BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302C04
Chromosome10 (Build37)
Map Location 113,027,763 - 113,158,381
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042639, 4921506J03Rik, LOC100042655
Downstream geneLOC100042666, Trhde
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302C04.bB6Ng01-302C04.g
ACCGA096266GA096267
length1,0111,077
definitionB6Ng01-302C04.b B6Ng01-302C04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,157,382 - 113,158,381)(113,027,763 - 113,028,827)
sequence
gaattcagcagatagctctggtcatgagcaaaattgatatatttgataca
taagctctttgacgttttcatttcaatgatcactcaaatttatgtgcacc
ttttcttactccactgtgaaaaagttcacgggttatagtctaagaatttc
agcatcacctggtacttgttagatgtaagaaacctcagccttgcctagaa
aatgggatcagctgttccataagtcttcagattattcttaggcatacaga
cagcagagctatggctctgtttttctctttttcattcaccatcatcagac
attttctattagttacaaatccacgggctctttgctccaaatgatgaggt
cacatatagttaatccaatacatggcactgttttggaaaacaaaagagaa
taacatactcctgagaacaacagaacatctgccttctctcctgagagttc
atgagaattctgtcctccactgaattacaaaagtcaagaaaccgagcttc
tattggtttccttaacccaatcaagaaagaacaagttagggtcatagaaa
gatggacatactctttaatgatgtatttgcattaacttttacttatcagt
ttatatattgggacagacatttgcttcctcactatttatgtagttgataa
cattacaacaaacccatatactgttaccatgacaaaggaaacattactga
tttttttttcctgtatgagtactgatgtgttgttgttgttgttgttgttg
ttgttgttgttgtctttgtgagctctcaagcacttgaatagaaatttgaa
tgaaatttcctctattacatcatttttcttttattaggattgtgaaagga
aatacaagggttttaacattcattgcaattaaataatggggagcccatac
caggcaatgtgtagaaatctcaaagttggataaagaggaacgacaaggtt
gtttggttttgtttctgttttcagaatcaaagaaattaccactatggacc
aagtgaatttt
gaattcttttctatttaagagaatttaaaaagtatttatgtttgtaatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataaatgt
gtatacacacacacacatatgcctaagcttagtttcttcaactgtgtatt
tgtggtatgtgttctgggatacagaatgtcttcatagaagagtggtcacc
agtgcatcagtactataattcaggacttcaactgagccctagaggactaa
agatttggattggattgtttagtgagaaaatattgaatcttatttatact
tatgtattatccttctgaacaagaagttagcaaaaaaacaaacaaacaac
aaacaaacaaacaaaataaccccatgtgatcaaagaaagtgaaggctagg
cttccatccattcatagttagaagggacagtccatggtaatgggaaagta
tggcaagaggatgtactgtatcgtgctcatcacatgatattcatgatgaa
caaacacagagagattaatattgctgtgtagctcatgctcttaaaacttt
tattcattctagaattctgctctagtaatggtgccagacacattcatgga
aggctttcctgctcagttaagtcttgttgttaaaacactcacccatgtag
gaagaaatggattttcatgataattctaacgctcatcaagttgacaatgt
ggattaatcaacacataatgattaaactgttcttatttagctctcacttt
tcttgtgtacatgagatatatttgtttttgattgaggtgttttgtttctt
ataagtttctgtcttatctggtagtagtatttgtttgaaaattagacatt
gtaataataaaattatagtaacatgttccacttttttatttgcttgtcat
tgttattgttgttctgtaagaaaatgatttttttctattccccatgcttt
tgtatcatctatctttactatgctttatatgaaatacctgtggatgatcc
tttttgtttatgacttggggagaaaaaatagggatttgaagcaaaaattg
cctacgtgaatattcagaatatttgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_113157382_113158381
seq2: B6Ng01-302C04.b_44_1053 (reverse)

seq1  AAATTCAC-TGGTCCATAGTGGGTATTTCTTTGATTCTGAAAACAG-AAC  48
      |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAATTCACTTGGTCCATAGTGGTAATTTCTTTGATTCTGAAAACAGAAAC  50

seq1  AAAACAAAACAACCTTGTCGTTCCTCTTTAT-CAACTTTGAGATTTCT-C  96
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  AAAACCAAACAACCTTGTCGTTCCTCTTTATCCAACTTTGAGATTTCTAC  100

seq1  ACATTGCCTGGTATGGGCT-CCCATTATTT-ATTGCAATGAATGTTAAA-  143
      ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| 
seq2  ACATTGCCTGGTATGGGCTCCCCATTATTTAATTGCAATGAATGTTAAAA  150

seq1  -CCTTGTATTTCC-TTCACAATCCTAAT-AAAGAAAAATGATGTAATAGA  190
       |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGTATTTCCTTTCACAATCCTAATAAAAGAAAAATGATGTAATAGA  200

seq1  GGAAATTTCATTCAAATTTCTATTCAAGTGCTTGAGAGCTCACAAAGACA  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTTCATTCAAATTTCTATTCAAGTGCTTGAGAGCTCACAAAGACA  250

seq1  ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACACATCAGTACTCATACAG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACACATCAGTACTCATACAG  300

seq1  GAAAAAAAAATCAGTAATGTTTCCTTTGTCATGGTAACAGTATATGGGTT  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAAAATCAGTAATGTTTCCTTTGTCATGGTAACAGTATATGGGTT  350

seq1  TGTTGTAATGTTATCAACTACATAAATAGTGAGGAAGCAAATGTCTGTCC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAATGTTATCAACTACATAAATAGTGAGGAAGCAAATGTCTGTCC  400

seq1  CAATATATAAACTGATAAGTAAAAGTTAATGCAAATACATCATTAAAGAG  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATATAAACTGATAAGTAAAAGTTAATGCAAATACATCATTAAAGAG  450

seq1  TATGTCCATCTTTCTATGACCCTAACTTGTTCTTTCTTGATTGGGTTAAG  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCATCTTTCTATGACCCTAACTTGTTCTTTCTTGATTGGGTTAAG  500

seq1  GAAACCAATAGAAGCTCGGTTTCTTGACTTTTGTAATTCAGTGGAGGACA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCAATAGAAGCTCGGTTTCTTGACTTTTGTAATTCAGTGGAGGACA  550

seq1  GAATTCTCATGAACTCTCAGGAGAGAAGGCAGATGTTCTGTTGTTCTCAG  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATGAACTCTCAGGAGAGAAGGCAGATGTTCTGTTGTTCTCAG  600

seq1  GAGTATGTTATTCTCTTTTGTTTTCCAAAACAGTGCCATGTATTGGATTA  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGTTATTCTCTTTTGTTTTCCAAAACAGTGCCATGTATTGGATTA  650

seq1  ACTATATGTGACCTCATCATTTGGAGCAAAGAGCCCGTGGATTTGTAACT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATATGTGACCTCATCATTTGGAGCAAAGAGCCCGTGGATTTGTAACT  700

seq1  AATAGAAAATGTCTGATGATGGTGAATGAAAAAGAGAAAAACAGAGCCAT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGAAAATGTCTGATGATGGTGAATGAAAAAGAGAAAAACAGAGCCAT  750

seq1  AGCTCTGCTGTCTGTATGCCTAAGAATAATCTGAAGACTTATGGAACAGC  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGCTGTCTGTATGCCTAAGAATAATCTGAAGACTTATGGAACAGC  800

seq1  TGATCCCATTTTCTAGGCAAGGCTGAGGTTTCTTACATCTAACAAGTACC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCCATTTTCTAGGCAAGGCTGAGGTTTCTTACATCTAACAAGTACC  850

seq1  AGGTGATGCTGAAATTCTTAGACTATAACCCGTGAACTTTTTCACAGTGG  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGATGCTGAAATTCTTAGACTATAACCCGTGAACTTTTTCACAGTGG  900

seq1  AGTAAGAAAAGGTGCACATAAATTTGAGTGATCATTGAAATGAAAACGTC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGAAAAGGTGCACATAAATTTGAGTGATCATTGAAATGAAAACGTC  950

seq1  AAAGAGCTTATGTATCAAATATATCAATTTTGCTCATGACCAGAGCTATC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGCTTATGTATCAAATATATCAATTTTGCTCATGACCAGAGCTATC  1000

seq1  TGCTGAATTC  1000
      ||||||||||
seq2  TGCTGAATTC  1010

seq1: chr10_113027763_113028827
seq2: B6Ng01-302C04.g_64_1140

seq1  GAATTCTTTTCTATTTAAGAGAATTTAAAAAGTATTTATGTTTGTAATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTCTATTTAAGAGAATTTAAAAAGTATTTATGTTTGTAATAT  50

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATGT  100

seq1  GTATACACACACACACATATGCCTAAGCTTAGTTTCTTCAACTGTGTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACACACACACACATATGCCTAAGCTTAGTTTCTTCAACTGTGTATT  150

seq1  TGTGGTATGTGTTCTGGGATACAGAATGTCTTCATAGAAGAGTGGTCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTATGTGTTCTGGGATACAGAATGTCTTCATAGAAGAGTGGTCACC  200

seq1  AGTGCATCAGTACTATAATTCAGGACTTCAACTGAGCCCTAGAGGACTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATCAGTACTATAATTCAGGACTTCAACTGAGCCCTAGAGGACTAA  250

seq1  AGATTTGGATTGGATTGTTTAGTGAGAAAATATTGAATCTTATTTATACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGGATTGGATTGTTTAGTGAGAAAATATTGAATCTTATTTATACT  300

seq1  TATGTATTATCCTTCTGAACAAGAAGTTAGCAAAAAAACAAACAAACAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATTATCCTTCTGAACAAGAAGTTAGCAAAAAAACAAACAAACAAC  350

seq1  AAACAAACAAACAAAATAACCCCATGTGATCAAAGAAAGTGAAGGCTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACAAACAAAATAACCCCATGTGATCAAAGAAAGTGAAGGCTAGG  400

seq1  CTTCCATCCATTCATAGTTAGAAGGGACAGTCCATGGTAATGGGAAAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATCCATTCATAGTTAGAAGGGACAGTCCATGGTAATGGGAAAGTA  450

seq1  TGGCAAGAGGATGTACTGTATCGTGCTCATCACATGATATTCATGATGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAGAGGATGTACTGTATCGTGCTCATCACATGATATTCATGATGAA  500

seq1  CAAACACAGAGAGATTAATATTGCTGTGTAGCTCATGCTCTTAAAACTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACAGAGAGATTAATATTGCTGTGTAGCTCATGCTCTTAAAACTTT  550

seq1  TATTCATTCTAGAATTCTGCTCTAGTAATGGTGCCAGACACATTCATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCATTCTAGAATTCTGCTCTAGTAATGGTGCCAGACACATTCATGGA  600

seq1  AGGCTTTCCTGCTCAGTTAAGTCTTGTTGTTAAAACACTCACCCATGTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTTCCTGCTCAGTTAAGTCTTGTTGTTAAAACACTCACCCATGTAG  650

seq1  GAAGAAATGGATTTTCATGATAATTCTAACGCTCATCAAGTTGACAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAATGGATTTTCATGATAATTCTAACGCTCATCAAGTTGACAATGT  700

seq1  GGATTAATCAACACATAATGATTAAACTGTTCTTA-TTAGCTCTCACTTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGATTAATCAACACATAATGATTAAACTGTTCTTATTTAGCTCTCACTTT  750

seq1  TCTTGTGTACATGAGATATATTTG-TTTTGATTGAGGTGTTTTGTTTCTT  798
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGTACATGAGATATATTTGTTTTTGATTGAGGTGTTTTGTTTCTT  800

seq1  ATAAGTTTCTGTCTTATCTGGTAGTAGTATTTGTTTGAAAATTAGACATT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTTTCTGTCTTATCTGGTAGTAGTATTTGTTTGAAAATTAGACATT  850

seq1  GTAATAAT-AAATTATAGTAACATGTTCCAC-TTTTTATTTGCTTGTCAT  896
      |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTAATAATAAAATTATAGTAACATGTTCCACTTTTTTATTTGCTTGTCAT  900

seq1  TGTTATTGTTGTTCTGTTAGGAAATGATTTTTTTCTATTCCCCATGC-TT  945
      ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGTTATTGTTGTTCTGTAAGAAAATGATTTTTTTCTATTCCCCATGCTTT  950

seq1  TGTATCATCTATCTTTACTATGCTTTATATG-AATACCTGTGGATGATCC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGTATCATCTATCTTTACTATGCTTTATATGAAATACCTGTGGATGATCC  1000

seq1  TTTTTGTTTATGACTT-GGGAG-AAAAATAGGGATTTG-AGCAAAAAT--  1039
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  
seq2  TTTTTGTTTATGACTTGGGGAGAAAAAATAGGGATTTGAAGCAAAAATTG  1050

seq1  GCTACGTGATATTTCAG-ATATTTGAT  1065
       ||||||||   ||||| |||||||||
seq2  CCTACGTGAATATTCAGAATATTTGAT  1077