BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129M03
Chromosome10 (Build37)
Map Location 121,925,244 - 121,926,135
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043500, Tbk1, Xpot, D930020B18Rik, BC048403, Srgap1, EG216394, LOC668272, Tmem5, LOC100043513, LOC668275, Avpr1a
Downstream genePpm1h, D630033A02Rik, Mon2, Usp15, LOC100042958, AI851790
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129M03.bB6Ng01-129M03.g
ACCDH931259DH931260
length8931,100
definitionDH931259|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129M03, 5' end.DH931260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129M03, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcatagctgtcatattggcatagatataaaagcacattgtagccca
ccatttataaggtgaatataattttaaagtactcaggatagtttaatgag
atctgagactgggttttatgctttcaaatgcaaataaacacctattactc
agattaatttttcctcattttctaattaaaagatggattgatcaaaataa
tgtagacttttaaaaatctatacaatgagtaaaacaatcttataaactat
cataaaataaagtcaaccacataataatagagaaaaatgattttaattag
aggtcataatttagcaaaaagagactagattgtttcttttatttttgtca
cactcattttattctcttcacttatatgtgtttgtgtgtatgcatgtttg
catgggcatgggcatgtgtgtgtttgtatgtttgcatatgcatgggcaca
tgtgtgtttgtgtgtatgtatgtttgcatgtgcatgggcttgtgtgtgtt
tgtgtgtatgcatgtttgcatgtgcatgagcacaggtttatgtttgcatg
tgtatgcatacatgtgtgtgtttgtgtgtatgcatgtttgcatgtgcatg
ggcacaggtttatgtttgcatgtatgcatgtttgtatgtgcatgcataca
tgtgtgtgtttgtgtatatgcatgtttgcatgtgcatgggcttgtgtgtg
tttatgtgtatgcatgtttgcatgtgcatgggcacaggtttatgtttgca
tgtatgcatgtttgcatgtgcatgcatacaggtgtgtgtttgtgtgcatg
catgtttgcacatttcatgggcgtgtgtgtttatgtgtgtgaatgtttgc
atgtgcatggatacatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatg
gaattcctatctcctttggggcctgcaatccttccccatattcttccata
agaattcccaaactatgtccactgtttggctgtgggtgtccacacctgtc
tgcgtcagctgctgagtggagcctctcagaagacaacatgctcctgtctg
caagcacaacagagtatcattaatagtgtcaggaagtggtgcttgcccat
gggatgggtctcaaattgggctggtttttggttgtctattctctcaatct
ctgctcaactttgtctccagttttaaggagcacagtactctgagcagtta
tggtgtttatcttttggttacatttctcttccaaggtggaaggaccactt
tggctccccgacctttcaaatgtgattcttcaccagttcagtttcttcca
atactctaagtcctttgcacagtccatttgcccaaagggttcaagggctg
tggaacaacttcttggtttaatttcttttatttctgagagtataactaca
taatttcctccttctcttctttccccccaaaccctcccatatacctctcc
ttgctctctttaaaaattcatggtctctctttttaaaaatgttgttaaat
gcatgaatgcatatatacatattatgtatatatatttttttctgtttcat
aaatacatcttgctcagtctgtataatgatactggtatgttttcagggct
tatcattttgatattggataaccaattcatgtgttcttccccgtggaaag
atatttcttctacttttagcatctcttagttgcctgtagttcttttgtgt
agaaataaggcctcatgggttttcctcatgtctacttaagcatgtctact
gctggtttccttgttcagatcatctttgggtcagtcatttggtaagactt
tatggagcatagcttttgccattcccagaataaaatttcttggcaactcc
atggtccttctggctcttataatctctcctacacccccttctcatgatct
ctggacccttaggtgaagtagttgtatggagatgtagccattgtgtccaa
gcctgcgacccaccatttgtgtgggtattacacccttggaaataccggat

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_121925244_121926135
seq2: B6Ng01-129M03.b_50_942

seq1  GAATTCATAGCTGTCATATTGGCATAGATATAAAAGCACATTGTAGCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGCTGTCATATTGGCATAGATATAAAAGCACATTGTAGCCCA  50

seq1  CCATTTATAAGGTGAATATAATTTTAAAGTACTCAGGATAGTTTAATGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTATAAGGTGAATATAATTTTAAAGTACTCAGGATAGTTTAATGAG  100

seq1  ATCTGAGACTGGGTTTTATGCTTTCAAATGCAAATAAACACCTATTACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGAGACTGGGTTTTATGCTTTCAAATGCAAATAAACACCTATTACTC  150

seq1  AGATTAATTTTTCCTCATTTTCTAATTAAAAGATGGATTGATCAAAATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAATTTTTCCTCATTTTCTAATTAAAAGATGGATTGATCAAAATAA  200

seq1  TGTAGACTTTTAAAAATCTATACAATGAGTAAAACAATCTTATAAACTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGACTTTTAAAAATCTATACAATGAGTAAAACAATCTTATAAACTAT  250

seq1  CATAAAATAAAGTCAACCACATAATAATAGAGAAAAATGATTTTAATTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAATAAAGTCAACCACATAATAATAGAGAAAAATGATTTTAATTAG  300

seq1  AGGTCATAATTTAGCAAAAAGAGACTAGATTGTTTCTTTTATTTTTGTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCATAATTTAGCAAAAAGAGACTAGATTGTTTCTTTTATTTTTGTCA  350

seq1  CACTCATTTTATTCTCTTCACTTATATGTGTTTGTGTGTATGCATGTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCATTTTATTCTCTTCACTTATATGTGTTTGTGTGTATGCATGTTTG  400

seq1  CATGGGCATGGGCATGTGTGTGTTTGTATGTTTGCATATGCATGGGCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGCATGGGCATGTGTGTGTTTGTATGTTTGCATATGCATGGGCACA  450

seq1  TGTGTGTTTGTGTGTATGTATGTTTGCATGTGCATGGGCTTGTGTGTGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTTTGTGTGTATGTATGTTTGCATGTGCATGGGCTTGTGTGTGTT  500

seq1  TGTGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATGAGCACAGGTTTATGTTTGCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATGAGCACAGGTTTATGTTTGCATG  550

seq1  TGTATGCATACATGTGTGTGTTTGTGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGCATACATGTGTGTGTTTGTGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATG  600

seq1  GGCACAGGTTTATGTTTGCATGTATGCATGTTTGTATGTGCATGCATACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACAGGTTTATGTTTGCATGTATGCATGTTTGTATGTGCATGCATACA  650

seq1  TGTGTGTGTTTGTGTATATGCATGTTTGCATGTGCATGGGCTTGTGTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTTTGTGTATATGCATGTTTGCATGTGCATGGGCTTGTGTGTG  700

seq1  TTTATGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATGGGCACAGGTTTATGTTTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTGTATGCATGTTTGCATGTGCATGGGCACAGGTTTATGTTTGCA  750

seq1  TGTATGCATGTTTGCATGTGCATGCATACAGGTGTGTGTTTGTGTGCATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGCATGTTTGCATGTGCATGCATACAGGTGTGTGTTTGTGTGCATG  800

seq1  CATGTTTGCACA-TTCATGGGCGTGTGTGTTTATGTGTGTGAATGTTTGC  849
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTGCACATTTCATGGGCGTGTGTGTTTATGTGTGTGAATGTTTGC  850

seq1  ATGTGCATGGATACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATG  892
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCATGGATACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATG  893