BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256B24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,327,016 - 24,502,890
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEnpp1, Enpp3
Upstream geneRps12, 1110021L09Rik, Vnn3, Vnn1, Taar1, Taar2, Taar3, Taar4, Taar5, Taar6, Taar7a, Taar7b, Taar7c-ps, Taar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf
Downstream geneCrsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256B24.bB6Ng01-256B24.g
ACCGA062164GA062165
length8751,141
definitionB6Ng01-256B24.b B6Ng01-256B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,502,017 - 24,502,890)(24,327,016 - 24,328,133)
sequence
gaattcacatgagcgggacgatgccaagggcagagagactgtccctggtt
gcaggctaggctgtcagtacagttttttattattctaaagctaacttcct
tgttagcggaagaccccattccatctccaggcccagagaggtgcttgtgc
atttccctgtctgcatgacagggtaggattctagcaattttctgctttct
aattcagagattactccatgcgtgtgttgtggtttgagaaaattacatag
aaggatgtttggagattcacataaaacactggagatcagctctctgtctg
aggaatcaggctttaaataagctctttggcgcaccggtgcaattggttgg
tctttaagttttacggagctcttgtttctctgaggttttggtgggtgttt
gtaatttctgttgtcctctcaggagccttctggggaggaattgtgacctg
aaggcatggccctcctgcaacaagcgttaaatctggtcaggtttgatttg
ggcgctgctcctggtcctgctcagtagaaagagctgggttacttgcctaa
ttagatggaaaatcaaaaataaagcaaaaattgcagtggctatttaaagg
agatgcttcatgatttaatttagcataaagtcaaagaattagataatatt
gaacaatacctataatttgatataagcactatgtatgtatgtatatatgt
gatgtatatatataatatataaaacatagcatacatatatatatatgtat
acatatacatacatacatacatacatacatacatatatctatatacatac
acacacatcttctacaccattaagaacttttaaaatctgtgtgagtgtat
gtgtgtttatgtgtgtgtgtgtgta
gaattcaaagatgaagtgaagaacggcagttacacaattgtacatgtggt
ttatactcacgggacttgaagaacttcatttaattatagaagtcctaagg
ttctaaggcttcgagtctcatgtggtaaatagtttcttactgtgtgctgt
ccactttagaaataggaattatcaacatactatgtatttgtgaatgtatt
ccatcagaatcctggtcggagagctgagagaagatggcacttttatggaa
aacaaaaatgattctcatctacttctccttgacctaacttttaaaatatc
aaaaactaattgaggaaaagctggacgcatcctggagcaggagccaaacg
aagtgatgttttcaatcaactgtactcacatgcggataaacaaaattatt
aaaaagtattttgtgtaaacatacttttatacaagaaaacaggtccgaat
gactcacagagcgtctaagtccttcctctacacaggctgggtaataaaga
aactccaaaatgcttccagtttccatccaagatgttaaaaaagaccaagt
tagggaggaaagcggattgagtggtatctttagtctttatcccatatttt
catgcgacttcagagctgcatcaccccatacagtaacccacagagcactt
caacttacctgccattgttctgggtgcgacacaaagcaacttgaacttgg
gaaacagagacagatctaatacaaaccatgtgtagcccaagaatctaaaa
agctatttgtattggaaaattctgatccacatttcaaacctataaatttt
tatcctccttctgcaatgttggcttgtgctcattttttaaaacctaatgc
atctatctgactttactctatgtttgagactaatctcctctaaaactgag
acattcaccataaaaaaattaaagataaacttccattgttttttattatt
ttttttcaaaaaatatatttctttttatggtcattccagaagattccttt
tatggtggaccaagaacaaaaactttcttttttttttattcaatctggga
gattcttttagactaaattctttccagggatggtgtcagcttggcctcaa
gttttggttatacccctcctggcagatgcctattgagtact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24502017_24502890
seq2: B6Ng01-256B24.b_47_921 (reverse)

seq1  TACACACACACACACAT-AACACACATACACTCACACAGATTTTAAAAGT  49
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACACACACACATAAACACACATACACTCACACAGATTTTAAAAGT  50

seq1  TCTTAATGGTGTAGAAGATGTGTGTGTATGTATATAGATATATGTATGTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAATGGTGTAGAAGATGTGTGTGTATGTATATAGATATATGTATGTA  100

seq1  TGTATGTATGTATGTATGTATATGTATACATATATATATATGTATGCTAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTATGTATGTATGTATATGTATACATATATATATATGTATGCTAT  150

seq1  GTTTTATATATTATATATATACATCACATATATACATACATACATAGTGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATATATTATATATATACATCACATATATACATACATACATAGTGC  200

seq1  TTATATCAAATTATAGGTATTGTTCAATATTATCTAATTCTTTGACTTTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATCAAATTATAGGTATTGTTCAATATTATCTAATTCTTTGACTTTA  250

seq1  TGCTAAATTAAATCATGAAGCATCTCCTTTAAATAGCCACTGCAATTTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAAATTAAATCATGAAGCATCTCCTTTAAATAGCCACTGCAATTTTT  300

seq1  GCTTTATTTTTGATTTTCCATCTAATTAGGCAAGTAACCCAGCTCTTTCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTATTTTTGATTTTCCATCTAATTAGGCAAGTAACCCAGCTCTTTCT  350

seq1  ACTGAGCAGGACCAGGAGCAGCGCCCAAATCAAACCTGACCAGATTTAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGCAGGACCAGGAGCAGCGCCCAAATCAAACCTGACCAGATTTAAC  400

seq1  GCTTGTTGCAGGAGGGCCATGCCTTCAGGTCACAATTCCTCCCCAGAAGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTGCAGGAGGGCCATGCCTTCAGGTCACAATTCCTCCCCAGAAGG  450

seq1  CTCCTGAGAGGACAACAGAAATTACAAACACCCACCAAAACCTCAGAGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGAGAGGACAACAGAAATTACAAACACCCACCAAAACCTCAGAGAA  500

seq1  ACAAGAGCTCCGTAAAACTTAAAGACCAACCAATTGCACCGGTGCGCCAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAGCTCCGTAAAACTTAAAGACCAACCAATTGCACCGGTGCGCCAA  550

seq1  AGAGCTTATTTAAAGCCTGATTCCTCAGACAGAGAGCTGATCTCCAGTGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTATTTAAAGCCTGATTCCTCAGACAGAGAGCTGATCTCCAGTGT  600

seq1  TTTATGTGAATCTCCAAACATCCTTCTATGTAATTTTCTCAAACCACAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTGAATCTCCAAACATCCTTCTATGTAATTTTCTCAAACCACAAC  650

seq1  ACACGCATGGAGTAATCTCTGAATTAGAAAGCAGAAAATTGCTAGAATCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGCATGGAGTAATCTCTGAATTAGAAAGCAGAAAATTGCTAGAATCC  700

seq1  TACCCTGTCATGCAGACAGGGAAATGCACAAGCACCTCTCTGGGCCTGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTGTCATGCAGACAGGGAAATGCACAAGCACCTCTCTGGGCCTGGA  750

seq1  GATGGAATGGGGTCTTCCGCTAACAAGGAAGTTAGCTTTAGAATAATAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAATGGGGTCTTCCGCTAACAAGGAAGTTAGCTTTAGAATAATAAA  800

seq1  AAACTGTACTGACAGCCTAGCCTGCAACCAGGGACAGTCTCTCTGCCCTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTACTGACAGCCTAGCCTGCAACCAGGGACAGTCTCTCTGCCCTT  850

seq1  GGCATCGTCCCGCTCATGTGAATTC  874
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCGTCCCGCTCATGTGAATTC  875

seq1: chr10_24327016_24328133
seq2: B6Ng01-256B24.g_67_1207

seq1  GAATTCAAAGATGAAGTGAAGAACGGCAGTTACACAATTGTACATGTGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGATGAAGTGAAGAACGGCAGTTACACAATTGTACATGTGGT  50

seq1  TTATACTCACGGGACTTGAAGAACTTCATTTAATTATAGAAGTCCTAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACTCACGGGACTTGAAGAACTTCATTTAATTATAGAAGTCCTAAGG  100

seq1  TTCTAAGGCTTCGAGTCTCATGTGGTAAATAGTTTCTTACTGTGTGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGGCTTCGAGTCTCATGTGGTAAATAGTTTCTTACTGTGTGCTGT  150

seq1  CCACTTTAGAAATAGGAATTATCAACATACTATGTATTTGTGAATGTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTAGAAATAGGAATTATCAACATACTATGTATTTGTGAATGTATT  200

seq1  CCATCAGAATCCTGGTCGGAGAGCTGAGAGAAGATGGCACTTTTATGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCAGAATCCTGGTCGGAGAGCTGAGAGAAGATGGCACTTTTATGGAA  250

seq1  AACAAAAATGATTCTCATCTACTTCTCCTTGACCTAACTTTTAAAATATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAATGATTCTCATCTACTTCTCCTTGACCTAACTTTTAAAATATC  300

seq1  AAAAACTAATTGAGGAAAAGCTGGACGCATCCTGGAGCAGGAGCCAAACG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTAATTGAGGAAAAGCTGGACGCATCCTGGAGCAGGAGCCAAACG  350

seq1  AAGTGATGTTTTCAATCAACTGTACTCACATGCGGATAAACAAAATTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATGTTTTCAATCAACTGTACTCACATGCGGATAAACAAAATTATT  400

seq1  AAAAAGTATTTTGTGTAAACATACTTTTATACAAGAAAACAGGTCCGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTATTTTGTGTAAACATACTTTTATACAAGAAAACAGGTCCGAAT  450

seq1  GACTCACAGAGCGTCTAAGTCCTTCCTCTACACAGGCTGGGTAATAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCACAGAGCGTCTAAGTCCTTCCTCTACACAGGCTGGGTAATAAAGA  500

seq1  AACTCCAAAATGCTTCCAGTTTCCATCCAAGATGTTAAAAAAGACCAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAAAATGCTTCCAGTTTCCATCCAAGATGTTAAAAAAGACCAAGT  550

seq1  TAGGGAGGAAAGCGGATTGAGTGGTATCTTTAGTCTTTATCCCATATTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGAGGAAAGCGGATTGAGTGGTATCTTTAGTCTTTATCCCATATTTT  600

seq1  CATGCGACTTCAGAGCTGCATCACCCCATACAGTAACCCACAGAGCACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCGACTTCAGAGCTGCATCACCCCATACAGTAACCCACAGAGCACTT  650

seq1  CAACTTACCTGCCATTGTTCTGGGTGCGACACAAAGCAACTTGAACTTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTACCTGCCATTGTTCTGGGTGCGACACAAAGCAACTTGAACTTGG  700

seq1  GAAACAGAGACAGATCTAATACAAACCATGTGTAGCCCAAGAATCTAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGAGACAGATCTAATACAAACCATGTGTAGCCCAAGAATCTAAAA  750

seq1  AGCTATTTGTATTGGAAAATTCTGATCCACATTTCAAACCTATAAATTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTTGTATTGGAAAATTCTGATCCACATTTCAAACCTATAAATTTT  800

seq1  TATCCTCCTTCTGCAATGTTGGCTTGTGCTCA-TTTTTAAAACCTAATGC  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TATCCTCCTTCTGCAATGTTGGCTTGTGCTCATTTTTTAAAACCTAATGC  850

seq1  ATCTATCTGAC-TTACTCTATGTTTGAGACTAATCTCCTCTAAAACTGAG  898
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTGACTTTACTCTATGTTTGAGACTAATCTCCTCTAAAACTGAG  900

seq1  ACATTCACCATAAAAAAATTAAAGATAAACTTCCATTGTTT----TTATA  944
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| 
seq2  ACATTCACCATAAAAAAATTAAAGATAAACTTCCATTGTTTTTTATTATT  950

seq1  TTTTTTCAAAAAATATATT--CTTTTAT-GTCATTCCAGAAGATT-CTTT  990
      |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  TTTTTTCAAAAAATATATTTCTTTTTATGGTCATTCCAGAAGATTCCTTT  1000

seq1  TATG--TGACC-AGA--CAAAACTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTG  1035
      ||||   |||| |||   |||||||||   |||||||||| || ||||||
seq2  TATGGTGGACCAAGAACAAAAACTTTC---TTTTTTTTTTATTCAATCTG  1047

seq1  AG---TTC-TTTAG-CTAAATTCTTCCCA-GGAT-GTGTCAGCTTGG-CT  1077
       |   ||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||
seq2  GGAGATTCTTTTAGACTAAATTCTTTCCAGGGATGGTGTCAGCTTGGCCT  1097

seq1  C-AGTGTTTGTTATA-CCCTC--TGCAGAGAGGCTATTGAGTACT  1118
      | ||| || |||||| |||||   |||||  | ||||||||||||
seq2  CAAGTTTTGGTTATACCCCTCCTGGCAGA-TGCCTATTGAGTACT  1141