BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150I07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 86,329,629 - 86,479,649
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStab2
Upstream genePwp1, Prdm4, Ascl4, D10Wsu52e, Bpil2, Fbxo7, Syn3, Timp3, EG627035, LOC672902, LOC100041419, EG382395, Hsp90b1, Nt5dc3, Fabp3-ps1, C630002B14Rik
Downstream gene1700113H08Rik, Ascl1, Pah, LOC100041517, ENSMUSG00000058934, Igf1, Tyms-ps
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150I07.bB6Ng01-150I07.g
ACCDH946577DH946578
length1,1391,135
definitionDH946577|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150I07, 5' end.DH946578|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150I07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,478,516 - 86,479,649)(86,329,629 - 86,330,775)
sequence
gaattcattgccatccacttcattatttaacagacaaaggctccaggact
tcagtacttaagatatctgtgtacatgagacagaatcagctctcaggctc
tgattttctccaatgtgatcatagaaattccctctgtttctctgacaatc
aatgtcacctaggaaagaaggtgttcgggagctgacttatgtttgtagca
ctttgagagaaaaagcccttctagtgagtgagtgctcagcatatgcctca
ccagaaagaggtcacgtgtccacaaagaggtgtgcacacatggaggcagg
aacttcctcaaaatgtgtgcatgacccagtacaacccacttacacacaca
cacacacacacgcacatgcacacacatacattccacacctcccagggaac
cctgccctgtccctgttcaaagacaacttccctttgttgacagcaattgt
gccagctgagcgactcttttgagtcacacaacaaaaaggcttgcaaagag
gcagctttcaagacctaatctatggtgaagaccaccccttccagacaagt
agggtggctgtcagctgccagccacattccagggatgggaggcagtatgt
gccctctgcccagagccacctcagccccacccaataaagggcaaggcctg
catcccacagacaacattcctccgccgtacagctgcgccgtgtttcaaca
cgccccattgtactgctgatttaatgaggcctctacgacactgggtttgg
agaccgtcatcaggttgccaaagctcgagacacttgagcttcttgggttc
ctctatctgagaattctgggccattagtgaacatattttaaaataagcac
aataataataacccctttacagacaagtgggactttgttaattctctcct
tgtccaaactaagagtataatagcaaacagagcacccactttgcagacat
aagccagcttcaactctgcaacatgctagctgggaaaattttctgaacga
ccattaaactttcaatttcttcagctgtagaatgaaccttgctaacctca
tcctttcttaaaagaaccactagaagaagctgagttacaaaacaaaacag
caacaaatgacagaaaacccccctcaaattattcagtcc
gaattccaggggtgtcagatgcttcttagccactcctgaaggcagtgaca
gaaaaggagcttgctataatgtaaaacaaaagcaatgccccaaacacctc
aagacacctgaatgcctctcagaatgggaacggttagggaacagcctcca
tgtcatggggtccaccctcacccccaagatattcacaatggagaacagcc
ttcatggtatgtgatcaccatcacttttcctgtcatgtgatcaccctcac
cccatgacactcacgacatcactgccagttccacacctcacactcagctc
ggaaccctgcagggtcttccaggaagcagacctggggaggtctgaagcta
aagcctgagggagagaggaagccctgttaatacctgcattaggactgaag
ggccagagctcctgtaccagcaaaccgaactcaaatgggtaacacaaaat
ttcctacatgttttaataactcaagctgaagcaacagagaatgtaagcaa
aggtgaggtatgcccatgactttccaggggtggagcttccttcttcaggg
acggtctatgagggctgggcatccgtgcttgggctgcctaggtgtatgaa
gacaacgagaagatgagtggagttagctggaaaatggttcagggcatctc
tgtggcctgaaatgtgctcctttaaaagttatatgagctagtcatggtgg
cacacacctttaatcccaacattcaggaggtagaggcaggcagacctctg
agtttaaggctagtttagtcttgtctactcagtgtgatacaagctagcca
tgactatgtagtgagaccccgtttcaagaaaacaaaacaaaacaaaaaaa
taaatctatataaaacttgaccccaatgaccttagaatatgaccttattt
ggggagcaatatagttaatagtaggggcaagatgaaaataatccttagag
taggttgagccctttatacaatataaatgatgcccttagaagaggaggtt
gccatggggacattggagaacagggaagatgctggtggaagataaaggcc
gattgcctgatgccacctacagctaaggaaccatgggcttgcctgaaaca
tgagcagcaggaacttaggaacagactcttcgaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_86478516_86479649
seq2: B6Ng01-150I07.b_45_1183 (reverse)

seq1  GGACTGGATAATATTGAGGGGG--TCTCTGTCATTTTGTTTGCTTGTTTG  48
      |||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||   |||||  ||||
seq2  GGACTGAATAAT-TTGAGGGGGGTTTTCTGTCATTT--GTTGCTGTTTTG  47

seq1  TTTTGTAACTCAGCT--CTCTGGTGGTCCTTTAAGGAA--GATGAGGTTA  94
      |||||||||||||||   ||| ||||| |||| | |||  ||||||||||
seq2  TTTTGTAACTCAGCTTCTTCTAGTGGTTCTTTTAAGAAAGGATGAGGTTA  97

seq1  GCAA-GTTCATCTTACAGCTG-AGGAATTG-AAGTTTAAT-GTCGTTCAG  140
      |||| ||||||  |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GCAAGGTTCATTCTACAGCTGAAGAAATTGAAAGTTTAATGGTCGTTCAG  147

seq1  AAAATTCTCCCAGCTAGCATGTTGCAGAGTTGAAGCTGGCTTATGTCTGC  190
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTCCCAGCTAGCATGTTGCAGAGTTGAAGCTGGCTTATGTCTGC  197

seq1  AAAGTGGGTGCTCTGTTTGCTATTAATACTCCTTAGTTTGGACAAGGAGA  240
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGGGTGCTCTGTTTGCTATT-ATACT-CTTAGTTTGGACAAGGAGA  245

seq1  GAATTAACAAAGTCCCACTTGTCTGTAAAGGGGTTATTATTATTGTGCTT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTAACAAAGTCCCACTTGTCTGTAAAGGGGTTATTATTATTGTGCTT  295

seq1  ATTTTAAAATATGTTCACTAATGGCCCAGAATTCTCAGATAGAGGAACCC  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAAATATGTTCACTAATGGCCCAGAATTCTCAGATAGAGGAACCC  345

seq1  AAGAAGCTCAAGTGTCTCGAGCTTTGGCAACCTGATGACGGTCTCCAAAC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGCTCAAGTGTCTCGAGCTTTGGCAACCTGATGACGGTCTCCAAAC  395

seq1  CCAGTGTCGTAGAGGCCTCATTAAATCAGCAGTACAATGGGGCGTGTTGA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGTCGTAGAGGCCTCATTAAATCAGCAGTACAATGGGGCGTGTTGA  445

seq1  AACACGGCGCAGCTGTACGGCGGAGGAATGTTGTCTGTGGGATGCAGGCC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACGGCGCAGCTGTACGGCGGAGGAATGTTGTCTGTGGGATGCAGGCC  495

seq1  TTGCCCTTTATTGGGTGGGGCTGAGGTGGCTCTGGGCAGAGGGCACATAC  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCTTTATTGGGTGGGGCTGAGGTGGCTCTGGGCAGAGGGCACATAC  545

seq1  TGCCTCCCATCCCTGGAATGTGGCTGGCAGCTGACAGCCACCCTACTTGT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCCATCCCTGGAATGTGGCTGGCAGCTGACAGCCACCCTACTTGT  595

seq1  CTGGAAGGGGTGGTCTTCACCATAGATTAGGTCTTGAAAGCTGCCTCTTT  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGGGGTGGTCTTCACCATAGATTAGGTCTTGAAAGCTGCCTCTTT  645

seq1  GCAAGCCTTTTTGTTGTGTGACTCAAAAGAGTCGCTCAGCTGGCACAATT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCCTTTTTGTTGTGTGACTCAAAAGAGTCGCTCAGCTGGCACAATT  695

seq1  GCTGTCAACAAAGGGAAGTTGTCTTTGAACAGGGACAGGGCAGGGTTCCC  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCAACAAAGGGAAGTTGTCTTTGAACAGGGACAGGGCAGGGTTCCC  745

seq1  TGGGAGGTGTGGAATGTATGTGTGTGCATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTG  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGTGTGGAATGTATGTGTGTGCATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTG  795

seq1  TGTAAGTGGGTTGTACTGGGTCATGCACACATTTTGAGGAAGTTCCTGCC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTGGGTTGTACTGGGTCATGCACACATTTTGAGGAAGTTCCTGCC  845

seq1  TCCATGTGTGCACACCTCTTTGTGGACACGTGACCTCTTTCTGGTGAGGC  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGTGTGCACACCTCTTTGTGGACACGTGACCTCTTTCTGGTGAGGC  895

seq1  ATATGCTGAGCACTCACTCACTAGAAGGGCTTTTTCTCTCAAAGTGCTAC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCTGAGCACTCACTCACTAGAAGGGCTTTTTCTCTCAAAGTGCTAC  945

seq1  AAACATAAGTCAGCTCCCGAACACCTTCTTTCCTAGGTGACATTGATTGT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATAAGTCAGCTCCCGAACACCTTCTTTCCTAGGTGACATTGATTGT  995

seq1  CAGAGAAACAGAGGGAATTTCTATGATCACATTGGAGAAAATCAGAGCCT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAAACAGAGGGAATTTCTATGATCACATTGGAGAAAATCAGAGCCT  1045

seq1  GAGAGCTGATTCTGTCTCATGTACACAGATATCTTAAGTACTGAAGTCCT  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCTGATTCTGTCTCATGTACACAGATATCTTAAGTACTGAAGTCCT  1095

seq1  GGAGCCTTTGTCTGTTAAATAATGAAGTGGATGGCAATGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCTTTGTCTGTTAAATAATGAAGTGGATGGCAATGAATTC  1139

seq1: chr10_86329629_86330775
seq2: B6Ng01-150I07.g_68_1202

seq1  GAATTCCAGGGGTGTCAGATGCTTCTTAGCCACTCCTGAAGGCAGTGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGGGTGTCAGATGCTTCTTAGCCACTCCTGAAGGCAGTGACA  50

seq1  GAAAAGGAGCTTGCTATAATGTAAAACAAAAGCAATGCCCCAAACACCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGAGCTTGCTATAATGTAAAACAAAAGCAATGCCCCAAACACCTC  100

seq1  AAGACACCTGAATGCCTCTCAGAATGGGAACGGTTAGGGAACAGCCTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACACCTGAATGCCTCTCAGAATGGGAACGGTTAGGGAACAGCCTCCA  150

seq1  TGTCATGGGGTCCACCCTCACCCCCAAGATATTCACAATGGAGAACAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATGGGGTCCACCCTCACCCCCAAGATATTCACAATGGAGAACAGCC  200

seq1  TTCATGGTATGTGATCACCATCACTTTTCCTGTCATGTGATCACCCTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGGTATGTGATCACCATCACTTTTCCTGTCATGTGATCACCCTCAC  250

seq1  CCCATGACACTCACGACATCACTGCCAGTTCCACACCTCACACTCAGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGACACTCACGACATCACTGCCAGTTCCACACCTCACACTCAGCTC  300

seq1  GGAACCCTGCAGGGTCTTCCAGGAAGCAGACCTGGGGAGGTCTGAAGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCTGCAGGGTCTTCCAGGAAGCAGACCTGGGGAGGTCTGAAGCTA  350

seq1  AAGCCTGAGGGAGAGAGGAAGCCCTGTTAATACCTGCATTAGGACTGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGAGGGAGAGAGGAAGCCCTGTTAATACCTGCATTAGGACTGAAG  400

seq1  GGCCAGAGCTCCTGTACCAGCAAACCGAACTCAAATGGGTAACACAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGAGCTCCTGTACCAGCAAACCGAACTCAAATGGGTAACACAAAAT  450

seq1  TTCCTACATGTTTTAATAACTCAAGCTGAAGCAACAGAGAATGTAAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTACATGTTTTAATAACTCAAGCTGAAGCAACAGAGAATGTAAGCAA  500

seq1  AGGTGAGGTATGCCCATGACTTTCCAGGGGTGGAGCTTCCTTCTTCAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAGGTATGCCCATGACTTTCCAGGGGTGGAGCTTCCTTCTTCAGGG  550

seq1  ACGGTCTATGAGGGCTGGGCATCCGTGCTTGGGCTGCCTAGGTGTATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGTCTATGAGGGCTGGGCATCCGTGCTTGGGCTGCCTAGGTGTATGAA  600

seq1  GACAACGAGAAGATGAGTGGAGTTAGCTGGAAAATGGTTCAGGGCATCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACGAGAAGATGAGTGGAGTTAGCTGGAAAATGGTTCAGGGCATCTC  650

seq1  TGTGGCCTGAAATGTGCTCCTTTAAAAGTTATATGAGCTAGTCATGGTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCCTGAAATGTGCTCCTTTAAAAGTTATATGAGCTAGTCATGGTGG  700

seq1  CACACACCTTTAATCCCAACATTCAGGAGGTAGAGGCAGGCAGACCTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACCTTTAATCCCAACATTCAGGAGGTAGAGGCAGGCAGACCTCTG  750

seq1  AGTTTAAGGCTAGTTTAGTCTTGTCTACTCAGTGTGATACAAGCTAGCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAAGGCTAGTTTAGTCTTGTCTACTCAGTGTGATACAAGCTAGCCA  800

seq1  TGACTATGTAGTGAGACCCCGTTTCAAGAAAACAAAAACAAAACAAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGACTATGTAGTGAGACCCCGTTTCAAGAAAAC-AAAACAAAACAAAAAA  849

seq1  ATAAATCTATATAAAACTTTGACCCCAATGACCTTAGAATATGACCTTAT  900
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATCTATATAAAAC-TTGACCCCAATGACCTTAGAATATGACCTTAT  898

seq1  TT-GGGAGCAAATATAGTTAATAGTA-GGGCAAGATG-AAATAATCC-TA  946
      || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||
seq2  TTGGGGAGC-AATATAGTTAATAGTAGGGGCAAGATGAAAATAATCCTTA  947

seq1  GAGTAGGGTGAGCCCTTAATACAATATAAATGATGCCCTTAGAAGAGGAG  996
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGGTTGAGCCCTTTATACAATATAAATGATGCCCTTAGAAGAGGAG  997

seq1  GTTGCCATGGGGGACATT-GAGACACAGGGAAGGATGGCTGTGGGAAGAT  1045
      |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  |||||||
seq2  GTTGCCAT-GGGGACATTGGAGA-ACAGGGAA-GAT-GCTGGTGGAAGAT  1043

seq1  AAAGGCAGATTGCATGGATG-CACCTACAAGCTAAGGAACACCAGGGGC-  1093
      |||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||| |||| 
seq2  AAAGGCCGATTGCCT-GATGCCACCTAC-AGCTAAGGA--ACCATGGGCT  1089

seq1  TGCCAGAAACCATGAGCAGCCAGGGGAGACTTAGGGAACAGACATCTTCA  1143
      |||| |||| ||||||||| ||||    ||||| ||||||||| ||||| 
seq2  TGCCTGAAA-CATGAGCAG-CAGG---AACTTA-GGAACAGAC-TCTTC-  1131

seq1  GAAG  1147
      ||||
seq2  GAAG  1135