BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-141D01
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,883,548 - 68,084,124
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700040L02Rik
Upstream geneEgr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136
Downstream geneEG665342, Tmem26, A930033H14Rik, Rhobtb1, LOC100040182, Cdc2a, LOC100039696, EG382371, Ank3, LOC100039734
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-141D01.bB6Ng01-141D01.g
ACCDH939708DH939709
length1,131324
definitionDH939708|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141D01, 5' end.DH939709|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141D01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,082,996 - 68,084,124)(67,883,548 - 67,883,871)
sequence
gaattccaaagagctatggcaggaactttaggagaacaaaataaaatagc
actgggtccactggataaaatagacatgacagtgactggagagatggctc
agctattgagaactcttgttgctcttccagaggacctggattcagtttcc
agcatctataatggaaggctaaggatcacctatagctccagcacaggaat
ccaatagcatcttctggcctcttcagataatcctatacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacaccatgcacattaacactgttt
taagattatgagagagtctatagtgacagaaattaatgaccaaaggaatc
agtagcaagatatgtcaccctcacagaagcattacagatgtgaatgtaga
tactcaactggcaagaggggagcatgccccacccccagtcattcaatgta
aagagattttcattcaaggagcacattatgtaaagagaggaaagaagagc
tccatagtaaagaatcctgacaactaaatacaatcataagtcacatagct
gaaaggtacccttgatatggcatcttgaaaatgctaccttatctctgtgg
acttactcctccaactcatcctttgtcatgaggagaagcatcggaaatct
caattgagaatcatcctataacacgcctcactagaaccgccaaggtcatt
gggtaaaggaaaatgtgagagtctgtcacagtaaataaggagcccacaga
cacattaccatagaatccactgtggtgtcccttacagatagatagaatat
acatatacacatacatatacatacatacacattcatacatatatgtgtgt
atatataccctgtttgtactacacttctgtctgtctataggttctagatt
cttatgacctttgggactacatggctgactttgaggaactaatgaatcca
tgaaacagcagccagctggaaaatgagagacaattttggtttgtttatgc
cactgagttatctaatgcctatgctaagttcggccaatcccatgtcagaa
tatcttaaaaaataatgttctaatttggtacattcaaaatggagaaattt
gggatccaaaggagagcctttttctaacctc
attttatggtttggggtgtccaccaggacatgagtcctgtattaaagggt
tacagagttaggaaggctgagaagcactgctctagagcataagctgtcct
ggatgcaagcagcaaacaagagcatatggttaactcttaccataggtttt
catctcagtccctattagaatatacctgctgttcaaattttaaggcacct
tgagacaatctttaatggcatgccttttttttgtggcaattggtttgtgt
gtgtgtgtttgtgtgtgtgtacacacgcatgtatggatatgtgtatgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgcaaacacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_68082996_68084124
seq2: B6Ng01-141D01.b_46_1176 (reverse)

seq1  GAGGTTAGAAAAAGGC-CTCCTTTGGGT-CCAAGATCCTCCATATTTGAT  48
      |||||||||||||||| ||||||||| | ||||  | |||||| ||||| 
seq2  GAGGTTAGAAAAAGGCTCTCCTTTGGATCCCAAATTTCTCCAT-TTTGAA  49

seq1  GTTACCAAA-TAGGACATTTATTTTTTAGATATCTGGACATGGGATTGGG  97
        ||||||| ||| |||||  ||||| ||||||   ||||||||||| ||
seq2  TGTACCAAATTAGAACATTATTTTTTAAGATATTCTGACATGGGATT-GG  98

seq1  CCGCACGTAGCCTAGGCATTAGAT-ACTCAGTGGCATAAACAAAACAAAA  146
      ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCGAACTTAGCATAGGCATTAGATAACTCAGTGGCATAAACAAACCAAAA  148

seq1  ATGTGTCTCTCATTTTCCAGCTGGCTGCTGCTTCATGAATTCCTTAGTTC  196
         ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||
seq2  --TTGTCTCTCATTTTCCAGCTGGCTGCTGTTTCATGGATTCATTAGTTC  196

seq1  CTCAAAGTCAG-CATGTAGTCCCAAAGGTCATATGAATCTAGAACCTATA  245
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGTCAGCCATGTAGTCCCAAAGGTCATAAGAATCTAGAACCTATA  246

seq1  GACAGACAGAAGTGTAGTACAAACA-GGTATATATACACACATATATGTA  294
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACAGAAGTGTAGTACAAACAGGGTATATATACACACATATATGTA  296

seq1  TGAATGTGTATGTATGTATATGTATGTGTATATGTATATTCTATCTATCT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTGTATGTATGTATATGTATGTGTATATGTATATTCTATCTATCT  346

seq1  GTAAGGGACACCACAGTGGATTCTATGGTAATGTGTCTGTGGGCTCCTTA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGGACACCACAGTGGATTCTATGGTAATGTGTCTGTGGGCTCCTTA  396

seq1  TTTACTGTGACAGACTCTCACATTTTCCTTTACCCAATGACCTTGGCGGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGTGACAGACTCTCACATTTTCCTTTACCCAATGACCTTGGCGGT  446

seq1  TCTAGTGAGGCGTGTTATAGGATGATTCTCAATTGAGATTTCCGATGCTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTGAGGCGTGTTATAGGATGATTCTCAATTGAGATTTCCGATGCTT  496

seq1  CTCCTCATGACAAAGGATGAGTTGGAGGAGTAAGTCCACAGAGATAAGGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCATGACAAAGGATGAGTTGGAGGAGTAAGTCCACAGAGATAAGGT  546

seq1  AGCATTTTCAAGATGCCATATCAAGGGTACCTTTCAGCTATGTGACTTAT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTTCAAGATGCCATATCAAGGGTACCTTTCAGCTATGTGACTTAT  596

seq1  GATTGTATTTAGTTGTCAGGATTCTTTACTATGGAGCTCTTCTTTCCTCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTATTTAGTTGTCAGGATTCTTTACTATGGAGCTCTTCTTTCCTCT  646

seq1  CTTTACATAATGTGCTCCTTGAATGAAAATCTCTTTACATTGAATGACTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACATAATGTGCTCCTTGAATGAAAATCTCTTTACATTGAATGACTG  696

seq1  GGGGTGGGGCATGCTCCCCTCTTGACAGTTGAGTATCTACATTCACATCT  744
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGGGGCATGCTCCCCTCTTGCCAGTTGAGTATCTACATTCACATCT  746

seq1  GTAATGCTTCTGTGAGGGTGACATATCTTGCTACTGATTCCTTTGGTCAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGCTTCTGTGAGGGTGACATATCTTGCTACTGATTCCTTTGGTCAT  796

seq1  TAATTTCTGTCACTATAGACTCTCTCATAATCTTAAAACAGTGTTAATGT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCTGTCACTATAGACTCTCTCATAATCTTAAAACAGTGTTAATGT  846

seq1  GCATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTA  896

seq1  TAGGATTATCTGAAGAGGCCAGAAGATGCTATTGGATTCCTGTGCTGGAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTATCTGAAGAGGCCAGAAGATGCTATTGGATTCCTGTGCTGGAG  946

seq1  CTATAGGTGATCCTTAGCCTTCCATTATAGATGCTGGAAACTGAATCCAG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGGTGATCCTTAGCCTTCCATTATAGATGCTGGAAACTGAATCCAG  996

seq1  GTCCTCTGGAAGAGCAACAAGAGTTCTCAATAGCTGAGCCATCTCTCCAG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTGGAAGAGCAACAAGAGTTCTCAATAGCTGAGCCATCTCTCCAG  1046

seq1  TCACTGTCATGTCTATTTTATCCAGTGGACCCAGTGCTATTTTATTTTGT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTCATGTCTATTTTATCCAGTGGACCCAGTGCTATTTTATTTTGT  1096

seq1  TCTCCAAAAGTTCCTGCCATAGCTCTTTGGAATTC  1129
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTAAAGTTCCTGCCATAGCTCTTTGGAATTC  1131

seq1: chr10_67883548_67883871
seq2: B6Ng01-141D01.g_73_396

seq1  ATTTTATGGTTTGGGGTGTCCACCAGGACATGAGTCCTGTATTAAAGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATGGTTTGGGGTGTCCACCAGGACATGAGTCCTGTATTAAAGGGT  50

seq1  TACAGAGTTAGGAAGGCTGAGAAGCACTGCTCTAGAGCATAAGCTGTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGTTAGGAAGGCTGAGAAGCACTGCTCTAGAGCATAAGCTGTCCT  100

seq1  GGATGCAAGCAGCAAACAAGAGCATATGGTTAACTCTTACCATAGGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCAAGCAGCAAACAAGAGCATATGGTTAACTCTTACCATAGGTTTT  150

seq1  CATCTCAGTCCCTATTAGAATATACCTGCTGTTCAAATTTTAAGGCACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAGTCCCTATTAGAATATACCTGCTGTTCAAATTTTAAGGCACCT  200

seq1  TGAGACAATCTTTAATGGCATGCCTTTTTTTTGTGGCAATTGGTTTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACAATCTTTAATGGCATGCCTTTTTTTTGTGGCAATTGGTTTGTGT  250

seq1  GTGTGTGTTTGTGTGTGTGTACACACGCATGTATGGATATGTGTATGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTTTGTGTGTGTGTACACACGCATGTATGGATATGTGTATGTGT  300

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGCATACACAT  324
      ||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGCAAACACAT  324