BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124A15
Chromosome10 (Build37)
Map Location 73,747,782 - 73,906,221
singlet/doubletdoublet
Overlap genePcdh15
Upstream geneLOC432471, LOC100039981, LOC623191
Downstream geneEG630453, EG623346, Gnaz, LOC100040057, Rab36, Bcr, Specc1l, LOC100040670, Adora2a, EG544707, Upb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124A15.bB6Ng01-124A15.g
ACCDH927049DH927050
length659807
definitionDH927049|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124A15, 5' end.DH927050|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124A15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,747,782 - 73,748,440)(73,905,414 - 73,906,221)
sequence
gaattccatcatcaagacaacaaaatgaagggggctttgttgatgtcatc
ccagtgaattttgatgtttgtctggctataatataaaattccaatggctc
tgggggtattgatattattttcatgagtcctgcccattgacttttgccca
gtgctctctgcactgctgttctagagaagacaatgatcagtgctgttagg
aaggcctggtgtctttcattgtggagtatatacgcctcacagctatatgt
aagggtcccatttgttaataagacatgataaaatccttcaatacagccta
attggctttgtcactcaccccaaattaatttgcctttcaaacatacacca
aaggcagagaacatgggacattttctgatatcttccaggcaatgtgttgt
ttctacaactggcaaaaagcaaaataagccaaataatagtggtcgctcaa
gggatcatgtaagtctaattatctatatacaaatatatgaaaaaacatat
tgagtttgtttatcatttctgtacacacacacacacacacacacacacac
acacacgcaaatctgtgagagaagaattccaaagactttttggaaaatac
tgaatttatgatacaatgaagaagaagaaggaggaggaggaggaggagga
ggaggagga
gtgaggcattttctcagttagtgatcaaggggggagggccccttgtgggt
ggtacaatcccttggctggtagtcttgggttctataagagagcaggctga
gtaagtcaggagaagcaagccagtaaagaacatccctccatggcctctgc
atcagctcctgcttcctgacttgcttgagttcaagtcctgacttcctttg
gtgatgaacagcaatttggaaatataaactgaataaaccctttcctcccc
atcttgctttgtggtcatatttgtgcaggaatagaaaccctgactaagac
aatatgtcaggctagttttatccttgcatgtctgtattttattttcctta
gactctattaactctgatattttgatgattatctgggaatttcagtgttg
acctgccaaagaactcatatataaaatgcacctgtttgttcacgtaacat
tattactgtagcaagttataattagaaggaaattatctgattcaaataat
atcttagacattatatggaagagcaatgaagatcaaagctttcttgtgta
cttgtaagtgtattgtagcaattataaaggtgtgagctatcacggagcac
ctaattgtgtgtatgcatgtgtgtaaatatgcacatccatgtgcatggga
gatgttccatgtgtgtaagtgtgttcaagtatgtgtttatgtgcatattt
gtatgtaggtttatacatatgtgtgtattactgtgggagagtacatatat
gttagagcatgtgcatggaattattacatgggtatgtatgtgtgttcatg
agtgggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_73747782_73748440
seq2: B6Ng01-124A15.b_32_690

seq1  GAATTCCATCATCAAGACAACAAAATGAAGGGGGCTTTGTTGATGTCATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCATCAAGACAACAAAATGAAGGGGGCTTTGTTGATGTCATC  50

seq1  CCAGTGAATTTTGATGTTTGTCTGGCTATAATATAAAATTCCAATGGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGAATTTTGATGTTTGTCTGGCTATAATATAAAATTCCAATGGCTC  100

seq1  TGGGGGTATTGATATTATTTTCATGAGTCCTGCCCATTGACTTTTGCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTATTGATATTATTTTCATGAGTCCTGCCCATTGACTTTTGCCCA  150

seq1  GTGCTCTCTGCACTGCTGTTCTAGAGAAGACAATGATCAGTGCTGTTAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTCTGCACTGCTGTTCTAGAGAAGACAATGATCAGTGCTGTTAGG  200

seq1  AAGGCCTGGTGTCTTTCATTGTGGAGTATATACGCCTCACAGCTATATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCTGGTGTCTTTCATTGTGGAGTATATACGCCTCACAGCTATATGT  250

seq1  AAGGGTCCCATTTGTTAATAAGACATGATAAAATCCTTCAATACAGCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCCCATTTGTTAATAAGACATGATAAAATCCTTCAATACAGCCTA  300

seq1  ATTGGCTTTGTCACTCACCCCAAATTAATTTGCCTTTCAAACATACACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTTTGTCACTCACCCCAAATTAATTTGCCTTTCAAACATACACCA  350

seq1  AAGGCAGAGAACATGGGACATTTTCTGATATCTTCCAGGCAATGTGTTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGAGAACATGGGACATTTTCTGATATCTTCCAGGCAATGTGTTGT  400

seq1  TTCTACAACTGGCAAAAAGCAAAATAAGCCAAATAATAGTGGTCGCTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACAACTGGCAAAAAGCAAAATAAGCCAAATAATAGTGGTCGCTCAA  450

seq1  GGGATCATGTAAGTCTAATTATCTATATACAAATATATGAAAAAACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATCATGTAAGTCTAATTATCTATATACAAATATATGAAAAAACATAT  500

seq1  TGAGTTTGTTTATCATTTCTGTACACACACACACACACACACACACACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTTGTTTATCATTTCTGTACACACACACACACACACACACACACAC  550

seq1  ACACACGCAAATCTGTGAGAGAAGAATTCCAAAGACTTTTTGGAAAATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACGCAAATCTGTGAGAGAAGAATTCCAAAGACTTTTTGGAAAATAC  600

seq1  TGAATTTATGATACAATGAAGAAGAAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTATGATACAATGAAGAAGAAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA  650

seq1  GGAGGAGGA  659
      |||||||||
seq2  GGAGGAGGA  659

seq1: chr10_73905414_73906221
seq2: B6Ng01-124A15.g_79_885 (reverse)

seq1  ACCCACTCATGAACACACATACATACCCATGTATATAATTCCATGCACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACCCACTCATGAACACACATACATACCCATGTA-ATAATTCCATGCACAT  49

seq1  GCTCAAACATATATGTACTCTCCCACAGTAATACACACATATGTATAAAC  100
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTAACATATATGTACTCTCCCACAGTAATACACACATATGTATAAAC  99

seq1  CTACATACAAATATGCACATAAACACATACTTGAACACACTTACACACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATACAAATATGCACATAAACACATACTTGAACACACTTACACACAT  149

seq1  GGAACATCTCCCATGCACATGGATGTGCATATTTACACACATGCATACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACATCTCCCATGCACATGGATGTGCATATTTACACACATGCATACAC  199

seq1  ACAATTAGGTGCTCCGTGATAGCTCACACCTTTATAATTGCTACAATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTAGGTGCTCCGTGATAGCTCACACCTTTATAATTGCTACAATACA  249

seq1  CTTACAAGTACACAAGAAAGCTTTGATCTTCATTGCTCTTCCATATAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAAGTACACAAGAAAGCTTTGATCTTCATTGCTCTTCCATATAATG  299

seq1  TCTAAGATATTATTTGAATCAGATAATTTCCTTCTAATTATAACTTGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGATATTATTTGAATCAGATAATTTCCTTCTAATTATAACTTGCTA  349

seq1  CAGTAATAATGTTACGTGAACAAACAGGTGCATTTTATATATGAGTTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAATAATGTTACGTGAACAAACAGGTGCATTTTATATATGAGTTCTT  399

seq1  TGGCAGGTCAACACTGAAATTCCCAGATAATCATCAAAATATCAGAGTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGGTCAACACTGAAATTCCCAGATAATCATCAAAATATCAGAGTTA  449

seq1  ATAGAGTCTAAGGAAAATAAAATACAGACATGCAAGGATAAAACTAGCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGTCTAAGGAAAATAAAATACAGACATGCAAGGATAAAACTAGCCT  499

seq1  GACATATTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCACAAATATGACCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATATTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCACAAATATGACCACAA  549

seq1  AGCAAGATGGGGAGGAAAGGGTTTATTCAGTTTATATTTCCAAATTGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGATGGGGAGGAAAGGGTTTATTCAGTTTATATTTCCAAATTGCTG  599

seq1  TTCATCACCAAAGGAAGTCAGGACTTGAACTCAAGCAAGTCAGGAAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCACCAAAGGAAGTCAGGACTTGAACTCAAGCAAGTCAGGAAGCAG  649

seq1  GAGCTGATGCAGAGGCCATGGAGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGATGCAGAGGCCATGGAGGGATGTTCTTTACTGGCTTGCTTCTCC  699

seq1  TGACTTACTCAGCCTGCTCTCTTATAGAACCCAAGACTACCAGCCAAGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTACTCAGCCTGCTCTCTTATAGAACCCAAGACTACCAGCCAAGGG  749

seq1  ATTGTACCACCCACAAGGGGCCCTCCCCCCTTGATCACTAACTGAGAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTACCACCCACAAGGGGCCCTCCCCCCTTGATCACTAACTGAGAAAA  799

seq1  TGCCTCAC  808
      ||||||||
seq2  TGCCTCAC  807