BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130H14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,737,556 - 24,852,882
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667479, LOC212399
Upstream geneTaar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1
Downstream geneAkap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130H14.bB6Ng01-130H14.g
ACCDH931777DH931778
length1,105864
definitionDH931777|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130H14, 5' end.DH931778|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130H14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,851,755 - 24,852,882)(24,737,556 - 24,738,420)
sequence
gaattcagtgccaggattaccagcactgactattactattcatggttttg
tttttgttttttgctctttgattattttttaatgtagattctggggatca
aattcattcatttttgctcatataccaagcagtctactgactatgttatg
tgctgaaccccacataatgctaggttggccttggagaccactgagtgtat
ctgggggatctattgaggtcagttaagggaaatctatttctatgtccaaa
gaatggaatttacctatggctctgggtggagacaagacgttctgatctgc
ttcaaagaccagaagattatataccatcgtctccttttcttaaaagttaa
tccagttggacctgtcaaccacccagctaagccacagcctctcagaaagg
ctggatcaccaaagccatggtgaggagatgggaggaatagttctctccct
tcccagaaatcgttctttatagacacacacagaatccccgtcatgtagca
ctgtagtctgtccacttctttagtaactcagaaaacaactttttgttttc
tgtattctttggaggtgtatactggccgagactgggggattcttccatgg
atgctctgtgctttctcactttttctcctcagctcacacagtatgactgc
ttatgaacaacatagttttttgttctctatatttcttctttggcagatgc
catgatttacagcttgcctgccctaatattttttttctcttaaaccctaa
ccagttgtccttgagctttgttctgagcctgtttctaaattatcttcttt
ataaagatttaaaatttatcctgcctgtacttaaccaatgcagatgtgga
tgtgtggagtcaaccatcagactgagctcaggaccccggtgggggagctg
acagaagcccagagattcagaggaagattgcaactctatagaaacacaac
atcacatggctggcagaccacccagtgctccagggactagacacagcaga
gtgtacaggaggatccatggcttcagaatctttgttagcaagaatgcctt
gtctgaatcattgggaggggaacttggtctgtggagtttgatgccccaca
taggg
gaattccttcagcaggagattaccattcctaatgttgaaaggatgttaaa
agttcggggcaggggtatgatagctgttttctactgaagggaggtctttg
tcagagggaggtagttctgggtgcattgaagagggcttctctggtcatgt
agctagggaagagttccaatttggtcagctgtgatagctcaggctgttgc
caccctgtgtttctaaagagacatcatgagggatatgtataagagggctg
taagcagatgaattatttattgagtaaaactggactgtacattcattaga
cacaatgacagacacaccaagggtccctaacatttatgaggctcctacat
acttagtatatatggcactacccataaaagatgcacatctgagcccttac
tattaattaaaacaattaaatattaatgtagtctcccactggtgacactc
atgtatccttttctcaagaaacataaatgaagctcgtggctggcttctct
tcccttgtgtctcactgtgagctcaaatccttcccataagctgcatgggt
tgagtccttcccctgaatggtctctggtagtggtggagacttccagacaa
ggtaacatctctcaggacttatgagaagagatgaaggaacaaccctcacc
acagagccggcagctgagtcagttccagccatctcagactggttctcctg
aacgtatttccttcttctgacctcctacctttctctacctccctctttgt
tcctggaactgcctgtccctctagctatagaaagagcagcaggaaggagt
ttggcttccttaaatcacttctttggatctacaagaacacaggcagggtg
gggtggggtggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24851755_24852882
seq2: B6Ng01-130H14.b_45_1149 (reverse)

seq1  CCCTATGCTGGGGCATCAAACTTCCACAGGACCAAAGGTCTCCCCTCCCA  50
      ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||
seq2  CCCTATG-TGGGGCATCAAAC-TCCACA-GACCAA--GT-TCCCCTCCCA  44

seq1  TTGATGTCAGACAAGGCCATTCTCTGCTACATATGTATCTGGAGCCATGG  100
       |||| |||||||||| |||||| |||||   | |  |||| ||||||||
seq2  ATGAT-TCAGACAAGG-CATTCT-TGCTAACAAAGATTCTGAAGCCATGG  91

seq1  ATCCCTCCCTGTACACTCCTTGGCTGGTGGTCTAGTCCCTGGGAGCACTG  150
      ||||   |||||||||||    ||||   ||||||||||| |||||||||
seq2  ATCC--TCCTGTACACTC---TGCTG--TGTCTAGTCCCT-GGAGCACTG  133

seq1  GGTGGTCTGGCCAGCCAATGTTGATGTTGTTGTTTCTATAGGGTTGCAAT  200
      |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  GGTGGTCT-GCCAGCC-ATG-TGATGTTG-TGTTTCTATAGAGTTGCAAT  179

seq1  CTTCCTCTGATTCTCTGGGCCTTCTGTCAGCTCCCCCACCGGGGTCCCTG  250
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTTCCTCTGAATCTCTGGG-CTTCTGTCAGCTCCCCCACCGGGGT-CCTG  227

seq1  AGCTCAGTCTGATGGTTGACTCCACACATCCACATCTGCATTGGTTAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGTCTGATGGTTGACTCCACACATCCACATCTGCATTGGTTAAGT  277

seq1  ACAGGCAGGATAAATTTTAAATCTTTATAAAGAAGATAATTTAGAAACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCAGGATAAATTTTAAATCTTTATAAAGAAGATAATTTAGAAACAG  327

seq1  GCTCAGAACAAAGCTCAAGGACAACTGGTTAGGGTTTAAGAGAAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGAACAAAGCTCAAGGACAACTGGTTAGGGTTTAAGAGAAAAAAAA  377

seq1  TATTAGGGCAGGCAAGCTGTAAATCATGGCATCTGCCAAAGAAGAAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGGGCAGGCAAGCTGTAAATCATGGCATCTGCCAAAGAAGAAATAT  427

seq1  AGAGAACAAAAAACTATGTTGTTCATAAGCAGTCATACTGTGTGAGCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACAAAAAACTATGTTGTTCATAAGCAGTCATACTGTGTGAGCTGA  477

seq1  GGAGAAAAAGTGAGAAAGCACAGAGCATCCATGGAAGAATCCCCCAGTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAAAGTGAGAAAGCACAGAGCATCCATGGAAGAATCCCCCAGTCT  527

seq1  CGGCCAGTATACACCTCCAAAGAATACAGAAAACAAAAAGTTGTTTTCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCAGTATACACCTCCAAAGAATACAGAAAACAAAAAGTTGTTTTCTG  577

seq1  AGTTACTAAAGAAGTGGACAGACTACAGTGCTACATGACGGGGATTCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTAAAGAAGTGGACAGACTACAGTGCTACATGACGGGGATTCTGT  627

seq1  GTGTGTCTATAAAGAACGATTTCTGGGAAGGGAGAGAACTATTCCTCCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCTATAAAGAACGATTTCTGGGAAGGGAGAGAACTATTCCTCCCA  677

seq1  TCTCCTCACCATGGCTTTGGTGATCCAGCCTTTCTGAGAGGCTGTGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCACCATGGCTTTGGTGATCCAGCCTTTCTGAGAGGCTGTGGCTT  727

seq1  AGCTGGGTGGTTGACAGGTCCAACTGGATTAACTTTTAAGAAAAGGAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGTGGTTGACAGGTCCAACTGGATTAACTTTTAAGAAAAGGAGAC  777

seq1  GATGGTATATAATCTTCTGGTCTTTGAAGCAGATCAGAACGTCTTGTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTATATAATCTTCTGGTCTTTGAAGCAGATCAGAACGTCTTGTCTC  827

seq1  CACCCAGAGCCATAGGTAAATTCCATTCTTTGGACATAGAAATAGATTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAGAGCCATAGGTAAATTCCATTCTTTGGACATAGAAATAGATTTC  877

seq1  CCTTAACTGACCTCAATAGATCCCCCAGATACACTCAGTGGTCTCCAAGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAACTGACCTCAATAGATCCCCCAGATACACTCAGTGGTCTCCAAGG  927

seq1  CCAACCTAGCATTATGTGGGGTTCAGCACATAACATAGTCAGTAGACTGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCTAGCATTATGTGGGGTTCAGCACATAACATAGTCAGTAGACTGC  977

seq1  TTGGTATATGAGCAAAAATGAATGAATTTGATCCCCAGAATCTACATTAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTATATGAGCAAAAATGAATGAATTTGATCCCCAGAATCTACATTAA  1027

seq1  AAAATAATCAAAGAGCAAAAAACAAAAACAAAACCATGAATAGTAATAGT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAATCAAAGAGCAAAAAACAAAAACAAAACCATGAATAGTAATAGT  1077

seq1  CAGTGCTGGTAATCCTGGCACTGAATTC  1128
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTGGTAATCCTGGCACTGAATTC  1105

seq1: chr10_24737556_24738420
seq2: B6Ng01-130H14.g_68_931

seq1  GAATTCCTTCAGCAGGAGATTACCATTCCTAATGTTGAAAGGATGTTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCAGCAGGAGATTACCATTCCTAATGTTGAAAGGATGTTAAA  50

seq1  AGTTCGGGGCAGGGGTATGATAGCTGTTTTCTACTGAAGGGAGGTCTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCGGGGCAGGGGTATGATAGCTGTTTTCTACTGAAGGGAGGTCTTTG  100

seq1  TCAGAGGGAGGTAGTTCTGGGTGCATTGAAGAGGGCTTCTCTGGTCATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGGAGGTAGTTCTGGGTGCATTGAAGAGGGCTTCTCTGGTCATGT  150

seq1  AGCTAGGGAAGAGTTCCAATTTGGTCAGCTGTGATAGCTCAGGCTGTTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGGGAAGAGTTCCAATTTGGTCAGCTGTGATAGCTCAGGCTGTTGC  200

seq1  CACCCTGTGTTTCTAAAGAGACATCATGAGGGATATGTATAAGAGGGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGTGTTTCTAAAGAGACATCATGAGGGATATGTATAAGAGGGCTG  250

seq1  TAAGCAGATGAATTATTTATTGAGTAAAACTGGACTGTACATTCATTAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGATGAATTATTTATTGAGTAAAACTGGACTGTACATTCATTAGA  300

seq1  CACAATGACAGACACACCAAGGGTCCCTAACATTTATGAGGCTCCTACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATGACAGACACACCAAGGGTCCCTAACATTTATGAGGCTCCTACAT  350

seq1  ACTTAGTATATATGGCACTACCCATAAAAGATGCACATCTGAGCCCTTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGTATATATGGCACTACCCATAAAAGATGCACATCTGAGCCCTTAC  400

seq1  TATTAATTAAAACAATTAAATATTAATGTAGTCTCCCACTGGTGACACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAATTAAAACAATTAAATATTAATGTAGTCTCCCACTGGTGACACTC  450

seq1  ATGTATCCTTTTCTCAAGAAACATAAATGAAGCTCGTGGCTGGCTTCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATCCTTTTCTCAAGAAACATAAATGAAGCTCGTGGCTGGCTTCTCT  500

seq1  TCCCTTGTGTCTCACTGTGAGCTCAAATCCTTCCCATAAGCTGCATGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGTGTCTCACTGTGAGCTCAAATCCTTCCCATAAGCTGCATGGGT  550

seq1  TGAGTCCTTCCCCTGAATGGTCTCTGGTAGTGGTGGAGACTTCCAGACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCCTTCCCCTGAATGGTCTCTGGTAGTGGTGGAGACTTCCAGACAA  600

seq1  GGTAACATCTCTCAGGACTTATGAGAAGAGATGAAGGAACAACCCTCACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACATCTCTCAGGACTTATGAGAAGAGATGAAGGAACAACCCTCACC  650

seq1  ACAGAGCCGGCAGCTGAGTCAGTTCCAGCCATCTCAGGACTGGTTCTCCT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACAGAGCCGGCAGCTGAGTCAGTTCCAGCCATCTCA-GACTGGTTCTCCT  699

seq1  GAACGTATTTCCTTCTTCTGACCTCCTACCTTTCTCTACCTCCCTCTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTATTTCCTTCTTCTGACCTCCTACCTTTCTCTACCTCCCTCTTTG  749

seq1  TTCCTGGAACTGCCTGTCCCTCTAGCTATAGAAAGAGCAGCAGGAAGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGAACTGCCTGTCCCTCTAGCTATAGAAAGAGCAGCAGGAAGGAG  799

seq1  TTTGGCTCCCTTAAATCAC-TCTTTGGATCTACAAGAACACAGGCAGGGG  849
      ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTGGCTTCCTTAAATCACTTCTTTGGATCTACAAGAACACAGGCA-GGG  848

seq1  TGGGGTGGGGTGGGGG  865
      ||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGGGGTGGGGG  864