BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326M08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,228,767 - 24,380,330
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC628537, Ctgf, Enpp1
Upstream geneRps12, 1110021L09Rik, Vnn3, Vnn1, Taar1, Taar2, Taar3, Taar4, Taar5, Taar6, Taar7a, Taar7b, Taar7c-ps, Taar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1
Downstream geneEnpp3, Crsp3, Arg1, EG667479, LOC212399, Akap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326M08.bB6Ng01-326M08.g
ACCGA114499GA114500
length1,1481,134
definitionB6Ng01-326M08.b B6Ng01-326M08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,228,767 - 24,229,935)(24,379,203 - 24,380,330)
sequence
gaattctcctcccaaaatgaacattgactttagtctatggggtctgtatt
ggacttttgaggataaagtggtattatgttaagttataaacttgtagtct
attataacaaaacctaagacctgtgcatttcactttcataagttttaata
actaagtttacaggttttcacaatggagacaagcaagttagatctgttaa
gtgaaagcagttcatcacactttagaaactgagttcactctctaagaccc
ctgcggtggaaggagggaattcatgctgaaagttattgactggtccatgt
gcaccacactgttcatttcatgcttggagcatcttggactctacgggatc
ttttacaaatgtggaatattcagagtggggagtggttaggttatgtcaaa
aaaaaactcaaggaaagctccatgcaattgcaagatgatagaatcctgtc
tataagtcccttctctagctctgctccattaaggaaacctcctaccttgc
tttccccttcaaggccaatatggaaatccattccaatcagacagccctat
tttggagctaacacaatggcactaattagagcttgtaacatcattccctc
caaacttcagactcctcttcattacctccctttctactcagcattgtgat
tttacaaagttcaaatacaatgacatgctaaggcattgtaagtattagct
ttaaaaacaatttttttttccttttaaagttatgtccaccaagggaacgt
gatgttctatatttaaaaacagactctttttagatttccaaacactagtc
gctcactgaagatctttcctccaaagagagtgaatgaggtataggaagag
atggaggaaactcgaggcagacagcaagacttcccaagagatttctgata
cttctagaatcttcccttttgacatgataaaagagaataaaaatcatatt
ttaagtattccagtcaaaaaagtatagttacttcttttggagaacctgag
tgaaaacagattttggactaaattgtatattatattttgtgtaaagttca
gcagcatagtatcctcctaaagttggacaactacatcaacaaatacagaa
atgacattggtaaaagagaattcaggtaatgactgatgttgtagctga
gaattctgtgtatatagataatcggttaaattctggaggtatcaggtggc
tgaggcaggcagatctctgtgagctcaagggcagcttggcatatgtaatg
agttttgggattatgttcagagaccctgtttcaataaaacaataagaaag
ggacaaaaactgattctggaagtgaaattaattatgctttatgtgcgatt
tcctttagtcatgttacgacatgttttgtgattgattttccaggcatgga
acaaggcagctgtaagaagtatgtgtacctgaataagtacttgggggatg
tgaacaatgtgaaagttgtgtatggacctgctgctcggttgagacccact
gatgttccagagacatactattcatgtgagtgaagctattggctaacttt
agatgtcactagagagaatgtactacatgccggccacaggaatgcacagg
tgttctgtacagggtagcactggagtgaagagagggtagccatttaccta
ttagatttttggaccggacactatgtggtaatctataatttcatattcca
gtatatagtctgctttttaagttttatacactgtttatgagaaaacttca
actatgtttttaaacattaggtaatgacattccattacaatgacccatca
ttagaatattattgttatgaagaggaatgcagcagaaattattcattctg
taggcaatcagtttctttactaagaaacaatttcccaaagcatacatctt
ttacatatagagagacatatgtcaaccactttggaacacaaaccgccaag
acaccttttaagatatttgttactttgcacagcaagctcacttcataact
gtctccaatctccatggctcctgttctgattttcatctttggctttgctt
atctttttgatacaattttttaaaaaaagattgttttattttatgtatgt
gagtaccacttgtatctgtacagatgggttgtgagccttcatgtggatgt
tgggaattgaattttaggacctctgaatcactctggtcaaaccttctcgc
ttccggccagccgctgctctggatcactctgctcgcctcagtccttgctt
cgctcgaattccaaagatttattattattgatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24228767_24229935
seq2: B6Ng01-326M08.b_48_1195

seq1  GAATTCTCCTCCCAAAATGAACATTGACTTTAGTCTATGGGGTCTGTATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTCCCAAAATGAACATTGACTTTAGTCTATGGGGTCTGTATT  50

seq1  GGACTTTTGAGGATAAAGTGGTATTATGTTAAGTTATAAACTTGTAGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTTGAGGATAAAGTGGTATTATGTTAAGTTATAAACTTGTAGTCT  100

seq1  ATTATAACAAAACCTAAGACCTGTGCATTTCACTTTCATAAGTTTTAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAACAAAACCTAAGACCTGTGCATTTCACTTTCATAAGTTTTAATA  150

seq1  ACTAAGTTTACAGGTTTTCACAATGGAGACAAGCAAGTTAGATCTGTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGTTTACAGGTTTTCACAATGGAGACAAGCAAGTTAGATCTGTTAA  200

seq1  GTGAAAGCAGTTCATCACACTTTAGAAACTGAGTTCACTCTCTAAGACCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGCAGTTCATCACACTTTAGAAACTGAGTTCACTCTCTAAGACCC  250

seq1  CTGCGGTGGAAGGAGGGAATTCATGCTGAAAGTTATTGACTGGTCCATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGGTGGAAGGAGGGAATTCATGCTGAAAGTTATTGACTGGTCCATGT  300

seq1  GCACCACACTGTTCATTTCATGCTTGGAGCATCTTGGACTCTACGGGATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCACACTGTTCATTTCATGCTTGGAGCATCTTGGACTCTACGGGATC  350

seq1  TTTTACAAATGTGGAATATTCAGAGTGGGGAGTGGTTAGGTTATGTCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACAAATGTGGAATATTCAGAGTGGGGAGTGGTTAGGTTATGTCAAA  400

seq1  AAAAAACTCAAGGAAAGCTCCATGCAATTGCAAGATGATAGAATCCTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACTCAAGGAAAGCTCCATGCAATTGCAAGATGATAGAATCCTGTC  450

seq1  TATAAGTCCCTTCTCTAGCTCTGCTCCATTAAGGAAACCTCCTACCTTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTCCCTTCTCTAGCTCTGCTCCATTAAGGAAACCTCCTACCTTGC  500

seq1  TTTCCCCTTCAAGGCCAATATGGAAATCCATTCCAATCAGACAGCCCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTTCAAGGCCAATATGGAAATCCATTCCAATCAGACAGCCCTAT  550

seq1  TTTGGAGCTAACACAATGGCACTAATTAGAGCTTGTAACATCATTCCCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGCTAACACAATGGCACTAATTAGAGCTTGTAACATCATTCCCTC  600

seq1  CAAACTTCAGACTCCTCTTCATTACCTCCCTTTCTACTCAGCATTGTGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTCAGACTCCTCTTCATTACCTCCCTTTCTACTCAGCATTGTGAT  650

seq1  TTTACAAAGTTCAAATACAATGACATGCTAAGGCATTGTAAGTATTAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAAAGTTCAAATACAATGACATGCTAAGGCATTGTAAGTATTAGCT  700

seq1  TTAAAAACAATTTTTTTTTCCTTTTAAAGTTATGTCCACCAAGGGAACGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAACAATTTTTTTTTCCTTTTAAAGTTATGTCCACCAAGGGAACGT  750

seq1  GATGTTCTATATTTAAAAACAGACTCTTTTTAGATTTCCAAACACTAGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTCTATATTTAAAAACAGACTCTTTTTAGATTTCCAAACACTAGTC  800

seq1  GCTCACTGAAGATCTTTCCTCCAAAGAGAGTGAATGAGGTATAGGAAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACTGAAGATCTTTCCTCCAAAGAGAGTGAATGAGGTATAGGAAGAG  850

seq1  ATGGAGGAAACTCGAGGCAGACAGCAAGACTTCCCAAGAGATTTCTGATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGGAAACTCGAGGCAGACAGCAAGACTTCCCAAGAGATTTCTGATA  900

seq1  CTTCTAGAATCTTCCCTTTTGACATGATAAAAGAGAATAAAAATCATATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGAATCTTCCCTTTTGACATGATAAAAGAGAATAAAAATCATATT  950

seq1  TTAAGTA-TCCAGTCAAAAAAGGTATAGTTACTTCCTTTTGGAGAACCTT  999
      ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
seq2  TTAAGTATTCCAGTCAAAAAA-GTATAGTTACTT-CTTTTGGAGAACC-T  997

seq1  GAGTGAAAAACAGATTTTGGACTAAATTGTATATTATATTTTGTGTTAAA  1049
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GAGTG-AAAACAGATTTTGGACTAAATTGTATATTATATTTTGTG-TAAA  1045

seq1  GTCAGGCAGCATAGTAATCTCCTAAAGTTGGACAAACTACAATCAAAACC  1099
      ||   |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||   |
seq2  GTTCAGCAGCATAGTATCCTCCTAAAGTTGGAC-AACTAC-ATCAA---C  1090

seq1  AAATACAGAAATGACAATTGGTATAAAAGGAAAGAATTCGAGGGTAATTG  1149
      ||||||||||||||| |||||  ||||||   |||||||   ||||| ||
seq2  AAATACAGAAATGAC-ATTGG--TAAAAG---AGAATTC--AGGTAA-TG  1131

seq1  ACTGATGTTGTAAGGGCTGA  1169
      ||||||||||||   |||||
seq2  ACTGATGTTGTA---GCTGA  1148

seq1: chr10_24379203_24380330
seq2: B6Ng01-326M08.g_66_1199 (reverse)

seq1  GTAT-AATAATAAATAAATCTTTGGA--TCGAAGCG-AGCAGGGACTGA-  45
      |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||| 
seq2  GTATCAATAAT-AATAAATCTTTGGAATTCG-AGCGAAGCAAGGACTGAG  48

seq1  GCGAGCAGAGTTGAT-CAGAGCAAGCGGGCTGGCCGG-AGCGAGAAGGGT  93
      |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
seq2  GCGAGCAGAG-TGATCCAGAGC-AGC-GGCTGGCCGGAAGCGAGAAGGTT  95

seq1  TGACCAGAGTGA-TCAGAGGTCCTAAAAATTCAATTCCCAACAACCACAT  142
      |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGACCAGAGTGATTCAGAGGTCCT-AAAATTCAATTCCCAACATCCACAT  144

seq1  GAAGGCTCACAA-CCATCTGTACAGATAC-AGT-GTACTCACATACATAA  189
      |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTCACAACCCATCTGTACAGATACAAGTGGTACTCACATACATAA  194

seq1  AATAAAACAAATCTTTTTT--AAAAATTGTATCAAAAAGATAAGCAAAGC  237
      |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAC-AATCTTTTTTTAAAAAATTGTATCAAAAAGATAAGCAAAGC  243

seq1  CAAAGATGAAAATCAGAACAGGAGCCATGGAGATTGGAGACAGTTATGAA  287
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATGAAAATCAGAACAGGAGCCATGGAGATTGGAGACAGTTATGAA  293

seq1  GTGAGCTTGCTGTGCAAAGTAACAAATATCTTTAAAGGTGTCTTGGCGGT  337
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTGAGCTTGCTGTGCAAAGTAACAAATATCTTAAAAGGTGTCTTGGCGGT  343

seq1  TTGTGTTCCAAAGTGGTTGACATATGTCTCTCTATATGTAAAAGATGTAT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTCCAAAGTGGTTGACATATGTCTCTCTATATGTAAAAGATGTAT  393

seq1  GCTTTGGGAAATTGTTTCTTAGTAAAGAAACTGATTGCCTACAGAATGAA  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGAAATTGTTTCTTAGTAAAGAAACTGATTGCCTACAGAATGAA  443

seq1  TAATTTCTGCTGCATTCCTCTTCATAACAATAATATTCTAATGATGGGTC  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCTGCTGCATTCCTCTTCATAACAATAATATTCTAATGATGGGTC  493

seq1  ATTGTAATGGAATGTCATTACCTAATGTTTAAAAACATAGTTGAAGTTTT  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAATGGAATGTCATTACCTAATGTTTAAAAACATAGTTGAAGTTTT  543

seq1  CTCATAAACAGTGTATAAAACTTAAAAAGCAGACTATATACTGGAATATG  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAAACAGTGTATAAAACTTAAAAAGCAGACTATATACTGGAATATG  593

seq1  AAATTATAGATTACCACATAGTGTCCGGTCCAAAAATCTAATAGGTAAAT  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATAGATTACCACATAGTGTCCGGTCCAAAAATCTAATAGGTAAAT  643

seq1  GGCTACCCTCTCTTCACTCCAGTGCTACCCTGTACAGAACACCTGTGCAT  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACCCTCTCTTCACTCCAGTGCTACCCTGTACAGAACACCTGTGCAT  693

seq1  TCCTGTGGCCGGCATGTAGTACATTCTCTCTAGTGACATCTAAAGTTAGC  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGGCCGGCATGTAGTACATTCTCTCTAGTGACATCTAAAGTTAGC  743

seq1  CAATAGCTTCACTCACATGAATAGTATGTCTCTGGAACATCAGTGGGTCT  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCTTCACTCACATGAATAGTATGTCTCTGGAACATCAGTGGGTCT  793

seq1  CAACCGAGCAGCAGGTCCATACACAACTTTCACATTGTTCACATCCCCCA  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCGAGCAGCAGGTCCATACACAACTTTCACATTGTTCACATCCCCCA  843

seq1  AGTACTTATTCAGGTACACATACTTCTTACAGCTGCCTTGTTCCATGCCT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTATTCAGGTACACATACTTCTTACAGCTGCCTTGTTCCATGCCT  893

seq1  GGAAAATCAATCACAAAACATGTCGTAACATGACTAAAGGAAATCGCACA  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAATCAATCACAAAACATGTCGTAACATGACTAAAGGAAATCGCACA  943

seq1  TAAAGCATAATTAATTTCACTTCCAGAATCAGTTTTTGTCCCTTTCTTAT  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCATAATTAATTTCACTTCCAGAATCAGTTTTTGTCCCTTTCTTAT  993

seq1  TGTTTTATTGAAACAGGGTCTCTGAACATAATCCCAAAACTCATTACATA  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTATTGAAACAGGGTCTCTGAACATAATCCCAAAACTCATTACATA  1043

seq1  TGCCAAGCTGCCCTTGAGCTCACAGAGATCTGCCTGCCTCAGCCACCTGA  1087
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGCTGCCCTTGAGCTCACAGAGATCTGCCTGCCTCAGCCACCTGA  1093

seq1  TACCTCCAGAATTTAACCGATTATCTATATACACAGAATTC  1128
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCCAGAATTTAACCGATTATCTATATACACAGAATTC  1134