BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121K05
Chromosome10 (Build37)
Map Location 91,968,885 - 92,109,231
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC216229, LOC100041814
Upstream geneLOC100041799, LOC667203
Downstream geneNedd1, Gm872, 4930485B16Rik, EG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, Ntn4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121K05.bB6Ng01-121K05.g
ACCDH925272DH925273
length6881,069
definitionDH925272|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121K05, 5' end.DH925273|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121K05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,108,544 - 92,109,231)(91,968,885 - 91,969,961)
sequence
gaattcttaatctcaggactggttctgagcttggaacttcattcatttaa
gcaggagaaatgttgctcaaattaacatgaaccggtcagcagagtcattt
cattactgaggtcagactccagactgttgcttgagtgagtttagctgttg
ggagaccagggggtctgcctcataaaaagacctgttttgttggaagcttc
ttcacgaagtgcatggcttggaatatgttaagctcttctttagtgaacaa
agtcataaaaatatgtgagcacacagacaaggattcatgtctgggatctc
atggggctcactgtctttccaagactggtttgcttgtctttcctttcctt
tccttttttttttcatttaagatgccagcaaaaagccgtggtattttatt
tttgtctctggtaaattgctctagaaacttaaacaaattaaatatcctgt
tcttgtgttgctgagactcactggaggaaattcaatctctgtagtctgat
ggcttgggagaagaacagcagctcataagatacagtttttaatcactttt
gtgaaatcgttacggatgtgttcagttaagggaaggctggggtgttcaga
atcacctggaatggcaggcagctgtgctgtctaaggaagaacaaaatagt
aggaaggtttttggaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtga
gaattcaatagtcacatgaggactcaaaaggagatgcttcagtggctaag
catcatggtcaaacatcctggtcaagctagagacagctctagcaccctgg
gctgcctctcagttgctcaccttgttttttcttgacccagactcttcctc
agtgcatggagacttgaggcacgtggatgagttatttggatcattgacag
aattcccagaacatcatgtgtctatagactctgcttcttatagcttcagg
gtgaaactcggtgtccatagaaattaattaggtccacctttacaaccagc
tacacatgattcctccctgttctgcttttaaccagggtaagatctaactc
actaagaacatgcctgtacatagtgaagcactgcatccacatgacagtac
agcgtggacactttagtgaacttcagctgtaaatagacagggagaggagc
tgtttcccgaggaacacaccagcagtgacacaaagaatctaacacaagga
tgtttggtgctactccacttaagtgtaacctcaagatttacatcagaaca
cactttaaaccattaaaagggcaaaataagtcaaatcaatgtaaaactga
tgctgctgagtgattgtcttgatttgcatttgcccaacctatgaagagat
gactgctaagcataaaccagtcacaatcaaagcacagtttagtggttctc
aaccttcctaatgctgcgaccctttggttaaagcccaagtaaaacattaa
gacctagatagagaattaaggactaggtaactgttacctggctagcctgc
aattttgtgctgttactacttttattaggaaagtttttcatatgttcttt
ctgctatgactaggaaattttctcaggcccaagttgactacatactctgc
tatattctgtgtccttggaaacaaatcacaatagaagtcagtagaactgc
tttgtatagctgcccacatagattagactgaaccactacccagcagcact
tctacaaaggatttatttatttaattatatgagctcactgtagctgtaca
gaatggtgtgaacttcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_92108544_92109231
seq2: B6Ng01-121K05.b_48_735 (reverse)

seq1  TCACACACACACACACACACACCTCCAAAAACCTTCCTACTATTTTGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACACACACACACACACACCTCCAAAAACCTTCCTACTATTTTGTTC  50

seq1  TTCCTTAGACAGCACAGCTGCCTGCCATTCCAGGTGATTCTGAACACCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTAGACAGCACAGCTGCCTGCCATTCCAGGTGATTCTGAACACCCC  100

seq1  AGCCTTCCCTTAACTGAACACATCCGTAACGATTTCACAAAAGTGATTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCCCTTAACTGAACACATCCGTAACGATTTCACAAAAGTGATTAA  150

seq1  AAACTGTATCTTATGAGCTGCTGTTCTTCTCCCAAGCCATCAGACTACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTATCTTATGAGCTGCTGTTCTTCTCCCAAGCCATCAGACTACAG  200

seq1  AGATTGAATTTCCTCCAGTGAGTCTCAGCAACACAAGAACAGGATATTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGAATTTCCTCCAGTGAGTCTCAGCAACACAAGAACAGGATATTTA  250

seq1  ATTTGTTTAAGTTTCTAGAGCAATTTACCAGAGACAAAAATAAAATACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTAAGTTTCTAGAGCAATTTACCAGAGACAAAAATAAAATACCA  300

seq1  CGGCTTTTTGCTGGCATCTTAAATGAAAAAAAAAAGGAAAGGAAAGGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTTTTTGCTGGCATCTTAAATGAAAAAAAAAAGGAAAGGAAAGGAAA  350

seq1  GACAAGCAAACCAGTCTTGGAAAGACAGTGAGCCCCATGAGATCCCAGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGCAAACCAGTCTTGGAAAGACAGTGAGCCCCATGAGATCCCAGAC  400

seq1  ATGAATCCTTGTCTGTGTGCTCACATATTTTTATGACTTTGTTCACTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATCCTTGTCTGTGTGCTCACATATTTTTATGACTTTGTTCACTAAA  450

seq1  GAAGAGCTTAACATATTCCAAGCCATGCACTTCGTGAAGAAGCTTCCAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCTTAACATATTCCAAGCCATGCACTTCGTGAAGAAGCTTCCAAC  500

seq1  AAAACAGGTCTTTTTATGAGGCAGACCCCCTGGTCTCCCAACAGCTAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGGTCTTTTTATGAGGCAGACCCCCTGGTCTCCCAACAGCTAAAC  550

seq1  TCACTCAAGCAACAGTCTGGAGTCTGACCTCAGTAATGAAATGACTCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCAAGCAACAGTCTGGAGTCTGACCTCAGTAATGAAATGACTCTGC  600

seq1  TGACCGGTTCATGTTAATTTGAGCAACATTTCTCCTGCTTAAATGAATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCGGTTCATGTTAATTTGAGCAACATTTCTCCTGCTTAAATGAATGA  650

seq1  AGTTCCAAGCTCAGAACCAGTCCTGAGATTAAGAATTC  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAAGCTCAGAACCAGTCCTGAGATTAAGAATTC  688

seq1: chr10_91968885_91969961
seq2: B6Ng01-121K05.g_68_1136

seq1  GAATTCAATAGTCACATGAGGACTCAAAAGGAGATGCTTCAGTGGCTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATAGTCACATGAGGACTCAAAAGGAGATGCTTCAGTGGCTAAG  50

seq1  CATCATGGTCAAACATCCTGGTCAAGCTAGAGACAGCTCTAGCACCCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATGGTCAAACATCCTGGTCAAGCTAGAGACAGCTCTAGCACCCTGG  100

seq1  GCTGCCTCTCAGTTGCTCACCTTGTTTTTTCTTGACCCAGACTCTTCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCTCTCAGTTGCTCACCTTGTTTTTTCTTGACCCAGACTCTTCCTC  150

seq1  AGTGCATGGAGACTTGAGGCACGTGGATGAGTTATTTGGATCATTGACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATGGAGACTTGAGGCACGTGGATGAGTTATTTGGATCATTGACAG  200

seq1  AATTCCCAGAACATCATGTGTCTATAGACTCTGCTTCTTATAGCTTCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCCAGAACATCATGTGTCTATAGACTCTGCTTCTTATAGCTTCAGG  250

seq1  GTGAAACTCGGTGTCCATAGAAATTAATTAGGTCCACCTTTACAACCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAACTCGGTGTCCATAGAAATTAATTAGGTCCACCTTTACAACCAGC  300

seq1  TACACATGATTCCTCCCTGTTCTGCTTTTAACCAGGGTAAGATCTAACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATGATTCCTCCCTGTTCTGCTTTTAACCAGGGTAAGATCTAACTC  350

seq1  ACTAAGAACATGCCTGTACATAGTGAAGCACTGCATCCACATGACAGTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGAACATGCCTGTACATAGTGAAGCACTGCATCCACATGACAGTAC  400

seq1  AGCGTGGACACTTTAGTGAACTTCAGCTGTAAATAGACAGGGAGAGGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGTGGACACTTTAGTGAACTTCAGCTGTAAATAGACAGGGAGAGGAGC  450

seq1  TGTTTCCCGAGGAACACACCAGCAGTGACACAAAGAATCTAACACAAGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCCGAGGAACACACCAGCAGTGACACAAAGAATCTAACACAAGGA  500

seq1  TGTTTGGTGCTACTCCACTTAAGTGTAACCTCAAGATTTACATCAGAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGTGCTACTCCACTTAAGTGTAACCTCAAGATTTACATCAGAACA  550

seq1  CACTTTAAACCATTAAAAGGGCAAAATAAGTCAAATCAATGTAAAACTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTAAACCATTAAAAGGGCAAAATAAGTCAAATCAATGTAAAACTGA  600

seq1  TGCTGCTGAGTGATTGTCTTGATTTGCATTTGCCCAACCTATGAAGAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGAGTGATTGTCTTGATTTGCATTTGCCCAACCTATGAAGAGAT  650

seq1  GACTGCTAAGCATAAACCAGTCACAATCAAAGCACAGTTTAGTGGTTCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTAAGCATAAACCAGTCACAATCAAAGCACAGTTTAGTGGTTCTC  700

seq1  AACCTTCCTAATGCTGCGACCCTTTGGTTAAAGCCCAAGTAAAACATTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTCCTAATGCTGCGACCCTTTGGTTAAAGCCCAAGTAAAACATTAA  750

seq1  GACCTAGATAGAGAATTAAGGACTAGGTAACTGTTACCTGGCTAGCCTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTAGATAGAGAATTAAGGACTAGGTAACTGTTACCTGGCTAGCCTGC  800

seq1  AATTTTGTGCTGTTACTACTTTTATTAGGAAAGTTTTTCATATGTTCTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTGTGCTGTTACTACTTTTATTAGGAAAGTTTTTCATATGTTCTTT  850

seq1  CTGCTATGACTAGGAAATTTTCTCAGGCCCAAGTTGACTACATACTCTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTATGACTAGGAAATTTTCTCAGGCCCAAGTTGACTACATACTCTGC  900

seq1  TATATTCTGTGTCCTTGGAAACAAATCACAATAGAAGTCAGTAGAACTGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCTGTGTCCTTGGAAACAAATCACAATAGAAGTCAGTAGAACTGC  950

seq1  TTTGTATAGCTGCCCACATTAGAATTAGACCTGAACCAACTACCCAGCAG  1000
      |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  TTTGTATAGCTGCCCACA-TAG-ATTAGA-CTGAACC-ACTACCCAGCAG  996

seq1  CACTTCCTACAAAAGGATTTATTTATTTAATGTATATGAGCTCACTGTAG  1050
      ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CACTT-CTAC-AAAGGATTTATTTATTTAAT-TATATGAGCTCACTGTAG  1043

seq1  CTGTACAGATGGTTGTGAACCTTCATG  1077
      |||||||||  | |||||| |||||||
seq2  CTGTACAGAATGGTGTGAA-CTTCATG  1069