BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151H09
Chromosome10 (Build37)
Map Location 66,915,487 - 66,997,312
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2
Downstream geneEgr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136, 1700040L02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151H09.bB6Ng01-151H09.g
ACCDH947273DH947274
length1,2121,173
definitionDH947273|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151H09, 5' end.DH947274|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151H09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,915,487 - 66,916,733)(66,996,135 - 66,997,312)
sequence
gaattcagagtcccacacagtctgttccaaaagaagccagctttggccac
ccaccctcaataagctaaaagagtcaagtgaataataaaacgctgaaaag
aatttatttaaccgtgccacatcgggaaggcagacagagacccagtgacc
cccctagttcattttttgaggtcctgaagtaaagttaaaacattgagaga
ggactaggaatacaagtgttccctgtcaaggtgtggttctacccaccatt
aacccatgattgtctctgcaaggttatgtctcaatcctgattgaagagtt
tctgagaggagttctttgagcccgttgttctaatggtctgacagccataa
agcctcttcatgacacatgcctctctgccaggcagggtggatacagcatt
ggacattttccatgggcgctaactctcagacacagctcatatgcctgcaa
agttgcacttcactacctgagccttttcctcagaccccgtagaccgtatt
ttcttccattcttcaattgttggacactctgtgaaccgtgtgacagtaaa
cactcctcaaagatcactgagatccgttcacttggagtcctttcagtggc
acccagaagtggtagagttaggtcctgtagttacagttatgtttagtttg
tgggtttgttttgttatgaggaacctgaggtctcacagcttcctaacttc
ccaggaagccttcctgaaccagttataatttttgccttcattaaattgaa
atgataaggttgttaatgacatcgtagaacaaatgtttattcatttgttt
atgtgtgagttatatgcatgactgtgcacataggtgtgtgtgtccatttc
agtgagcctggctgaacactgagcccccctcccacttcccccagtgctgg
ggttacaggtggccagggagatgccaggcttgatgtgaatgatgggtttc
tcagacataggcatcagcactttatctacagcagctccacaccctaaggt
ggggggaccctatttatgatcatgtatccagttccagagaatacaataat
ggagttcatttagctacatttggttaccactattatcccatgttaccatg
ttgtagttgggtgaattgacaagggaaaaagaacactcccttagcttagc
aagagctcatggaatacaagctatcactttgaattgcaagttccattgga
tctgcagctggg
gaattccaatgtagcgactctgcagacctgttccagggaaggaatgacca
agcatattaatgctgctgtcttaagagaacccaaccccatggtatccttc
ctggaggcaaggaggggtaagaggaaggcagggggtgtgattctgttcta
cggagaggaagaaccctgagatgtgggagtggaataccaaggtgagacca
ggattccctactttggagcatttgaactgttagtgtttagataaaaatgc
aacaaacaaatgacgagagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagagttgtcactacatgtgaataagacactccaaaagat
atcaagtcaggaacaatttgctgccagactcatttgctttttccagagga
ggtcaaaaaaaacccaggagattcctttgatgcaggctgcctgggatgag
ggtaaagtagcactgtgggcagttgggagatggctagaaggtcctaagga
atgccttgtcagggtggttttggactttctttcggtcggtctcgtagctg
ttctacaaagtgtgttaacaggatgatggttactcaagagacacgtcaaa
tgatttaccacatgcattttgatgtgccaagaaacgtgtttggatatctt
cacatgtgatgtcattttcctcccacctgcgactgctggtgggagaatgg
gagatgcagccaaggttagcatcccccttaaccatagacgcaagcaagga
ccagatctgcaattctgatggcacaaagcacgtgggctttaaaaaccaga
caaatgctaactgacaaatagctccccacacctagtatctcaggacaaac
ttgaggacctatgggtttttagctgagctcatgctatgcctgacagagct
gtggagccaaagttaatgacatcccagtggcatagatatatggacagacc
cttagaccatattttcgaagatgtatcagtactgtttcaagcagtggatg
ggcagagtcttaaaacctatttcttgatgatcaaccgtggattcagcatt
gtgcttacacttctgaggatatgaatgtacctagaccaggtccagctccg
attcccatcgagtttgtccagcccatactcaaggaacccataccgtggct
gtgattgctccaacaacaatatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_66915487_66916733
seq2: B6Ng01-151H09.b_48_1259

seq1  GAATTCAGAGTCCCACACAGTCTGTTCCAAAAGAAGCCAGCTTTGGCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGTCCCACACAGTCTGTTCCAAAAGAAGCCAGCTTTGGCCAC  50

seq1  CCACCCTCAATAAGCTAAAAGAGTCAAGTGAATAATAAAACGCTGAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCTCAATAAGCTAAAAGAGTCAAGTGAATAATAAAACGCTGAAAAG  100

seq1  AATTTATTTAACCGTGCCACATCGGGAAGGCAGACAGAGACCCAGTGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATTTAACCGTGCCACATCGGGAAGGCAGACAGAGACCCAGTGACC  150

seq1  CCCCTAGTTCATTTTTTGAGGTCCTGAAGTAAAGTTAAAACATTGAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTAGTTCATTTTTTGAGGTCCTGAAGTAAAGTTAAAACATTGAGAGA  200

seq1  GGACTAGGAATACAAGTGTTCCCTGTCAAGGTGTGGTTCTACCCACCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGGAATACAAGTGTTCCCTGTCAAGGTGTGGTTCTACCCACCATT  250

seq1  AACCCATGATTGTCTCTGCAAGGTTATGTCTCAATCCTGATTGAAGAGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCATGATTGTCTCTGCAAGGTTATGTCTCAATCCTGATTGAAGAGTT  300

seq1  TCTGAGAGGAGTTCTTTGAGCCCGTTGTTCTAATGGTCTGACAGCCATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAGGAGTTCTTTGAGCCCGTTGTTCTAATGGTCTGACAGCCATAA  350

seq1  AGCCTCTTCATGACACATGCCTCTCTGCCAGGCAGGGTGGATACAGCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTTCATGACACATGCCTCTCTGCCAGGCAGGGTGGATACAGCATT  400

seq1  GGACATTTTCCATGGGCGCTAACTCTCAGACACAGCTCATATGCCTGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATTTTCCATGGGCGCTAACTCTCAGACACAGCTCATATGCCTGCAA  450

seq1  AGTTGCACTTCACTACCTGAGCCTTTTCCTCAGACCCCGTAGACCGTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCACTTCACTACCTGAGCCTTTTCCTCAGACCCCGTAGACCGTATT  500

seq1  TTCTTCCATTCTTCAATTGTTGGACACTCTGTGAACCGTGTGACAGTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCATTCTTCAATTGTTGGACACTCTGTGAACCGTGTGACAGTAAA  550

seq1  CACTCCTCAAAGATCACTGAGATCCGTTCACTTGGAGTCCTTTCAGTGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTCAAAGATCACTGAGATCCGTTCACTTGGAGTCCTTTCAGTGGC  600

seq1  ACCCAGAAGTGGTAGAGTTAGGTCCTGTAGTTACAGTTATGTTTAGTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGAAGTGGTAGAGTTAGGTCCTGTAGTTACAGTTATGTTTAGTTTG  650

seq1  TGGGTTTGTTTTGTTATGAGGAACCTGAGGTCTCACAGCTTCCTAACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTTGTTTTGTTATGAGGAACCTGAGGTCTCACAGCTTCCTAACTTC  700

seq1  CCAGGAAGCCTTCCTGAACCAGTTATAATTTTTGCCTTCATTAAATTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAGCCTTCCTGAACCAGTTATAATTTTTGCCTTCATTAAATTGAA  750

seq1  ATGATAAGGTTGTTAATGACATCGTAGGAACAAATGTTTATTCATTTGTT  800
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAAGGTTGTTAATGACATCGTA-GAACAAATGTTTATTCATTTGTT  799

seq1  TATGTGTGAGTTATATGCATGACTGTGCACATAGGTGTGTGTGTCCATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTGAGTTATATGCATGACTGTGCACATAGGTGTGTGTGTCCATTT  849

seq1  CAGTGAGCCTGGCTGAACACTGAGCCCCCCTCCCACTTCCCCCAGTGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGAGCCTGGCTGAACACTGAGCCCCCCTCCCACTTCCCCCAGTGCTG  899

seq1  GGGTTACAGGTGGCCAGGGAGATGCCAGGCTTGATGTGAATGATGGGTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTACAGGTGGCCAGGGAGATGCCAGGCTTGATGTGAATGATGGGTTT  949

seq1  CTCAGACATAGGCATCAAGCACTTTATCTACCAAGCCAGCTCCACAACCC  1000
      |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||
seq2  CTCAGACATAGGCATC-AGCACTTTATCTAC--AG-CAGCTCCAC-ACCC  994

seq1  TAAGGTGGGGGGACCCTATTTATGAATCAATGTATCCAGTTCCAGGAGAA  1050
      |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TAAGGTGGGGGGACCCTATTTATG-ATC-ATGTATCCAGTTCCA-GAGAA  1041

seq1  TAACAATAAATGAGTTCAATTATAGCTACATTTGGTTACCACTATTATTC  1100
      | |||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  T-ACAATAATGGAGTTCA--TTTAGCTACATTTGGTTACCACTATTA-TC  1087

seq1  CCATGTTACCATGTTTGTAGGTTGGGTGGATTGACAGGTGAAAAAAGAAC  1150
      ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||
seq2  CCATGTTACCATG-TTGTA-GTTGGGTGAATTGACAAG-GGAAAAAGAAC  1134

seq1  A-TCCCTTATAGCTGTAGCAAGATGTCACAATGAATTACAAAAGTACTAT  1199
      | |||||  ||||| ||||||||  ||   ||| | |||||     ||||
seq2  ACTCCCT--TAGCT-TAGCAAGAGCTC---ATGGAATACAA----GCTAT  1174

seq1  CCCAACTTTTGGATTGGCCAAGTCTCCAATTTGGAATCTGCAGCTGGG  1247
      | |    |||| ||||  ||||| ||||  |||| |||||||||||||
seq2  CAC----TTTGAATTG--CAAGT-TCCA--TTGG-ATCTGCAGCTGGG  1212

seq1: chr10_66996135_66997312
seq2: B6Ng01-151H09.g_69_1241 (reverse)

seq1  GATATTTTGTTTTGTTGGGAGCAAACACAGCCACCGTGATGGTGCCTTTG  50
      |||||    | ||||| ||||||| ||||||||| || ||||   | |||
seq2  GATAT----TGTTGTT-GGAGCAATCACAGCCACGGT-ATGGGTTCCTTG  44

seq1  AGTGATGTGCTGGACAAACTCGGTGGGATTCGGAGCTGGACCTGGGTCTA  100
      ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  AGT-ATGGGCTGGACAAACTCGATGGGAATCGGAGCTGGACCT-GGTCTA  92

seq1  GGTACCATCATATCCCTCAG-AGTGT-AGCAC-ATGCTGGAATCACGGTT  147
      |||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |  |||||||
seq2  GGTACATTCATAT-CCTCAGAAGTGTAAGCACAATGCTGAATCCACGGTT  141

seq1  GATCATCAAGAAATA-GTTTTAAGACTCTGCCCATCCACTGCTTGAACCA  196
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GATCATCAAGAAATAGGTTTTAAGACTCTGCCCATCCACTGCTTGAAACA  191

seq1  GTACTGATACATC-TCTGAAATATGGTCCTAAGGGTCTTGTCCATATTAT  245
      ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||
seq2  GTACTGATACATCTTCGAAAATATGGT-CTAAGGGTC-TGTCCATA-TAT  238

seq1  CTATGCCACTGGGATGTCATTAACTTTGGCTCCACAGCTCTGTCAGGCAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCACTGGGATGTCATTAACTTTGGCTCCACAGCTCTGTCAGGCAT  288

seq1  AGCATGAGCTCAGCT-AAAACCCATAGGTCCTCAAGTTTGTCCTGAGATA  344
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGAGCTCAGCTAAAAACCCATAGGTCCTCAAGTTTGTCCTGAGATA  338

seq1  CTAGGTGTGGGGAGCTATTTGTCAGTTAGCATTTGTCTGGTTTTTAAAGG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTAGGTGTGGGGAGCTATTTGTCAGTTAGCATTTGTCTGGTTTTTAAAGC  388

seq1  CCACGTGCTTTGTGCCATCAGAATTGCAGATCTGGTCCTTGCTTGCGTCT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGTGCTTTGTGCCATCAGAATTGCAGATCTGGTCCTTGCTTGCGTCT  438

seq1  ATGGTTAAGGGGGATGCTAACCTTGGCTGCATCTCCCATTCT-CCACCAG  493
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATGGTTAAGGGGGATGCTAACCTTGGCTGCATCTCCCATTCTCCCACCAG  488

seq1  CAGTCGCAGGTGGGAGGAAAATGACATCACATGTGAAGATATCCAAACAC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCGCAGGTGGGAGGAAAATGACATCACATGTGAAGATATCCAAACAC  538

seq1  GTTTCTTGGCACATCAAAATGCATGTGGTAAATCATTTGACGTGTCTCTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTTGGCACATCAAAATGCATGTGGTAAATCATTTGACGTGTCTCTT  588

seq1  GAGTAACCATCATCCTGTTAACACACTTTGTAGAACAGCTACGAGACCGA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAACCATCATCCTGTTAACACACTTTGTAGAACAGCTACGAGACCGA  638

seq1  CCGAAAGAAAGTCCAAAACCACCCTGACAAGGCATTCCTTAGGACCTTCT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAAAGAAAGTCCAAAACCACCCTGACAAGGCATTCCTTAGGACCTTCT  688

seq1  AGCCATCTCCCAACTGCCCACAGTGCTACTTTACCCTCATCCCAGGCAGC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCTCCCAACTGCCCACAGTGCTACTTTACCCTCATCCCAGGCAGC  738

seq1  CTGCATCAAAGGAATCTCCTGGGTTTTTTTTGACCTCCTCTGGAAAAAGC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATCAAAGGAATCTCCTGGGTTTTTTTTGACCTCCTCTGGAAAAAGC  788

seq1  AAATGAGTCTGGCAGCAAATTGTTCCTGACTTGATATCTTTTGGAGTGTC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGTCTGGCAGCAAATTGTTCCTGACTTGATATCTTTTGGAGTGTC  838

seq1  TTATTCACATGTAGTGACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCACATGTAGTGACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  888

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCATTTGTTTGTTGCATTTTTATCTAAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTCATTTGTTTGTTGCATTTTTATCTAAA  938

seq1  CACTAACAGTTCAAATGCTCCAAAGTAGGGAATCCTGGTCTCACCTTGGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACAGTTCAAATGCTCCAAAGTAGGGAATCCTGGTCTCACCTTGGT  988

seq1  ATTCCACTCCCACATCTCAGGGTTCTTCCTCTCCGTAGAACAGAATCACA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCACTCCCACATCTCAGGGTTCTTCCTCTCCGTAGAACAGAATCACA  1038

seq1  CCCCCTGCCTTCCTCTTACCCCTCCTTGCCTCCAGGAAGGATACCATGGG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTGCCTTCCTCTTACCCCTCCTTGCCTCCAGGAAGGATACCATGGG  1088

seq1  GTTGGGTTCTCTTAAGACAGCAGCATTAATATGCTTGGTCATTCCTTCCC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGTTCTCTTAAGACAGCAGCATTAATATGCTTGGTCATTCCTTCCC  1138

seq1  TGGAACAGGTCTGCAGAGTCGCTACATTGGAATTC  1178
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACAGGTCTGCAGAGTCGCTACATTGGAATTC  1173