BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114D22
Chromosome10 (Build37)
Map Location 49,319,969 - 49,436,563
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrik2
Upstream geneLOC546562, LOC100041689
Downstream geneLOC629652, Ascc3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114D22.bB6Ng01-114D22.g
ACCDH919812DH919813
length9721,084
definitionDH919812|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114D22, 5' end.DH919813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114D22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,319,969 - 49,320,941)(49,435,471 - 49,436,563)
sequence
gaattcattacaaattcatagagatcctaaagcatgaaaagatactgttt
ataatacatttgtgaattattgtcagtttatgaaggatcttttccaaaag
agagtaaaagtaaatatcacattaagttattgcattatccttggactttg
ttgaggacttaaagcctcttcacagttccagtctcaagacttctctgccc
ctgcaattaaacaggttttatttctcttctgatggacttcagtattacaa
ccaaaaatcccatttataaaattgcctgtgtatggtcttctctctttcaa
taatgtacaagacttaatgcatcaaacagaccaggtttcttccctcttcc
ttcataactctaaaacaatggctgttttcctgcaatggctgtaattatac
cactaatatcaactacttacctgctttgtcttcatgtgaatatactagaa
tttgtgaattatactctgtgcagtagaaactgttcctgtgtatgttcatt
cacttacttttgaactctgtacctactaaatttacttagggtttgagatc
attcacagaagacaacgcatcctttggccttattccttccaataccaagt
taaaatgtctcctgagaggctctgccggagcctgactaatacaaggcaga
tgcttacagctagccatcagactgaccaagagaaccacaatggaggagtt
agaggaaggactgaaggagctaagggggtttgcaaacctataggaagaac
gacaatatcaaccaaccagaaccgtcccccccagagttaccaagaactaa
accaccaatcaaagcatacaaatggagggatccatggctccagctgcata
tgtagcagaggatggccttaactggcctcagtggaggggaagcccttggt
cctctgaaggcttgatgccccagcatagggaattctagggtggtgagaca
ggagtggatgggttgggtgagg
gaattcagtaatgaaaatatgacatttacttcaccatttttatcattata
aacaataatagaatggttttatcagttctaagttttcatgttgtattctt
aatatgtaacgaatgcattgggacaattcttgaacttattatctttcaac
cgagttcatatctagattcatctgtgtcatcatgttgctaggtggttttg
aaaagttcttgtacctttttaagttttgctccacagcttcatgttaacaa
tttagaaatttatttagtctctcaactcatgctgaaaactaatgtccatt
gttaagaaaatgatactgaatgattaatgtgtttgatcaatatgtgtcat
ctgatatttctcagttcccaacaggctcattggtatctataactttaaga
aactttttaaaattagaccatcatatgtctgaattaagttaaagattttg
gttactgacagttaccaatttaaatataaagttataggcagattgtataa
gtaaatactagtaattaagatgacttgaaaaatattaatagaaagtagta
tgaaactgagttattttaattataagtataaggtctattgattttaaaaa
ttaatattttcacaatttcaagccttgtagaaattattacttagaaagca
cacatgtgatatattccattaatacatttaatttcctaattctttaaagt
catggcttaaagttctgaaaactctaagtgttgaatctataagcaaaagt
tcagtatcctgttaattgctgatcatctgggagaaccattcctattcacg
tgctgttgtcattaacagcaatggctcagctcacagttggatgggaagga
gggaggtcagcatgtgttcagattccatgtatgatattatgtcaagggtg
ttttttttttttttttaaagagatctttctgcctgccaaaccacatttaa
tgcactgtttttcttacaagcacatgatgttagatttgcattgctagcat
tttattgcaattagctaagatatagtccagagatttgttggcatacagcg
atcaccttttctaaagaatatgatctctagatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_49319969_49320941
seq2: B6Ng01-114D22.b_46_1017

seq1  GAATTCATTACAAATTCATAGAGATCCTAAAGCATGAAAAGATACTGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTACAAATTCATAGAGATCCTAAAGCATGAAAAGATACTGTTT  50

seq1  ATAATACATTTGTGAATTATTGTCAGTTTATGAAGGATCTTTTCCAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATACATTTGTGAATTATTGTCAGTTTATGAAGGATCTTTTCCAAAAG  100

seq1  AGAGTAAAAGTAAATATCACATTAAGTTATTGCATTATCCTTGGACTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAAAAGTAAATATCACATTAAGTTATTGCATTATCCTTGGACTTTG  150

seq1  TTGAGGACTTAAAGCCTCTTCACAGTTCCAGTCTCAAGACTTCTCTGCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGACTTAAAGCCTCTTCACAGTTCCAGTCTCAAGACTTCTCTGCCC  200

seq1  CTGCAATTAAACAGGTTTTATTTCTCTTCTGATGGACTTCAGTATTACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAATTAAACAGGTTTTATTTCTCTTCTGATGGACTTCAGTATTACAA  250

seq1  CCAAAAATCCCATTTATAAAATTGCCTGTGTATGGTCTTCTCTCTTTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAATCCCATTTATAAAATTGCCTGTGTATGGTCTTCTCTCTTTCAA  300

seq1  TAATGTACAAGACTTAATGCATCAAACAGACCAGGTTTCTTCCCTCTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTACAAGACTTAATGCATCAAACAGACCAGGTTTCTTCCCTCTTCC  350

seq1  TTCATAACTCTAAAACAATGGCTGTTTTCCTGCAATGGCTGTAATTATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAACTCTAAAACAATGGCTGTTTTCCTGCAATGGCTGTAATTATAC  400

seq1  CACTAATATCAACTACTTACCTGCTTTGTCTTCATGTGAATATACTAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAATATCAACTACTTACCTGCTTTGTCTTCATGTGAATATACTAGAA  450

seq1  TTTGTGAATTATACTCTGTGCAGTAGAAACTGTTCCTGTGTATGTTCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGAATTATACTCTGTGCAGTAGAAACTGTTCCTGTGTATGTTCATT  500

seq1  CACTTACTTTTGAACTCTGTACCTACTAAATTTACTTAGGGTTTGAGATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTACTTTTGAACTCTGTACCTACTAAATTTACTTAGGGTTTGAGATC  550

seq1  ATTCACAGAAGACAACGCATCCTTTGGCCTTATTCCTTCCAATACCAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACAGAAGACAACGCATCCTTTGGCCTTATTCCTTCCAATACCAAGT  600

seq1  TAAAATGTCTCCTGAGAGGCTCTGCCGGAGCCTGACTAATACAAGGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGTCTCCTGAGAGGCTCTGCCGGAGCCTGACTAATACAAGGCAGA  650

seq1  TGCTTACAGCTAGCCATCAGACTGACCAAGAGAACCACAATGGAGGAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTACAGCTAGCCATCAGACTGACCAAGAGAACCACAATGGAGGAGTT  700

seq1  AGAGGAAGGACTGAAGGAGCTAAGGGGGTTTGCAAACCTATAGGAAGAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAGGACTGAAGGAGCTAAGGGGGTTTGCAAACCTATAGGAAGAAC  750

seq1  GACAATATCAACCAACCAGAACCGTCCCCCCCAGAGTTACCAAGAACTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATATCAACCAACCAGAACCGTCCCCCCCAGAGTTACCAAGAACTAA  800

seq1  ACCACCAATCAAAGCATACAAATGGAGGGATCCATGGCTCCAGCTGCATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCAATCAAAGCATACAAATGGAGGGATCCATGGCTCCAGCTGCATA  850

seq1  TGTAGCAGAGGATGGCCTTAACTGGCCTCAGTGGGAGGGGAAGCCCTTGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTAGCAGAGGATGGCCTTAACTGGCCTCAGT-GGAGGGGAAGCCCTTGG  899

seq1  TCCTCTGAAGGCTTGATGCCCCAGCATAGGGGAATTCTAGGGTGGTGAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGAAGGCTTGATGCCCCAGCATA-GGGAATTCTAGGGTGGTGAGA  948

seq1  CAGGAGTGGATGGG-TGGGTGAGG  973
      |||||||||||||| |||||||||
seq2  CAGGAGTGGATGGGTTGGGTGAGG  972

seq1: chr10_49435471_49436563
seq2: B6Ng01-114D22.g_67_1150 (reverse)

seq1  TCATCTAGGAGAATTCATATTCTTTAGAAAAGGTGATCGCTGTATGGCAA  50
      ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |
seq2  TCATCTA-GAGA--TCATATTCTTTAGAAAAGGTGATCGCTGTAT-GCCA  46

seq1  ACAAAT-TCTGTGACTATAATCTAAGCTAAATTGCAATAAAATGCTTAGC  99
      |||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||
seq2  ACAAATCTCTG-GACTAT-ATCTTAGCT-AATTGCAATAAAATGC-TAGC  92

seq1  AATGCAAATCTAACAATCATGTGCTTGTAAGAAAAACAGTGCATTAAATG  149
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCAAATCTAAC-ATCATGTGCTTGTAAGAAAAACAGTGCATTAAATG  141

seq1  TGGTTTGGCAGGCAGAAAGATCTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAACACCCTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGGCAGGCAGAAAGATCTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAACACCCTT  191

seq1  GACATAATATCATACATGGAATCTTGAACACATGCTGACCTCCCTCCTTC  249
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATAATATCATACATGGAATC-TGAACACATGCTGACCTCCCTCCTTC  240

seq1  CCATCCAACTGTGAGCTGAGCCATTGCTGTTAATGACAACAGCACGTGAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCAACTGTGAGCTGAGCCATTGCTGTTAATGACAACAGCACGTGAA  290

seq1  TAGGAATGGTTCTCCCAGATGATCAGCAATTAACAGGATACTGAACTTTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATGGTTCTCCCAGATGATCAGCAATTAACAGGATACTGAACTTTT  340

seq1  GCTTATAGATTCAACACTTAGAGTTTTCAGAACTTTAAGCCATGACTTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATAGATTCAACACTTAGAGTTTTCAGAACTTTAAGCCATGACTTTA  390

seq1  AAGAATTAGGAAATTAAATGTATTAATGGAATATATCACATGTGTGCTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATTAGGAAATTAAATGTATTAATGGAATATATCACATGTGTGCTTT  440

seq1  CTAAGTAATAATTTCTACAAGGCTTGAAATTGTGAAAATATTAATTTTTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTAATAATTTCTACAAGGCTTGAAATTGTGAAAATATTAATTTTTA  490

seq1  AAATCAATAGACCTTATACTTATAATTAAAATAACTCAGTTTCATACTAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAATAGACCTTATACTTATAATTAAAATAACTCAGTTTCATACTAC  540

seq1  TTTCTATTAATATTTTTCAAGTCATCTTAATTACTAGTATTTACTTATAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATTAATATTTTTCAAGTCATCTTAATTACTAGTATTTACTTATAC  590

seq1  AATCTGCCTATAACTTTATATTTAAATTGGTAACTGTCAGTAACCAAAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGCCTATAACTTTATATTTAAATTGGTAACTGTCAGTAACCAAAAT  640

seq1  CTTTAACTTAATTCAGACATATGATGGTCTAATTTTAAAAAGTTTCTTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAACTTAATTCAGACATATGATGGTCTAATTTTAAAAAGTTTCTTAA  690

seq1  AGTTATAGATACCAATGAGCCTGTTGGGAACTGAGAAATATCAGATGACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGATACCAATGAGCCTGTTGGGAACTGAGAAATATCAGATGACA  740

seq1  CATATTGATCAAACACATTAATCATTCAGTATCATTTTCTTAACAATGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTGATCAAACACATTAATCATTCAGTATCATTTTCTTAACAATGGA  790

seq1  CATTAGTTTTCAGCATGAGTTGAGAGACTAAATAAATTTCTAAATTGTTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGTTTTCAGCATGAGTTGAGAGACTAAATAAATTTCTAAATTGTTA  840

seq1  ACATGAAGCTGTGGAGCAAAACTTAAAAAGGTACAAGAACTTTTCAAAAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAAGCTGTGGAGCAAAACTTAAAAAGGTACAAGAACTTTTCAAAAC  890

seq1  CACCTAGCAACATGATGACACAGATGAATCTAGATATGAACTCGGTTGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAGCAACATGATGACACAGATGAATCTAGATATGAACTCGGTTGAA  940

seq1  AGATAATAAGTTCAAGAATTGTCCCAATGCATTCGTTACATATTAAGAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAATAAGTTCAAGAATTGTCCCAATGCATTCGTTACATATTAAGAAT  990

seq1  ACAACATGAAAACTTAGAACTGATAAAACCATTCTATTATTGTTTATAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACATGAAAACTTAGAACTGATAAAACCATTCTATTATTGTTTATAAT  1040

seq1  GATAAAAATGGTGAAGTAAATGTCATATTTTCATTACTGAATTC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAAATGGTGAAGTAAATGTCATATTTTCATTACTGAATTC  1084