BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264P24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 21,421,319 - 21,555,904
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039936, LOC628133
Upstream genePde7b, LOC667202, Ahi1, Myb, LOC100039870, Hbs1l, Aldh8a1, LOC100039906, 1700020N01Rik, EG432436
Downstream geneSgk, LOC667254, LOC665523, 4930444G20Rik, LOC100039992, E030030I06Rik, LOC665543, Ube2q2l, Raet1e, LOC100040023, LOC100038830, LOC667280, EG667281, LOC432438, Raet1d, LOC667299, LOC667303, LOC100040072, LOC100040078, Slc2a12, Tbpl1, Tcf21
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264P24.bB6Ng01-264P24.g
ACCGA068762GA068763
length1,1411,046
definitionB6Ng01-264P24.b B6Ng01-264P24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,554,762 - 21,555,904)(21,421,319 - 21,422,368)
sequence
gaattctaggattcaatgtgtccccaaaagaaagaaaatttttccatcac
acattggtgaaatagcagtaataagccctgactcacagtttaatagattc
aaaagcaaacacaagtagaatatattttctccacttgtcacaaaatttct
aacttcaaagctttatggaatctaagtcttaaaatccaatatgtaacaaa
atcagcaaggttgcttctgctgttcggttccatctcattggtctcagggg
cttcagtctggagcaaacctgtgctccagatgcagccgaagctgtgatgc
tccatctgcccagggttgtttatctcctttaataagcaaggttaataatg
ttcaggggagcaaggatgggcagtgatgacaagactgccttggcgtttga
ggacagtctctatctcagttaatgagtccatctgattcatccagagtgga
agtacacagaccacctgccccacagccatctgggaagggcagtaggatgg
cctctggcctagtgactgccccatccaactctgtaatgagctctgcatcc
agttgttgagtcctgctgtctaggaggtaaagagttaatgaaaataggtt
ggtgaccccttggaaagtctgacccataaacatatgtgcatcgttttgtt
agagagaaggacaagaaggcaacaagaacaaaaggaactctggatttcag
aaggcacttacttaaatggatgggctcctcggagtgtcttccccttgacc
ttgtctcgcagaaagggaggctgcagtcgcccactgccgtggaagctttc
agaggggggcaaggagcaggaattcaaagtgatcattgctaacatccatt
tacagccgcatccccccggggaatgtaattagatttaatgggcttagagc
ttcagagtgaaagtgcatgggatttgatttacttaacttaattagaccta
tactttgggttatctcattcaaatgtgtttccatttcagctttgactcct
gggccttattagacagaacccaagttccctactctgaagaaatgactggc
atcctcactcttctttcacgtctcacgatgcagggtctgctgtctcaggt
ctccaccttgatgtcgaaatgtggccttggtatagcatgag
gaattctactttaatgaggctgcagtggcttttacccttatttcctttgt
gtttattctgggtagtgcctgcaagaagactattttggttaaggacactg
ttcttgtcctaaggaggaagtgagcacactgagccttgtctccagccctt
gagcagctagacaggtcagacagacagctctgtcagccaggctccaggaa
gggctctcctgtctcatggaacaaccaaacaattgttactatttacaatg
gcccatatgccgaagtattcttagaacaatgaggaaagggaaagtcggcc
accaggcaggaaagagggctttcaagccacagcaagctcagagaatgtgc
atgccctttaaatgtaaacagctggctgcagagcttatccaaataacaat
gtacagggtgcttgccatgtgccggacacttgacatagccattgtccctg
atcccataaccatttcaccagaccagcatgatcccaatctaatctgtgaa
gaaatcaaggcaaagagagatgctaacaagggaaacacgtttccaagggt
gtggaacgttgtagcgaagctacaactcatccaaatcagagcctatgtat
tcttagctaccactcttaaaaattaaaaataaagaaaaagtttacacttc
tttgaaaaggaatccataatcttgttactaaaagcacaaggcagtacaaa
gaacaccaataacagtttgaaatatgctctttttgagttcctctgaattt
cacagaggcagtgggaacttgaagaaagtatgctaaatgttgtatgtgac
agcccaacagcttcccttgccatatacataatggatacccttggcgagct
ctccaactatgtaaatgacacagaacaatctcttgttctgcttatagtaa
ttttagaccttaacaaatgtatgcaaaaacttccaattaacaaaaatagg
aatctgctgggcacttgggttattctcaatgaatgggcttcaatgtgact
gatgttttctgagagctgctatagtagaaggagaccttttttttaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_21554762_21555904
seq2: B6Ng01-264P24.b_47_1187 (reverse)

seq1  CTCATGCTATA-CAAAGCCACA-TTCGACATCAAGTTGGGAGGACCTGAG  48
      ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||
seq2  CTCATGCTATACCAAGGCCACATTTCGACATCAAGGTGG--AGACCTGAG  48

seq1  ACAGCAGACCCTGGCAACCGTGGAGGACCGTGAAAGAAGAGTGA-GATGC  97
      |||||||||||||   | ||| |||   |||||||||||||||| |||||
seq2  ACAGCAGACCCTG--CATCGT-GAG--ACGTGAAAGAAGAGTGAGGATGC  93

seq1  CAGTCATTTCTTCAGAGTAGGGAAACTTGG--TCTGTCTAATAAGG-CCA  144
      |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||
seq2  CAGTCATTTCTTCAGAGTAGGG-AACTTGGGTTCTGTCTAATAAGGCCCA  142

seq1  GGAGTCAAAGCTGAAATGGAAACACATTTGAATGAGATAACCCAAAGTAT  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCAAAGCTGAAATGGAAACACATTTGAATGAGATAACCCAAAGTAT  192

seq1  AGGTCTAATTAAGTTAAGTAAATCAAATCCCATGCACTTTCACTCTGAAG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTAATTAAGTTAAGTAAATCAAATCCCATGCACTTTCACTCTGAAG  242

seq1  CTCTAAGCCCATTAAATCTAATTACATTCCCCGGGGGGATGCGGCTGTAA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAGCCCATTAAATCTAATTACATTCCCCGGGGGGATGCGGCTGTAA  292

seq1  ATGGATGTTAGCAATGATCACTTTGAATTCCTGCTCCTTGCCCCCCTCTG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGTTAGCAATGATCACTTTGAATTCCTGCTCCTTGCCCCCCTCTG  342

seq1  AAAGCTTCCACGGCAGTGGGCGACTGCAGCCTCCCTTTCTGCGAGACAAG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTTCCACGGCAGTGGGCGACTGCAGCCTCCCTTTCTGCGAGACAAG  392

seq1  GTCAAGGGGAAGACACTCCGAGGAGCCCATCCATTTAAGTAAGTGCCTTC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGGGGAAGACACTCCGAGGAGCCCATCCATTTAAGTAAGTGCCTTC  442

seq1  TGAAATCCAGAGTTCCTTTTGTTCTTGTTGCCTTCTTGTCCTTCTCTCTA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCCAGAGTTCCTTTTGTTCTTGTTGCCTTCTTGTCCTTCTCTCTA  492

seq1  ACAAAACGATGCACATATGTTTATGGGTCAGACTTTCCAAGGGGTCACCA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACGATGCACATATGTTTATGGGTCAGACTTTCCAAGGGGTCACCA  542

seq1  ACCTATTTTCATTAACTCTTTACCTCCTAGACAGCAGGACTCAACAACTG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATTTTCATTAACTCTTTACCTCCTAGACAGCAGGACTCAACAACTG  592

seq1  GATGCAGAGCTCATTACAGAGTTGGATGGGGCAGTCACTAGGCCAGAGGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAGAGCTCATTACAGAGTTGGATGGGGCAGTCACTAGGCCAGAGGC  642

seq1  CATCCTACTGCCCTTCCCAGATGGCTGTGGGGCAGGTGGTCTGTGTACTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTACTGCCCTTCCCAGATGGCTGTGGGGCAGGTGGTCTGTGTACTT  692

seq1  CCACTCTGGATGAATCAGATGGACTCATTAACTGAGATAGAGACTGTCCT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTGGATGAATCAGATGGACTCATTAACTGAGATAGAGACTGTCCT  742

seq1  CAAACGCCAAGGCAGTCTTGTCATCACTGCCCATCCTTGCTCCCCTGAAC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACGCCAAGGCAGTCTTGTCATCACTGCCCATCCTTGCTCCCCTGAAC  792

seq1  ATTATTAACCTTGCTTATTAAAGGAGATAAACAACCCTGGGCAGATGGAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTAACCTTGCTTATTAAAGGAGATAAACAACCCTGGGCAGATGGAG  842

seq1  CATCACAGCTTCGGCTGCATCTGGAGCACAGGTTTGCTCCAGACTGAAGC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACAGCTTCGGCTGCATCTGGAGCACAGGTTTGCTCCAGACTGAAGC  892

seq1  CCCTGAGACCAATGAGATGGAACCGAACAGCAGAAGCAACCTTGCTGATT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGACCAATGAGATGGAACCGAACAGCAGAAGCAACCTTGCTGATT  942

seq1  TTGTTACATATTGGATTTTAAGACTTAGATTCCATAAAGCTTTGAAGTTA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACATATTGGATTTTAAGACTTAGATTCCATAAAGCTTTGAAGTTA  992

seq1  GAAATTTTGTGACAAGTGGAGAAAATATATTCTACTTGTGTTTGCTTTTG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTTTGTGACAAGTGGAGAAAATATATTCTACTTGTGTTTGCTTTTG  1042

seq1  AATCTATTAAACTGTGAGTCAGGGCTTATTACTGCTATTTCACCAATGTG  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATTAAACTGTGAGTCAGGGCTTATTACTGCTATTTCACCAATGTG  1092

seq1  TGATGGAAAAATTTTCTTTCTTTTGGGGACACATTGAATCCTAGAATTC  1143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGAAAAATTTTCTTTCTTTTGGGGACACATTGAATCCTAGAATTC  1141

seq1: chr10_21421319_21422368
seq2: B6Ng01-264P24.g_66_1111

seq1  GAATTCTACTTTAATGAGGCTGCAGTGGCTTTTACCCTTATTTCCTTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTTTAATGAGGCTGCAGTGGCTTTTACCCTTATTTCCTTTGT  50

seq1  GTTTATTCTGGGTAGTGCCTGCAAGAAGACTATTTTGGTTAAGGACACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTCTGGGTAGTGCCTGCAAGAAGACTATTTTGGTTAAGGACACTG  100

seq1  TTCTTGTCCTAAGGAGGAAGTGAGCACACTGAGCCTTGTCTCCAGCCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTCCTAAGGAGGAAGTGAGCACACTGAGCCTTGTCTCCAGCCCTT  150

seq1  GAGCAGCTAGACAGGTCAGACAGACAGCTCTGTCAGCCAGGCTCCAGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCTAGACAGGTCAGACAGACAGCTCTGTCAGCCAGGCTCCAGGAA  200

seq1  GGGCTCTCCTGTCTCATGGAACAACCAAACAATTGTTACTATTTACAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTCCTGTCTCATGGAACAACCAAACAATTGTTACTATTTACAATG  250

seq1  GCCCATATGCCGAAGTATTCTTAGAACAATGAGGAAAGGGAAAGTCGGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATATGCCGAAGTATTCTTAGAACAATGAGGAAAGGGAAAGTCGGCC  300

seq1  ACCAGGCAGGAAAGAGGGCTTTCAAGCCACAGCAAGCTCAGAGAATGTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCAGGAAAGAGGGCTTTCAAGCCACAGCAAGCTCAGAGAATGTGC  350

seq1  ATGCCCTTTAAATGTAAACAGCTGGCTGCAGAGCTTATCCAAATAACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCTTTAAATGTAAACAGCTGGCTGCAGAGCTTATCCAAATAACAAT  400

seq1  GTACAGGGTGCTTGCCATGTGCCGGACACTTGACATAGCCATTGTCCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGGGTGCTTGCCATGTGCCGGACACTTGACATAGCCATTGTCCCTG  450

seq1  ATCCCATAACCATTTCACCAGACCAGCATGATCCCAATCTAATCTGTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCATAACCATTTCACCAGACCAGCATGATCCCAATCTAATCTGTGAA  500

seq1  GAAATCAAGGCAAAGAGAGATGCTAACAAGGGAAACACGTTTCCAAGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAAGGCAAAGAGAGATGCTAACAAGGGAAACACGTTTCCAAGGGT  550

seq1  GTGGAACGTTGTAGCGAAGCTACAACTCATCCAAATCAGAGCCTATGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAACGTTGTAGCGAAGCTACAACTCATCCAAATCAGAGCCTATGTAT  600

seq1  TCTTAGCTACCACTCTTAAAAATTAAAAATAAAGAAAAAGTTTACACTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGCTACCACTCTTAAAAATTAAAAATAAAGAAAAAGTTTACACTTC  650

seq1  TTTGAAAAGGAATCCATAATCTTGTTACTAAAAGCACAAGGCAGTACAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAAAGGAATCCATAATCTTGTTACTAAAAGCACAAGGCAGTACAAA  700

seq1  GAACACCAATAACAGTTTGAAATATGCTCTTTTTGAGTTCCTCTGAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACCAATAACAGTTTGAAATATGCTCTTTTTGAGTTCCTCTGAATTT  750

seq1  CACAGAGGCAGTGGGAACTTGAAGAAAGTATGCTAAATGTTGTATGTGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGGCAGTGGGAACTTGAAGAAAGTATGCTAAATGTTGTATGTGAC  800

seq1  AGCCCAACAGCTTCCCTTGCCATATACATAATGGATACCCTTGGCGAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAACAGCTTCCCTTGCCATATACATAATGGATACCCTTGGCGAGCT  850

seq1  CTCCAACTATGTAAATGACACAGAACAATCTCTTGTTCTGCTTATAGTAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAACTATGTAAATGACACAGAACAATCTCTTGTTCTGCTTATAGTAA  900

seq1  TTTTAGACCTTAACAAAATGTATGCAAAAAC-TCCAATTAACAAAAATAG  949
      |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGACCTTAAC-AAATGTATGCAAAAACTTCCAATTAACAAAAATAG  949

seq1  GAATCTGCTGGGCAACTTGGGTTATTCTCAAATGAAATGGGCTTCAATGT  999
      ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  GAATCTGCTGGGC-ACTTGGGTTATTCTC-AATG-AATGGGCTTCAATGT  996

seq1  GACTGAATGTTTCTGAGAGCTGCTATAGTAGAAAGGAGACTTTTTTTTTA  1049
      ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  GACTGATGTTTTCTGAGAGCTGCTATAGTAG-AAGGAGACCTTTTTTTTA  1045

seq1  A  1050
      |
seq2  A  1046