BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-060N20.T7 (MSMg01no060_n20.b1) | MSMg01-060N20.TJ (MSMg01no060_n20.g1) |
ACC | AG287209 | AG287210 |
length | 731 | 679 |
length of high quality (start - end) | 463 (38 - 500) | 532 (71 - 602) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_n20.b1 PHD_FILE: MSMg01no060_n20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:03:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no060_n20.g1 PHD_FILE: MSMg01no060_n20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:03:41 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (99,430,169 - 99,430,525) | (99,303,937 - 99,304,466) |
---|
sequence | TAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAGAGGATCCGCGGAA
TTCAATGAATGTCCTTTCACTTTAAAAAGTAGCAAATCCTAGCAGCATGC
CACAGCATGTGACATGTCTGCAACCTCAATTACTCCAGAGAATGGAGACA
GAGGAGATGCCTGGACAATTTGACATGACCTTCATCTAAACTACTGGTTC
TCAGCCTTCCTGATGCTACAACCTTTTACTATAGTTCTTTGTATTGTGGT
TGGTCCTAAGCCATTAAATTATTTCAGTGTTCCTTCATGACTGTAATCTT
GTCACTGCTGTGAATTGTAATGTAACAGGACGGGACATGTGATGTGTGTC
CCCCTAAAGGGGTTGTGACTCACAGGTTGAGAACCATTTGATCTAAACAG
CAGTAACAACAAATGTAAATCTTTAGGCAGGTGCTCGATGCTTTGGAGGA
AATTTCAATTTATATCCTTAGTGAACTAAGTAGGAGATTTGAATCCACCA
AAGAGATGGTCAGTTCTGTAAAAACAACAGCGAAAAATTTATTTCAACAA
TAAAAGGACACGTCTATTAGGAACTTGAAAAAAAGACAACCGAGGCTCCT
CTTCTTATCGCTGAAAAATAATTGCTTTTAATAGAACTACTGCCATAAAA
GAGCTTAAGAAGCCATTCCCCTCCATAACAGCTGACTTCAGAACATGTGA
CAATCACACCTGAAATGATCTATTCTGGAGC
| CATGAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGAGACAGAAATATCATCTGAAATGGTAC
TGAGTCTAGAAAGGACATGATGGGTAGGGGGAAGACAGGACAGATGACTC
AGCCCATCCACATGGCCTTTGGCTCAACTACTGGAGTTGGTAAGTGTTAG
CTGGAGCTGTTAAGTGCTTTCCTGCCTTTCCTTCCATCTCTTTAGAGTGA
CTTTTGTCAGTTTCTCACCTTGCTACTAGAGAGACACTTTCAAAATGTAA
ACCACAAATTCCACAGTGACTCCCCCGCCCCCCACACACACACAACTGCC
CACACAGTGAATGTCAAATTCCCAGCATGGGCTCGCAGGAATCTTCTGTT
CCTTTGCCTGTGTTTCCACCCCCCTCCAGCCCTAAATGCCAATGGCTCTG
TTTATGGCTCTTCAAAGCAGTCCTGTTCGGTCACCTACTTATGTCTCTGC
CAACTGCTACTTCCTTTGCTTACAATGCCTTGGACTGCCTGCAGAACTGC
CACACTGCCTTTCATCGGGGCACAGACTCTGTAGTTTGTGAACAGAGGAC
CGCCAACTATAGCGACGATTGAAATTCGAAGCTTTGACCATTAACGTATG
CTCTTGCTATCTAAAAACCGCTTTCCCTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 9 18 28 34 30 37 37 37 32 32 37 22 22 10 10 10 22 30 48 30 28 24 22 19 21 13 9 9 9 9 9 11 16 18 24 24 28 33 33 33 37 39 39 30 30 32
32 33 33 37 36 36 39 39 39 37 23 23 12 12 12 15 19 20 24 26 24 32 31 28 28 39 33 34 34 34 28 29 43 43 47 59 59 59 43 34 16 12 12 16 27 32 43 46 42 48
48 48 50 50 42 42 36 39 39 48 48 48 48 42 42 37 43 43 42 42 57 44 44 32 32 42 42 44 57 59 68 68 68 50 50 50 50 68 68 48 48 37 37 35 42 50 57 59 57 57
57 57 57 27 21 10 10 10 17 20 43 44 26 26 26 36 36 43 38 38 43 44 43 35 35 35 50 43 37 37 50 50 32 32 17 32 24 21 27 28 33 43 43 43 43 35 31 31 24 28
12 12 9 11 11 28 28 39 39 39 39 39 43 43 52 43 43 39 35 35 44 44 57 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 52 62 52 62 52
52 62 62 62 62 62 43 43 43 35 35 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 44 43 31 31 31 43 43 62 62 62 57 52 52 52 57 52 43 43 35 38 27 20 20 38 38 43
35 35 44 44 29 39 35 43 43 52 57 57 57 57 52 52 43 43 39 27 27 29 43 44 57 57 52 52 52 57 43 35 28 43 43 44 36 43 38 43 43 43 43 37 43 42 43 43 35 35
43 43 57 57 57 57 52 43 43 50 41 41 18 19 19 23 23 44 44 57 57 57 57 57 44 42 33 27 32 32 32 48 57 34 44 42 42 43 43 44 48 57 57 44 43 37 42 48 57 57
57 48 48 48 57 59 59 57 43 39 28 25 12 12 9 15 15 26 26 32 32 37 34 34 48 47 54 47 34 28 20 23 23 32 32 37 37 23 28 28 32 32 28 32 26 28 13 13 13 19
28 34 39 32 32 23 21 11 18 18 28 29 30 35 35 39 43 47 34 32 23 23 23 34 37 43 34 34 25 28 40 42 48 37 25 22 15 26 26 32 41 47 48 43 42 31 32 22 16 16
16 22 30 25 25 11 22 16 15 18 20 22 18 29 21 21 15 11 11 24 25 43 39 30 30 25 25 15 15 10 10 10 13 13 11 15 19 21 28 34 33 32 28 28 24 19 25 32 33 30
27 21 15 14 10 14 12 12 9 11 11 11 10 17 20 23 17 9 9 9 13 19 31 41 41 32 32 20 20 20 22 26 31 32 15 13 8 8 8 8 11 25 18 21 15 17 17 30 30 37
35 35 39 39 37 33 23 19 16 23 11 11 12 10 10 12 16 11 15 13 13 8 9 10 19 31 30 22 20 14 14 19 14 14 12 30 24 23 23 23 23 23 17 13 11 11 10 10 12 11
15 13 22 22 22 23 22 18 20 12 12 14 17 14 15 22 27 28 30 18 24 15 18 16 26 22 19 13 11 8 11 10 10 15 11 14 9 14 10 10 9 11 11 12 11 17 11 9 9 9
9 10 18 16 13 11 12 11 13 11 11 11 15 17 30 21 19 14 13 16 13 23 22 21 17 17 17 16 10 10 10 | Open.Hide. 7 15 10 6 6 8 11 17 3 0 3 8 11 11 24 17 15 23 21 10 10 10 17 16 18 23 15 10 9 9 12 13 10 15 11 12 11 19 21 23 29 32 36 29 35 28 33 33 33 37
33 33 33 21 21 11 9 11 11 12 11 12 12 12 11 12 21 22 28 29 23 28 28 29 30 36 36 36 36 36 36 50 37 42 42 34 34 30 30 39 39 42 42 42 40 36 42 42 42 36
43 43 44 44 59 43 47 39 47 47 44 44 41 32 32 28 35 35 42 42 57 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 47 47 47 48 57 57 57 57 57 57 57 57 37 30 30
16 16 32 32 43 50 50 50 41 41 43 52 42 50 44 44 35 44 44 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
52 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 59 59 57 57 57 57 54 57 50 50 50 52 52 50 50 57 57 59 59 59 57 57 57 57 43 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68
57 57 48 54 54 57 57 68 68 57 57 54 54 48 57 46 44 37 32 32 40 43 43 43 40 47 47 57 54 59 57 57 54 48 50 50 50 50 57 57 50 50 50 50 53 53 59 59 57 57
53 53 50 50 50 35 32 21 15 15 15 14 14 12 15 13 21 24 36 59 41 39 37 35 35 39 39 39 33 39 43 39 43 43 43 43 47 47 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 47 59 47 26 25 16 16 16 26 34 43 47 41 40 34 32 25 25 20 22 34 34 37 59 59 59 41 48 48 48 48 48 57 57 47 39 39 39 35
43 43 48 48 59 46 46 40 39 39 30 30 17 17 17 28 30 43 47 47 47 47 59 59 48 47 47 34 34 18 23 11 12 12 26 30 41 59 59 59 59 59 59 47 37 37 32 37 30 26
18 22 23 34 34 47 59 59 59 47 44 44 41 37 44 44 59 59 47 41 30 30 25 19 19 28 34 47 37 34 32 32 30 35 39 39 39 37 38 41 34 34 28 28 22 32 34 43 41 37
32 34 28 28 28 34 25 24 22 25 21 23 11 11 11 23 22 24 34 37 32 31 24 20 20 20 32 34 37 38 30 34 28 30 25 25 27 20 20 20 25 25 37 37 37 37 31 22 14 10
10 10 10 10 12 10 13 16 20 20 16 15 11 15 15 11 12 11 15 11 15 9 9 10 8 10 11 11 11 11 13 14 21 24 29 25 23 18 18 22 22 29 17 13 11 10 10 13 10 10
16 16 22 22 20 24 15 15 15 12 10 12 9 12 19 23 23 19 15 14 14 14 18 18 16 8 8 6 6 |