BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268K22
Chromosome10 (Build37)
Map Location 76,512,208 - 76,656,802
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc19a1, Col18a1, LOC665762
Upstream geneSlc5a4b, Slc5a4a, LOC100040150, Prmt2, S100b, Dip2a, Pcnt, 2610028H24Rik, A130042E20Rik, Mcm3ap, Lss, 1700027D21Rik, Ftcd, Col6a2, Col6a1, Pcbp3, LOC100041099
Downstream genePofut2, Adarb1, 1810008A18Rik, Itgb2, Pttg1ip, Sumo3, Ube2g2, LOC674243, LOC670895, Krtap12-1, A030009A09Rik, LOC100041250, LOC100041261, LOC634517, LOC100041281, LOC634504, LOC675294, LOC670880, LOC100040299, LOC675238, C330046G03Rik, EG544710, LOC100041351, 1700009J07Rik, Lrrc3, Trpm2, 1810043G02Rik, Pfkl, Aire, Dnmt3l, Icosl, D10Jhu81e, Pwp2, Tmem1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268K22.bB6Ng01-268K22.g
ACCGA071475GA071476
length1,1521,107
definitionB6Ng01-268K22.b B6Ng01-268K22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,655,640 - 76,656,802)(76,512,208 - 76,513,318)
sequence
gaattctagaataattagcatcattctccgggaaggctgataactaggga
taatgttccttatgtagaatgagctttcatgttaaaatggcagcatgtta
gaatagcgatctaggactaagtccctaatgtccttgggaaggaccccctt
cagccacagacactttgtgggaacctcacaaacaagcctgttaaccttgt
ttacattggagctctcctggcttcctgcattcctgagatctagagtttta
acctatcaattgtcatcttgtcaggtgccctcaggaaagatccagtaaca
ggctcatttaaattccttagaaaccctttgaagataatgactttaaaact
caccaaaatcctctgtttggccacaatggagggctggggagatgactcag
tcagatttgtgtgtgtcatgcaagcatagggttctcagcttgagccccca
gaaacagtgtaaaataaaactgggcagggccacttaaccagtgactccaa
cactggggaaggtggaggcaggaggatgcctggggctccatggccaggca
gtgtagccaattgttgagctctaggttcaatgagagaccctgttgaacaa
caaccacaacaacaaccaccacaacaaaggtggagagcaacctgtgacaa
cactcgatgtcgatctcgcacatgcacgtgcacgcatacatatacataag
taaaaagtacttttagaaatctctctttaagtgtgcttcatactgaaatt
cttttctgtgttgacgccgaaagttacagttttatgttagtctctgttta
aaaacaaaacaaaaacaacaataagacaaacaaacaaacaaaacttctca
gtaggcttggctctcatccctgccatcccgacaaggtgagggaacggcat
agagcacactggaaattctgagggccatcttcatgtccaagaggcaaaat
agcttaacgaagcaaagcctgatcatggtgatagcttcgtcgcgaaatga
cttctctggccccatgggagcagccatagctcagtgctgacgtgggttat
cgggacggctttaacggtgcaaagtgagccgtgatgttctttgagagccg
aagctgtgccgcccactagatgcttggcagtgtttggatgaccggatgct
gc
gaattccctaagtagggcaggggttgggacaagggtgggcacaaagcctg
cagttacccagactctctttctttcagttccgtatctacttcatatactt
cctgatgctgtctatcacctgctttgcctgggcggggctggatggcttaa
ggtactgccagcgtggtcgccaccagcccctggcccaggcccaggagctg
aggagtcccttggagacttctgtgcaagcgataagcctacaggatggaga
cctaaggggaccgcagccctcagcgccacagctgctctcagaggatggca
tggaggacgacaggggagacttaagagtcgaagccaaggcttgaccttcc
tagcttcatcccagttcagcggcgggattcctgactcagaggcagcccct
cctgtttgcactccacctgaaccagcctgggcctgatgctacacacagtg
ctcccagtcgatgttgccttgagtccaagacatacagggggcccccgctg
ttgccttttaggagcctttaggttaggccacagaaccctccttaaggggc
cacctgttagcttatccttctgaggaccctaaacccagcctacttcatgc
tttagcaatggctgtagcctgctaccgacactcaagggcagctccctggc
tttgtgaaccacgtgccaggccactgcgagtctgggttgtctattgcttg
ccaagaagaacctgtgtcgggctcaactatgcccaccaggccattctgcc
ttttttgctctgggaagctctgggcaaatcatgtctgccccttagggcta
gtgaggtagcccagatgccagccaaggtccgctgagcctgcaagggtgcc
agttgcctgccctaggctcctggctatgctgccatacatccttccactat
cggaggtgcttgtttaaatgggtttctgattctttttaacttgacattaa
aatggagaactaccttgggctttctgttgtgagacactagagtcagagga
gcactaggcataattcccatctgatgaggtagcggcagaactcagcccag
cgtcctcccatgtccctctgtcatccctatgactggtacacagcccaaaa
ggactgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_76655640_76656802
seq2: B6Ng01-268K22.b_47_1198 (reverse)

seq1  GCAGCATCCGCTCATTCAAACACCTGCCAAGCATCTAAGTGGGCGGCACA  50
      |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCAGCATCCGGTCATCCAAACA-CTGCCAAGCATCT-AGTGGGCGGCACA  48

seq1  GCTTCCGGCCTCTC-AAGAACATCACGGGCTCCACTTTGCACCGTTAAAG  99
      |||||  | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  GCTTC--GGCTCTCAAAGAACATCAC-GGCT-CACTTTGCACCGTTAAAG  94

seq1  CCGGTTCCCGAT-ACCCACGTCAGCACTGAGCTATTGGCCTGGCTCCCAT  148
      |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||
seq2  CCG--TCCCGATAACCCACGTCAGCACTGAGCTA-TGGC--TGCTCCCAT  139

seq1  GGGGCCAGAGAAGTCATTTCGCGACGAAGCTATCACCATGATCAGGCTTT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GGGGCCAGAGAAGTCATTTCGCGACGAAGCTATCACCATGATCAGGC-TT  188

seq1  TGCTTCGTTAAGCTATTTTGCCTCTTGGACATGAAGATGGCCCTCAGAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCGTTAAGCTATTTTGCCTCTTGGACATGAAGATGGCCCTCAGAAT  238

seq1  TTCCAGTGTGCTCTATGCCGTTCCCTCACCTTGTCGGGATGGCAGGGATG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTGTGCTCTATGCCGTTCCCTCACCTTGTCGGGATGGCAGGGATG  288

seq1  AGAGCCAAGCCTACTGAGAAGTTTTTGTTTGTTTGTTTGTCTTATTGTTG  348
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAAGCCTACTGAGAAG-TTTTGTTTGTTTGTTTGTCTTATTGTTG  337

seq1  TTTTTGTTTTGTTTTTAAACAGAGACTAACATAAAACTGTAACTTTCGGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTTTGTTTTTAAACAGAGACTAACATAAAACTGTAACTTTCGGC  387

seq1  GTCAACACAGAAAAGAATTTCAGTATGAAGCACACTTAAAGAGAGATTTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACACAGAAAAGAATTTCAGTATGAAGCACACTTAAAGAGAGATTTC  437

seq1  TAAAAGTACTTTTTACTTATGTATATGTATGCGTGCACGTGCATGTGCGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTACTTTTTACTTATGTATATGTATGCGTGCACGTGCATGTGCGA  487

seq1  GATCGACATCGAGTGTTGTCACAGGTTGCTCTCCACCTTTGTTGTGGTGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCGACATCGAGTGTTGTCACAGGTTGCTCTCCACCTTTGTTGTGGTGG  537

seq1  TTGTTGTTGTGGTTGTTGTTCAACAGGGTCTCTCATTGAACCTAGAGCTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTTGTGGTTGTTGTTCAACAGGGTCTCTCATTGAACCTAGAGCTC  587

seq1  AACAATTGGCTACACTGCCTGGCCATGGAGCCCCAGGCATCCTCCTGCCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTGGCTACACTGCCTGGCCATGGAGCCCCAGGCATCCTCCTGCCT  637

seq1  CCACCTTCCCCAGTGTTGGAGTCACTGGTTAAGTGGCCCTGCCCAGTTTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTTCCCCAGTGTTGGAGTCACTGGTTAAGTGGCCCTGCCCAGTTTT  687

seq1  ATTTTACACTGTTTCTGGGGGCTCAAGCTGAGAACCCTATGCTTGCATGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACACTGTTTCTGGGGGCTCAAGCTGAGAACCCTATGCTTGCATGA  737

seq1  CACACACAAATCTGACTGAGTCATCTCCCCAGCCCTCCATTGTGGCCAAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAAATCTGACTGAGTCATCTCCCCAGCCCTCCATTGTGGCCAAA  787

seq1  CAGAGGATTTTGGTGAGTTTTAAAGTCATTATCTTCAAAGGGTTTCTAAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGATTTTGGTGAGTTTTAAAGTCATTATCTTCAAAGGGTTTCTAAG  837

seq1  GAATTTAAATGAGCCTGTTACTGGATCTTTCCTGAGGGCACCTGACAAGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTAAATGAGCCTGTTACTGGATCTTTCCTGAGGGCACCTGACAAGA  887

seq1  TGACAATTGATAGGTTAAAACTCTAGATCTCAGGAATGCAGGAAGCCAGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATTGATAGGTTAAAACTCTAGATCTCAGGAATGCAGGAAGCCAGG  937

seq1  AGAGCTCCAATGTAAACAAGGTTAACAGGCTTGTTTGTGAGGTTCCCACA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTCCAATGTAAACAAGGTTAACAGGCTTGTTTGTGAGGTTCCCACA  987

seq1  AAGTGTCTGTGGCTGAAGGGGGTCCTTCCCAAGGACATTAGGGACTTAGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTCTGTGGCTGAAGGGGGTCCTTCCCAAGGACATTAGGGACTTAGT  1037

seq1  CCTAGATCGCTATTCTAACATGCTGCCATTTTAACATGAAAGCTCATTCT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGATCGCTATTCTAACATGCTGCCATTTTAACATGAAAGCTCATTCT  1087

seq1  ACATAAGGAACATTATCCCTAGTTATCAGCCTTCCCGGAGAATGATGCTA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGGAACATTATCCCTAGTTATCAGCCTTCCCGGAGAATGATGCTA  1137

seq1  ATTATTCTAGAATTC  1163
      |||||||||||||||
seq2  ATTATTCTAGAATTC  1152

seq1: chr10_76512208_76513318
seq2: B6Ng01-268K22.g_64_1170

seq1  GAATTCCCTAAGTAGGGCAGGGGTTGGGACAAGGGTGGGCACAAAGCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTAAGTAGGGCAGGGGTTGGGACAAGGGTGGGCACAAAGCCTG  50

seq1  CAGTTACCCAGACTCTCTTTCTTTCAGTTCCGTATCTACTTCATATACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTACCCAGACTCTCTTTCTTTCAGTTCCGTATCTACTTCATATACTT  100

seq1  CCTGATGCTGTCTATCACCTGCTTTGCCTGGGCGGGGCTGGATGGCTTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATGCTGTCTATCACCTGCTTTGCCTGGGCGGGGCTGGATGGCTTAA  150

seq1  GGTACTGCCAGCGTGGTCGCCACCAGCCCCTGGCCCAGGCCCAGGAGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTGCCAGCGTGGTCGCCACCAGCCCCTGGCCCAGGCCCAGGAGCTG  200

seq1  AGGAGTCCCTTGGAGACTTCTGTGCAAGCGATAAGCCTACAGGATGGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTCCCTTGGAGACTTCTGTGCAAGCGATAAGCCTACAGGATGGAGA  250

seq1  CCTAAGGGGACCGCAGCCCTCAGCGCCACAGCTGCTCTCAGAGGATGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGGGGACCGCAGCCCTCAGCGCCACAGCTGCTCTCAGAGGATGGCA  300

seq1  TGGAGGACGACAGGGGAGACTTAAGAGTCGAAGCCAAGGCTTGACCTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGACGACAGGGGAGACTTAAGAGTCGAAGCCAAGGCTTGACCTTCC  350

seq1  TAGCTTCATCCCAGTTCAGCGGCGGGATTCCTGACTCAGAGGCAGCCCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCATCCCAGTTCAGCGGCGGGATTCCTGACTCAGAGGCAGCCCCT  400

seq1  CCTGTTTGCACTCCACCTGAACCAGCCTGGGCCTGATGCTACACACAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTTGCACTCCACCTGAACCAGCCTGGGCCTGATGCTACACACAGTG  450

seq1  CTCCCAGTCGATGTTGCCTTGAGTCCAAGACATACAGGGGGCCCCCGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGTCGATGTTGCCTTGAGTCCAAGACATACAGGGGGCCCCCGCTG  500

seq1  TTGCCTTTTAGGAGCCTTTAGGTTAGGCCACAGAACCCTCCTTAAGGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTTTAGGAGCCTTTAGGTTAGGCCACAGAACCCTCCTTAAGGGGC  550

seq1  CACCTGTTAGCTTATCCTTCTGAGGACCCTAAACCCAGCCTACTTCATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGTTAGCTTATCCTTCTGAGGACCCTAAACCCAGCCTACTTCATGC  600

seq1  TTTAGCAATGGCTGTAGCCTGCTACCGACACTCAAGGGCAGCTCCCTGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCAATGGCTGTAGCCTGCTACCGACACTCAAGGGCAGCTCCCTGGC  650

seq1  TTTGTGAACCACGTGCCAGGCCACTGCGAGTCTGGGTTGTCTATTGCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGAACCACGTGCCAGGCCACTGCGAGTCTGGGTTGTCTATTGCTTG  700

seq1  CCAAGAAGAACCTGTGTCGGGCTCAACTATGCCCACCAGGCCATTCTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAGAACCTGTGTCGGGCTCAACTATGCCCACCAGGCCATTCTGCC  750

seq1  TTTTTTGCTCTGGGAAGCTCTGGGCAAATCATGTCTGCCCCTTAGGGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGCTCTGGGAAGCTCTGGGCAAATCATGTCTGCCCCTTAGGGCTA  800

seq1  GTGAGGTAGCCCAGATGCCAGCCAAGGTCCGCTGAGCCTGC-AGGGTGCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGAGGTAGCCCAGATGCCAGCCAAGGTCCGCTGAGCCTGCAAGGGTGCC  850

seq1  AGTTGCCTGCCCTAGGCTCCTGGCTATGCTGCCATACATCCTTCCACTAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCTGCCCTAGGCTCCTGGCTATGCTGCCATACATCCTTCCACTAT  900

seq1  CGGAGGTGCTTGTTTAAATGGTTTTCTGATTTCTTTTTTAACTTGACATT  949
      ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||
seq2  CGGAGGTGCTTGTTTAAATGGGTTTCTGATT--CTTTTTAACTTGACATT  948

seq1  AAAATGGAGAACTACCTTGGGCTTTTCTGTTGTGAGACACTAGAGTCAGA  999
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGAGAACTACCTTGGGC-TTTCTGTTGTGAGACACTAGAGTCAGA  997

seq1  GGAGCACTAGGCAT-ATTCCCATCTGATGAGGTAGCGGCAGACTTCAGCC  1048
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  GGAGCACTAGGCATAATTCCCATCTGATGAGGTAGCGGCAGAACTCAGCC  1047

seq1  CAGCGTCCTCCCTTGTCCCTCCTGTCATCCCTAAATGACTTGTCACACAG  1098
      |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||
seq2  CAGCGTCCTCCCATGTCCCT-CTGTCATCCCT--ATGACTGGT-ACACAG  1093

seq1  CCC-AGAGGACTGC  1111
      ||| | ||||||||
seq2  CCCAAAAGGACTGC  1107