BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130D11
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,286,727 - 67,423,761
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp365
Upstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2, Egr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618
Downstream genePlekhk1, Arid5b, LOC100040136, 1700040L02Rik, EG665342, Tmem26
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130D11.bB6Ng01-130D11.g
ACCDH931587DH931588
length1,049977
definitionDH931587|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130D11, 5' end.DH931588|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130D11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,286,727 - 67,287,776)(67,422,772 - 67,423,761)
sequence
gaattcattggaaggaaatataactcccacttcaattgaaaactcttgag
gaatttattgagggggcttgatgccagggctttgtgggcttgaaaagaaa
ctaaagtttcctctcttataccctgagagacttctagacttcatagttgt
cttctctgaattctgaggtcacgtaaagtcaaaggttttccttttatttt
acagtaaggcagcctgaatcagtagacagtcacaattgttgagcaccttg
tctgttaactggatttaagtaattccattagccaggcctctagcttctgg
acccattttacttgcccatatgaagagttaagaaattttcataaactttt
agctcttcacaactacaataggggaaggagcatggttcagcccagaatga
ggccatgcatgccctaccttgggagtcacacagactaggacaaacttagg
cagtcaagttccaaccctgctaattccatttacacaaggacacagtctaa
gagctaccatgcaagataggtatgggggttatacctttaatcccagcatt
tgagaggcagaggcaggtgtatctccagattcaaggacagcctggtctac
agagacagcctgggctacatgaaaaccaaacaacaaaagaatagctattg
tgtaaaggaaactagttaccagagaacaggatggcagagaaggtggacta
gaaagggttaatggggaagttgattaatttgacaaggaagtgtcctgaga
agtgaaacgtgtcagaaacatatagttcaaggcaagacaattgattagag
ctactatttttacaaccttgatgtttgtgtccaagttatagagaagcatg
ctcagttttaacttgaaattcttctaggacagccaaatacagggtgtgtc
atcagaagtggaatatgattttgtgaatctcagagagagctctgaagtgg
accgtggagatctgagcatcatcagcttggtgagcaggaggcaagatcat
gaatgctgacagagtcattgaagagatcaagcagctgggtataaaagag
gaattcagagctagtgtggtactgcatgtttgtaatctgagccctctgga
gatggaaactggagggccaatcactaaggttgtccttagctatttagtga
ttttgaaaccagccgggagtacatgagacctaatctcaaacaagatagaa
caaaaatagtggaattgagatctcagagcaggctgaagagattgctccat
ggttaagagcactggctgccctttcagagaaccgagattcagttcccatc
acccagatagctgctcacaaccacttataactccagtccaagggatccag
catcctcttgcctggtttccacagataccacacacatgtgctatgtagag
atacactcaggtacacacacatacacataagtgagaattaaaaaaaaatg
aagtctttttgcttaggtaataaataatcttttccacagccataggatat
ggaggaaaaacagacacttgacagagagcgcagcagcagatgtacctaat
gctggcttgggtacagatgtgctttgctgtctgtcactgtgcttagtttt
ctgtgtgtttcatcttatgtaatcctcgtagtgcaaaggaggtaagaaca
cagaagcaaacgtgctcaactcacagggccacagtgagaacatcctgatt
ggagctgcaagccgatggctgactctctatagctaactgctccgtgtttt
caaacacactagaacagggtggaatggaacagatctctctttgtcaacta
gcctgtctgatcacccacaaaccctggcttccccagaacagtagcactgg
gaactcagccaaggtcattgcactttgtacaaacgcagcccttttttttt
tttccaatttctgagggttaccatagcagcaactatttcacctctatttc
agccacatctggtgtattagtagacggaacatgtcttctgtaacttcccc
ttctgccaagtgatcagtccattgtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67286727_67287776
seq2: B6Ng01-130D11.b_47_1095

seq1  GAATTCATTGGAAGGAAATATAACTCCCACTTCAATTGAAAACTCTTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGGAAGGAAATATAACTCCCACTTCAATTGAAAACTCTTGAG  50

seq1  GAATTTATTGAGGGGGCTTGATGCCAGGGCTTTGTGGGCTTGAAAAGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTATTGAGGGGGCTTGATGCCAGGGCTTTGTGGGCTTGAAAAGAAA  100

seq1  CTAAAGTTTCCTCTCTTATACCCTGAGAGACTTCTAGACTTCATAGTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGTTTCCTCTCTTATACCCTGAGAGACTTCTAGACTTCATAGTTGT  150

seq1  CTTCTCTGAATTCTGAGGTCACGTAAAGTCAAAGGTTTTCCTTTTATTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTGAATTCTGAGGTCACGTAAAGTCAAAGGTTTTCCTTTTATTTT  200

seq1  ACAGTAAGGCAGCCTGAATCAGTAGACAGTCACAATTGTTGAGCACCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAAGGCAGCCTGAATCAGTAGACAGTCACAATTGTTGAGCACCTTG  250

seq1  TCTGTTAACTGGATTTAAGTAATTCCATTAGCCAGGCCTCTAGCTTCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAACTGGATTTAAGTAATTCCATTAGCCAGGCCTCTAGCTTCTGG  300

seq1  ACCCATTTTACTTGCCCATATGAAGAGTTAAGAAATTTTCATAAACTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATTTTACTTGCCCATATGAAGAGTTAAGAAATTTTCATAAACTTTT  350

seq1  AGCTCTTCACAACTACAATAGGGGAAGGAGCATGGTTCAGCCCAGAATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTTCACAACTACAATAGGGGAAGGAGCATGGTTCAGCCCAGAATGA  400

seq1  GGCCATGCATGCCCTACCTTGGGAGTCACACAGACTAGGACAAACTTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATGCATGCCCTACCTTGGGAGTCACACAGACTAGGACAAACTTAGG  450

seq1  CAGTCAAGTTCCAACCCTGCTAATTCCATTTACACAAGGACACAGTCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAAGTTCCAACCCTGCTAATTCCATTTACACAAGGACACAGTCTAA  500

seq1  GAGCTACCATGCAAGATAGGTATGGGGGTTATACCTTTAATCCCAGCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTACCATGCAAGATAGGTATGGGGGTTATACCTTTAATCCCAGCATT  550

seq1  TGAGAGGCAGAGGCAGGTGTATCTCCAGATTCAAGGACAGCCTGGTCTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGCAGAGGCAGGTGTATCTCCAGATTCAAGGACAGCCTGGTCTAC  600

seq1  AGAGACAGCCTGGGCTACATGAAAACCAAACAACAAAAGAATAGCTATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGCCTGGGCTACATGAAAACCAAACAACAAAAGAATAGCTATTG  650

seq1  TGTAAAGGAAACTAGTTACCAGAGAACAGGATGGCAGAGAAGGTGGACTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGGAAACTAGTTACCAGAGAACAGGATGGCAGAGAAGGTGGACTA  700

seq1  GAAAGGGTTAATGGGGAAGTTGATTAATTTGACAAGGAAGTGTCCTGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGTTAATGGGGAAGTTGATTAATTTGACAAGGAAGTGTCCTGAGA  750

seq1  AGTGAAACGTGTCAGAAACATATAGTTCAAGGCAAGACAATTGATTAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAACGTGTCAGAAACATATAGTTCAAGGCAAGACAATTGATTAGAG  800

seq1  CTACTATTTTTACAACCTTGATGTTTGTGTCCAAGTTATAGAGAAGCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTATTTTTACAACCTTGATGTTTGTGTCCAAGTTATAGAGAAGCATG  850

seq1  CTCAGTTTTTAACTTGAAATTCTTCTAGGACAGCCAAATACAGGGTGTGT  900
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAG-TTTTAACTTGAAATTCTTCTAGGACAGCCAAATACAGGGTGTGT  899

seq1  CATCAAGAAGTGGAATATGTATTTGTGAATCTCAGAGAGAGCTCTGAAGT  950
      |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATC-AGAAGTGGAATATGATTTTGTGAATCTCAGAGAGAGCTCTGAAGT  948

seq1  GGACCGT-GAGATCTGAGCATCATCAGCTT-GTGAGCAGGAGGCAAGACC  998
      ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  GGACCGTGGAGATCTGAGCATCATCAGCTTGGTGAGCAGGAGGCAAGATC  998

seq1  ATGAATGCTGACAGAGTCATTGAAGAAGAACAAGCAGCTGGGTATAAAAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGCTGACAGAGTCATTGAAG-AGATCAAGCAGCTGGGTATAAAAG  1047

seq1  AG  1050
      ||
seq2  AG  1049

seq1: chr10_67422772_67423761
seq2: B6Ng01-130D11.g_71_1047 (reverse)

seq1  CCACAAATGGACCTTGATCACTTGGCAGAAGGGGAAGTTACAGAAGACAT  50
      |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAC-AATGGAC--TGATCACTTGGCAGAAGGGGAAGTTACAGAAGACAT  47

seq1  GTTCCTGTTCTACTAGATTACACCAGAATGTGGCTGGAAATAGAGGTGAA  100
      |||||   ||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  GTTCC--GTCTACT--AATACACCAG-ATGTGGCT-GAAATAGAGGTGAA  91

seq1  ATAGTTGCTGCTATGGTAAACTCTCAGAAATTTGGAAAAAAAAAAAAAGG  150
      ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  ATAGTTGCTGCTATGGT-AACCCTCAGAAA-TTGGAAAAAAAAAAAAGGG  139

seq1  CTGCGTTTGTTACAAAGTTGCATTGACCTTGGCTGAGTTCCAAGTGCTAC  200
      ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGCGTTTG-TACAAAG-TGCAATGACCTTGGCTGAGTTCCCAGTGCTAC  187

seq1  TGTTCTGGGGAAGCCAGGGTTTGTGGGTGATCAGACAGGCTAGTTGACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTGGGGAAGCCAGGGTTTGTGGGTGATCAGACAGGCTAGTTGACAA  237

seq1  AGAGAGATCTGTTCCATTCCACCCTGTTCTAGTGTGTTTGAAAACACGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGATCTGTTCCATTCCACCCTGTTCTAGTGTGTTTGAAAACACGGA  287

seq1  GCAGTTAGCTATAGAGAGTCAGCCATCGGCTTGCAGCTCCAATCAGGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTAGCTATAGAGAGTCAGCCATCGGCTTGCAGCTCCAATCAGGATG  337

seq1  TTCTCACTGTGGCCCTGTGAGTTGAGCACGTTTGCTTCTGTGTTCTTACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACTGTGGCCCTGTGAGTTGAGCACGTTTGCTTCTGTGTTCTTACC  387

seq1  TCCTTTGCACTACGAGGATTACATAAGATGAAACACACAGAAAACTAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGCACTACGAGGATTACATAAGATGAAACACACAGAAAACTAAGC  437

seq1  ACAGTGACAGACAGCAAAGCACATCTGTACCCAAGCCAGCATTAGGTACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGACAGACAGCAAAGCACATCTGTACCCAAGCCAGCATTAGGTACA  487

seq1  TCTGCTGCTGCGCTCTCTGTCAAGTGTCTGTTTTTCCTCCATATCCTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGCTGCGCTCTCTGTCAAGTGTCTGTTTTTCCTCCATATCCTATG  537

seq1  GCTGTGGAAAAGATTATTTATTACCTAAGCAAAAAGACTTCATTTTTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGGAAAAGATTATTTATTACCTAAGCAAAAAGACTTCATTTTTTTT  587

seq1  TAATTCTCACTTATGTGTATGTGTGTGTACCTGAGTGTATCTCTACATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCTCACTTATGTGTATGTGTGTGTACCTGAGTGTATCTCTACATAG  637

seq1  CACATGTGTGTGGTATCTGTGGAAACCAGGCAAGAGGATGCTGGATCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGTGTGGTATCTGTGGAAACCAGGCAAGAGGATGCTGGATCCCT  687

seq1  TGGACTGGAGTTATAAGTGGTTGTGAGCAGCTATCTGGGTGATGGGAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGGAGTTATAAGTGGTTGTGAGCAGCTATCTGGGTGATGGGAACT  737

seq1  GAATCTCGGTTCTCTGAAAGGGCAGCCAGTGCTCTTAACCATGGAGCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCGGTTCTCTGAAAGGGCAGCCAGTGCTCTTAACCATGGAGCAAT  787

seq1  CTCTTCAGCCTGCTCTGAGATCTCAATTCCACTATTTTTGTTCTATCTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCAGCCTGCTCTGAGATCTCAATTCCACTATTTTTGTTCTATCTTG  837

seq1  TTTGAGATTAGGTCTCATGTACTCCCGGCTGGTTTCAAAATCACTAAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGATTAGGTCTCATGTACTCCCGGCTGGTTTCAAAATCACTAAATA  887

seq1  GCTAAGGACAACCTTAGTGATTGGCCCTCCAGTTTCCATCTCCAGAGGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGGACAACCTTAGTGATTGGCCCTCCAGTTTCCATCTCCAGAGGGC  937

seq1  TCAGATTACAAACATGCAGTACCACACTAGCTCTGAATTC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATTACAAACATGCAGTACCACACTAGCTCTGAATTC  977