seq1: chr10_37157071_37158270
seq2: B6Ng01-222E03.b_43_1241
seq1 GAATTCAAATGGTCAAGAGTTCATAGAAAGTAAAGCATAGTGCTGCTTAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCAAATGGTCAAGAGTTCATAGAAAGTAAAGCATAGTGCTGCTTAT 50
seq1 CAGAGACTGGATCCACAGGGTACCCAATAACACTCTGATCTGACGTTTCA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGAGACTGGATCCACAGGGTACCCAATAACACTCTGATCTGACGTTTCA 100
seq1 TATGTGCCCTAGGATATCAAGGAGTTTATTCTGACTTGTTTCAGATTCGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATGTGCCCTAGGATATCAAGGAGTTTATTCTGACTTGTTTCAGATTCGT 150
seq1 AGGTAGAAAAAGTATTCTGGTTGGTTATTTCAACAAAGAAAAACAATCTG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTAGAAAAAGTATTCTGGTTGGTTATTTCAACAAAGAAAAACAATCTG 200
seq1 TGCAGAAGGCCCTAGTGTTTCTCATAGTTGCTGTCTGATAATTATCTAGA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCAGAAGGCCCTAGTGTTTCTCATAGTTGCTGTCTGATAATTATCTAGA 250
seq1 TTCCTATAGTAATCGATAAGAATATATGGCCAGGAATTGATTCTGTGTTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCTATAGTAATCGATAAGAATATATGGCCAGGAATTGATTCTGTGTTG 300
seq1 TTATTGTGATGCCACCTGTTGAGAGGCTTCTGAGAACTCAGCAGCAGCTT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATTGTGATGCCACCTGTTGAGAGGCTTCTGAGAACTCAGCAGCAGCTT 350
seq1 CTGTTTATGCCCTGTGGGCTGGCAGCAGTTTATAAATGAGCTTTGCTCTC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGTTTATGCCCTGTGGGCTGGCAGCAGTTTATAAATGAGCTTTGCTCTC 400
seq1 TTCCACCACCCCAGAGGAGCATGGCTTGAGGAGAATGGCTCTAAGAACCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCACCACCCCAGAGGAGCATGGCTTGAGGAGAATGGCTCTAAGAACCC 450
seq1 TGGTGTAATTTAAAGTTAGACTTGAGGTAGTGCCAGTTAAGCTAAGATGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTGTAATTTAAAGTTAGACTTGAGGTAGTGCCAGTTAAGCTAAGATGC 500
seq1 TCTTTGACTTGGCATCTTCTGGAGGATTTAACTTCCTTTCCTGGCCATTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTGACTTGGCATCTTCTGGAGGATTTAACTTCCTTTCCTGGCCATTT 550
seq1 AGTAGGAATTATGCTGTCTATCAGACAAAGATTGAAGGTCACATAGAATA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTAGGAATTATGCTGTCTATCAGACAAAGATTGAAGGTCACATAGAATA 600
seq1 TGTGCATACACACACACACACACACACACACACACACAAAACACACACAC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGCATACACACACACACACACACACACACACACACAAAACACACACAC 650
seq1 CAGATATATATATATGTATGTATACATACACATACACACACACACAGATA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGATATATATATATGTATGTATACATACACATACACACACACACAGATA 700
seq1 CATATATATAATACACACATACACAGTTATGTATATACACACATACACAC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATATATATAATACACACATACACAGTTATGTATATACACACATACACAC 750
seq1 GTATATACACACACACATTCAAACAGACAAACACAAGTACACACAGAGTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTATATACACACACACATTCAAACAGACAAACACAAGTACACACAGAGTT 800
seq1 CAAGCTAGTACACTGTACACTATGCTTATTCTATGTTGGATTTTTGCTTA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGCTAGTACACTGTACACTATGCTTATTCTATGTTGGATTTTTGCTTA 850
seq1 GTCTGAGAACTGACTTAAATGTTTAGTGTTTGGCATGGCTGCTTTGATCA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCTGAGAACTGACTTAAATGTTTAGTGTTTGGCATGGCTGCTTTGATCA 900
seq1 ACTGGGTAATTTTTTTTTTTAATCACAGATGAGACGTATTTAACTTTCCC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTGGGTAATTTTTTTTTTTAATCACAGATGAGACGTATTTAACTTTCCC 950
seq1 CTCTTAAAAGTATGCGGCTATTAAGAGACCCTTTTCTTTTATTATTTTTA 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
seq2 CTCTTAAAAGTATGCGGCTATTAAGAGACCCTTTTC-TTTAT--ATTTTA 997
seq1 TTCTGTCATTCAGCCACCTTTGACCTTGACTTC-ACCATTTCTGCATCAT 1049
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2 TTCTGTCATTCAGCCA-CTTTGACCTTGACTTCAACCATTTCTGCATCAT 1046
seq1 TTCTTCAGCTGTA--GAAAACACCCTG-TATCTG-TATCTACA-GCCAAT 1094
||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||
seq2 TTCTTCAGCTGTAAGAAAAACACCCTGTTATCTGTTATCTACAGGCCAAT 1096
seq1 ATA--GCTGCTATTT-ATTTTTCT-GAACAGTTTATTTCTTCAATGTGTC 1140
||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||| | |||
seq2 ATAAGCCTGCTATTTAATTTTTCTGGAACAGTTAAATTC-TCAA-GGGTC 1144
seq1 TTTATGTTTCTCTTGGCTCGGCTCCATTCACCAGTC-TTTTACCCAATAA 1189
|| | | ||| ||| || | ||| ||||||||| ||||| ||||| |
seq2 -CTAGGATCCTC-TGGATC--CGCCA-TCACCAGTCTTTTTAACCAAT-A 1188
seq1 TGTCATGTCTG 1200
||||||||||
seq2 GGTCATGTCTG 1199
| seq1: chr8_7324445_7324733
seq2: B6Ng01-222E03.g_100_365 (reverse)
seq1 CCCCATATCCACCCACCCCCACTCCCCTGCCCACCCACTCCCCCTTTTTG 50
||||| |||||||| ||| ||| |||
seq2 -----------------------CCCCTATCCACCCACCCCCACTTCTTG 27
seq1 GCCCTGGTATTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGG 100
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
seq2 GCCCTGGAATTCCCCTGTACTGAGGCATATAAAGTTTGCACAACCAATGG 77
seq1 GCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGATATATATGCA 150
|| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||
seq2 GC--CTCTTTCCACTGATGGCTGGCTAGACCATCTTCTGATACATATGCA 125
seq1 GCTAGAGTCAAGAGCTC--CGGGGTACTGGTTAGCTCATAATGTTGTTCC 198
||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2 GCTGGAGACATGAGCTCCACGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCC 175
seq1 ACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGCTACTTTCTCTAGCTC 248
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2 ACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTC 225
seq1 CTCCATTGGGAGCCCTATGATCCATCCATTAGCTGACTGTG 289
|||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||
seq2 CTCCATTGGGGGCCCTGTGATCCATCCAATAGCTGACTGTG 266
|
