC-TTTCTATTACAGATACCTCACAGAAATGGAGTCTTGTAGCATCC  999
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTTTCTA-TACAGATACCTCACAGAAATGGAGTCTTGTAGCATCC  999

seq1  GTCCTTCTCTGCACTCTTGAGTTCACTTAGCACAATGTAAAGTTGTCACA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTCTCTGCACTCTTGAGTTCACTTAGCACAATGTAAAGTTGTCACA  1049

seq1  AATGGAGATATTTCCTTGCCTCC  1072
      ||||||||   ||||||||||||
seq2  AATGGAGAATATTCCTTGCCTCC  1072