BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115B03
Chromosome10 (Build37)
Map Location 125,313,203 - 125,468,855
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrig3
Upstream geneSlc16a7, LOC100042987, EG668313, LOC100042992, LOC668317, LOC100042994
Downstream geneLOC100043547, LOC668336, Xrcc6bp1, LOC622567, Ctdsp2, Avil, Tsfm
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115B03.bB6Ng01-115B03.g
ACCDH920430DH920431
length1,1151,137
definitionDH920430|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115B03, 5' end.DH920431|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115B03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,313,203 - 125,314,334)(125,467,688 - 125,468,855)
sequence
gaattctctacaatcctccaacctcagggggatgtttttccagtgatgcc
aagttgattcttggaaatttacatgctgctatctgtttgacagtaaattg
gtgtgcaaatccctcatgtgatacacagactgggcttttataataacaag
ctctataccttaatgaccaatttgtctttttgctttatttttttctgaaa
agtggtcttgctctctacagaggtcattctgaagaggcagtatttggttc
tccatgagccaccacacccattctctgggcttctgattccatcccacaac
acctgttgccttacttgaaaagatttgcttttgatgtgttcctttctaga
aaaacaaacatattttaaagggtgtcattcaaggccaaactccaaagctt
gtttgaaacctgactcctccgatgggtttgttcttgactttgtgacacca
agcaagtgtcaatctccttgttccttagacacaacgtgctgccctggtca
ctactgtacttctgaagagacaccatgaccagccacagcaactcttataa
aggaaaacattgccttggggctggcttacagttgagaggtatggttcatt
attgtcatggcaggaaacatggtggggcacaagcagacatggtgctggtt
ttatatccagagtgagagttctatatccagagacacaagcagaagaagag
agtggccctggcccaggcatgggctttggaaaactcaaggtccactcaca
gtggactttttatctccccctacaaggccatacctcctaatcctggttac
tacctggtgactaaggagggggccctagggacattcttattcaaatcgcc
aactatcctataggattgttgtgagagtaagctgagttaggaatgctaag
agctcctcctcctcacactcctcctcctgtttgtcctcttcctggtcctc
ctcttcctcccgttctttctctcttctcttctttaccttctttgtttctt
gatttcatttgaaacaggtttattgtagccgagcagtctgaaactcacta
tgtacctgaggctagcctgacctctgagctctcctccacctctcaatgct
gattaagcacgcacc
gaattcactcctatcctctacacttccaagaacaatcctgaaaacaactg
atgtcacaagactcacctggtcttggagtattcccacaagcactcaggat
tctcctcacacgaccccattcttggaccatgctccaaaagtgaatgattg
acaaagatattcaatattagccttggaccaccatgagtaaacacacacac
acacacacacacatacatacacacctatacacatgcgccccaaaatacac
atacacacatgcatgcatattatgtatacatacacagaacaaacaaacaa
acaaaaaaaccaaagcaaaacaaaaacccataagtccattaggtttcaag
ttaactcagtaaatgttaaaacccaggattggctggagatgacacttcac
tctctgctcctccagaaatctggagttccattcccagcacctatgtggtg
gatcacaatcatctgtaactcaaatctcaggggatccaataccctcttct
ggtctccaagggcaccaggcacacgcatggtacacatacaaacatgcagg
taaagcgtctatacacacaacaaacaaaaaaacaaacaacaacaacaata
aaaccttagaaaacaggctcaactacaagctaattcttaacatagaatac
gttttccgtttgacagtttagatcatgagaaagtatttagattgtgtttc
catgttcccttgcctgtgttataaagacgcggataggattgcctcactgt
atctccttcatagggttattatgtagatcaaatgatgtaattccctttca
gggtactaaaaactctttggcataggcactaaaggatcttagctaaatta
aaataacagcaaatttttcttttttttccttttccatttttttattaggt
atttagctcattacatttccaatgctataccaaagtcccccatacccacc
cactcccccttttgccctggcgttcccctgtactgggcatataagttgca
tgtccatggctctcttccatgatgccgactagccatctttgatacatatg
cagctagagtcagagctccggtactgattagtcataatgttgtccaccta
tagggtgccaaatcctagctcctagtactctagctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_125313203_125314334
seq2: B6Ng01-115B03.b_48_1162

seq1  GAATTCTCTACAATCCTCCAACCTCAGGGGGATGTTTTTCCAGTGATGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTACAATCCTCCAACCTCAGGGGGATGTTTTTCCAGTGATGCC  50

seq1  AAGTTGATTCTTGGAAATTTACATGCTGCTATCTGTTTGACAGTAAATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGATTCTTGGAAATTTACATGCTGCTATCTGTTTGACAGTAAATTG  100

seq1  GTGTGCAAATCCCTCATGTGATACACAGACTGGGCTTTTATAATAACAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCAAATCCCTCATGTGATACACAGACTGGGCTTTTATAATAACAAG  150

seq1  CTCTATACCTTAATGACCAATTTGTCTTTTTGCTTTATTTTTTTCTGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATACCTTAATGACCAATTTGTCTTTTTGCTTTATTTTTTTCTGAAA  200

seq1  AGTGGTCTTGCTCTCTACAGAGGTCATTCTGAAGAGGCAGTATTTGGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTCTTGCTCTCTACAGAGGTCATTCTGAAGAGGCAGTATTTGGTTC  250

seq1  TCCATGAGCCACCACACCCATTCTCTGGGCTTCTGATTCCATCCCACAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAGCCACCACACCCATTCTCTGGGCTTCTGATTCCATCCCACAAC  300

seq1  ACCTGTTGCCTTACTTGAAAAGATTTGCTTTTGATGTGTTCCTTTCTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTTGCCTTACTTGAAAAGATTTGCTTTTGATGTGTTCCTTTCTAGA  350

seq1  AAAACAAACATATTTTAAAGGGTGTCATTCAAGGCCAAACTCCAAAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAACATATTTTAAAGGGTGTCATTCAAGGCCAAACTCCAAAGCTT  400

seq1  GTTTGAAACCTGACTCCTCCGATGGGTTTGTTCTTGACTTTGTGACACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGAAACCTGACTCCTCCGATGGGTTTGTTCTTGACTTTGTGACACCA  450

seq1  AGCAAGTGTCAATCTCCTTGTTCCTTAGACACAACGTGCTGCCCTGGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGTGTCAATCTCCTTGTTCCTTAGACACAACGTGCTGCCCTGGTCA  500

seq1  CTACTGTACTTCTGAAGAGACACCATGACCAGCCACAGCAACTCTTATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGTACTTCTGAAGAGACACCATGACCAGCCACAGCAACTCTTATAA  550

seq1  AGGAAAACATTGCCTTGGGGCTGGCTTACAGTTGAGAGGTATGGTTCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAACATTGCCTTGGGGCTGGCTTACAGTTGAGAGGTATGGTTCATT  600

seq1  ATTGTCATGGCAGGAAACATGGTGGGGCACAAGCAGACATGGTGCTGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCATGGCAGGAAACATGGTGGGGCACAAGCAGACATGGTGCTGGTT  650

seq1  TTATATCCAGAGTGAGAGTTCTATATCCAGAGACACAAGCAGAAGAAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATCCAGAGTGAGAGTTCTATATCCAGAGACACAAGCAGAAGAAGAG  700

seq1  AGTGGCCCTGGCCCAGGCATGGGCTTTGGAAAACTCAAGGTCCACTCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCCTGGCCCAGGCATGGGCTTTGGAAAACTCAAGGTCCACTCACA  750

seq1  GTGGACTTTTTATCTCCCCCTACAAGGCCATACCTCCTAATCCTGGTTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACTTTTTATCTCCCCCTACAAGGCCATACCTCCTAATCCTGGTTAC  800

seq1  TACCTGGTGACTAAGGAGGGGGCCCTAGGGACATTCTTATTCAAATCGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGGTGACTAAGGAGGGGGCCCTAGGGACATTCTTATTCAAATCGCC  850

seq1  AACTATCCTATAGGATTGTTGTGAGAGTAAGCTGAGTTAGGAATGCTAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCCTATAGGATTGTTGTGAGAGTAAGCTGAGTTAGGAATGCTAAG  900

seq1  AGCTCCTCCTCCTCACCCTCCTCCTCCTGTTTGTCCTCTTCCTGGTCCTC  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCTCCTCCTCACACTCCTCCTCCTGTTTGTCCTCTTCCTGGTCCTC  950

seq1  CTCTTCCTCCCGTTCTTTCTCTCCTTCTTCTTCCTTTACCTTCTTTGTTT  1000
      |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCTCCCGTTCTTTCTCT-CTTC-TCTT-CTTTACCTTCTTTGTTT  997

seq1  CTTGGATTTCATTTTGAAACAGGGTTTTATTGTAGCCGAGGCCAGTCTGA  1050
      ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||
seq2  CTT-GATTTCA-TTTGAAACAGG--TTTATTGTAGCCGAG--CAGTCTGA  1041

seq1  AACTCACTATGTACCTGAGGCTAGCCTTGAACTTCTGAGCTTCTCCTCCA  1100
      |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||
seq2  AACTCACTATGTACCTGAGGCTAGCCT--GACCTCTGAGC-TCTCCTCCA  1088

seq1  CCTCTCAAATGCTGGAATTATAGGCACGCACC  1132
      |||||| |||||||  ||  || |||||||||
seq2  CCTCTC-AATGCTG--AT--TAAGCACGCACC  1115

seq1: chr10_125467688_125468855
seq2: B6Ng01-115B03.g_68_1204 (reverse)

seq1  GGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCACCCCTATAGG  50
      |||||||||| |      | ||||||||   |||| ||   |||||||||
seq2  GGAGCTAGAGTA------CTAGGAGCTA---GGATTTGGCACCCTATAGG  41

seq1  TGGAACAACATTATGAACTAATCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCT  100
      ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||
seq2  TGG-ACAACATTATG-ACTAATCAGTA--CCGGAGCTC-TGACTCTAGCT  86

seq1  GCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCATTGGAAAGAGAGGCC  150
      ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  | |||||||  |
seq2  GCATATGTATC-AAAGATGG-CTAGTCGG-CATCAT--GGAAGAGAG--C  129

seq1  CATTGGACATGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCC  200
      || |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| 
seq2  CA-TGGACATGCAA--CTTATATG-CCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGC-  174

seq1  AAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAA  250
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -AAAAGGGGGAGTGGGTGGGTATGGGGGAC-TTTGGTATAGCATTGGAAA  222

seq1  TGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAAAATGGAAAAGGAAAAAAAAAAG  300
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  TGT-AATGAGCTAAATACCTAATAAAAAAATGGAAAAGG--AAAAAAAAG  269

seq1  AAAAATTTGCTGTTATTTTAATTTAGCTAAGATCCTTTAGTGCCTATGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTGCTGTTATTTTAATTTAGCTAAGATCCTTTAGTGCCTATGCC  319

seq1  AAAGAGTTTTTAGTACCCTGAAAGGGAATTACATCATTTGATCTACATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTTTTTAGTACCCTGAAAGGGAATTACATCATTTGATCTACATAA  369

seq1  TAACCCTATGAAGGAGATACAGTGAGGCAATCCTATCCGCGTCTTTATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCTATGAAGGAGATACAGTGAGGCAATCCTATCCGCGTCTTTATAA  419

seq1  CACAGGCAAGGGAACATGGAAACACAATCTAAATACTTTCTCATGATCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCAAGGGAACATGGAAACACAATCTAAATACTTTCTCATGATCTA  469

seq1  AACTGTCAAACGGAAAACGTATTCTATGTTAAGAATTAGCTTGTAGTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTCAAACGGAAAACGTATTCTATGTTAAGAATTAGCTTGTAGTTGA  519

seq1  GCCTGTTTTCTAAGGTTTTATTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTTGTTTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTTTTCTAAGGTTTTATTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTTGTTTGTT  569

seq1  GTGTGTATAGACGCTTTACCTGCATGTTTGTATGTGTACCATGCGTGTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATAGACGCTTTACCTGCATGTTTGTATGTGTACCATGCGTGTGC  619

seq1  CTGGTGCCCTTGGAGACCAGAAGAGGGTATTGGATCCCCTGAGATTTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCCCTTGGAGACCAGAAGAGGGTATTGGATCCCCTGAGATTTGAG  669

seq1  TTACAGATGATTGTGATCCACCACATAGGTGCTGGGAATGGAACTCCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGATGATTGTGATCCACCACATAGGTGCTGGGAATGGAACTCCAGA  719

seq1  TTTCTGGAGGAGCAGAGAGTGAAGTGTCATCTCCAGCCAATCCTGGGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGAGGAGCAGAGAGTGAAGTGTCATCTCCAGCCAATCCTGGGTTT  769

seq1  TAACATTTACTGAGTTAACTTGAAACCTAATGGACTTATGGGTTTTTGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATTTACTGAGTTAACTTGAAACCTAATGGACTTATGGGTTTTTGTT  819

seq1  TTGCTTTGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTCTGTGTATGTATACATAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTTGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTCTGTGTATGTATACATAAT  869

seq1  ATGCATGCATGTGTGTATGTGTATTTTGGGGCGCATGTGTATAGGTGTGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGCATGTGTGTATGTGTATTTTGGGGCGCATGTGTATAGGTGTGT  919

seq1  ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACTCATGGTGGTCCAAGGCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTACTCATGGTGGTCCAAGGCT  969

seq1  AATATTGAATATCTTTGTCAATCATTCACTTTTGGAGCATGGTCCAAGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTGAATATCTTTGTCAATCATTCACTTTTGGAGCATGGTCCAAGAA  1019

seq1  TGGGGTCGTGTGAGGAGAATCCTGAGTGCTTGTGGGAATACTCCAAGACC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTCGTGTGAGGAGAATCCTGAGTGCTTGTGGGAATACTCCAAGACC  1069

seq1  AGGTGAGTCTTGTGACATCAGTTGTTTTCAGGATTGTTCTTGGAAGTGTA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGTCTTGTGACATCAGTTGTTTTCAGGATTGTTCTTGGAAGTGTA  1119

seq1  GAGGATAGGAGTGAATTC  1168
      ||||||||||||||||||
seq2  GAGGATAGGAGTGAATTC  1137