BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213C14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 100,090,022 - 100,230,577
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCsl, LOC100042246, Kitl, LOC100043208, LOC100043211, EG667532, LOC670007, LOC235966, LOC667556, LOC100043224, LOC100043227, LOC100043231, LOC100043235, LOC667580, LOC100043239, LOC100043242, LOC100043244, LOC667607, LOC100043247, EG213051, Tmtc3, 4930430F08Rik, 1700017N19Rik
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213C14.bB6Ng01-213C14.g
ACCGA030772GA030773
length6381,210
definitionB6Ng01-213C14.b B6Ng01-213C14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,090,022 - 100,090,659)(100,229,359 - 100,230,577)
sequence
gaattccaggcctagaagaaggattccaggccaactgggtaccaacttcc
gtgttagtcacatttctgtggtgataaacaccatgtctgagtcaacttat
caaagaaagaaggcatagtatggttagaaattgtccgtttagtggagaag
gatggaacattaagtgggggagaggagagatggggcagcttgctgtttga
tgtaagatgtggaacttactcatagagtgtcagtttgaacaaagccttgt
gaagaaatcgggctggctgaccatgctttctcgcctccttgtatacttag
ggcacaccaagggtcagcacaataaggaggatacttcagatacacgcact
gaaggaacaaacacacttgcattgtcaaagaaaaacttctgtgaacaaag
atagaggagtaaacaatgctttatatgtaacatgacacggaggctaagct
caactccccaaagggctggtgatgtgaagagctgggatgagggattgctg
aaccatctgctcctgctattggcttcactgaaaaacaaaacatgtgataa
aatggaaaccgctgtattctccccaccttgggcactgttacaactgcaga
agagaaagttaggctcggggctgcggggggggggggtg
gaattcagaaatcatccgcatatgtagcaagaaacattctgctcttagaa
tattaacaattaaaaaatcccgaggctccagaaataaagtaatggtgaag
agaagggaatactaattaccttgatttgacagtgccattctgtgagcctg
tgtgtaaacgtcactctgtactggatcaacatgaagaattaacacgtgtt
aaagaaagtaataaaatcagtcctaagactttaaacttacttttcctcaa
tggactcacatatttactaatcagaaatgggaattttgaagaaacgctat
agtcactaatattttaagaagcatgatcgcagtgtttcataaagatctgt
cagaagataggtttccatgttcagtctcaatctcttcatgatcacccaaa
catttctgtgtgatgtttgagcaggtcttctgaggttgtcaatggcagta
ttatgcaaatttaactttatcttttattgctaactattttcattgtatag
atggacccacttcagtctacctatggcaaaagaatgaaattattcagaga
aacataaacatcaagagaatataacttttaggagcaccataaacggggaa
gcctttaatatttagtagagatcattaagctactcttaataagataaaag
catgctgacatttacgaaagagagtctggtcttacctatacatagcattt
aatagaatacaacagttaaatactcttacaccttttagttgactaaccct
gcccctgacccccatgcttaccactcctgtccctcatcctcccacacttt
tccctattttaaccctttccattccagtcttctctccatccttggcttac
atctatgctagccttttgcagcacttagacacttccctcaaagccatccc
tttccagcttctggtctcctggggctttcccaagtctaagaaacagaatt
caagagtaaaggctatgatctgcttatgagagaaagcacacagtcttctt
aagactgaatgggctctatatctttttcagcttcatccctttacctacaa
gcataatttgtcacacccgagtaaattcccattgtgtatatgaaccacaa
ttcaatcatggatcatcagaccaagactgcccatgtctcgttattttaat
cgagatcattagtagatatggtaatgctcgttgtactagggttattcact
tgaggtaagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_100090022_100090659
seq2: B6Ng01-213C14.b_44_681

seq1  GAATTCCAGGCCTAGAAGAAGGATTCCAGGCCAACTGGGTACCAACTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCCTAGAAGAAGGATTCCAGGCCAACTGGGTACCAACTTCC  50

seq1  GTGTTAGTCACATTTCTGTGGTGATAAACACCATGTCTGAGTCAACTTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAGTCACATTTCTGTGGTGATAAACACCATGTCTGAGTCAACTTAT  100

seq1  CAAAGAAAGAAGGCATAGTATGGTTAGAAATTGTCCGTTTAGTGGAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAAGAAGGCATAGTATGGTTAGAAATTGTCCGTTTAGTGGAGAAG  150

seq1  GATGGAACATTAAGTGGGGGAGAGGAGAGATGGGGCAGCTTGCTGTTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAACATTAAGTGGGGGAGAGGAGAGATGGGGCAGCTTGCTGTTTGA  200

seq1  TGTAAGATGTGGAACTTACTCATAGAGTGTCAGTTTGAACAAAGCCTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGATGTGGAACTTACTCATAGAGTGTCAGTTTGAACAAAGCCTTGT  250

seq1  GAAGAAATCGGGCTGGCTGACCATGCTTTCTCGCCTCCTTGTATACTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAATCGGGCTGGCTGACCATGCTTTCTCGCCTCCTTGTATACTTAG  300

seq1  GGCACACCAAGGGTCAGCACAATAAGGAGGATACTTCAGATACACGCACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACACCAAGGGTCAGCACAATAAGGAGGATACTTCAGATACACGCACT  350

seq1  GAAGGAACAAACACACTTGCATTGTCAAAGAAAAACTTCTGTGAACAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAACAAACACACTTGCATTGTCAAAGAAAAACTTCTGTGAACAAAG  400

seq1  ATAGAGGAGTAAACAATGCTTTATATGTAACATGACACGGAGGCTAAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGAGTAAACAATGCTTTATATGTAACATGACACGGAGGCTAAGCT  450

seq1  CAACTCCCCAAAGGGCTGGTGATGTGAAGAGCTGGGATGAGGGATTGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCCCAAAGGGCTGGTGATGTGAAGAGCTGGGATGAGGGATTGCTG  500

seq1  AACCATCTGCTCCTGCTATTGGCTTCACTGAAAAACAAAACATGTGATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATCTGCTCCTGCTATTGGCTTCACTGAAAAACAAAACATGTGATAA  550

seq1  AATGGAAACCGCTGTATTCTCCCCACCTTGGGCACTGTTACAACTGCAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAAACCGCTGTATTCTCCCCACCTTGGGCACTGTTACAACTGCAGA  600

seq1  AGAGAAAGTTAGGCTCGGGGCTGCGGGGGGGGGGGGTG  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGTTAGGCTCGGGGCTGCGGGGGGGGGGGGTG  638

seq1: chr10_100229359_100230577
seq2: B6Ng01-213C14.g_64_1273 (reverse)

seq1  CCTTCCCTCAAGTTGATAA-CCTAGTACACAGA-CATTTACATATCTACA  48
      |||| ||||||||  |||| |||||||||  || ||||  ||||||||| 
seq2  CCTTACCTCAAGTGAATAACCCTAGTACAACGAGCATTACCATATCTAC-  49

seq1  TTCATGTATCTCTGATTATAATAACGAAGACATGGGGCCAGTCTTTGTCT  98
       | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| 
seq2  -TAATG-ATCTC-GATTAAAATAACG-AGACATGGG--CAGTCTTGGTC-  92

seq1  TGATGATTCATGATGAAAATGTGTTTCATATACACAAT-GGAATTTACTC  147
      ||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGATGATCCATGATTGAATTGTGGTTCATATACACAATGGGAATTTACTC  142

seq1  GGGTGTGACAAAATATGGCTTTGTAGGTAAAGGGATGAAGCTGGAAAAGA  197
      |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GGGTGTGACAAATTATG--CTTGTAGGTAAAGGGATGAAGCTGAAAAAGA  190

seq1  ATTATAGAGGCCATTCAGTCTTAAGAAGACTGTGTGCTTTCTCTCATAAG  247
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  --TATAGAGCCCATTCAGTCTTAAGAAGACTGTGTGCTTTCTCTCATAAG  238

seq1  CAGATCATAGCCTTTACTCTTGAATTCTGTTTCTTAGACTTGGGAAAGCC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCATAGCCTTTACTCTTGAATTCTGTTTCTTAGACTTGGGAAAGCC  288

seq1  CCAGGAGACCAGAAGCTGGAAAGGGATGGCTTTGAGGGAAGTGTCTAAGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAGACCAGAAGCTGGAAAGGGATGGCTTTGAGGGAAGTGTCTAAGT  338

seq1  GCTGCAAAAGGCTAGCATAGATGTAAGCCAAGGATGGAGAGAAGACTGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAAAAGGCTAGCATAGATGTAAGCCAAGGATGGAGAGAAGACTGGA  388

seq1  ATGGAAAGGGTTAAAATAGGGAAAAGTGTGGGAGGATGAGGGACAGGAGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAAGGGTTAAAATAGGGAAAAGTGTGGGAGGATGAGGGACAGGAGT  438

seq1  GGTAAGCATGGGGGTCAGGGGCAGGGTTAGTCAACTAAAAGGTGTAAGAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGCATGGGGGTCAGGGGCAGGGTTAGTCAACTAAAAGGTGTAAGAG  488

seq1  TATTTAACTGTTGTATTCTATTAAATGCTATGTATAGGTAAGACCAGACT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAACTGTTGTATTCTATTAAATGCTATGTATAGGTAAGACCAGACT  538

seq1  CTCTTTCGTAAATGTCAGCATGCTTTTATCTTATTAAGAGTAGCTTAATG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCGTAAATGTCAGCATGCTTTTATCTTATTAAGAGTAGCTTAATG  588

seq1  ATCTCTACTAAATATTAAAGGCTTCCCCGTTTATGGTGCTCCTAAAAGTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTACTAAATATTAAAGGCTTCCCCGTTTATGGTGCTCCTAAAAGTT  638

seq1  ATATTCTCTTGATGTTTATGTTTCTCTGAATAATTTCATTCTTTTGCCAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCTCTTGATGTTTATGTTTCTCTGAATAATTTCATTCTTTTGCCAT  688

seq1  AGGTAGACTGAAGTGGGTCCATCTATACAATGAAAATAGTTAGCAATAAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGACTGAAGTGGGTCCATCTATACAATGAAAATAGTTAGCAATAAA  738

seq1  AGATAAAGTTAAATTTGCATAATACTGCCATTGACAACCTCAGAAGACCT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAAGTTAAATTTGCATAATACTGCCATTGACAACCTCAGAAGACCT  788

seq1  GCTCAAACATCACACAGAAATGTTTGGGTGATCATGAAGAGATTGAGACT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAACATCACACAGAAATGTTTGGGTGATCATGAAGAGATTGAGACT  838

seq1  GAACATGGAAACCTATCTTCTGACAGATCTTTATGAAACACTGCGATCAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGGAAACCTATCTTCTGACAGATCTTTATGAAACACTGCGATCAT  888

seq1  GCTTCTTAAAATATTAGTGACTATAGCGTTTCTTCAAAATTCCCATTTCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTAAAATATTAGTGACTATAGCGTTTCTTCAAAATTCCCATTTCT  938

seq1  GATTAGTAAATATGTGAGTCCATTGAGGAAAAGTAAGTTTAAAGTCTTAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGTAAATATGTGAGTCCATTGAGGAAAAGTAAGTTTAAAGTCTTAG  988

seq1  GACTGATTTTATTACTTTCTTTAACACGTGTTAATTCTTCATGTTGATCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGATTTTATTACTTTCTTTAACACGTGTTAATTCTTCATGTTGATCC  1038

seq1  AGTACAGAGTGACGTTTACACACAGGCTCACAGAATGGCACTGTCAAATC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAGAGTGACGTTTACACACAGGCTCACAGAATGGCACTGTCAAATC  1088

seq1  AAGGTAATTAGTATTCCCTTCTCTTCACCATTACTTTATTTCTGGAGCCT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAATTAGTATTCCCTTCTCTTCACCATTACTTTATTTCTGGAGCCT  1138

seq1  CGGGATTTTTTAATTGTTAATATTCTAAGAGCAGAATGTTTCTTGCTACA  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGATTTTTTAATTGTTAATATTCTAAGAGCAGAATGTTTCTTGCTACA  1188

seq1  TATGCGGATGATTTCTGAATTC  1219
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCGGATGATTTCTGAATTC  1210