BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-207A14.T7 (MSMg01no207_a14.b1) | MSMg01-207A14.TJ (MSMg01no207_a14.g1) |
ACC | AG390421 | AG390422 |
length | 1,261 | 1,231 |
length of high quality (start - end) | 416 (44 - 459) | 387 (72 - 458) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_a14.b1 PHD_FILE: MSMg01no207_a14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:29:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no207_a14.g1 PHD_FILE: MSMg01no207_a14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:29:27 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (123,757,341 - 123,757,751) | (123,873,381 - 123,873,764) |
---|
sequence | NNNGGGGCACTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTGGCCTTAAGTGGCTCACCAGGTTGTTTTGAATAATAATGATGCTGA
TGACAAAAAACCACAGCTAACATTTCTCACTCAAGTCCTGAGCAGGGCTG
ACCTCCCACTGAGAGTTTGCAAAGAAGGTCTCTGCCCTTCCCCTGTACTT
TGCACAAATTATAGCATTTCAAGCTTCTAAAGCTCCTAATGGGACCATTT
AACAGGCAAAGGAACTGGGGTACTAAAAGGTTAAATAACATAGACAAGAT
GACCAGGCATGTACTGAGACCAGATCTGCCTGACGCCGTACCCTGATTCG
TACACAGTGCATTAGAATGCCAAAATATTGTGCTTCTCTGGACACGATGA
TTTATATGGAGAAGAAGGAAAATTATTTGAATTTGTAGCTACTAGAAATT
TTAAGGATTTTTTTCCGCCCCCTGAATAGCCTAGTGATAAATATAAAAAA
AGAGGATTTTTAAAAGACCAAATGACAGCAACCCATGTTTTTGAAGATGT
TAATGCCTTTTATGTGTGACTCTAGAATCAGGCAGAAGTCCAGAGTGAAG
ATGTCTCAGCTTGTTCTCCCTTCACTGGACAGGATACACTGTGGCCAGAG
AAAAGAAAGAAGCCGAAGGAGCTGGATGCTGGAAGCAGGCAGGACTCCGT
ACATCATTTCCTCTGTGCAGCTGTGTTTATGAGCACAGTTTGAACTTGGC
TGCTGTAATCAGCTGAGTTTTTACTGGTTGTTTAAGAGATGTTTCCAGTC
TGTTTACTTCCAAAGTTGGGTTACAATTTATGGAGAAATCTTTAAGCAAA
ACTAAAATCCACACAGAGGCATAGGCCAAGTGAAGGATGAAGAATGAGAG
AAATTAAATAAATAAAGATATACAAAGGAGTTCATTATTTTGCTTCTTTT
ACAAATGAAGCTGTACTTTTTATACATACAAAAAAATTGGTTTTTTGTGT
TTGTTTTTTGGGGTTGTTTGCTTGGTTTGTTGATACCTAAAAACTTTCCA
CTATAATAATATTTCTTTTTTTAATAATTAATTTTATATATCTCCTTGTT
TCTTTGATTTTTTTTATTTAATATTTTTTATCCTCATCTCTTACATTCCA
TTCTTTCTATTTTCCATAACCATCTTCTTCTTTCTTCTTTTTTAATACAG
CTTTTCTTTGCTGTTTTTTTATTTCTTTCTATTTCTGCTTTATTTCTTAT
CTCATTTTCTT
| TTTTTGCAGAAGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAGCTGTTCCATCTAAATTATGTAAGGC
CTGATTGAAACATCTGTGTAGAATGCACAACTTCCCAAGTCCTCATGGAA
ATGCAGTCAGGCAGTGAGGCAGCCAAGGAAACTACCAGGAGGCCACAGTA
GCACTCTTCCTGGGCTGCTCTGCCTTGATGATAAATATTGCTATGAGGAT
CTATCTGTAGGGGTGAGTTTGGGCTACACCACTTTGTGACTCTAACAGGT
CTCACACTTCAAACCAATTGCCCAGCAGCTCCCTGGATTCACGAAAATGC
TTTGGCTATTTCAAAGACTGGACACTCCTAAACCTTGCTCTGCTATCCCA
GGCCTAAGCAGAATAGTGGCCAAATTCTCACATGGCTGGCTGGCTTTTAT
CTCCTGTTTTATCTCACCTCCATTTGTTTCCCATCAATTCATGACAAACC
TTTTTTTCCACCCTGCATCCTTGCCCATGCCACTGTCCAGCCCTGTCTCC
CTTTGCCCAGACATTAGCCTTTGGCATCTTTATTGATCAATTTATCAAAA
ACAAATTGGGGACAAAGACCCTTAGAGTTTGGACACACAGATTGCTGATT
GAATCAAAGCTCAGTGCTTGTCTACAGTTCTATGAGGACTTGGGTAGTGG
GGGCTGGAGAGAAGTTAGTGTATCCTACAGGTATTGCAATCAATCTACAT
CTCCAACAGGATCAGCCAGTATGAGAGCAGGGAGGCTTGAAGGAAGTCGG
AACTCATTCTTAATCAGGTAAAGTTGGGAATGGAGTTACGAAGCACTTAT
AGCATAGGGAATGCTTTCTGCTCTGCTGATCATGAATATTGATACTATTA
TTCAGATTACCAGCAGGATTTGAAGGCCCTGTGATTTATATTGAAGAAGG
CCCTCCTCCTCCTCCTTCTTTTTCTTTCGCTTTTGCTCTGATTTCTTGGT
TTTTCCCTTTCTTCCTCTCCTTTNCCTTTTTCTTTTCCTTTTTCCTTTTC
CTTTTTCATCATCTGCTTCCACATTTTTCTATTAGAAACTTCTATATCTC
TTATCTTCACCTTCCTTTTTATTTTCTTATTATTATCTCCCCTTCTTTTT
TTTTTTATCTTCCTTATCATTAATCCTATTTGCTTTTATAGTTTCTCTAT
TAAATTTTATATTTTTATTGTGATATTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 11 10 14 16 18 16 17 10 8 8 8 10 15 16 19 18 19 22 20 21 18 18 33 24 24 28 23 24 24 37 37 40 43 48 48 48 43 43 47
47 50 50 59 59 57 59 50 50 36 35 30 31 31 31 31 34 27 26 15 12 12 15 12 11 11 11 22 27 33 37 42 50 41 41 53 53 53 53 57 53 53 57 57 57 57 57 57 53 50
50 50 50 50 68 68 68 68 68 43 34 19 10 10 10 13 13 26 36 40 50 57 68 68 68 53 57 48 48 37 37 35 42 42 50 50 51 51 53 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 50 50 48 48 42 48 48 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 50 50 46 28 25 21 14 11 11 13 15 12 21 27 37 33 33 33 33 36 36 50 57
57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 54 54 57 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 34 28 13 13 11 18 34 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 68 48 34 26 13 13 13 13 13 21 21 36 32 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 53 50 50
50 59 30 21 11 10 12 12 17 19 16 16 12 8 8 8 8 8 11 16 24 14 12 12 22 23 34 47 47 47 59 59 48 48 48 37 37 37 41 41 23 23 12 12 13 15 23 19 14 14
13 15 15 21 30 34 40 40 48 59 59 48 48 48 48 48 48 50 50 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 43 36 32 32 31 39 37 43 37 44 44 57 57 57 57 57
59 59 59 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 44 44 23 19 19 32 32 48 46 46 48 57 57 57 57 57 54 54 57 57 44 44
30 42 37 57 59 59 59 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 68 68 68 68 68 54 57 54 54 54 54 54 54 54 54 57 59 59 57 48 43 43 43 43 43 47 47 48 48
48 47 59 46 46 46 59 59 41 41 39 36 24 26 15 14 11 17 17 32 37 37 39 19 17 9 9 12 22 27 37 37 37 37 41 39 39 39 40 41 39 37 37 47 48 57 57 57 57 57
48 39 39 43 39 39 43 43 44 43 43 43 43 59 48 48 48 59 47 47 47 47 47 43 41 37 36 40 39 34 34 19 19 20 24 28 34 31 35 36 36 43 44 41 39 39 39 34 37 43
41 47 47 59 43 41 34 36 39 39 30 30 30 22 19 9 10 8 13 15 15 18 19 32 37 30 28 28 18 23 23 30 25 32 22 22 10 10 10 13 10 11 11 17 22 17 30 30 28 28
34 34 39 34 29 21 22 22 27 27 41 37 37 37 32 29 29 27 29 27 27 31 30 35 31 19 14 12 11 14 14 14 18 20 20 12 13 13 19 19 17 9 8 7 8 11 8 9 9 16
15 19 19 29 26 37 28 24 24 24 28 35 37 37 30 35 26 24 13 17 13 17 17 12 17 17 17 17 17 24 25 23 20 22 22 18 24 16 11 11 9 9 9 12 12 22 22 21 25 15
15 10 10 11 11 11 12 23 15 21 13 16 21 19 12 12 8 8 8 10 9 9 10 15 14 18 10 10 10 15 10 24 24 19 10 10 10 11 11 27 19 13 13 11 8 8 10 8 8 9
13 23 31 39 37 41 28 20 12 12 12 11 12 15 14 19 12 16 12 17 12 12 12 12 8 8 9 9 10 11 14 10 11 10 12 10 10 10 12 18 24 28 23 25 28 22 15 15 10 9
8 9 12 11 12 21 17 21 11 11 11 14 11 10 10 10 10 10 15 11 10 10 10 10 9 9 11 12 12 12 18 10 8 8 8 8 8 8 12 11 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8
8 8 8 11 15 10 8 8 8 9 12 12 12 12 12 12 10 13 13 14 12 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 11 11 12 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
10 8 8 13 9 9 9 10 10 13 22 19 18 18 12 10 10 10 10 8 8 8 8 11 11 13 13 15 21 12 11 9 8 8 8 8 10 15 10 10 10 13 13 9 6 8 8 8 8 8
8 8 8 10 13 8 8 8 10 8 8 14 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 11 10 8 7 7 10 7 8 10 10 10 10 13 8 7 7 7 6 6 6
6 6 11 8 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 14 10 9 9 10 9 9 8 10 6 9 6 6 9 10 11 10 8 8 8 8 6 6 6 7 6 8 9 9 11 9 9 9 10 10 10
6 6 8 7 8 12 12 12 13 12 9 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 6 8 6 6 6 7 9 12 18 9 8 6 6 8 19 19 19 17 8 9 10 22 21 24 14 14 19 31 34 37 43 50 40 40
40 40 40 40 42 57 57 68 68 68 68 68 68 68 43 34 19 16 16 18 15 14 14 13 15 24 25 42 42 47 50 57 48 48 48 48 48 48 50 68 68 51 51 50 50 50 50 57 57 68
68 68 68 68 68 57 44 25 16 11 12 11 17 18 24 21 19 24 24 28 38 42 57 57 59 59 44 42 32 32 37 39 39 42 44 57 50 48 48 48 41 41 47 47 47 47 48 48 68 68
68 68 59 57 54 54 48 57 57 57 57 57 43 42 42 43 43 48 57 48 48 48 48 59 59 50 50 59 50 33 26 12 12 10 10 10 10 19 22 36 59 47 46 48 48 48 48 43 43 37
43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 43 43 43 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 54 54
54 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 50 43 43 47 47 48 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57
59 59 59 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 54 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37
31 24 15 15 18 15 11 11 12 21 22 30 39 37 41 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 47 34 19 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 17 20 30 34 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 34 28 25 15 15 12 11 8 8 8 8 8
10 24 31 35 39 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 59 68
68 68 59 59 54 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 54 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 48 48 48 59
48 44 44 32 32 41 44 41 43 41 46 42 39 39 39 40 46 46 48 48 48 43 40 28 28 28 37 32 43 42 35 35 39 40 43 43 43 43 43 43 48 48 48 39 47 32 37 33 37 32
27 18 14 11 23 19 29 32 41 41 37 59 39 39 35 39 39 43 48 37 37 28 33 26 30 17 18 19 41 34 48 50 37 37 28 28 28 34 34 39 40 32 37 41 32 23 22 18 15 17
27 37 39 41 41 26 24 19 19 17 21 19 25 31 39 37 33 33 30 30 25 28 43 39 39 33 28 25 34 34 43 43 48 43 47 47 47 47 31 18 18 15 18 22 37 59 41 32 29 12
13 13 16 13 25 28 28 28 34 34 39 39 37 35 35 33 33 24 19 18 18 16 16 10 11 11 13 13 12 13 12 14 21 21 16 17 18 16 11 8 8 8 8 14 13 13 17 22 19 21
17 15 19 22 22 19 26 21 19 22 21 15 18 16 19 15 11 10 10 9 10 10 13 13 17 13 11 11 11 16 19 14 17 18 19 12 15 16 14 14 10 14 12 12 12 12 15 22 16 17
11 11 15 15 13 12 16 15 10 10 8 8 10 13 21 27 24 27 28 25 28 24 19 19 17 17 14 24 16 10 10 8 6 6 8 14 14 14 14 14 14 15 26 26 22 14 12 13 12 11
12 19 15 9 9 9 10 10 11 8 8 8 8 8 10 9 11 9 8 8 8 9 18 17 21 13 10 10 10 10 11 11 10 10 13 23 17 13 10 10 8 8 8 7 6 6 6 6 9 10
12 10 11 12 12 12 12 12 11 10 10 10 16 18 14 17 18 20 15 15 8 6 8 15 10 10 8 12 9 9 9 10 10 10 10 10 8 6 6 6 6 8 10 9 9 8 11 9 9 11
11 16 19 20 23 24 24 22 18 18 10 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 12 3 0 3 17 10 8 11 8 8 8 8 10 15 10 12 12 13 13 16 12 12 9 9 12 12 21 22 22
22 28 20 17 15 12 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 8 8 8 8 6 6 7 8 8 12 12 11 7 6 8 8 10 11 12 11 10 10 8 8 7 7 9 7 10 8 8 6 6 6
8 7 7 12 10 12 10 11 9 9 9 9 8 8 8 10 8 10 12 11 10 10 10 10 10 10 10 12 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 12 9 10 10 10 10 10 11 11 18 15 14
14 21 19 15 15 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 10 8 9 9 8 12 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 11 12 9 9 11 8 8 8 11 11 12 15 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 11 11 11 |