BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-269G07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 71,179,696 - 71,277,545
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC622812, EG327767
Upstream geneBicc1, LOC622551, C730027H18Rik, Tfam, Ube2d1, LOC665472, Zcd1, Ipmk, LOC100039860, LOC216081, EG216082
Downstream gene1700049L16Rik, LOC100040505, Zwint
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-269G07.bB6Ng01-269G07.g
ACCGA072005GA072006
length9151,188
definitionB6Ng01-269G07.b B6Ng01-269G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,179,696 - 71,180,605)(71,276,364 - 71,277,545)
sequence
gaattcctccttcaccctcacattgactgttgtgttgataaaaataagca
aacttcttttttagagcctctgttatgaaggcagggcagcagggtcagtt
gtatccttgggcctaggctttacatccttggacctcttgacttaccataa
cttcacaatgttcatgtctttttaaagatatctagcatatttggtatgtc
gggcttctttgggtgacccttagccaaagtctttccagcatctcttttgt
tctccctgtcctttaaccagatcaagagcagatatactttggtggagcac
caatggaggaggaggggaagaaggtgatggtgctatggtaacggatgtgg
atgtatctaagtgacctgaactgggattctgttgctcctgcagggtcaca
atcttggcattctgagctctaatagcagcaagctcattctggagtgtcca
gatcctcttcaaggcttcctcatgggtctcactttggaggaggctcatct
tgaaagaagttcaagaaggaaatatgcctcctctggggtttctcagagaa
aggaaggtcttcttcaaggggagaggcttgggccttacctctgccctctt
gttgagcaccctccttctgtagatccaacatcagcaaaagatgccatcac
atcctctcctaggactcttggatactgaatcagagatatgtgggtaccaa
ttttccttgatgatacttcaagatgaaccatacaggtttacagaccaaaa
tacacactgaccccaatttgctgaaacaccatcctcatgggcactttatt
ccagcccagcatttagatggccaagtcttcccatcatgcagttgaagtac
ttcaggcatcaatagcagcacatggtccatagaacatacttctgcttgct
ttgatatttctattt

gaattcaggttttcaaaatcccactatggaaagcagctgaagttggagac
ttggcagaaatgatcaccctttaccccgtgagcattagaaggctttatag
tacaggcaaggtctcaagggcattctcttcatccagaatcccagccatgc
cctgtaaagcaacagtacctatgaataataaatgatcagtctatacctct
agaaccaccatctccaggagagaaggtagacaggccccgactgggatcca
ctcttgagctacaggttatggccctgaatgtgaacattgcccatgaccct
agtctttcctaatctggtgagaatcagccccaatcctaactgttggtact
gtgtactaccacatgcactgaacattcaacatttacagcaaattgtttag
gggaaaaaaaatctctgttcttggcctctgccatacttaaaacaatgaaa
acagttataatttggacataaagtgtcccttggtgatgcacaggttgagg
cttgctcctcagcagtatctcaactgagaggacatcagggcattgatcta
ctccatggatcagttcattgatggattcatgactggaatgcatcattgga
tggtggtaaacattaggttctaagtcttatatataagagagtcttatttc
actaaagcacatgaatcaatccaatttcacagatggtagatctattcaca
acaaatgtttcaggatgtagttttctccaaattcactggaaatactggta
tttggaaatttcaatcaccctagccactgtccacctctttacttctcccc
tgtctttgtacagcttcagtccagtttcctcatacccaactggtccctga
ctatattgccatgtctataactaagttaaatgtctgtcactataaatgct
cacctaaagagtctgctgcctttggggccacagtcactgccaggcttctt
cagaaaggaaggcactatgtgatcactcattaccccttgctacccaatgt
tctttccagttttgttctctgcttactattctgtgaatatgcaatccctt
tggctgcttgattctgattgtgtttggctgtgcttgagattccagacttc
ctttctatcgctattggtctttttttgaagttagtctgcataatttgacc
cacaggtatttaattcctctttgatcacatccttggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_71179696_71180605
seq2: B6Ng01-269G07.b_44_957

seq1  GAATTCCTCCTTCACCCTCACATTGACTGTTGTGTTGATAAAAATAAGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTTCACCCTCACATTGACTGTTGTGTTGATAAAAATAAGCA  50

seq1  AACTTCTTTTTTAGAGCCTCTGTTATGAAGGCAGGGCAGCAGGGTCAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTTTTTTAGAGCCTCTGTTATGAAGGCAGGGCAGCAGGGTCAGTT  100

seq1  GTATCCTTGGGCCTAGGCTTTACATCCTTGGACCTCTTGACTTACCATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCTTGGGCCTAGGCTTTACATCCTTGGACCTCTTGACTTACCATAA  150

seq1  CTTCACAATGTTCATGTCTTTTTAAAGATATCTAGCATATTTGGTATGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACAATGTTCATGTCTTTTTAAAGATATCTAGCATATTTGGTATGTC  200

seq1  GGGCTTCTTTGGGTGACCCTTAGCCAAAGTCTTTCCAGCATCTCTTTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTCTTTGGGTGACCCTTAGCCAAAGTCTTTCCAGCATCTCTTTTGT  250

seq1  TCTCCCTGTCCTTTAACCAGATCAAGAGCAGATATACTTTGGTGGAGCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTGTCCTTTAACCAGATCAAGAGCAGATATACTTTGGTGGAGCAC  300

seq1  CAATGGAGGAGGAGGGGAAGAAGGTGATGGTGCTATGGTAACGGATGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGAGGAGGAGGGGAAGAAGGTGATGGTGCTATGGTAACGGATGTGG  350

seq1  ATGTATCTAAGTGACCTGAACTGGGATTCTGTTGCTCCTGCAGGGTCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATCTAAGTGACCTGAACTGGGATTCTGTTGCTCCTGCAGGGTCACA  400

seq1  ATCTTGGCATTCTGAGCTCTAATAGCAGCAAGCTCATTCTGGAGTGTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGGCATTCTGAGCTCTAATAGCAGCAAGCTCATTCTGGAGTGTCCA  450

seq1  GATCCTCTTCAAGGCTTCCTCATGGGTCTCACTTTGGAGGAGGCTCATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTCTTCAAGGCTTCCTCATGGGTCTCACTTTGGAGGAGGCTCATCT  500

seq1  TGAAAGAAGTTCAAGAAGGAAATATGCCTCCTCTGGGGTTTCTCAGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGAAGTTCAAGAAGGAAATATGCCTCCTCTGGGGTTTCTCAGAGAA  550

seq1  AGGAAGGTCTTCTTCAAGGGGAGAGGCTTGGGCCTTACCTCTGCCCTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGTCTTCTTCAAGGGGAGAGGCTTGGGCCTTACCTCTGCCCTCTT  600

seq1  GTTGAGCACCCTCCTTCTGTAGATCCAACATCAGCAAAAGATGCCATCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGCACCCTCCTTCTGTAGATCCAACATCAGCAAAAGATGCCATCAC  650

seq1  ATCCTCTCCTAGGACTCTTGGATACTGAATCAGAGATATGTGGGTACCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCTCCTAGGACTCTTGGATACTGAATCAGAGATATGTGGGTACCAA  700

seq1  TTTTCC-TGATGATACTTCAAGATGAACCATACAGGTTTACAGACCAAAA  749
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTTGATGATACTTCAAGATGAACCATACAGGTTTACAGACCAAAA  750

seq1  TACACACTGACCCCAATTTGCTGAAACACCATCCTCATGGGCAC-TTAAT  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
seq2  TACACACTGACCCCAATTTGCTGAAACACCATCCTCATGGGCACTTTATT  800

seq1  CCAGCCCAGCATTTAGATGGCCAAGTCTTCCCATCATGCAGTTGAAGTAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCAGCATTTAGATGGCCAAGTCTTCCCATCATGCAGTTGAAGTAC  850

seq1  TTCAGGCATCAATAGCAGCACATGGTCCATAGAACATAC-TCTGC-TGCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  TTCAGGCATCAATAGCAGCACATGGTCCATAGAACATACTTCTGCTTGCT  900

seq1  TTGATATTTCTATT  910
      ||||||||||||||
seq2  TTGATATTTCTATT  914


seq1: chr10_71276364_71277545
seq2: B6Ng01-269G07.g_63_1250 (reverse)

seq1  AACCAAGGA--TGACCAAAGAG--AATAAATACATGTGGTCCAAATAAAG  46
      |||||||||  ||| |||||||  | ||||||| |||||  |||||  | 
seq2  AACCAAGGATGTGATCAAAGAGGAATTAAATACCTGTGGGTCAAAT-TAT  49

seq1  GGAGACTATACTTAAAAAAAAAAGACAATAGCGATAGAAA-GAAGTCTTG  95
      | |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |
seq2  GCAGACTA-ACTTCAAAAAAAGA-CCAATAGCGATAGAAAGGAAGTCTGG  97

seq1  GATCTCAAACCACAG-CAAACAC-ATCAGAATCAAGCAG-CAAAGGGATT  142
       ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATCTC-AAGCACAGCCAAACACAATCAGAATCAAGCAGCCAAAGGGATT  146

seq1  GCATATTCAACAGAATAGTAAGCAGAGA--CAAACTGGAAAGAACATTGG  190
      |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  GCATATTC-ACAGAATAGTAAGCAGAGAACAAAACTGGAAAGAACATTGG  195

seq1  GTAGCAAGGGGTAATGAGTGATCACATAGTGCCTTCC-TTCTGAAG-AGC  238
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  GTAGCAAGGGGTAATGAGTGATCACATAGTGCCTTCCTTTCTGAAGAAGC  245

seq1  CTGGCAGTGACTGTGGCCCCCAAAGGCAGCAGACTCTTTAGGTGAGCATT  288
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGTGACTGTGG-CCCCAAAGGCAGCAGACTCTTTAGGTGAGCATT  294

seq1  TATAGTGACAGACATTTAACTTAGTTATAGACATGGCAATATAGTCAGGG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTGACAGACATTTAACTTAGTTATAGACATGGCAATATAGTCAGGG  344

seq1  ACCAGTTGGGTATGAGGAAACTGGACTGAAGCTGTACAAAGACAGGGGAG  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTTGGGTATGAGGAAACTGGACTGAAGCTGTACAAAGACAGGGGAG  394

seq1  AAGTAAAGAGGTGGACAGTGGCTAGGGTGATTGAAATTTCCAAATACCAG  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAAGAGGTGGACAGTGGCTAGGGTGATTGAAATTTCCAAATACCAG  444

seq1  TATTTCCAGTGAATTTGGAGAAAACTACATCCTGAAACATTTGTTGTGAA  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCAGTGAATTTGGAGAAAACTACATCCTGAAACATTTGTTGTGAA  494

seq1  TAGATCTACCATCTGTGAAATTGGATTGATTCATGTGCTTTAGTGAAATA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCTACCATCTGTGAAATTGGATTGATTCATGTGCTTTAGTGAAATA  544

seq1  AGACTCTCTTATATATAAGACTTAGAACCTAATGTTTACCACCATCCAAT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCTCTTATATATAAGACTTAGAACCTAATGTTTACCACCATCCAAT  594

seq1  GATGCATTCCAGTCATGAATCCATCAATGAACTGATCCATGGAGTAGATC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCATTCCAGTCATGAATCCATCAATGAACTGATCCATGGAGTAGATC  644

seq1  AATGCCCTGATGTCCTCTCAGTTGAGATACTGCTGAGGAGCAAGCCTCAA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCCTGATGTCCTCTCAGTTGAGATACTGCTGAGGAGCAAGCCTCAA  694

seq1  CCTGTGCATCACCAAGGGACACTTTATGTCCAAATTATAACTGTTTTCAT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGCATCACCAAGGGACACTTTATGTCCAAATTATAACTGTTTTCAT  744

seq1  TGTTTTAAGTATGGCAGAGGCCAAGAACAGAGATTTTTTTTCCCCTAAAC  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTAAGTATGGCAGAGGCCAAGAACAGAGATTTTTTTTCCCCTAAAC  794

seq1  AATTTGCTGTAAATGTTGAATGTTCAGTGCATGTGGTAGTACACAGTACC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGCTGTAAATGTTGAATGTTCAGTGCATGTGGTAGTACACAGTACC  844

seq1  AACAGTTAGGATTGGGGCTGATTCTCACCAGATTAGGAAAGACTAGGGTC  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTTAGGATTGGGGCTGATTCTCACCAGATTAGGAAAGACTAGGGTC  894

seq1  ATGGGCAATGTTCACATTCAGGGCCATAACCTGTAGCTCAAGAGTGGATC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCAATGTTCACATTCAGGGCCATAACCTGTAGCTCAAGAGTGGATC  944

seq1  CCAGTCGGGGCCTGTCTACCTTCTCTCCTGGAGATGGTGGTTCTAGAGGT  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCGGGGCCTGTCTACCTTCTCTCCTGGAGATGGTGGTTCTAGAGGT  994

seq1  ATAGACTGATCATTTATTATTCATAGGTACTGTTGCTTTACAGGGCATGG  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACTGATCATTTATTATTCATAGGTACTGTTGCTTTACAGGGCATGG  1044

seq1  CTGGGATTCTGGATGAAGAGAATGCCCTTGAGACCTTGCCTGTACTATAA  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATTCTGGATGAAGAGAATGCCCTTGAGACCTTGCCTGTACTATAA  1094

seq1  AGCCTTCTAATGCTCACGGGGTAAAGGGTGATCATTTCTGCCAAGTCTCC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTCTAATGCTCACGGGGTAAAGGGTGATCATTTCTGCCAAGTCTCC  1144

seq1  AACTTCAGCTGCTTTCCATAGTGGGATTTTGAAAACCTGAATTC  1182
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAGCTGCTTTCCATAGTGGGATTTTGAAAACCTGAATTC  1188


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |