BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328A17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 21,303,049 - 21,435,457
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700020N01Rik, EG432436
Upstream genePde7b, LOC667202, Ahi1, Myb, LOC100039870, Hbs1l, Aldh8a1, LOC100039906
Downstream geneLOC100039936, LOC628133, Sgk, LOC667254, LOC665523, 4930444G20Rik, LOC100039992, E030030I06Rik, LOC665543, Ube2q2l, Raet1e, LOC100040023, LOC100038830, LOC667280, EG667281, LOC432438, Raet1d, LOC667299, LOC667303, LOC100040072, LOC100040078, Slc2a12, Tbpl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328A17.bB6Ng01-328A17.g
ACCGA115411GA115412
length1,1741,147
definitionB6Ng01-328A17.b B6Ng01-328A17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(21,434,286 - 21,435,457)(21,303,049 - 21,304,201)
sequence
gaattcagtataacctagagctttgcctccaggcaggaaagtctgactca
ctggggataattgcaaacctgtgcacacaatccatgtaactagactaaat
atgaacggaatcaatattaagacatttcctctcaataatgataactggat
cttagaagcatttcagcaataaatagccatggtttaatttctttaaaaaa
tatatgtggcgaatccacacccctatgagacataataaatgacttaatgt
tcaactcactagagagattaatgtccatctagtttagcaaatagaataca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacaaagagagtacgttg
gctgatgcctttggtcattcagatgatggttaaccttgcagactcctaga
gagagttgggtacacataggggttatcccaatacggtctgtaaaaagccc
aaagggaaagaaacttctagatcatactgccaactcccaactagcaagtc
tcatttgagaacaggggggtaattgttctgatattgcagagagccacatg
ggaacaaagttcacagtgaagaatatgggcaataaaaacagttggtgtta
gggtacgaggacaggggtgggggtgtgaatctcgggtttatacttagaat
ttatttaatgctatttgtattttaaaagtcttgcttcatgtgtaaatgct
tacacatgaagaagctttagttatgtgaatgtcaactaatatttattttg
taccagttgtgcattgctttcagtcatgtctacataagctttgtggtagg
agtatacattgtggattccttgggaccacagacaccaaaaacgaaggtga
aagttatattttaatcatgagatcaaactattaaaattactcaaaaaatc
atatagtgaattttagaatttctgcaattgaaaatcatcataatacctaa
agacatgtcatatttcttggccttcaccctcttctcctaccttgaactac
cattgctaagccaatcttcccaaagaccagcttcctccaaaattctgcta
acacttcagttctctctccctggacactccacagttttgcctcctgatgc
ctgctataatttggtcccatattaacccacacaagcatcctctttctacc
tcactgtgcctaacttcaatctgt
gaattcacactgtagcccaggcaagccttgaacttgagattacccctacc
ccagcttcccaagtaggcactacaagcctgtgccactaagttttctccct
tgatatgcaatgccttcttcttcatctgtctgacattaactgagaaacta
acccaaggggttaatcataaaagtactaaacaaagcaagggaacagatgt
gtgagaaagctagtagagctttattctggagaaaaatctgagcttgagat
gaacaaacacctacttagttcctactaggtacacattctgccagccccca
aaaggaatatacatgatgtataacagaacccattctcaaggaatttctaa
tactctaaagggtattttatatattcattgtgtaaataatggtgtaaatt
ttccctgtataatagctgttgcttttgtagtgtctacagatggtggaacg
gatgacacaccatgtcttatttggcatcgccaaagtactattattccctt
atttgtggatgaggagatggaggctcagaaagcttagcctgcttgtccca
tgcataacatatatgatgctgaggagaaaatcagaacttggacttacatt
ggctttagtgcgtgcctcctatgagagtaaagatgtgtttgctgttgtgg
gtgacatgtcccacagcacctggaagacagacactgagatgacacacttg
ttttctctagaatgtgattcatccaaataattgaggatggaagcaaggaa
cacttaattttagaaaagcatccaatagccagatgaaattctgccaagaa
tgaaatctagcctggaagtttcccgtcccactctgggcctttccatcttt
aaaacacgctgatcaagcgtttgctttaactgcccttctaatgcattaaa
gcatggtggaatgattcaaagttttaataactttgttgatatccatatat
atccacttactacagttgttcttggcaaacacacattgtacttcattgta
cacagataaactgaattcagtggcctttgttgttgttgttaatgaactag
acactcctcactctgtttctgacaccagttcttttggagcaatagcctct
ttcctaggcctttcccacaatattcatacagcagagccatggtgatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_21434286_21435457
seq2: B6Ng01-328A17.b_46_1219 (reverse)

seq1  ACAGATTGAAGTTA-GCACAGGTGAGGTAG-AAGA-GATGCTTGTGT-GG  46
      |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||
seq2  ACAGATTGAAGTTAGGCACA-GTGAGGTAGAAAGAGGATGCTTGTGTGGG  49

seq1  TTAATATGGGACCCAATTATAGCAGGCATCAGGAGGCAAAACTGTGGAGT  96
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATGGGACCAAATTATAGCAGGCATCAGGAGGCAAAACTGTGGAGT  99

seq1  GTCCAGGGAGAG-GAACTGAAGGTGTTAGCAGAATTTTGGGAGGAAGCTG  145
      |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTCCAGGGAGAGAGAACTGAA-GTGTTAGCAGAATTTT-GGAGGAAGCTG  147

seq1  GTCTTTGGGAAGATTGGCTTAGCAATGGTAGTTCAAGGTAGGAGAAGAGG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTGGGAAGATTGGCTTAGCAATGGTAGTTCAAGGTAGGAGAAGAGG  197

seq1  GTGAAGGCCAAGAAATATGACATGTCTTTAGGTATTATGATGATTTTCAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGGCCAAGAAATATGACATGTCTTTAGGTATTATGATGATTTTCAA  247

seq1  TTGCAGAAATTCTAAAATTCACTATATGATTTTTTGAGTAATTTTAATAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGAAATTCTAAAATTCACTATATGATTTTTTGAGTAATTTTAATAG  297

seq1  TTTGATCTCATGATTAAAATATAACTTTCACCTTCGTTTTTGGTGTCTGT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATCTCATGATTAAAATATAACTTTCACCTTCGTTTTTGGTGTCTGT  347

seq1  GGTCCCAAGGAATCCACAATGTATACTCCTACCACAAAGCTTATGTAGAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCAAGGAATCCACAATGTATACTCCTACCACAAAGCTTATGTAGAC  397

seq1  ATGACTGAAAGCAATGCACAACTGGTACAAAATAAATATTAGTTGACATT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGAAAGCAATGCACAACTGGTACAAAATAAATATTAGTTGACATT  447

seq1  CACATAACTAAAGCTTCTTCATGTGTAAGCATTTACACATGAAGCAAGAC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAACTAAAGCTTCTTCATGTGTAAGCATTTACACATGAAGCAAGAC  497

seq1  TTTTAAAATACAAATAGCATTAAATAAATTCTAAGTATAAACCCGAGATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAATACAAATAGCATTAAATAAATTCTAAGTATAAACCCGAGATT  547

seq1  CACACCCCCACCCCTGTCCTCGTACCCTAACACCAACTGTTTTTATTGCC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCCCCACCCCTGTCCTCGTACCCTAACACCAACTGTTTTTATTGCC  597

seq1  CATATTCTTCACTGTGAACTTTGTTCCCATGTGGCTCTCTGCAATATCAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTCTTCACTGTGAACTTTGTTCCCATGTGGCTCTCTGCAATATCAG  647

seq1  AACAATTACCCCCCTGTTCTCAAATGAGACTTGCTAGTTGGGAGTTGGCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTACCCCCCTGTTCTCAAATGAGACTTGCTAGTTGGGAGTTGGCA  697

seq1  GTATGATCTAGAAGTTTCTTTCCCTTTGGGCTTTTTACAGACCGTATTGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGATCTAGAAGTTTCTTTCCCTTTGGGCTTTTTACAGACCGTATTGG  747

seq1  GATAACCCCTATGTGTACCCAACTCTCTCTAGGAGTCTGCAAGGTTAACC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACCCCTATGTGTACCCAACTCTCTCTAGGAGTCTGCAAGGTTAACC  797

seq1  ATCATCTGAATGACCAAAGGCATCAGCCAACGTACTCTCTTTGTGTGTGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTGAATGACCAAAGGCATCAGCCAACGTACTCTCTTTGTGTGTGT  847

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTCTATTTGCTAAACTAGA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTCTATTTGCTAAACTAGA  897

seq1  TGGACATTAATCTCTCTAGTGAGTTGAACATTAAGTCATTTATTATGTCT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATTAATCTCTCTAGTGAGTTGAACATTAAGTCATTTATTATGTCT  947

seq1  CATAGGGGTGTGGATTCGCCACATATATTTTTTAAAGAAATTAAACCATG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGGGTGTGGATTCGCCACATATATTTTTTAAAGAAATTAAACCATG  997

seq1  GCTATTTATTGCTGAAATGCTTCTAAGATCCAGTTATCATTATTGAGAGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTATTGCTGAAATGCTTCTAAGATCCAGTTATCATTATTGAGAGG  1047

seq1  AAATGTCTTAATATTGATTCCGTTCATATTTAGTCTAGTTACATGGATTG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCTTAATATTGATTCCGTTCATATTTAGTCTAGTTACATGGATTG  1097

seq1  TGTGCACAGGTTTGCAATTATCCCCAGTGAGTCAGACTTTCCTGCCTGGA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACAGGTTTGCAATTATCCCCAGTGAGTCAGACTTTCCTGCCTGGA  1147

seq1  GGCAAAGCTCTAGGTTATACTGAATTC  1172
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGCTCTAGGTTATACTGAATTC  1174

seq1: chr10_21303049_21304201
seq2: B6Ng01-328A17.g_66_1212

seq1  GAATTCACACTGTAGCCCAGGCAAGCCTTGAACTTGAGATTACCCCTACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACTGTAGCCCAGGCAAGCCTTGAACTTGAGATTACCCCTACC  50

seq1  CCAGCTTCCCAAGTAGGCACTACAAGCCTGTGCCACTAAGTTTTCTCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTTCCCAAGTAGGCACTACAAGCCTGTGCCACTAAGTTTTCTCCCT  100

seq1  TGATATGCAATGCCTTCTTCTTCATCTGTCTGACATTAACTGAGAAACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGCAATGCCTTCTTCTTCATCTGTCTGACATTAACTGAGAAACTA  150

seq1  ACCCAAGGGGTTAATCATAAAAGTACTAAACAAAGCAAGGGAACAGATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGGGGTTAATCATAAAAGTACTAAACAAAGCAAGGGAACAGATGT  200

seq1  GTGAGAAAGCTAGTAGAGCTTTATTCTGGAGAAAAATCTGAGCTTGAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAAGCTAGTAGAGCTTTATTCTGGAGAAAAATCTGAGCTTGAGAT  250

seq1  GAACAAACACCTACTTAGTTCCTACTAGGTACACATTCTGCCAGCCCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAACACCTACTTAGTTCCTACTAGGTACACATTCTGCCAGCCCCCA  300

seq1  AAAGGAATATACATGATGTATAACAGAACCCATTCTCAAGGAATTTCTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAATATACATGATGTATAACAGAACCCATTCTCAAGGAATTTCTAA  350

seq1  TACTCTAAAGGGTATTTTATATATTCATTGTGTAAATAATGGTGTAAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTAAAGGGTATTTTATATATTCATTGTGTAAATAATGGTGTAAATT  400

seq1  TTCCCTGTATAATAGCTGTTGCTTTTGTAGTGTCTACAGATGGTGGAACG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGTATAATAGCTGTTGCTTTTGTAGTGTCTACAGATGGTGGAACG  450

seq1  GATGACACACCATGTCTTATTTGGCATCGCCAAAGTACTATTATTCCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACACACCATGTCTTATTTGGCATCGCCAAAGTACTATTATTCCCTT  500

seq1  ATTTGTGGATGAGGAGATGGAGGCTCAGAAAGCTTAGCCTGCTTGTCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGGATGAGGAGATGGAGGCTCAGAAAGCTTAGCCTGCTTGTCCCA  550

seq1  TGCATAACATATATGATGCTGAGGAGAAAATCAGAACTTGGACTTACATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATAACATATATGATGCTGAGGAGAAAATCAGAACTTGGACTTACATT  600

seq1  GGCTTTAGTGCGTGCCTCCTATGAGAGTAAAGATGTGTTTGCTGTTGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTAGTGCGTGCCTCCTATGAGAGTAAAGATGTGTTTGCTGTTGTGG  650

seq1  GTGACATGTCCCACAGCACCTGGAAGACAGACACTGAGATGACACACTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACATGTCCCACAGCACCTGGAAGACAGACACTGAGATGACACACTTG  700

seq1  TTTTCTCTAGAATGTGATTCATCCAAATAATTGAGGATGGAAGCAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTAGAATGTGATTCATCCAAATAATTGAGGATGGAAGCAAGGAA  750

seq1  CACTTAATTTTAGAAAAGCATCCAATAGCCAGATGAAATTCTGCCAAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAATTTTAGAAAAGCATCCAATAGCCAGATGAAATTCTGCCAAGAA  800

seq1  TGAAATCTAGCCTGGAAGTTTCCCGTCCCACTCTGGGCCTTTCCATCTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCTAGCCTGGAAGTTTCCCGTCCCACTCTGGGCCTTTCCATCTTT  850

seq1  AAAACACGCTGATCAAGCGTTTGCTTTAACTGCCCTTCTAATGCATTAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACGCTGATCAAGCGTTTGCTTTAACTGCCCTTCTAATGCATTAAA  900

seq1  GCATGGTGGAATGATTCAAAGTTTTAATAACTTTGTTGATATCCATATAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GCATGGTGGAATGATTCAAAGTTTTAATAACTTTGTTGATATCCATAT-A  949

seq1  TATCCACTTACTACAGTTGTTCTTGGCAAACAACACATTGTACTTCATTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TATCCACTTACTACAGTTGTTCTTGGCAAAC-ACACATTGTACTTCATTG  998

seq1  TACACAGAATAAACTGAATTCAGTGGCCTTTGTTGTTGTTGTTAAATGAA  1050
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TACACAG-ATAAACTGAATTCAGTGGCCTTTGTTGTTGTTGTT-AATGAA  1046

seq1  CTAGACACTCCTCACTCTGTTTCTGACACCAGTTCTTTTGGAGCAATAGC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACACTCCTCACTCTGTTTCTGACACCAGTTCTTTTGGAGCAATAGC  1096

seq1  CTCTTTCCCTAGGCCTTTTCCAACAATATTCATACAGCAGAGCCATTGTG  1150
      |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTCTTT-CCTAGGCC-TTTCCCACAATATTCATACAGCAGAGCCATGGTG  1144

seq1  ATT  1153
      |||
seq2  ATT  1147