BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-251L24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 92,167,527 - 92,332,387
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNedd1, Gm872, 4930485B16Rik
Upstream geneLOC100041799, LOC667203, LOC216229, LOC100041814
Downstream geneEG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, Ntn4, LOC667338, LOC100041907, Usp44, Metap2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-251L24.bB6Ng01-251L24.g
ACCGA058925GA058926
length1,0701,151
definitionB6Ng01-251L24.b B6Ng01-251L24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,331,320 - 92,332,387)(92,167,527 - 92,168,684)
sequence
gaattctattgtttgtcaagagatactgtgaccactgcaagtcttataaa
gagacacatttaattggggctggcttacagttcagagtttcagtccatta
ctattatggtgggatgcatggtggtgtgtaggtagacatgtggccggaga
aggagctgagagttctacatctggatcatcagtcagcaggaaaagactga
gccactaggcctcgcttgaacttctgagaactcaaagtccacccctagtg
acacacatccttcaacaaagccacacctactctagcaaggctacacctcc
taacagtgccaccccccaaacaatgtatgtcaaatattattttgtgaatt
catgccttcatgtttaccatctctgcttatattgtgctgctgtaacagaa
cagcctattctgggtaatttatgttaaacatggatctactaactcaccgt
tgttgagcctggtaggtctaagatcaagggctagcatctggggagagcct
tcttgctctgtaattacaaggcagaaggtggtaaggcaagaacaaaaata
aaatgggaagacagcttctcctgtttgaaggagctatgtgatgacccctc
cctcagtctatgcttcagggttgagctctcttgacctaatcatctctcta
aattatctccacccccatcctggtgccacagtgaggaccagattcccagc
acatgaactaggagggacatggtcaaacaatagcctttactaacacctaa
cataagaatcctattgtgtttattctaggtcagtgaatctgtactgggga
tcaacctcctgataggaaagaagagggccatgatcgacaaagtcaataac
attacattgccaaacatcccagagtttgccacggtggatcttctgtcttc
atatacagattatttactcggtatgtttgaatgactacagaactgacttg
tgtaccacgttaagccaagttgggaagactttattgttgtgatttgttgg
ccttttggcttagaggagaatatgttttgggggggatttccagagctcta
cctagggtcagtgccacaac
gaattcttacatccactacaggtatttagaaaaaaaaatgaagtagcaaa
gacagtaaattcacctgtcacctcagcaactacagacaactgatttacca
tctttggaggtgcctcttaagtacctttctgtacgtgcatctgtgctgag
tgtaatagaacccgtacctgggattacattccactgcgacacagtcacct
cagcaaaatatcttctctttcattttacagctggataatatcaatttatc
tcttccaggttctaacaaatctatcattgctaatgttgacttgagataat
ttatatttctgttgtccagcactcttcagagatactaagatgagaagact
aagttagcatttatctatctttgttcttatgaattgtctactaatttacc
ttgcctattttctattaagatactaagaatttgtaagtgctaatttgtag
ctgctctaagtaaggccatagatgctcatatagactgtcaatgctttctc
catttcttgctgtattgatcttttttctgacagagagatggtccatagaa
acagtctcaaggcttctggacaagcccttccattatcaattctgttattt
taaaaagaactgacatcttaaagtatttcatagtgaaaaattacaaaact
aaagaaaggaatgttttaaatcagtgatttttcaactttcctaatgctgc
aaccctttaatatagttcctcatgttatggtgaccacaagccataaaatt
ttgtcattacttcataactttaattttgctactattataaatcgtaaata
tctgatatgtggagttgctacccacaggttaataactactgctttaaatg
ttagtcctttgctgatttttttttcccagagtctataaaacatccacttt
ttctttgtattttactatttttatatctttgatgtttttttaatcatttg
ctggatacataagtttcaaagattcctttctttttaaagtgtattttcta
tttgctatttcgtgtacacatttttcggtgtttaaggtgttttcttctct
ggtgctccctgagaatctaaacagctgacagggcagcatctaacttgctt
tctgggtggcctcttagctggtgggcttgggatcgcctgcagttcaacag
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_92331320_92332387
seq2: B6Ng01-251L24.b_53_1122 (reverse)

seq1  GTTGTGGCAACTGACCCTAGGTAGAGCTCTGGAAAT-CCCCCCAAAACAT  49
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GTTGTGGC-ACTGACCCTAGGTAGAGCTCTGGAAATCCCCCCCAAAACAT  49

seq1  TATCTCCTCTAAG-CAAAAGGCCAACAAATCACAACAATAAAGTCTTCCA  98
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTCTCCTCTAAGCCAAAAGGCCAACAAATCACAACAATAAAGTCTTCCC  99

seq1  AACTTGGCTT-ACGTGGTACACAAGTCAGTTCTGTAGTCATTCAAACATA  147
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGGCTTAACGTGGTACACAAGTCAGTTCTGTAGTCATTCAAACATA  149

seq1  CCGAGTAAATAATCTGTATATGAAGACAGAAGATCCACCGTGGCAAACTC  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAGTAAATAATCTGTATATGAAGACAGAAGATCCACCGTGGCAAACTC  199

seq1  TGGGATGTTTGGCAATGTAATGTTATTGACTTTGTCGATCATGGCCCTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGTTTGGCAATGTAATGTTATTGACTTTGTCGATCATGGCCCTCT  249

seq1  TCTTTCCTATCAGGAGGTTGATCCCCAGTACAGATTCACTGACCTAGAAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCTATCAGGAGGTTGATCCCCAGTACAGATTCACTGACCTAGAAT  299

seq1  AAACACAATAGGATTCTTATGTTAGGTGTTAGTAAAGGCTATTGTTTGAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAATAGGATTCTTATGTTAGGTGTTAGTAAAGGCTATTGTTTGAC  349

seq1  CATGTCCCTCCTAGTTCATGTGCTGGGAATCTGGTCCTCACTGTGGCACC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCCCTCCTAGTTCATGTGCTGGGAATCTGGTCCTCACTGTGGCACC  399

seq1  AGGATGGGGGTGGAGATAATTTAGAGAGATGATTAGGTCAAGAGAGCTCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGGGGGTGGAGATAATTTAGAGAGATGATTAGGTCAAGAGAGCTCA  449

seq1  ACCCTGAAGCATAGACTGAGGGAGGGGTCATCACATAGCTCCTTCAAACA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGAAGCATAGACTGAGGGAGGGGTCATCACATAGCTCCTTCAAACA  499

seq1  GGAGAAGCTGTCTTCCCATTTTATTTTTGTTCTTGCCTTACCACCTTCTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGCTGTCTTCCCATTTTATTTTTGTTCTTGCCTTACCACCTTCTG  549

seq1  CCTTGTAATTACAGAGCAAGAAGGCTCTCCCCAGATGCTAGCCCTTGATC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTAATTACAGAGCAAGAAGGCTCTCCCCAGATGCTAGCCCTTGATC  599

seq1  TTAGACCTACCAGGCTCAACAACGGTGAGTTAGTAGATCCATGTTTAACA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACCTACCAGGCTCAACAACGGTGAGTTAGTAGATCCATGTTTAACA  649

seq1  TAAATTACCCAGAATAGGCTGTTCTGTTACAGCAGCACAATATAAGCAGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTACCCAGAATAGGCTGTTCTGTTACAGCAGCACAATATAAGCAGA  699

seq1  GATGGTAAACATGAAGGCATGAATTCACAAAATAATATTTGACATACATT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTAAACATGAAGGCATGAATTCACAAAATAATATTTGACATACATT  749

seq1  GTTTGGGGGGTGGCACTGTTAGGAGGTGTAGCCTTGCTAGAGTAGGTGTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGGGGTGGCACTGTTAGGAGGTGTAGCCTTGCTAGAGTAGGTGTG  799

seq1  GCTTTGTTGAAGGATGTGTGTCACTAGGGGTGGACTTTGAGTTCTCAGAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTTGAAGGATGTGTGTCACTAGGGGTGGACTTTGAGTTCTCAGAA  849

seq1  GTTCAAGCGAGGCCTAGTGGCTCAGTCTTTTCCTGCTGACTGATGATCCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGCGAGGCCTAGTGGCTCAGTCTTTTCCTGCTGACTGATGATCCA  899

seq1  GATGTAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCGGCCACATGTCTACCTACACACCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCGGCCACATGTCTACCTACACACCA  949

seq1  CCATGCATCCCACCATAATAGTAATGGACTGAAACTCTGAACTGTAAGCC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCATCCCACCATAATAGTAATGGACTGAAACTCTGAACTGTAAGCC  999

seq1  AGCCCCAATTAAATGTGTCTCTTTATAAGACTTGCAGTGGTCACAGTATC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAATTAAATGTGTCTCTTTATAAGACTTGCAGTGGTCACAGTATC  1049

seq1  TCTTGACAAACAATAGAATTC  1068
      |||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACAAACAATAGAATTC  1070

seq1: chr10_92167527_92168684
seq2: B6Ng01-251L24.g_64_1214

seq1  GAATTCTTACATCCACTACAGGTATTTAGAAAAAAAAATGAAGTAGCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTACATCCACTACAGGTATTTAGAAAAAAAAATGAAGTAGCAAA  50

seq1  GACAGTAAATTCACCTGTCACCTCAGCAACTACAGACAACTGATTTACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTAAATTCACCTGTCACCTCAGCAACTACAGACAACTGATTTACCA  100

seq1  TCTTTGGAGGTGCCTCTTAAGTACCTTTCTGTACGTGCATCTGTGCTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGGAGGTGCCTCTTAAGTACCTTTCTGTACGTGCATCTGTGCTGAG  150

seq1  TGTAATAGAACCCGTACCTGGGATTACATTCCACTGCGACACAGTCACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATAGAACCCGTACCTGGGATTACATTCCACTGCGACACAGTCACCT  200

seq1  CAGCAAAATATCTTCTCTTTCATTTTACAGCTGGATAATATCAATTTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAAATATCTTCTCTTTCATTTTACAGCTGGATAATATCAATTTATC  250

seq1  TCTTCCAGGTTCTAACAAATCTATCATTGCTAATGTTGACTTGAGATAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAGGTTCTAACAAATCTATCATTGCTAATGTTGACTTGAGATAAT  300

seq1  TTATATTTCTGTTGTCCAGCACTCTTCAGAGATACTAAGATGAGAAGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATTTCTGTTGTCCAGCACTCTTCAGAGATACTAAGATGAGAAGACT  350

seq1  AAGTTAGCATTTATCTATCTTTGTTCTTATGAATTGTCTACTAATTTACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTAGCATTTATCTATCTTTGTTCTTATGAATTGTCTACTAATTTACC  400

seq1  TTGCCTATTTTCTATTAAGATACTAAGAATTTGTAAGTGCTAATTTGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTATTTTCTATTAAGATACTAAGAATTTGTAAGTGCTAATTTGTAG  450

seq1  CTGCTCTAAGTAAGGCCATAGATGCTCATATAGACTGTCAATGCTTTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCTAAGTAAGGCCATAGATGCTCATATAGACTGTCAATGCTTTCTC  500

seq1  CATTTCTTGCTGTATTGATCTTTTTTCTGACAGAGAGATGGTCCATAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTTGCTGTATTGATCTTTTTTCTGACAGAGAGATGGTCCATAGAA  550

seq1  ACAGTCTCAAGGCTTCTGGACAAGCCCTTCCATTATCAATTCTGTTATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCTCAAGGCTTCTGGACAAGCCCTTCCATTATCAATTCTGTTATTT  600

seq1  TAAAAAGAACTGACATCTTAAAGTATTTCATAGTGAAAAATTACAAAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGAACTGACATCTTAAAGTATTTCATAGTGAAAAATTACAAAACT  650

seq1  AAAGAAAGGAATGTTTTAAATCAGTGATTTTTCAACTTTCCTAATGCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAGGAATGTTTTAAATCAGTGATTTTTCAACTTTCCTAATGCTGC  700

seq1  AACCCTTTAATATAGTTCCTCATGTTATGGTGACCACAAGCCATAAAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTAATATAGTTCCTCATGTTATGGTGACCACAAGCCATAAAATT  750

seq1  TTGTCATTACTTCATAACTTTAATTTTGCTACTATTATAAATCGTAAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATTACTTCATAACTTTAATTTTGCTACTATTATAAATCGTAAATA  800

seq1  TCTGATATGTGGAGTTGCTACCCACAGGTTAATAACTACTGCTTTAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATATGTGGAGTTGCTACCCACAGGTTAATAACTACTGCTTTAAATG  850

seq1  TTAGTCCTTTGCTGA-TTTTTTTTCCCAGAGTCTATAAAACATCCACTTT  899
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCCTTTGCTGATTTTTTTTTCCCAGAGTCTATAAAACATCCACTTT  900

seq1  TTCTTTGTATTTTACTATTTTTATATCTTTGATGTTTTTTTAATCATTTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGTATTTTACTATTTTTATATCTTTGATGTTTTTTTAATCATTTG  950

seq1  CTGGATACATAAGTTTCAAAGATTCCTTTCTTTTTAAAGTGTATTTTCTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATACATAAGTTTCAAAGATTCCTTTCTTTTTAAAGTGTATTTTCTA  1000

seq1  TTTGCTATTTTCGTGTAACACATTTTTCGGTGTTTAA-GTGTTTTC-TCT  1047
      ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  TTTGCTA-TTTCGTGT-ACACATTTTTCGGTGTTTAAGGTGTTTTCTTCT  1048

seq1  CTGGTGCTCCCTGAGGAATCTAAACAGCTGAACAGGGGCAGCATCCTTAA  1097
      |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||
seq2  CTGGTGCTCCCTGA-GAATCTAAACAGCTG-ACA-GGGCAGCATC--TAA  1093

seq1  CTTGCTTTCTGGGTGGCCTCTTTAGCTTGTGGGCTTGTGGTTCGGCTGCA  1147
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| |||||
seq2  CTTGCTTTCTGGGTGGCCTC-TTAGCTGGTGGGCTTG-GGATCGCCTGCA  1141

seq1  GGTTCAACAGC  1158
       ||||||||||
seq2  -GTTCAACAGC  1151