BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-218E22
Chromosome10 (Build37)
Map Location 93,201,942 - 93,333,643
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNtn4, LOC100041907, Usp44, Metap2
Upstream geneGm872, 4930485B16Rik, EG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, LOC667338
Downstream geneVezt, Fgd6, Nr2c1, Ndufa12, EG215472, LOC100041955, Tmcc3, EG667315, 4921537D05Rik, Plxnc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-218E22.bB6Ng01-218E22.g
ACCGA034471GA034472
length1,1351,117
definitionB6Ng01-218E22.b B6Ng01-218E22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,332,517 - 93,333,643)(93,201,942 - 93,203,052)
sequence
gaattcttacatttctatacacaaatatagtgagggaactagtaaactta
ttcttcttaaccttgtgaaatgattagcagagaagagaattctcttactt
aaataatttttaaaatacacactatgagcctggagagatgggtcagtggt
tgagagaacactggctgctcttcaagctgtcctgggtggaattcccagca
cccacgtggcagtgcagtggcagctcacagttgtttgtaactccatggag
ggcatctgctgcttttttctggcctctttcagcaccaggcatgcaggtgg
tacgtacatagacatacatgcaggcagagcacccaggtatataacattaa
aacgtatatatgtgtgtgcacatatgcacatgacgtgcagcttgtagcag
caacttaaatttggtgtaagttgaaacttataaaatggctggtaactgaa
gttcagagtagtgttctcttgagtttgggatggcagagatttatttccgt
gtctcttatgagctccgcattcagaaagtactcatatcattcccagaaag
taaccaggtttttaaggtatgaaactgaaaacaaatcctttgtctttcag
tgagaagttggaagactgttcccgaaagctaataaaggaaaatgggttaa
atgcaggcctggcgttccccactgggtgttctctcaacaactgtgctgcc
cattacactcccaatgctggtgacacgacagtcttgcagtatgatgacat
ctgtaagatagactttggaacacatataagtggtgagtctggggtaatcc
catcccatcttccacccagccatgcctcctgggctcccaggatgcctttt
gtaagcagtagatggagctgtgaatactaaacaccaagctttgttcttgg
ctcctttctctaaagctgtactggggcagagttttgtttgctttaggttt
aaagcatcctacttaaactgggaaactatttgaatattgacattcatttt
tgttttcatatgattgtacatttttcccccatttcagccattgttttata
tacaatatactcaaaataacagaatattggaaccagggctggctattata
taggctcaatagtctgaacgtttcagtctcaatat
gaattccaggacagccagagctacccagagaagaaaatagagcttctcta
aataattactatcttcagattctaaaaggctctgtaatcatagtgtgcta
ctctgtataccagtgaattagttaactgctttggctcctggcgggtctca
cacatgatgtacctgcccaagagctctctggattctccaatgaaagacag
acagacagaccgacagacagacagacacacacacacacacacacacacca
gctaattttgttatgccttgactagctcaatggctgagcacttctaaacc
tccctgcacacagccagcattcctgacttaacaccttttaaatctatatt
ttatcttattgctctggctccttctgggcagcccccttatctttgctgcc
caagatgctctgggcagcctttctgggggctgcatttcttcttgtatcta
cattttggccattactccctcctgttccttcccagcatggtccttcctat
tcccttctccatgatatcctttctctctcctctctgggtttcttctcttg
ggaacctagaagccccgcccccatccctctctctgcccaaccattggcca
ttggctcttctatgatcaatcaaaaaccaattgggaacagggactttcag
cgtttgaacacacagatcgggagatttgggggccaaatcaagtaggtatt
ttgattacggaggaatgatgaatgtttgaactggtcaactgactctgttc
tacattttacaatgtatatattaaaatattacataggatttcataagcat
gtactatatctatgtgtcaacttagaaatattgcttaattattaaaaatt
aaaagaaagggtctggagagatggttcagcagttaagagcacgtgccagt
cttccagaggaccagggttcagttctcagtttgcacacagaagcttataa
ctgtctgctactctagctcaaggaggggatctgatgctttctcctggcct
ccctgggcacaaggcacacacgtggttgccacataacatacattacatac
tacatacatacatacatgggaggcaaacactcatacccataaaggtcgaa
taaaataagttttaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_93332517_93333643
seq2: B6Ng01-218E22.b_45_1179 (reverse)

seq1  ATATTGGGGACTGAA--TGTCAGACTATTGAG-CTATAT-ATACCCAGCC  46
      ||||| | |||||||    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||
seq2  ATATT-GAGACTGAAACGTTCAGACTATTGAGCCTATATAATAGCCAGCC  49

seq1  CTGG-TCCAATATCTTGT--ATTTGAGTATAATTGTATATAAAACAATGG  93
      |||| ||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTCCAATATTCTGTTATTTTGAGTAT-ATTGTATATAAAACAATGG  98

seq1  CCTGAATGGGGGAAAAATGTACAATCATATGAAAAC-AAAATGAATGTCA  142
      |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTGAAATGGGGGAAAAATGTACAATCATATGAAAACAAAAATGAATGTCA  148

seq1  ATATTCAAATAGTTT-CCAGTTTAAGTAGGATGCTTTAAACCTAAAGCAA  191
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCAAATAGTTTCCCAGTTTAAGTAGGATGCTTTAAACCTAAAGCAA  198

seq1  ACAAAACTCTGCCCCAGTACAGCTTTAGAG-AAGGAGCCAAGAACAAAGC  240
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACTCTGCCCCAGTACAGCTTTAGAGAAAGGAGCCAAGAACAAAGC  248

seq1  TTGGTGTTTAGTATTCACAGCTCCATCTACTGCTTACAAAAGGCATCCTG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGTTTAGTATTCACAGCTCCATCTACTGCTTACAAAAGGCATCCTG  298

seq1  GGAGCCCAGGAGGCATGGCTGGGTGGAAGATGGGATGGGATTACCCCAGA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCCAGGAGGCATGGCTGGGTGGAAGATGGGATGGGATTACCCCAGA  348

seq1  CTCACCACTTATATGTGTTCCAAAGTCTATCTTACAGATGTCATCATACT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCACTTATATGTGTTCCAAAGTCTATCTTACAGATGTCATCATACT  398

seq1  GCAAGACTGTCGTGTCACCAGCATTGGGAGTGTAATGGGCAGCACAGTTG  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGACTGTCGTGTCACCAGCATTGGGAGTGTAATGGGCAGCACAGTTG  448

seq1  TTGAGAGAACACCCAGTGGGGAACGCCAGGCCTGCATTTAACCCATTTTC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGAACACCCAGTGGGGAACGCCAGGCCTGCATTTAACCCATTTTC  498

seq1  CTTTATTAGCTTTCGGGAACAGTCTTCCAACTTCTCACTGAAAGACAAAG  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTAGCTTTCGGGAACAGTCTTCCAACTTCTCACTGAAAGACAAAG  548

seq1  GATTTGTTTTCAGTTTCATACCTTAAAAACCTGGTTACTTTCTGGGAATG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGTTTTCAGTTTCATACCTTAAAAACCTGGTTACTTTCTGGGAATG  598

seq1  ATATGAGTACTTTCTGAATGCGGAGCTCATAAGAGACACGGAAATAAATC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGTACTTTCTGAATGCGGAGCTCATAAGAGACACGGAAATAAATC  648

seq1  TCTGCCATCCCAAACTCAAGAGAACACTACTCTGAACTTCAGTTACCAGC  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCATCCCAAACTCAAGAGAACACTACTCTGAACTTCAGTTACCAGC  698

seq1  CATTTTATAAGTTTCAACTTACACCAAATTTAAGTTGCTGCTACAAGCTG  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTATAAGTTTCAACTTACACCAAATTTAAGTTGCTGCTACAAGCTG  748

seq1  CACGTCATGTGCATATGTGCACACACATATATACGTTTTAATGTTATATA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTCATGTGCATATGTGCACACACATATATACGTTTTAATGTTATATA  798

seq1  CCTGGGTGCTCTGCCTGCATGTATGTCTATGTACGTACCACCTGCATGCC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTGCTCTGCCTGCATGTATGTCTATGTACGTACCACCTGCATGCC  848

seq1  TGGTGCTGAAAGAGGCCAGAAAAAAGCAGCAGATGCCCTCCATGGAGTTA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCTGAAAGAGGCCAGAAAAAAGCAGCAGATGCCCTCCATGGAGTTA  898

seq1  CAAACAACTGTGAGCTGCCACTGCACTGCCACGTGGGTGCTGGGAATTCC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAACTGTGAGCTGCCACTGCACTGCCACGTGGGTGCTGGGAATTCC  948

seq1  ACCCAGGACAGCTTGAAGAGCAGCCAGTGTTCTCTCAACCACTGACCCAT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGACAGCTTGAAGAGCAGCCAGTGTTCTCTCAACCACTGACCCAT  998

seq1  CTCTCCAGGCTCATAGTGTGTATTTTAAAAATTATTTAAGTAAGAGAATT  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCAGGCTCATAGTGTGTATTTTAAAAATTATTTAAGTAAGAGAATT  1048

seq1  CTCTTCTCTGCTAATCATTTCACAAGGTTAAGAAGAATAAGTTTACTAGT  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTCTGCTAATCATTTCACAAGGTTAAGAAGAATAAGTTTACTAGT  1098

seq1  TCCCTCACTATATTTGTGTATAGAAATGTAAGAATTC  1127
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCACTATATTTGTGTATAGAAATGTAAGAATTC  1135

seq1: chr10_93201942_93203052
seq2: B6Ng01-218E22.g_65_1181

seq1  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCTACCCAGAGAAGAAAATAGAGCTTCTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGACAGCCAGAGCTACCCAGAGAAGAAAATAGAGCTTCTCTA  50

seq1  AATAATTACTATCTTCAGATTCTAAAAGGCTCTGTAATCATAGTGTGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTACTATCTTCAGATTCTAAAAGGCTCTGTAATCATAGTGTGCTA  100

seq1  CTCTGTATACCAGTGAATTAGTTAACTGCTTTGGCTCCTGGCGGGTCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTATACCAGTGAATTAGTTAACTGCTTTGGCTCCTGGCGGGTCTCA  150

seq1  CACATGATGTACCTGCCCAAGAGCTCTCTGGATTCTCCAATGAAAGACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGATGTACCTGCCCAAGAGCTCTCTGGATTCTCCAATGAAAGACAG  200

seq1  ACAGACAGACCGACAGACAGACAGACACACACACACACACACACACACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGACCGACAGACAGACAGACACACACACACACACACACACACCA  250

seq1  GCTAATTTTGTTATGCCTTGACTAGCTCAATGGCTGAGCACTTCTAAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATTTTGTTATGCCTTGACTAGCTCAATGGCTGAGCACTTCTAAACC  300

seq1  TCCCTGCACACAGCCAGCATTCCTGACTTAACACCTTTTAAATCTATATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGCACACAGCCAGCATTCCTGACTTAACACCTTTTAAATCTATATT  350

seq1  TTATCTTATTGCTCTGGCTCCTTCTGGGCAGCCCCCTTATCTTTGCTGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTTATTGCTCTGGCTCCTTCTGGGCAGCCCCCTTATCTTTGCTGCC  400

seq1  CAAGATGCTCTGGGCAGCCTTTCTGGGGGCTGCATTTCTTCTTGTATCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATGCTCTGGGCAGCCTTTCTGGGGGCTGCATTTCTTCTTGTATCTA  450

seq1  CATTTTGGCCATTACTCCCTCCTGTTCCTTCCCAGCATGGTCCTTCCTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGGCCATTACTCCCTCCTGTTCCTTCCCAGCATGGTCCTTCCTAT  500

seq1  TCCCTTCTCCATGATATCCTTTCTCTCTCCTCTCTGGGTTTCTTCTCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTCTCCATGATATCCTTTCTCTCTCCTCTCTGGGTTTCTTCTCTTG  550

seq1  GGAACCTAGAAGCCCCGCCCCCATCCCTCTCTCTGCCCAACCATTGGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCTAGAAGCCCCGCCCCCATCCCTCTCTCTGCCCAACCATTGGCCA  600

seq1  TTGGCTCTTCTATGATCAATCAAAAACCAATTGGGAACAGGGACTTTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTCTTCTATGATCAATCAAAAACCAATTGGGAACAGGGACTTTCAG  650

seq1  CGTTTGAACACACAGATCGGGAGATTTGGGGGCCAAATCAAGTAGGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTGAACACACAGATCGGGAGATTTGGGGGCCAAATCAAGTAGGTATT  700

seq1  TTGATTACGGAGGAATGATGAATGTTTGAACTGGTCAACTGACTCTGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTACGGAGGAATGATGAATGTTTGAACTGGTCAACTGACTCTGTTC  750

seq1  TACATTTTACAATGTATATATTAAAATATTACATAGGATTTCATAAGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTTACAATGTATATATTAAAATATTACATAGGATTTCATAAGCAT  800

seq1  GTACTATATCTATGTGTCAACTTAGAAATATTGCTTAATTATTAAAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTATATCTATGTGTCAACTTAGAAATATTGCTTAATTATTAAAAATT  850

seq1  AAAAG-AAGGGTCTGGAGAGATGGTTCAGCAGTTAAGAGCACGTGCCAGT  899
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAAGGGTCTGGAGAGATGGTTCAGCAGTTAAGAGCACGTGCCAGT  900

seq1  CTTCCAGAGGACCAGGGTTCAGTTCTCAGTTTGCACACAGAAGCTTATAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGAGGACCAGGGTTCAGTTCTCAGTTTGCACACAGAAGCTTATAA  950

seq1  CTGTCTGCTACTCTAGCTCAAGGAGGGGATCTGATGCTTTCTTCTGGCCT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTGTCTGCTACTCTAGCTCAAGGAGGGGATCTGATGCTTTCTCCTGGCCT  1000

seq1  CCCTGGGCACAAGGCACACACGTGGT--GCACAT-ACATACA-TACATAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||
seq2  CCCTGGGCACAAGGCACACACGTGGTTGCCACATAACATACATTACATAC  1050

seq1  ATACATACATACATACAT-GGAGGCAAACACTCATACACATAAA-GTCAA  1093
       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |
seq2  -TACATACATACATACATGGGAGGCAAACACTCATACCCATAAAGGTCGA  1099

seq1  AATAAATAAGTTTTAAAA  1111
      |  |||||||||||||||
seq2  ATAAAATAAGTTTTAAAA  1117