BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128K04
Chromosome10 (Build37)
Map Location 118,252,399 - 118,407,099
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDyrk2, LOC668223
Upstream geneRap1b, Mdm1, Il22, LOC672934, LOC668180, LOC668186, LOC668187, LOC668191, EG668193, Iltifb, LOC668198, EG668203, EG668205, EG668209, EG668213, LOC668216, Ifng, LOC100043478, LOC100042850
Downstream geneLOC100042861, LOC674417, Cand1, Grip1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128K04.bB6Ng01-128K04.g
ACCDH930435DH930436
length7651,162
definitionDH930435|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128K04, 5' end.DH930436|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128K04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,406,335 - 118,407,099)(118,252,399 - 118,253,579)
sequence
gaattcatttgcatccatgccttggatatcttttaggctctgcttcaata
aggctatcacctgatcgcactctctaactctatccatgaatgtcatgggc
attttatctgtaggtttcctaaacaccacgttagagtgcaggacactgct
tcctctcagagcacaactgtgtatcttttggtacctccctgttttaatta
gggtagattagataggagacgatcctggagacagaagcctcaagatcaag
gtctaggtcagtagtgagtcctctcccctagactttcagaaatctgcctt
ctctgtgtatcattacatggcaaagaagaagtggtggaaagagagagggc
ctccttcctcttgtcttaaaaagatgctcactctgccaaggggccctcac
tcttgtgaactcatcaaaagctaactaccgtgaagtcctcacctccagac
attgtcactcagagtgtgttaggcactcaatgtgaaaatgtgggatagac
actcacacagctgctagcagtgcccaaggggcgtccttgatcaccaggag
ttcagcactcatatgcccacagcctgaaagcaagaggtacttggaagcta
cccccaaaagatgagaggagctaacacaggcatgcttctgtttcagccca
agatagacagttcaaagacatgttttatgagactgtgggtatgaatgaga
attttcctataagcgcatatatttgaatacttggtctctagttggtggaa
cttttgggaaggagc
gaattcactgcctgcaggaaaacgttcctaggcaaagatttcctaagaca
cagaagcaaaaccccaaagggctaaaaaaatattgatcagttgggcttca
ctgattttagagctttagatcttcagggccattaacaggagcaagctaag
gtctagactggaaaacaagatcatgaatgtatatatatgatgactatata
gagaatgcattcaaatcaaaaaatttttaaaagaagacatcaacatgaag
atgagcatatagacacacacacacccacaagagaccatacctgaatagaa
aataatcatatgaaaatgtgtcagatttatttagtctttggggaaatggg
ttaacaatcataatgaagaagcttcaatatgcctttccaatggggaaaac
aagagaagctagaggaatcagaactcccatacccaataaaactgaataac
ccatgcccacagcccaaaggttccactcataagtttgccccgaacagaac
tgcacttaggtagccaacaaatggcaagtgcatggatgttaagtgaggta
ctagttgcaatatgcccccaagaaacaactcaaatatccatttatagaat
gtatatgaaagtcactgcatacttccatacagtgggtagcatacaatgat
aacatggtcaaactatcattgcatacaaaacaaaataactcacaagtaat
gttgagtgaagagtgtcagtcatagaggaacacactaaaatccttttgct
cagcatatacatctataaacataccaaagttattgtgtgggtttagaagt
acgagttcttctcactctgactgggatgagatcatcaaaggtatagggac
acagacacacctggggtcctgattataatctgggtagattccatgcatgt
gttcattttgcgaaaatgaattgagcttacgatttgcatccttccacact
tgcttcacatttcagaaaaagcttcacgtggtaagagataaaaaattcat
gtagctatatctttcttagcatagcgcagatcccatgatttgttctgtgc
aacttcagccgccctagacaggtttaaccacactgcttcttgtcacccgg
tggattaatgaatttcagagaagtttaaaattggtaccttgcttctattg
tgggttccttgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_118406335_118407099
seq2: B6Ng01-128K04.b_48_812 (reverse)

seq1  GCTCCTTCCCAAAAGTTCCACCAACTAGAGACCAAGTATTCAAATATATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTTCCCAAAAGTTCCACCAACTAGAGACCAAGTATTCAAATATATG  50

seq1  CGCTTATAGGAAAATTCTCATTCATACCCACAGTCTCATAAAACATGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTTATAGGAAAATTCTCATTCATACCCACAGTCTCATAAAACATGTCT  100

seq1  TTGAACTGTCTATCTTGGGCTGAAACAGAAGCATGCCTGTGTTAGCTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTGTCTATCTTGGGCTGAAACAGAAGCATGCCTGTGTTAGCTCCT  150

seq1  CTCATCTTTTGGGGGTAGCTTCCAAGTACCTCTTGCTTTCAGGCTGTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTTTTGGGGGTAGCTTCCAAGTACCTCTTGCTTTCAGGCTGTGGG  200

seq1  CATATGAGTGCTGAACTCCTGGTGATCAAGGACGCCCCTTGGGCACTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGAGTGCTGAACTCCTGGTGATCAAGGACGCCCCTTGGGCACTGCT  250

seq1  AGCAGCTGTGTGAGTGTCTATCCCACATTTTCACATTGAGTGCCTAACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTGTGTGAGTGTCTATCCCACATTTTCACATTGAGTGCCTAACAC  300

seq1  ACTCTGAGTGACAATGTCTGGAGGTGAGGACTTCACGGTAGTTAGCTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAGTGACAATGTCTGGAGGTGAGGACTTCACGGTAGTTAGCTTTT  350

seq1  GATGAGTTCACAAGAGTGAGGGCCCCTTGGCAGAGTGAGCATCTTTTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTTCACAAGAGTGAGGGCCCCTTGGCAGAGTGAGCATCTTTTTAA  400

seq1  GACAAGAGGAAGGAGGCCCTCTCTCTTTCCACCACTTCTTCTTTGCCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGAGGAAGGAGGCCCTCTCTCTTTCCACCACTTCTTCTTTGCCATG  450

seq1  TAATGATACACAGAGAAGGCAGATTTCTGAAAGTCTAGGGGAGAGGACTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGATACACAGAGAAGGCAGATTTCTGAAAGTCTAGGGGAGAGGACTC  500

seq1  ACTACTGACCTAGACCTTGATCTTGAGGCTTCTGTCTCCAGGATCGTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTGACCTAGACCTTGATCTTGAGGCTTCTGTCTCCAGGATCGTCTC  550

seq1  CTATCTAATCTACCCTAATTAAAACAGGGAGGTACCAAAAGATACACAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTAATCTACCCTAATTAAAACAGGGAGGTACCAAAAGATACACAGT  600

seq1  TGTGCTCTGAGAGGAAGCAGTGTCCTGCACTCTAACGTGGTGTTTAGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCTGAGAGGAAGCAGTGTCCTGCACTCTAACGTGGTGTTTAGGAA  650

seq1  ACCTACAGATAAAATGCCCATGACATTCATGGATAGAGTTAGAGAGTGCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACAGATAAAATGCCCATGACATTCATGGATAGAGTTAGAGAGTGCG  700

seq1  ATCAGGTGATAGCCTTATTGAAGCAGAGCCTAAAAGATATCCAAGGCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGTGATAGCCTTATTGAAGCAGAGCCTAAAAGATATCCAAGGCATG  750

seq1  GATGCAAATGAATTC  765
      |||||||||||||||
seq2  GATGCAAATGAATTC  765

seq1: chr10_118252399_118253579
seq2: B6Ng01-128K04.g_67_1228

seq1  GAATTCACTGCCTGCAGGAAAACGTTCCTAGGCAAAGATTTCCTAAGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGCCTGCAGGAAAACGTTCCTAGGCAAAGATTTCCTAAGACA  50

seq1  CAGAAGCAAAACCCCAAAGGGCTAAAAAAATATTGATCAGTTGGGCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCAAAACCCCAAAGGGCTAAAAAAATATTGATCAGTTGGGCTTCA  100

seq1  CTGATTTTAGAGCTTTAGATCTTCAGGGCCATTAACAGGAGCAAGCTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTTAGAGCTTTAGATCTTCAGGGCCATTAACAGGAGCAAGCTAAG  150

seq1  GTCTAGACTGGAAAACAAGATCATGAATGTATATATATGATGACTATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGACTGGAAAACAAGATCATGAATGTATATATATGATGACTATATA  200

seq1  GAGAATGCATTCAAATCAAAAAATTTTTAAAAGAAGACATCAACATGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGCATTCAAATCAAAAAATTTTTAAAAGAAGACATCAACATGAAG  250

seq1  ATGAGCATATAGACACACACACACCCACAAGAGACCATACCTGAATAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCATATAGACACACACACACCCACAAGAGACCATACCTGAATAGAA  300

seq1  AATAATCATATGAAAATGTGTCAGATTTATTTAGTCTTTGGGGAAATGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATCATATGAAAATGTGTCAGATTTATTTAGTCTTTGGGGAAATGGG  350

seq1  TTAACAATCATAATGAAGAAGCTTCAATATGCCTTTCCAATGGGGAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAATCATAATGAAGAAGCTTCAATATGCCTTTCCAATGGGGAAAAC  400

seq1  AAGAGAAGCTAGAGGAATCAGAACTCCCATACCCAATAAAACTGAATAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAGCTAGAGGAATCAGAACTCCCATACCCAATAAAACTGAATAAC  450

seq1  CCATGCCCACAGCCCAAAGGTTCCACTCATAAGTTTGCCCCGAACAGAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCACAGCCCAAAGGTTCCACTCATAAGTTTGCCCCGAACAGAAC  500

seq1  TGCACTTAGGTAGCCAACAAATGGCAAGTGCATGGATGTTAAGTGAGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTTAGGTAGCCAACAAATGGCAAGTGCATGGATGTTAAGTGAGGTA  550

seq1  CTAGTTGCAATATGCCCCCAAGAAACAACTCAAATATCCATTTATAGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTGCAATATGCCCCCAAGAAACAACTCAAATATCCATTTATAGAAT  600

seq1  GTATATGAAAGTCACTGCATACTTCCATACAGTGGGTAGCATACAATGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGAAAGTCACTGCATACTTCCATACAGTGGGTAGCATACAATGAT  650

seq1  AACATGGTCAAACTATCATTGCATACAAAACAAAATAACTCACAAGTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGTCAAACTATCATTGCATACAAAACAAAATAACTCACAAGTAAT  700

seq1  GTTGAGTGAAGAGTGTCAGTCATAGAGGAACACACTAAAATCCTTTTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGTGAAGAGTGTCAGTCATAGAGGAACACACTAAAATCCTTTTGCT  750

seq1  CAGCATATACATCTATAAACATACCAAAGTTATTGTGTGGGTTTAGAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATATACATCTATAAACATACCAAAGTTATTGTGTGGGTTTAGAAGT  800

seq1  ACGAGTTCTTCTCACTCTGACTGGGATGAGATCATCAAAGGTATAAGGGA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACGAGTTCTTCTCACTCTGACTGGGATGAGATCATCAAAGGTAT-AGGGA  849

seq1  CACAGACACACCTGGGGTCCTGATTATTAATCTGGGTAAGAATTCCATGC  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||
seq2  CACAGACACACCTGGGGTCCTGATTA-TAATCTGGGTA--GATTCCATGC  896

seq1  ATGTGTTCATTTTGCGAAAATGAATTGAGCTTACGATTTGCATCCTTTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGTGTTCATTTTGCGAAAATGAATTGAGCTTACGATTTGCATCC-TTCC  945

seq1  ACACTTGCTTCACATTTCAAGAAAAAGC-TCACGTGGTAAGAGATTAAAA  999
      |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||
seq2  ACACTTGCTTCACATTTC-AGAAAAAGCTTCACGTGGTAAGAGAT--AAA  992

seq1  AAATCCATGTAGCTAATATCTTTCTTAGCCATAAGCGCAGAACCACATTG  1049
      |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || || ||
seq2  AAATTCATGTAGCT-ATATCTTTCTTAG-CAT-AGCGCAGATCC-CA-TG  1037

seq1  ATTTGTTCTGTGCAACTTCAGCCGCCCCTAGACAGTGTCTTACACACACT  1099
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||
seq2  ATTTGTTCTGTGCAACTTCAGCCG-CCCTAGACAG-GT-TTAACCACACT  1084

seq1  GCTTCTTGTTCAACC-GTTGATTAATGAATTTCAAGAGAGTTTTAAAAAT  1148
      |||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||  |||||||  
seq2  GCTTCTTG-TCACCCGGTGGATTAATGAATTTC-AGAGAAGTTTAAAA--  1130

seq1  CTGTTACTTGTCTTCCTTTGTGGGTTTCCTTGT  1181
       || ||| |  ||||  ||||||| ||||||||
seq2  TTGGTACCTTGCTTCTATTGTGGG-TTCCTTGT  1162