BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-108N15
Chromosome10 (Build37)
Map Location 129,067,138 - 129,214,346
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr799, Olfr800, Smt3h2-ps3, Olfr801, Olfr802, Olfr803, Olfr804, Olfr805, Olfr806, Olfr807, Olfr808, Olfr809
Upstream geneIkzf4, Suox, EG622589, Rab5b, Cdk2, Si, Dgka, LOC100043669, Wibg, LOC622655, Mmp19, 1110012D08Rik, Dnajc14, Ormdl2, 1110005A23Rik, Gdf11, Cd63, Rdh5, Bloc1s1, Itga7, Mettl7b, Olfr9, Olfr763, EG622733, EG546487, Olfr765, Olfr768, Olfr769, Olfr770, Olfr771, Olfr772, Olfr773-ps1, LOC624925, Olfr774, Olfr1518, Olfr776, Olfr777, Olfr778-ps1, LOC544749, Olfr780, Olfr781, Olfr782, Olfr783-ps1, Olfr784, EG546488, Olfr786, Olfr787, Olfr788, Olfr789-ps1, Olfr790, Olfr791, Olfr792, GA_x5J8B7W6HFP-3168293-3169194, Olfr794, GA_x5J8B7W6HFP-3198834-3199739, Olfr796, GA_x5J8B7W6HFP-3231749-3230798, Olfr798
Downstream geneOlfr810, Olfr811, Olfr812, Olfr813, Olfr814, Olfr815, Olfr816, Olfr1544-ps1, Olfr817-ps1, Olfr818, LOC100043200, Olfr247, LOC100043203, Olfr820, Olfr821, Olfr822, Olfr1542-ps1, Olfr823, LOC382471, Olfr824, LOC672405, Olfr825, Olfr826, Olfr827, Neurod4, 5830405N20Rik, EG625068, LOC100043719, EG623734, EG625109, EG625131
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-108N15.bB6Ng01-108N15.g
ACCDH915927DH915928
length1,1131,082
definitionDH915927|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108N15, 5' end.DH915928|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108N15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,213,223 - 129,214,346)(129,067,138 - 129,068,227)
sequence
gaattcatttttttcagtatcactaaaggaaacagttatggtatatatgt
aacacaaacatagacacatatacatacatgtaagaatatatatgcgtgta
tagaattgcataacatacacatgaattaacagggaggctcaatgacttaa
cctttccaaaaatatgcatgatgtcattgacatatgtgtcacttgagata
tataagatataattcaaatttgcttcatctctaattttataatacaaatt
agtaaagccatttcataataatcatgttcagaaactcatcaagtaaatta
aagtgtattgcaacacgagtatagtaactgtattaagagtatcatacact
tttatttctgagatgaactgaaacaaggatacgttcatcagttttatggt
tgaaactgttacatgttgcatgtgtaagctatatcagatcagcagttttg
aagcaagtttttttcgcacgagatccttaaatgcttgtttcacctgctgg
ttccttaaagtgtaaataaaaggattcagcatgggagcaacagaggtgtt
gagcatagccaccccctttgttaaagcaactccagccttggcagatgttt
tcacatacatgaagatgcagcttccataggatatagagacaacaatcatg
tgtgaggagcaggttgagaaggccttttccctttgtttggctgagggaaa
tttcagaatagttctgagaatacaggtgtaagagagaattatcagcatca
gcgtggtcataagtgtgatcaaagctaatataaagctcataagctccaag
gtgcttgtgtctgtgcaggatatttgcagcaaaggagcagagtcacatgt
gaagtggtcaatagtgttggagtcacagaaatctagatctaagcccatgg
ccagtggaggaaaaactaccaagaaaccagccagccaggagctgatgatg
agctggtggcagatcttgttactgatgatgtcgtatagtgcagaggcttg
caaatagccacatagcgatcataggaaatggatgccagatgaaactctgt
gagcagagataagaaaaatagttgggcagccaggcattataggagatcga
tttgtccttagtt
gaattctcattttggctagtctcttaattaaggtagtcttttacaaagag
catttgttttgtttaagtacaggacaagttgcactggagatggcttaaga
catgcagcagtttggaaacactaaacatggaaagtgtgttgcatctgtgc
atgtgaggtcatggagaggatggaggctggttttgaacgatgtagcttgg
ttaaattgctttgtttatcagagcatctaggatatgattcaagatataag
atttaatgggaattggtagagtacacatactttctttttagatgactaaa
cagaggagttccttatttcctacaaaatattgatgtagtttgggtttcat
tttcagagtgaggtctaggtgaacagaatatctagactttctcaaattgt
ttccaaatctatttgcaagtatattcaggctctaagaacagaacatagag
agctgaattgaattattttagcaaactaacaacttcaggagctgctaccc
ataactgtcagggagatgtgaaaggtatggcttatataccatttcttcct
aaaagatgcaaaatcattagaatgtaaaggcaaaccccataccaaaggta
gttagggatttttcctacaaaataccaatagtaaatattttgtgcctctt
ccatgagtctctgtgttacaactattggattctgtcactaaaaatccaac
tatgggaactatgaatatagacatgtttcaacaatactttgtttatatgc
atattttccttcaagcctgagtttactatctttgcccatggatgtgaccc
ttactcctaaggctttccactatgtttttctctagtgttcaagctagaag
cctgtggtttgcagagataaaaaatgtcttttgccatctgcctaagagag
tgaacttctgcttaaagattacttggctctaagattttactcaacacagc
cttatgtctgaaaatctcattactctcatactctctgatcctagtcattt
ctagcaagcatacttagtatagcacacagatgctgtcataccgcatccct
ccatgtgtttagtcaattcagtagcatactgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_129213223_129214346
seq2: B6Ng01-108N15.b_50_1162 (reverse)

seq1  AACTAAGGACAAATCGATCTCCTATAATGCTTGTGCTGCCCAACTATTTT  50
      |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
seq2  AACTAAGGACAAATCGATCTCCTATAATGCCTG-GCTGCCCAACTATTTT  49

seq1  TCTTTATCTTCCTTGGCTCAACAGAGTTTTTCCTTCTGGCATCCATGTCC  100
      || ||||||  ||  |||| |||||||||   | |||||||||||| |||
seq2  TC-TTATCT--CT--GCTC-ACAGAGTTT---CATCTGGCATCCATTTCC  90

seq1  TATGATCGCTATGTGGCTATTTGCAAGCCTCTGCACTATACGACCATCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATGATCGCTATGTGGCTATTTGCAAGCCTCTGCACTATACGA-CATCAT  139

seq1  CAGTAACAAGATCTGCCACCAGCTCATCATCAGCTCCTGGCTGGCTGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAACAAGATCTGCCACCAGCTCATCATCAGCTCCTGGCTGGCTGGTT  189

seq1  TCTTGGTAGTTTTTCCTCCACTGGCCATGGGCTTAGATCTAGATTTCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTAGTTTTTCCTCCACTGGCCATGGGCTTAGATCTAGATTTCTGT  239

seq1  GACTCCAACACTATTGACCACTTCACATGTGACTCTGCTCCTTTGCTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCAACACTATTGACCACTTCACATGTGACTCTGCTCCTTTGCTGCA  289

seq1  AATATCCTGCACAGACACAAGCACCTTGGAGCTTATGAGCTTTATATTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCTGCACAGACACAAGCACCTTGGAGCTTATGAGCTTTATATTAG  339

seq1  CTTTGATCACACTTATGACCACGCTGATGCTGATAATTCTCTCTTACACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGATCACACTTATGACCACGCTGATGCTGATAATTCTCTCTTACACC  389

seq1  TGTATTCTCAGAACTATTCTGAAATTTCCCTCAGCCAAACAAAGGGAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCTCAGAACTATTCTGAAATTTCCCTCAGCCAAACAAAGGGAAAA  439

seq1  GGCCTTCTCAACCTGCTCCTCACACATGATTGTTGTCTCTATATCCTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTCTCAACCTGCTCCTCACACATGATTGTTGTCTCTATATCCTATG  489

seq1  GAAGCTGCATCTTCATGTATGTGAAAACATCTGCCAAGGCTGGAGTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGCATCTTCATGTATGTGAAAACATCTGCCAAGGCTGGAGTTGCT  539

seq1  TTAACAAAGGGGGTGGCTATGCTCAACACCTCTGTTGCTCCCATGCTGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAAAGGGGGTGGCTATGCTCAACACCTCTGTTGCTCCCATGCTGAA  589

seq1  TCCTTTTATTTACACTTTAAGGAACCAGCAGGTGAAACAAGCATTTAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTATTTACACTTTAAGGAACCAGCAGGTGAAACAAGCATTTAAGG  639

seq1  ATCTCGTGCGAAAAAAACTTGCTTCAAAACTGCTGATCTGATATAGCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCGTGCGAAAAAAACTTGCTTCAAAACTGCTGATCTGATATAGCTTA  689

seq1  CACATGCAACATGTAACAGTTTCAACCATAAAACTGATGAACGTATCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCAACATGTAACAGTTTCAACCATAAAACTGATGAACGTATCCTT  739

seq1  GTTTCAGTTCATCTCAGAAATAAAAGTGTATGATACTCTTAATACAGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGTTCATCTCAGAAATAAAAGTGTATGATACTCTTAATACAGTTA  789

seq1  CTATACTCGTGTTGCAATACACTTTAATTTACTTGATGAGTTTCTGAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACTCGTGTTGCAATACACTTTAATTTACTTGATGAGTTTCTGAACA  839

seq1  TGATTATTATGAAATGGCTTTACTAATTTGTATTATAAAATTAGAGATGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTATTATGAAATGGCTTTACTAATTTGTATTATAAAATTAGAGATGA  889

seq1  AGCAAATTTGAATTATATCTTATATATCTCAAGTGACACATATGTCAATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAATTTGAATTATATCTTATATATCTCAAGTGACACATATGTCAATG  939

seq1  ACATCATGCATATTTTTGGAAAGGTTAAGTCATTGAGCCTCCCTGTTAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATGCATATTTTTGGAAAGGTTAAGTCATTGAGCCTCCCTGTTAAT  989

seq1  TCATGTGTATGTTATGCAATTCTATACACGCATATATATTCTTACATGTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGTATGTTATGCAATTCTATACACGCATATATATTCTTACATGTA  1039

seq1  TGTATATGTGTCTATGTTTGTGTTACATATATACCATAACTGTTTCCTTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATGTGTCTATGTTTGTGTTACATATATACCATAACTGTTTCCTTT  1089

seq1  AGTGATACTGAAAAAAATGAATTC  1124
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATACTGAAAAAAATGAATTC  1113

seq1: chr10_129067138_129068227
seq2: B6Ng01-108N15.g_66_1147

seq1  GAATTCTCATTTTGGCTAGTCTCTTAATTAAGGTAGTCTTTTACAAAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTTTGGCTAGTCTCTTAATTAAGGTAGTCTTTTACAAAGAG  50

seq1  CATTTGTTTTGTTTAAGTACAGGACAAGTTGCACTGGAGATGGCTTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTTTGTTTAAGTACAGGACAAGTTGCACTGGAGATGGCTTAAGA  100

seq1  CATGCAGCAGTTTGGAAACACTAAACATGGAAAGTGTGTTGCATCTGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGCAGTTTGGAAACACTAAACATGGAAAGTGTGTTGCATCTGTGC  150

seq1  ATGTGAGGTCATGGAGAGGATGGAGGCTGGTTTTGAACGATGTAGCTTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGGTCATGGAGAGGATGGAGGCTGGTTTTGAACGATGTAGCTTGG  200

seq1  TTAAATTGCTTTGTTTATCAGAGCATCTAGGATATGATTCAAGATATAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTGCTTTGTTTATCAGAGCATCTAGGATATGATTCAAGATATAAG  250

seq1  ATTTAATGGGAATTGGTAGAGTACACATACTTTCTTTTTAGATGACTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATGGGAATTGGTAGAGTACACATACTTTCTTTTTAGATGACTAAA  300

seq1  CAGAGGAGTTCCTTATTTCCTACAAAATATTGATGTAGTTTGGGTTTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGTTCCTTATTTCCTACAAAATATTGATGTAGTTTGGGTTTCAT  350

seq1  TTTCAGAGTGAGGTCTAGGTGAACAGAATATCTAGACTTTCTCAAATTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAGTGAGGTCTAGGTGAACAGAATATCTAGACTTTCTCAAATTGT  400

seq1  TTCCAAATCTATTTGCAAGTATATTCAGGCTCTAAGAACAGAACATAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAATCTATTTGCAAGTATATTCAGGCTCTAAGAACAGAACATAGAG  450

seq1  AGCTGAATTGAATTATTTTAGCAAACTAACAACTTCAGGAGCTGCTACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAATTGAATTATTTTAGCAAACTAACAACTTCAGGAGCTGCTACCC  500

seq1  ATAACTGTCAGGGAGATGTGAAAGGTATGGCTTATATACCATTTCTTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGTCAGGGAGATGTGAAAGGTATGGCTTATATACCATTTCTTCCT  550

seq1  AAAAGATGCAAAATCATTAGAATGTAAAGGCAAACCCCATACCAAAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGATGCAAAATCATTAGAATGTAAAGGCAAACCCCATACCAAAGGTA  600

seq1  GTTAGGGATTTTTCCTACAAAATACCAATAGTAAATATTTTGTGCCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGGATTTTTCCTACAAAATACCAATAGTAAATATTTTGTGCCTCTT  650

seq1  CCATGAGTCTCTGTGTTACAACTATTGGATTCTGTCACTAAAAATCCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGTCTCTGTGTTACAACTATTGGATTCTGTCACTAAAAATCCAAC  700

seq1  TATGGGAACTATGAATATAGACATGTTTCAACAATACTTTGTTTATATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGAACTATGAATATAGACATGTTTCAACAATACTTTGTTTATATGC  750

seq1  ATATTTTCCTTCAAGCCTGAGTTTACTATCTTTGCCCATGGATGTGACCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTCCTTCAAGCCTGAGTTTACTATCTTTGCCCATGGATGTGACCC  800

seq1  TTACTCCTAAGGCTTTCCACTATGTTTTTCTCTAGTGTTCAAGCTAGAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCCTAAGGCTTTCCACTATGTTTTTCTCTAGTGTTCAAGCTAGAAG  850

seq1  CCTGTGGTTTGCAGAGAT-AAAAATGTC-TTTGCCATCTGCCTAAGAGAG  898
      |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGTTTGCAGAGATAAAAAATGTCTTTTGCCATCTGCCTAAGAGAG  900

seq1  TGAACTTCTGCTTAAAGATTACTTGGCTCTAAGATTTTACTCAACACAGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTCTGCTTAAAGATTACTTGGCTCTAAGATTTTACTCAACACAGC  950

seq1  CTTATGTCTGAAAATCTCATTACTCTCATTACTCTCTGAATCCTAGTCAA  998
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| 
seq2  CTTATGTCTGAAAATCTCATTACTCTCA-TACTCTCTG-ATCCTAGTCA-  997

seq1  TTTCCTAGCAAGCATACTTAGGTATAGCACACAGATGCTGTCATACCCGC  1048
       || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  -TTTCTAGCAAGCATACTTA-GTATAGCACACAGATGCTGTCATA-CCGC  1044

seq1  ATCCCTCCATGTGTTTAGTCAATTTTCAGGTAAGCATACTGG  1090
      ||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||
seq2  ATCCCTCCATGTGTTTAGTCAA--TTCAG--TAGCATACTGG  1082