BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096H17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 123,855,579 - 123,944,255
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930503E24Rik
Upstream geneAI851790
Downstream geneLOC671416, Slc16a7, LOC100042987, EG668313, LOC100042992
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096H17.bB6Ng01-096H17.g
ACCDH907119DH907120
length1,2251,212
definitionDH907119|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096H17, 5' end.DH907120|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096H17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,943,006 - 123,944,255)(123,855,579 - 123,856,800)
sequence
gaattctattagaaggtcaagtcctgaaagattccttgtgataaggagaa
ttagttgtatagacaagtcccgatcagcatttatcactgcataaatattg
actaggcacagtttctagattctttggttaaatacagcattgtagaaata
ttttcaaatacttttaaccaggaagcagaaaaaacctaatgaagtagacg
ttcaggatatctgaagatattccaggaatatgccatactttttcatttag
tagtgaatactaaccaatactctgtcatttaattaccaatggtcaaatgg
gcttcattatacagctatatttctataatattttgagcaaaagttcatag
aaataattccttgtatttaatgtttaataataatgctttaaaacacagat
acacacacacacacacacgcaccgcacaacaaaccacacacacacacacc
aaaaccattctttaaaattattttttataaatactttatatttttgttgg
atttcaattataatgctctataaaacatttatgaggagctggagagatgg
ctccactgtaagagtacccattcaattcctagtcctaaatgaagaaggct
ttcaagggtcgataattccagtcccaagggatctgacaccctcttctgtc
ctcttcagaaactctgtgatacatagtcgttcaggcaaacactaataaaa
ataaaataaaataaataaactctttaaacattataaattaacattataaa
ttaacttgtctttgggtaatacgtgaatctctaagtgtccatcttagagt
gtaattgtggaatggcacattgtttttagttttttaacatttatctgtga
aaataagtcagtacaattttggtctgttttcatatcttggttgttttcaa
tatatagtgacatgattctcacgcaaatgtaatttaatggatttttgaaa
tctctcatacccttaatacatacctcttaaatattattatttttaaagta
agtagaatttcattgtggtgttctggttagaaataacattgctgcgataa
aagactgtgatcaaaccaagtaggactctagcttgatcagttgacataaa
ttccaactggattgctctatgctaacttgaacacattgcttgctattgtt
gaaacaagtcctagaattggaatgacatttattgcgctagctaaaaccat
gactctttgcaacacagggttctct
gaattctttatgttgtatacacttcaatatatttgcaattggctaccaaa
gtatggtaatcactaatagcttgttgttactttcatgttggatagacctt
aaatttctttatagaaatttacacatgtgatatgcccttcatactaagtt
gttccttttgagatgtatctttgggcattacattcttaggcaactctgag
tttttttacatctcagtgtaatcatcttcctgtggttgttattagtgagt
ttggacacaatggattctatagtagagttgaagaaattcaccctctgtgt
ggatcttgcgagagtatggtcctcttagaaatttatgggtgtgtgatgca
cacactaaagtgtgtgtactgtactgtgcatggttattcccacaacataa
tgctgatccttgatgagaactttctcagcccacgttaacattagttgcta
cttgaatgcctctctattactagctattccaatagtagtgaaagcctgaa
gtacttattgagttagaaagtggcagaggaaaagacacttcacaagagaa
taggaattgcaggcactctgtgatacccataacaaatcctgtcaacactg
tgtgaaatgtgtgtgacccaggtccttcctctccagctgtggctgcataa
agatggggtaatggttaaggttttactcaaccaggtatttttaagtttta
ttatcatcaaggcacaaacaaaaaattgtcaatttcactgagggtctctt
ggagccatctagagaatgggcatgtccggatttttgttgtctagcaacat
ttctgtctgactcctctgaagttgtatgatcacggtgaggcaatagccaa
ggatgctattcttttcatttacagtgagcatcatgggtcagactgagtgc
actgtagcttgagcaaagcgaaagatctatcggaggtgatctgaaagtaa
atcaaaagacataacacttcttaaataagattctttaaatgtgtgcaaat
gtaactagaccacgtatgaactcaggaacttttctcatccttttgccatc
atcatacaaaggttgagtaaatgtttcaaatatccataacctaaatccat
taaatgcagatggccaaactaattctggagagctataaacaaatggctgg
aaccttactgggatgatctagtaacgcttcatggctaacagccccaaccc
tttttcccaata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_123943006_123944255
seq2: B6Ng01-096H17.b_48_1272 (reverse)

seq1  AGAGAACCTGGTTTTGCAAAGATTTCTAGGGTCTCTGCCTTAGCCGGATA  50
      ||||||||  || ||||||||| |   | ||| |  ||  ||||  |  |
seq2  AGAGAACCCTGTGTTGCAAAGAGT--CATGGTTTTAGC--TAGC--GCAA  44

seq1  TATATGTCATATCACAATACTAAGTACTTGTCTCAACAATAGCAAGCATA  100
      || ||||||| || |||| || || |||||| |||||||||||||||| |
seq2  TAAATGTCAT-TC-CAATTCT-AGGACTTGTTTCAACAATAGCAAGCA-A  90

seq1  TGTGTTCAAAGTTAGCATAGAGCAGAATCCAGTTGTGATTTTATGTCAAC  150
      ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||
seq2  TGTGTTC-AAGTTAGCATAGAGC--AATCCAGTTG-GAATTTATGTCAAC  136

seq1  TTGATACCAGCTAGAGTCCCTTACTTGGTTTTGATCACAGTCTTTTATCG  200
       |||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  -TGAT-CAAGCTAGAGTCC--TACTTGG-TTTGATCACAGTCTTTTATCG  181

seq1  CAGCAATTGTTATTTCTAACCAGAACACCAACAATGAAATTTCTACTTAC  250
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  CAGCAA-TGTTATTTCTAACCAGAACACC-ACAATGAAA-TTCTACTTAC  228

seq1  TTTTAAAAATAAATAATATTTTAAGAGGTATGTATTAAGGGTATGAGAGA  300
       ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTAAAAAT-AATAATA-TTTAAGAGGTATGTATTAAGGGTATGAGAGA  275

seq1  TTTCAAAAATCCATTAAATTACATTTGCGTGAGAATCATGTCACTATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAAATCCATTAAATTACATTTGCGTGAGAATCATGTCACTATATA  325

seq1  TTGAAAACAACCAAGATATGAAAACAGACCAAAATTGTACTGACTTATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAACAACCAAGATATGAAAACAGACCAAAATTGTACTGACTTATTT  375

seq1  TCACAGATAAATGTTAAAAAACTAAAAACAATGTGCCATTCCACAATTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGATAAATGTTAAAAAACTAAAAACAATGTGCCATTCCACAATTAC  425

seq1  ACTCTAAGATGGACACTTAGAGATTCACGTATTACCCAAAGACAAGTTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAAGATGGACACTTAGAGATTCACGTATTACCCAAAGACAAGTTAA  475

seq1  TTTATAATGTTAATTTATAATGTTTAAAGAGTTTATTTATTTTATTTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAATGTTAATTTATAATGTTTAAAGAGTTTATTTATTTTATTTTAT  525

seq1  TTTTATTAGTGTTTGCCTGAACGACTATGTATCACAGAGTTTCTGAAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATTAGTGTTTGCCTGAACGACTATGTATCACAGAGTTTCTGAAGAG  575

seq1  GACAGAAGAGGGTGTCAGATCCCTTGGGACTGGAATTATCGACCCTTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAAGAGGGTGTCAGATCCCTTGGGACTGGAATTATCGACCCTTGAA  625

seq1  AGCCTTCTTCATTTAGGACTAGGAATTGAATGGGTACTCTTACAGTGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCTTCATTTAGGACTAGGAATTGAATGGGTACTCTTACAGTGGAG  675

seq1  CCATCTCTCCAGCTCCTCATAAATGTTTTATAGAGCATTATAATTGAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCTCCAGCTCCTCATAAATGTTTTATAGAGCATTATAATTGAAAT  725

seq1  CCAACAAAAATATAAAGTATTTATAAAAAATAATTTTAAAGAATGGTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACAAAAATATAAAGTATTTATAAAAAATAATTTTAAAGAATGGTTTT  775

seq1  GGTGTGTGTGTGTGTGGTTTGTTGTGCGGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGTGTGTGTGTGGTTTGTTGTGCGGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGT  825

seq1  ATCTGTGTTTTAAAGCATTATTATTAAACATTAAATACAAGGAATTATTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGTTTTAAAGCATTATTATTAAACATTAAATACAAGGAATTATTT  875

seq1  CTATGAACTTTTGCTCAAAATATTATAGAAATATAGCTGTATAATGAAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAACTTTTGCTCAAAATATTATAGAAATATAGCTGTATAATGAAGC  925

seq1  CCATTTGACCATTGGTAATTAAATGACAGAGTATTGGTTAGTATTCACTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGACCATTGGTAATTAAATGACAGAGTATTGGTTAGTATTCACTA  975

seq1  CTAAATGAAAAAGTATGGCATATTCCTGGAATATCTTCAGATATCCTGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATGAAAAAGTATGGCATATTCCTGGAATATCTTCAGATATCCTGAA  1025

seq1  CGTCTACTTCATTAGGTTTTTTCTGCTTCCTGGTTAAAAGTATTTGAAAA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTACTTCATTAGGTTTTTTCTGCTTCCTGGTTAAAAGTATTTGAAAA  1075

seq1  TATTTCTACAATGCTGTATTTAACCAAAGAATCTAGAAACTGTGCCTAGT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTACAATGCTGTATTTAACCAAAGAATCTAGAAACTGTGCCTAGT  1125

seq1  CAATATTTATGCAGTGATAAATGCTGATCGGGACTTGTCTATACAACTAA  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATTTATGCAGTGATAAATGCTGATCGGGACTTGTCTATACAACTAA  1175

seq1  TTCTCCTTATCACAAGGAATCTTTCAGGACTTGACCTTCTAATAGAATTC  1250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTTATCACAAGGAATCTTTCAGGACTTGACCTTCTAATAGAATTC  1225

seq1: chr10_123855579_123856800
seq2: B6Ng01-096H17.g_66_1277

seq1  GAATTCTTTATGTTGTATACACTTCAATATATTTGCAATTGGCTACCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATGTTGTATACACTTCAATATATTTGCAATTGGCTACCAAA  50

seq1  GTATGGTAATCACTAATAGCTTGTTGTTACTTTCATGTTGGATAGACCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGTAATCACTAATAGCTTGTTGTTACTTTCATGTTGGATAGACCTT  100

seq1  AAATTTCTTTATAGAAATTTACACATGTGATATGCCCTTCATACTAAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCTTTATAGAAATTTACACATGTGATATGCCCTTCATACTAAGTT  150

seq1  GTTCCTTTTGAGATGTATCTTTGGGCATTACATTCTTAGGCAACTCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTTTTGAGATGTATCTTTGGGCATTACATTCTTAGGCAACTCTGAG  200

seq1  TTTTTTTACATCTCAGTGTAATCATCTTCCTGTGGTTGTTATTAGTGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTACATCTCAGTGTAATCATCTTCCTGTGGTTGTTATTAGTGAGT  250

seq1  TTGGACACAATGGATTCTATAGTAGAGTTGAAGAAATTCACCCTCTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACACAATGGATTCTATAGTAGAGTTGAAGAAATTCACCCTCTGTGT  300

seq1  GGATCTTGCGAGAGTATGGTCCTCTTAGAAATTTATGGGTGTGTGATGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTTGCGAGAGTATGGTCCTCTTAGAAATTTATGGGTGTGTGATGCA  350

seq1  CACACTAAAGTGTGTGTACTGTACTGTGCATGGTTATTCCCACAACATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTAAAGTGTGTGTACTGTACTGTGCATGGTTATTCCCACAACATAA  400

seq1  TGCTGATCCTTGATGAGAACTTTCTCAGCCCACGTTAACATTAGTTGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATCCTTGATGAGAACTTTCTCAGCCCACGTTAACATTAGTTGCTA  450

seq1  CTTGAATGCCTCTCTATTACTAGCTATTCCAATAGTAGTGAAAGCCTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAATGCCTCTCTATTACTAGCTATTCCAATAGTAGTGAAAGCCTGAA  500

seq1  GTACTTATTGAGTTAGAAAGTGGCAGAGGAAAAGACACTTCACAAGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTATTGAGTTAGAAAGTGGCAGAGGAAAAGACACTTCACAAGAGAA  550

seq1  TAGGAATTGCAGGCACTCTGTGATACCCATAACAAATCCTGTCAACACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATTGCAGGCACTCTGTGATACCCATAACAAATCCTGTCAACACTG  600

seq1  TGTGAAATGTGTGTGACCCAGGTCCTTCCTCTCCAGCTGTGGCTGCATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAATGTGTGTGACCCAGGTCCTTCCTCTCCAGCTGTGGCTGCATAA  650

seq1  AGATGGGGTAATGGTTAAGGTTTTACTCAACCAGGTATTTTTAAGTTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGGTAATGGTTAAGGTTTTACTCAACCAGGTATTTTTAAGTTTTA  700

seq1  TTATCATCAAGGCACAAACAAAAAATTGTCAATTTCACTGAGGGTCTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATCAAGGCACAAACAAAAAATTGTCAATTTCACTGAGGGTCTCTT  750

seq1  GGAGCCATCTAGAGAATGGGCATGTCCGGATTTTTGTTGTCTAGCAACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCATCTAGAGAATGGGCATGTCCGGATTTTTGTTGTCTAGCAACAT  800

seq1  TTCTGTCTGACTCCTCTGAAGTTGTATGATCACGGTGAGGCAATAGCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTGACTCCTCTGAAGTTGTATGATCACGGTGAGGCAATAGCCAA  850

seq1  GGATGCTATTCTTTTCATTTACAGTGAGCATCATGGGTCAGACTGAGTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTATTCTTTTCATTTACAGTGAGCATCATGGGTCAGACTGAGTGC  900

seq1  ACTGTAGCTTGAGCAAAGCGAAAGATCTATCGGAGGTGATCTGAAAGTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAGCTTGAGCAAAGCGAAAGATCTATCGGAGGTGATCTGAAAGTAA  950

seq1  ATCAAAAGACATAACACTTC-TAAATAAGATTCTTTAAATGTGTGCAAAT  999
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGACATAACACTTCTTAAATAAGATTCTTTAAATGTGTGCAAAT  1000

seq1  GTAACTAGACCACGTATGAACTCCAGGAACTTTTCTCAATCCTTTTGCCA  1049
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GTAACTAGACCACGTATGAACT-CAGGAACTTTTCTC-ATCCTTTTGCCA  1048

seq1  TCATCATACAAAGGTTGAATTAAAATGTTTTCATATATCCATAA-CTAAA  1098
      |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||| |||||
seq2  TCATCATACAAAGGTTGAGT--AAATG-TTTCAAATATCCATAACCTAAA  1095

seq1  TCCCATTAAATGCAGATGGCCAAACTAAATTCT-GAGAGTCAT-AACAAA  1146
      | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||
seq2  T-CCATTAAATGCAGATGGCCAAACT-AATTCTGGAGAGCTATAAACAAA  1143

seq1  TAGCTTGGAGCACTTCACTTTGGATGAATCTTG-GACGCTCACTTGCTAA  1195
      | || ||||  || | || | ||||| |||| |  |||||   | |||  
seq2  TGGC-TGGA--ACCTTAC-TGGGATG-ATCTAGTAACGCTTCATGGCT--  1186

seq1  AACAGCCCCCACTCTTTTTTCCCAATA  1222
      ||||||||| || | ||||||||||||
seq2  AACAGCCCCAAC-CCTTTTTCCCAATA  1212