BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-179A17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 103,712,483 - 103,862,431
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043277, 6430590A10Rik, Slc6a15, EG667697, LOC667701, EG627488, EG667692, EG667695, LOC100043292
Downstream geneLOC100042383, Tmtc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-179A17.bB6Ng01-179A17.g
ACCGA005871GA005872
length1,0741,175
definitionB6Ng01-179A17.b B6Ng01-179A17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,861,358 - 103,862,431)(103,712,483 - 103,713,641)
sequence
gaattcacacccaacgtttgctcagggtaccagctcagaccagagggaaa
ctgtgccactggtcaggtgtagattctggctgcctgagacccactggtcc
cagttactttcagtgttggggcagatgttttgtcctcctcacctctgatc
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tcctactcagtacctttcccttttctacctgatataaaaaggaagcacta
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cttgaaccattacatctggttaaatttgaccataaagatacattggaatc
taaggcagagtacaactgggcaggtcattatcacagtctttaaggcatca
tacaatcaggtttgaaatcctgaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_103861358_103862431
seq2: B6Ng01-179A17.b_40_1113 (reverse)

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      |||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||| ||||||||||||
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        ||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||| ||||||||
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      ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||
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      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTTTCTGAAAAATATTACATAAAGTTTAAAGAAAAACTTGAATCT  343

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCCAGTTTGTGGTAAGTTTATTCGAGTTTTAGAATTATGAGCTTTG  393

seq1  GGAGAATCTTTGTATACTTTTCTATGCAATTGTAAATGAAGTGTGTGACA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAATCTTTGTATACTTTTCTATGCAATTGTAAATGAAGTGTGTGACA  443

seq1  TTTCATTTTACTAAATAAAAAATACAACAATTTATCTCATGGGATAAATG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTTTACTAAATAAAAAATACAACAATTTATCTCATGGGATAAATG  493

seq1  TGACTTCATGCAAAGATGAAAAGTAGGCATACAAATGACATGACTGGATA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTCATGCAAAGATGAAAAGTAGGCATACAAATGACATGACTGGATA  543

seq1  GTTAGAAGTGGATATAAAATTGTTACTCAACTGAAAATCCCAATAATGAA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGAAGTGGATATAAAATTGTTACTCAACTGAAAATCCCAATAATGAA  593

seq1  AATATTTGTTTCTGATATTTCACAAAGTGGAAATCTTTAGAGAGATGCTG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTGTTTCTGATATTTCACAAAGTGGAAATCTTTAGAGAGATGCTG  643

seq1  TTGTCAAAGTTTATAGAAATAGTGTGGTCCTTTGTGTTTAAATTACTTAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAAAGTTTATAGAAATAGTGTGGTCCTTTGTGTTTAAATTACTTAT  693

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGATATGATTAATTATTGGCAGCTATGTTATTGTATTACCTAAGGAG  743

seq1  ATGTTTAAAAAGTTAAAATCTGCAGACCTTGGGGGTGAACTCTGTAAGCC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATTCCACAACATTCAGAGGAATATTCACCCCCAGGTACTCCAACACTCCC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCACAACATTCAGAGGAATATTCACCCCCAGGTACTCCAACACTCCC  843

seq1  AGGATCATAGGATCACAGCCAGGCCAACAACACCCAGAGGAATCTCCACT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCATAGGATCACAGCCAGGCCAACAACACCCAGAGGAATCTCCACT  893

seq1  CCCAAGCTCTCTAACATGCTCAGGATCTTAGGATCAGAGGTGAGGAGGAC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGCTCTCTAACATGCTCAGGATCTTAGGATCAGAGGTGAGGAGGAC  943

seq1  AAAACATCTGCCCCAACACTGAAAGTAACTGGGACCAGTGGGTCTCAGGC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATCTGCCCCAACACTGAAAGTAACTGGGACCAGTGGGTCTCAGGC  993

seq1  AGCCAGAATCTACACCTGACCAGTGGCACAGTTTCCCTCTGGTCTGAGCT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGAATCTACACCTGACCAGTGGCACAGTTTCCCTCTGGTCTGAGCT  1043

seq1  GGTACCCTGAGCAAACGTTGGGTGTGAATTC  1074
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACCCTGAGCAAACGTTGGGTGTGAATTC  1074


seq1: chr10_103712483_103713641
seq2: B6Ng01-179A17.g_60_1234

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGTCTTATAATATCATTTTTAATTTTATTTCTTATGGAATGCAATGT  100

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCAATTGTCATGAGTAATTCATTTTGGAATCAGAAACAACTCCTTC  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AAACCAACACTTGTACTTTCAAAAGCTCATTTTTCATAGAGGTTAGTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAACACTTGTACTTTCAAAAGCTCATTTTTCATAGAGGTTAGTAAT  250

seq1  ATGAAAATCATATTGTTTCTGAGGAAATCAAATATTAAAGCCCAGTTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTTTTAATTGGCAACTTTCATGTAGATACAGCTTTTTGATTAAAGTCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAATTGGCAACTTTCATGTAGATACAGCTTTTTGATTAAAGTCTAC  400

seq1  ATGTATTTCTTCCCAAAGGACTTTTCATGTACAAAGATGATTTGAATTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATTTCTTCCCAAAGGACTTTTCATGTACAAAGATGATTTGAATTCC  450

seq1  ACAAACCAGACATAGATTTTTAGTACTTATCAAAATGATTTGCTTTCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCAGACATAGATTTTTAGTACTTATCAAAATGATTTGCTTTCAGC  500

seq1  CATAGATTTAAAAATATTCCCAATATCTGAATAATTACTTTCATAACCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGATTTAAAAATATTCCCAATATCTGAATAATTACTTTCATAACCCA  550

seq1  AATTTGTCATTGTTTTATAACCAATTTTAATCATATAGGTAGGATATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTCATTGTTTTATAACCAATTTTAATCATATAGGTAGGATATGGA  600

seq1  AAGTGATTATATGAATATCTACACATATATGTTTATATGTGTATAGATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATTATATGAATATCTACACATATATGTTTATATGTGTATAGATAT  650

seq1  GCATAT-AATCACCCATTATATTTACATACATTATATATATATATATAAA  699
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATAAATCACCCATTATATTTACATACATTATATATATATATATAAA  700

seq1  CATATACACATATGCATATAAAATATATAGACTGAATATAATCAAGTGTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAAGTG-CCTGATGGATTAAGATGAAATATATTGTGATTAAGCTAATGTA  798
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGCCCTGATGGATTAAGATGAAATATATTGTGATTAAGCTAATGTA  800

seq1  CATAAAATAGCAACATAAAAGTG-ATTATGTCTTAATCATTTTAAAAGTT  847
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAATAGCAACATAAAAGTGAATTATGTCTTAATCATTTTAAAAGTT  850

seq1  ACTAAATAACATTGAAATTATTTATGTTCAAACTTTGAAATGATATATCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAAACTAAAATTTAAAGGTTGTATAAC-TTGTAATATAAAACACA  949

seq1  CACCTCAAAT-ATTAACACC-ATTTAATATTT--ATTTTCAATGT-GGCT  991
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||
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seq1  TTTTA-CCCAGCATT-CAGGAGAAATAG-TTTTCTACATATTAA--AATG  1036
      ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||
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seq1  GCT--GACCA-TACATCTGG-TAAAATTGAACATAAAGATACATTG--AA  1080
      |||   |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  | 
seq2  GCTTGAACCATTACATCTGGTTAAATTTGACCATAAAGATACATTGGAAT  1099

seq1  CTAAAGCAGAG-ACAAC--GGCA-GTCATTATACACCAGTCTTAAAGCAA  1126
      |||| |||||| |||||  |||| |||||||| || ||||||| |||  |
seq2  CTAAGGCAGAGTACAACTGGGCAGGTCATTAT-CA-CAGTCTTTAAGGCA  1147

seq1  CAATTTAAAAATCAGTGTTTGAAAATCCTGACA  1159
        ||   | |||||| ||||| |||||||||||
seq2  TCAT---ACAATCAG-GTTTG-AAATCCTGACA  1175


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