BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087O11
Chromosome10 (Build37)
Map Location 25,150,466 - 25,332,430
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEpb4.1l2, 2010003K15Rik
Upstream geneLOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800
Downstream geneEG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352, Samd3, L3mbtl3, LOC435208
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087O11.bB6Ng01-087O11.g
ACCDH900902DH900903
length1,1871,112
definitionDH900902|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O11, 5' end.DH900903|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,150,466 - 25,151,653)(25,331,308 - 25,332,430)
sequence
gaattctctgctggcaatatagtggctaagctttataactggattcagtt
aataatctagaaaccaaaggtattaaaattgataagagagatggaaagtc
gcctgctttggagcagactggagtaattttcgctttcctctgtaccgacg
cctgagtgcaggaacacatttaatatttttgggttgtatttgcaaatcct
agtgccacaaagttgccctgctacttagctctcttggtctctccagctat
gaggttcatgtgtctcatgaatggggtcttcagtttgaaacttcagcagc
tgaggtgactcccatggctgtgaggagtcaggctgatggaacaaaccacc
acagactggcctggccggctgagacgtcagatatcgcttctcacagttct
ggaggttgcacattggaattggcagggcattctgagttcgttaggtgggt
gtggtgtaagctctctgctgttctcacaggcttttagcagaggacctgtg
ctccacaagcacattctacatttgctataccctgaagcctccacgtactc
agtgcagatcttagtggggacacgtttctgaccttacagctaggctaaag
aaaagaaaggcacgctggtgtggtagaggtctgagctagagctctgagac
ttgctggctgatgcctggggcactggtgtttgtgctgtaggtcagtagct
gctaggtttctttgttccacagaagaagtctggaactgtgtatgtaatat
attcgtatgaccagtatttattcaaaatgtgttttaaaggcgtgtgagat
gctcagtgggtaaggtgctttttggcaagtctgaagacctcagtttagca
tgtgagactaagacagtggagagagggacctagctcctgtaaggttcctc
agagctttacacattcagtatgctgtgcatacttgtatacacttctaatg
tacagaataagtaagtgtaagtacatttaaataggtttacagttcaaaat
atgcatacaggatatactttgattaactaaaatgaattcttcctgaagaa
tcctcagccaattgctccattcgtgggtggcagtgaactgggaaagtctg
ctttcattatatagaacacaccgaaaggttacatttgtgtgtagttcgca
cggatcttttgagacctactataaaacttaccttgag
gaattcttaggaagtggcagggtgtagttctgagcagcaaacctaaccct
tgggtcagatctctacctcttcttcaacgcacattcaagatttaaaccac
agaaatcttgacattgcctttgctgttccaatattgaagcaaatgtgatc
ccaggaaggcctggcgagatctcagcttattttccatctatgtcctgctt
gctggttctgagaagtacctgctataagctcatcatttcttcttgaattt
ccccaagtctcctatgttttctgcttcatcgttaggtcttagcacgtgtg
tctattagtgtccagatcagccttgcccactactgcctatctaggactca
ctgctaagaaacaccttggcaatgttgctaaacaaagaggtcatggtaag
aaggttccaccaggtgggcacccaataatctccaagttttgacttttact
tcatgttctgactagtcaaaatgacatgctacttattctcaatagatttt
actgtcctgtactcggggaatcctgccaccataatttagttgaacctagt
aaatacagggagagggcttaagctcttaaacgctcaagaaatgataggga
gaaaagaagaaaacagaaaagcaagctgagaagtcagcactattggccca
taggcttcccactgagtctttcagagaccaagctaatttatcagagagag
ttgtcatctttggaatagtacatgactctgttttaatgttctggtatgag
gataagaaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacaaacactttcgctta
ctcctgttttggtcagtgtgactattgctgtggtaaacaccatgaccaaa
agaatttgaggagggaagggttatatggatacatatcttgtctcagttca
ttgagggaagccaaagtaggaattcaaactggacaggatcttcaaggcag
gagctgatgcagaggccatagaggggtgttgcttactggccagatcttca
tgacttgctcagcctgctttctataaaacccaggattaccagcctaggga
tgacatcacccacatggactggtcctcacccaaagcatattagaaaatac
ctacaggcttgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_25150466_25151653
seq2: B6Ng01-087O11.b_49_1235

seq1  GAATTCTCTGCTGGCAATATAGTGGCTAAGCTTTATAACTGGATTCAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGCTGGCAATATAGTGGCTAAGCTTTATAACTGGATTCAGTT  50

seq1  AATAATCTAGAAACCAAAGGTATTAAAATTGATAAGAGAGATGGAAAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATCTAGAAACCAAAGGTATTAAAATTGATAAGAGAGATGGAAAGTC  100

seq1  GCCTGCTTTGGAGCAGACTGGAGTAATTTTCGCTTTCCTCTGTACCGACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCTTTGGAGCAGACTGGAGTAATTTTCGCTTTCCTCTGTACCGACG  150

seq1  CCTGAGTGCAGGAACACATTTAATATTTTTGGGTTGTATTTGCAAATCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGTGCAGGAACACATTTAATATTTTTGGGTTGTATTTGCAAATCCT  200

seq1  AGTGCCACAAAGTTGCCCTGCTACTTAGCTCTCTTGGTCTCTCCAGCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCACAAAGTTGCCCTGCTACTTAGCTCTCTTGGTCTCTCCAGCTAT  250

seq1  GAGGTTCATGTGTCTCATGAATGGGGTCTTCAGTTTGAAACTTCAGCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTCATGTGTCTCATGAATGGGGTCTTCAGTTTGAAACTTCAGCAGC  300

seq1  TGAGGTGACTCCCATGGCTGTGAGGAGTCAGGCTGATGGAACAAACCACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTGACTCCCATGGCTGTGAGGAGTCAGGCTGATGGAACAAACCACC  350

seq1  ACAGACTGGCCTGGCCGGCTGAGACGTCAGATATCGCTTCTCACAGTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACTGGCCTGGCCGGCTGAGACGTCAGATATCGCTTCTCACAGTTCT  400

seq1  GGAGGTTGCACATTGGAATTGGCAGGGCATTCTGAGTTCGTTAGGTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTTGCACATTGGAATTGGCAGGGCATTCTGAGTTCGTTAGGTGGGT  450

seq1  GTGGTGTAAGCTCTCTGCTGTTCTCACAGGCTTTTAGCAGAGGACCTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGTAAGCTCTCTGCTGTTCTCACAGGCTTTTAGCAGAGGACCTGTG  500

seq1  CTCCACAAGCACATTCTACATTTGCTATACCCTGAAGCCTCCACGTACTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACAAGCACATTCTACATTTGCTATACCCTGAAGCCTCCACGTACTC  550

seq1  AGTGCAGATCTTAGTGGGGACACGTTTCTGACCTTACAGCTAGGCTAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCAGATCTTAGTGGGGACACGTTTCTGACCTTACAGCTAGGCTAAAG  600

seq1  AAAAGAAAGGCACGCTGGTGTGGTAGAGGTCTGAGCTAGAGCTCTGAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAAGGCACGCTGGTGTGGTAGAGGTCTGAGCTAGAGCTCTGAGAC  650

seq1  TTGCTGGCTGATGCCTGGGGCACTGGTGTTTGTGCTGTAGGTCAGTAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGGCTGATGCCTGGGGCACTGGTGTTTGTGCTGTAGGTCAGTAGCT  700

seq1  GCTAGGTTTCTTTGTTCCACAGAAGAAGTCTGGAACTGTGTATGTAATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGTTTCTTTGTTCCACAGAAGAAGTCTGGAACTGTGTATGTAATAT  750

seq1  ATTCGTATGACCAGTATTTATTCAAAATGTGTTTTAAAGGCGTGTGAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGTATGACCAGTATTTATTCAAAATGTGTTTTAAAGGCGTGTGAGAT  800

seq1  GCTCAGTGGGTAAGGTGCTTTTTGGCAAGTCTGAAGACCTCAGTTTAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGTGGGTAAGGTGCTTTTTGGCAAGTCTGAAGACCTCAGTTTAGCA  850

seq1  TGTGAGACTAAGACAGTGGAGAGAGGGACCTAGCTCCTGTAAGGTTCCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGACTAAGACAGTGGAGAGAGGGACCTAGCTCCTGTAAGGTTCCTC  900

seq1  AGAGCTTTACACATTCAGTATGCTGTGCATACTTGTATACACTTCTAATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTTACACATTCAGTATGCTGTGCATACTTGTATACACTTCTAATG  950

seq1  TACAGAATAAGTAAGTGTAAGTACATTTAAAATAGGTTTACAGTTCAAAA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAATAAGTAAGTGTAAGTACATTT-AAATAGGTTTACAGTTCAAAA  999

seq1  TTATGCATACAGGATTATACTTTGAATTAACTAAAATGAATTC-TCCTG-  1048
       ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| 
seq2  -TATGCATACAGGA-TATACTTTG-ATTAACTAAAATGAATTCTTCCTGA  1046

seq1  AGAAT-CTCAGCAAATTGCT-CATTCGTGG--TGCAGTGAAAACTGGGAA  1094
      ||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||  |||||||||
seq2  AGAATCCTCAGCCAATTGCTCCATTCGTGGGTGGCAGTG--AACTGGGAA  1094

seq1  CAGTCTGCTTTCATTATATAGAACAACACGAAAGTTTACAT---TGTGTA  1141
       ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||   ||||||
seq2  -AGTCTGCTTTCATTATATAGAACACACCGAAAGGTTACATTTGTGTGTA  1143

seq1  GTTCGACAGGAATCTTTTTGGAGCTACTATAAAAACTTAACCTTGAG  1188
      ||||| || | |||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||
seq2  GTTCG-CACGGATCTTTTGAGACCTACTAT-AAAACTT-ACCTTGAG  1187

seq1: chr10_25331308_25332430
seq2: B6Ng01-087O11.g_71_1182 (reverse)

seq1  GCAAGCCTGTAGGGTATTTTCTTAATTAATGCTTATGGGTGAGGGCCCAG  50
      ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||
seq2  GCAAGCCTGTA-GGTATTTTC-TAAT--ATGCTT-TGGGTGA-GGACCAG  44

seq1  TCCATTGTGGGTGATGTCATCCCTAGGCTGGTAATCCTGGGTTTTATAGA  100
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCCA-TGTGGGTGATGTCATCCCTAGGCTGGTAATCCTGGGTTTTATAG-  92

seq1  AAAGCAGGCTGAGCAAGTCATGAAGATCTGGCCAGTAAGCAACACCCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAGGCTGAGCAAGTCATGAAGATCTGGCCAGTAAGCAACACCCCTC  142

seq1  TATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCCTTGAAGATCCTGTCCAGTTTGAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCCTTGAAGATCCTGTCCAGTTTGAATT  192

seq1  CCTACTTTGGCTTCCCTCAATGAACTGAGACAAGATATGTAATCCATATA  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  CCTACTTTGGCTTCCCTCAATGAACTGAGACAAGATATGT-ATCCATAT-  240

seq1  AACCCTTCCCTCCTCAAATTCTTTTGGTCATGGTGTTTTACCACAGCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AACCCTTCCCTCCTCAAATTCTTTTGGTCATGGTG-TTTACCACAGCAAT  289

seq1  AGTCACACTGACCAAAACAGGAGTAAGCGAAAGTGTTTGTTTGTTTGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCACACTGACCAAAACAGGAGTAAGCGAAAGTGTTTGTTTGTTTGTTT  339

seq1  GTTTGTTTGTTTGTTTTCTTATCCTCATACCAGAACATTAAAACAGAGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGTTTGTTTTCTTATCCTCATACCAGAACATTAAAACAGAGTC  389

seq1  ATGTACTATTCCAAAGATGACAACTCTCTCTGATAAATTAGCTTGGTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACTATTCCAAAGATGACAACTCTCTCTGATAAATTAGCTTGGTCTC  439

seq1  TGAAAGACTCAGTGGGAAGCCTATGGGCCAATAGTGCTGACTTCTCAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGACTCAGTGGGAAGCCTATGGGCCAATAGTGCTGACTTCTCAGCT  489

seq1  TGCTTTTCTGTTTTCTTCTTTTCTCCCTATCATTTCTTGAGCGTTTAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTCTGTTTTCTTCTTTTCTCCCTATCATTTCTTGAGCGTTTAAGA  539

seq1  GCTTAAGCCCTCTCCCTGTATTTACTAGGTTCAACTAAATTATGGTGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAAGCCCTCTCCCTGTATTTACTAGGTTCAACTAAATTATGGTGGCA  589

seq1  GGATTCCCCGAGTACAGGACAGTAAAATCTATTGAGAATAAGTAGCATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCCCCGAGTACAGGACAGTAAAATCTATTGAGAATAAGTAGCATGT  639

seq1  CATTTTGACTAGTCAGAACATGAAGTAAAAGTCAAAACTTGGAGATTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGACTAGTCAGAACATGAAGTAAAAGTCAAAACTTGGAGATTATT  689

seq1  GGGTGCCCACCTGGTGGAACCTTCTTACCATGACCTCTTTGTTTAGCAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCCCACCTGGTGGAACCTTCTTACCATGACCTCTTTGTTTAGCAAC  739

seq1  ATTGCCAAGGTGTTTCTTAGCAGTGAGTCCTAGATAGGCAGTAGTGGGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCAAGGTGTTTCTTAGCAGTGAGTCCTAGATAGGCAGTAGTGGGCA  789

seq1  AGGCTGATCTGGACACTAATAGACACACGTGCTAAGACCTAACGATGAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGATCTGGACACTAATAGACACACGTGCTAAGACCTAACGATGAAG  839

seq1  CAGAAAACATAGGAGACTTGGGGAAATTCAAGAAGAAATGATGAGCTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAACATAGGAGACTTGGGGAAATTCAAGAAGAAATGATGAGCTTAT  889

seq1  AGCAGGTACTTCTCAGAACCAGCAAGCAGGACATAGATGGAAAATAAGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGTACTTCTCAGAACCAGCAAGCAGGACATAGATGGAAAATAAGCT  939

seq1  GAGATCTCGCCAGGCCTTCCTGGGATCACATTTGCTTCAATATTGGAACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCTCGCCAGGCCTTCCTGGGATCACATTTGCTTCAATATTGGAACA  989

seq1  GCAAAGGCAATGTCAAGATTTCTGTGGTTTAAATCTTGAATGTGCGTTGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGCAATGTCAAGATTTCTGTGGTTTAAATCTTGAATGTGCGTTGA  1039

seq1  AGAAGAGGTAGAGATCTGACCCAAGGGTTAGGTTTGCTGCTCAGAACTAC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGTAGAGATCTGACCCAAGGGTTAGGTTTGCTGCTCAGAACTAC  1089

seq1  ACCCTGCCACTTCCTAAGAATTC  1123
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGCCACTTCCTAAGAATTC  1112