BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244K18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 59,514,696 - 59,641,147
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAscc1, Spock2
Upstream geneSh3md4, Sept10, Ankrd57, LOC664892, P4ha1, LOC100039174, Pla2g12b, Oit3, Ccdc109a, LOC100039225, Cbara1, EG664907, LOC664936, Dnajb12, Ddit4, D10Ertd641e
Downstream geneChst3, LOC100039080, Psap, Cdh23, 4632428N05Rik, Slc29a3, Unc5b, Pcbd1, Sgpl1, 1700021K02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244K18.bB6Ng01-244K18.g
ACCGA053748GA053749
length1,105228
definitionB6Ng01-244K18.b B6Ng01-244K18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,640,044 - 59,641,147)(59,514,696 - 59,514,923)
sequence
gaattctcacttaaattttcttgccaatggttaagagcacttgctgctct
tgcaggacctgggtttggttcccagcacccacatcaaaagacttacagct
ttctgttactcaagttccaagggatccagtgctgccttctggctcctgca
gacatctctcctcctgtgagaaggtacctgtgtctttctttcatcatgat
aaaatgtgtgcaatctgagatttattcatcaccatacccaggccattcat
aatggaatgtgtacaacataggccattcataatagactgtgtacaataca
agccattcataatggaccattctcagcaatggttctaaaatatagtcacc
atttccttcctaccaaaataggaagcagcaggcacagttcagtcccacaa
atcctaaccgggagccttcagaatgcagggcccacaccagcctcaggaac
acagggaaccccagtgtgtccatggagacaaatgtcctgtatcagattgc
ccaatgaagggagtccaccaacaatgtcataggaccttcatttgtaatca
tctatacaatatggtcccaaacagagcaacacacctcaacttttctatca
gtccctcccttgtatacccgaggctatcccatgtgaagtgggtggtgggg
tcaaggacagctcaccccctctgcccgttctatacactgtaccactcaga
ccctgcccaaaggagctctaacaggttacagaaggtcacaactgtgtgct
tatctcagcaccaaagccatgggagcagctggcatagccaagtgaggcca
cacgtgacctctagagagcaagtggaagcaaaactaaaggaaaggtggtc
atttttcctcacagaaccataggaccactgtcattgaaaattcaggatat
gaatggggaatcttttaaccaacctgcaggctgagacattaagcaagctc
tcagcctgacttgtggcatcctcttcatctgtaggaaaggggccaagaat
tggcctctgcttcaaatatcaagtaagatttagacacaactgtccatgtg
caagtcttcagaataccttagtgaattatacactaagaggccttagttat
tatac
atcgtgtttaccaggctcacctcaaactcagtattattaggcctcctgct
tctgtcttctagagctgggatggcagcatgtgcccgcatacccagctttc
tctagggtctcctgggagctgctctcacatctctgtagtctccagttaga
agtgggtttagagggaaaaagaagaaagatgctatagtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgggtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_59640044_59641147
seq2: B6Ng01-244K18.b_46_1150 (reverse)

seq1  GTATAATAACTAAGG-CTCCTAGTGTAATAATCACTAAGGTATTCCTGAG  49
      ||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||| 
seq2  GTATAATAACTAAGGCCTCTTAGTGTATAATTCACTAAGGTATT-CTGAA  49

seq1  AACTTGCACAT-GACAGTTGTGTCTAAATCTTACCTTGAATATTTGAAGC  98
       |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  GACTTGCACATGGACAGTTGTGTCTAAATCTTA-CTTG-ATATTTGAAGC  97

seq1  AGAGGCC-ATTCTTGGCCCC-TTCCTACAGATGAAGAGGATGCCACAAGT  146
      ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCCAATTCTTGGCCCCTTTCCTACAGATGAAGAGGATGCCACAAGT  147

seq1  CAGGCTGAGAGCTTTGCTTAATGTCTCAGCCTGCAGG-TGGTT-AAAGAT  194
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
seq2  CAGGCTGAGAGC-TTGCTTAATGTCTCAGCCTGCAGGTTGGTTAAAAGAT  196

seq1  TCCCCATTCATATCCTGAATTTTCAATGACAGTGGTCCTATGGTTCTGTG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATTCATATCCTGAATTTTCAATGACAGTGGTCCTATGGTTCTGTG  246

seq1  AGGAAAAATGACCACCTTTCCTTTAGTTTTGCTTCCACTTGCTCTCTAGA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAATGACCACCTTTCCTTTAGTTTTGCTTCCACTTGCTCTCTAGA  296

seq1  GGTCACGTGTGGCCTCACTTGGCTATGCCAGCTGCTCCCATGGCTTTGGT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACGTGTGGCCTCACTTGGCTATGCCAGCTGCTCCCATGGCTTTGGT  346

seq1  GCCTGAGATAAGCACACAGTTGTGACCTTCTGTAACCTGTTAGAGCTCCT  394
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-CTGAGATAAGCACACAGTTGTGACCTTCTGTAACCTGTTAGAGCTCCT  395

seq1  TTGGGCAGGGTCTGAGTGGTACAGTGTATAGAACGGGCAGAGGGGGTGAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCAGGGTCTGAGTGGTACAGTGTATAGAACGGGCAGAGGGGGTGAG  445

seq1  CTGTCCTTGACCCCACCACCCACTTCACATGGGATAGCCTCGGGTATACA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTTGACCCCACCACCCACTTCACATGGGATAGCCTCGGGTATACA  495

seq1  AGGGAGGGACTGATAGAAAAGTTGAGGTGTGTTGCTCTGTTTGGGACCAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGGACTGATAGAAAAGTTGAGGTGTGTTGCTCTGTTTGGGACCAT  545

seq1  ATTGTATAGATGATTACAAATGAAGGTCCTATGACATTGTTGGTGGACTC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATAGATGATTACAAATGAAGGTCCTATGACATTGTTGGTGGACTC  595

seq1  CCTTCATTGGGCAATCTGATACAGGACATTTGTCTCCATGGACACACTGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATTGGGCAATCTGATACAGGACATTTGTCTCCATGGACACACTGG  645

seq1  GGTTCCCTGTGTTCCTGAGGCTGGTGTGGGCCCTGCATTCTGAAGGCTCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCTGTGTTCCTGAGGCTGGTGTGGGCCCTGCATTCTGAAGGCTCC  695

seq1  CGGTTAGGATTTGTGGGACTGAACTGTGCCTGCTGCTTCCTATTTTGGTA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTTAGGATTTGTGGGACTGAACTGTGCCTGCTGCTTCCTATTTTGGTA  745

seq1  GGAAGGAAATGGTGACTATATTTTAGAACCATTGCTGAGAATGGTCCATT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGAAATGGTGACTATATTTTAGAACCATTGCTGAGAATGGTCCATT  795

seq1  ATGAATGGCTTGTATTGTACACAGTCTATTATGAATGGCCTATGTTGTAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGGCTTGTATTGTACACAGTCTATTATGAATGGCCTATGTTGTAC  845

seq1  ACATTCCATTATGAATGGCCTGGGTATGGTGATGAATAAATCTCAGATTG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCATTATGAATGGCCTGGGTATGGTGATGAATAAATCTCAGATTG  895

seq1  CACACATTTTATCATGATGAAAGAAAGACACAGGTACCTTCTCACAGGAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATTTTATCATGATGAAAGAAAGACACAGGTACCTTCTCACAGGAG  945

seq1  GAGAGATGTCTGCAGGAGCCAGAAGGCAGCACTGGATCCCTTGGAACTTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGTCTGCAGGAGCCAGAAGGCAGCACTGGATCCCTTGGAACTTG  995

seq1  AGTAACAGAAAGCTGTAAGTCTTTTGATGTGGGTGCTGGGAACCAAACCC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACAGAAAGCTGTAAGTCTTTTGATGTGGGTGCTGGGAACCAAACCC  1045

seq1  AGGTCCTGCAAGAGCAGCAAGTGCTCTTAACCATTGGCAAGAAAATTTAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCTGCAAGAGCAGCAAGTGCTCTTAACCATTGGCAAGAAAATTTAA  1095

seq1  GTGAGAATTC  1104
      ||||||||||
seq2  GTGAGAATTC  1105

seq1: chr10_59514696_59514923
seq2: B6Ng01-244K18.g_71_298

seq1  ATCGTGTTTACCAGGCTCACCTCAAACTCAGTATTATTAGGCCTCCTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTGTTTACCAGGCTCACCTCAAACTCAGTATTATTAGGCCTCCTGCT  50

seq1  TCTGTCTTCTAGAGCTGGGATGGCAGCATGTGCCCGCATACCCAGCTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTTCTAGAGCTGGGATGGCAGCATGTGCCCGCATACCCAGCTTTC  100

seq1  TCTAGGGTCTCCTGGGAGCTGCTCTCACATCTCTGTAGTCTCCAGTTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGGTCTCCTGGGAGCTGCTCTCACATCTCTGTAGTCTCCAGTTAGA  150

seq1  AGTGGGTTTAGAGGGAAAAAGAAGAAAGATGCTATAGTGTGTGTGTGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTTTAGAGGGAAAAAGAAGAAAGATGCTATAGTGTGTGTGTGTGT  200

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGT  228
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGT  228