BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305N08.T7 (MSMg01no305_n08.b1) | MSMg01-305N08.TJ (MSMg01no305_n08.g1) |
ACC | AG430674 | AG430675 |
length | 1,369 | 1,302 |
length of high quality (start - end) | 370 (518 - 887) | 344 (128 - 471) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n08.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_n08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n08.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_n08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:15 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGAATCANNNNNGGGGCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCGCATGTCAGAGAAGCACTTGAAA
AAATGTTCAACATCCTTAACCTTCAAGGAAATGCAAATCAAAACAACCCT
GAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATCCAGGTG
ACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGT
TGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTT
CCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCC
TGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCC
ACTATGTTCATATTTTTCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACC
TAGATGCCCCTCAACTTTTTTTCCCCCCCCCCCAATGTGGNACATCTACA
CAATAAAAAAGGGGGCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTA
GCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTC
ACAAAGAAACTCACACAATATGTATTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCC
AAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTAAACACATGAAAC
TCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGATTT
GGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACGGAGTTTGGAGCTGA
GATGAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGNGATCCACCCCA
TAATCAGCATCCCAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTAT
TGAAAGGACGCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCCAG
CAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGTT
CCCCATGGAGGAAGTTGAAAAAGTACCCCAGAGCTTAAGGGTTTGCCACC
CTTTAGGTGGGACAAATTATTAGTTATCCGTACCCCGGAACTTTTGATCA
TACTGGAATTAATAAAAAAAGGCCAATCGCCCTCCCTGGAAAAAAACCCA
TGGATTGTAATTTTATTTCCCCACAGGGAAACCTGGCCTAAAGGAATTGG
TGTGTGCAATGACTGTTTTTCTTTTCATAACTCCTAACTAATCCTATAAT
TTTTGTATTTATTTTCCATTTGTTGACTCCATTTTTCCTATATAATCTAA
ACCCCGCCCTGATTCTTCGCTACTAGCTTTCTATACTTGATCATATTATT
ACATTTATATATCACGNCT
| CCCTCTCTTTNNNNNACGCATGGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAGGACACACAGAGNA
GAGTTTATTATGAGACTATCCCTGGAACTCTCAAGGGTAAGAGTTGACAA
AGTCATTTTGACAACTGTAGAGGAATATACTGTCAAAGGATGACCAAAGA
CAATGGCTAAAGGGGCCACTGCACCAACCTACATGTTAAGAAGGCTTTGC
TTTCTACTAATTAAAAATTTCTATGATAGAAATCTTTCCTGAGGCATATT
TTCTTGCCCTACTTAGATTAACTCTTAAGAGACAAGGCAAGACAATCTCT
TTTCTTTACTAGAAAACCTCTGATGAGAAAATAATTTGTATTATCTTTTG
AGCCAGTATGCTTTTTCCTACTCATGGTGAGACATAAAACTCTTCTTTCC
ATGCCTTGTCTTCTGAGGAAGAGGCCGACGCCCAGGGCATTAAAGATTGC
TATTTTTGTTCTTCCTTTAATTTATTCTTTGAAATTTTATACATATATAA
TATATTCTGGCCATGCTCATATTCATTCTCTCTCCCTTATCTTCCTCTTG
TTCCCACCAACTTTCTCTCTCTTCTTTCTGCCAAGTCCCTCATCCTGCTT
TTTACATCTTGGTTGTTTTGCTTTGTGCCCTCTTGCATTTAATGGATCCA
CTCTCGTGTGAGGCTATATCCATTGGAGCATGAGTAATTCATCAGTGTCT
ACATTACTGAGGACATTAGATTTCTGTTTGCCCACAGCCATAGACTTCCA
TTAGCATGTCTGGGTGGGGAAGGGACCCCTGAGCCCCTCCTCTATTTGTG
ACTGAATGTTTTCAGTCTAAGTCTTCTGCAAAGCTTACACCAGCAACCAC
AGCTACAGTGAGTTCTTGAAGGGCCTACCCAAGCCATGTCCCTGTTGCTA
AACTAATTTAAAAAAATTTTTTTTTAAAAAAAAATTTTTGTTTAGGGTTG
AGGACGCGTTTTAAAACAAAAAAAAATTATTCGGGGTATTTGTGAAAGGA
ACCCTCTTTTTTTCTTTTCGTAGAATAACATCTTGTTTGTTTTTTTCCAA
ACCCAAAAGAGGGAAAGAACCCCAATTTTGTTTAGGGTTAAAAAAATTCC
TCCCTACCTAAAGAATATAATGCTGGATCTCTTGGGAAACGGCAAAAAGT
TTTTGTACCCTTGGGGGTGTTTTTGTGTACACATATTTTCTTGTATTTTA
GTATTTATCTAAAAACATACATACCTATAGACGTGAGTATTACTTCATAT
AA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 9 9 7 7 8 8 9 14 10 8 6 6 6 6 8 13 15 8 8 8 10 15 16 18 19 35 30 24 28 28 33 34 37 37
40 47 48 50 50 50 50 47 42 43 43 42 42 38 36 36 36 36 31 31 31 33 33 33 25 23 12 11 11 10 10 10 10 10 11 22 24 37 37 37 39 33 33 36 36 36 36 38 36 47
43 47 46 46 43 46 44 48 59 44 33 33 33 33 33 26 25 11 12 12 12 14 12 23 12 13 13 18 24 34 37 48 48 43 43 43 43 43 43 44 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 50 54 68 68 68 51 51 51 68 68 68 57 53 53 47 47 47 47 47 47 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 50 59 59 33 23 12 11 11 9 9 9 15 23 29
37 50 46 59 43 43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 42 35 35 42 42 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 29 21 8 6 6 6 6 11 11 15 15 34 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 53 53 50 50 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
53 53 50 50 50 50 59 59 59 34 23 15 9 9 9 9 10 12 16 15 16 12 12 14 28 20 22 28 27 26 12 10 9 9 9 17 27 27 29 3 0 3 23 23 37 37 34 34 28 28
16 16 9 10 10 8 9 10 10 9 10 11 11 9 11 11 11 12 25 30 46 59 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 54 57 57 57 59 48 48 54 59 59 68
68 59 59 57 57 59 54 54 54 54 54 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 54 57 48 57 57 48 57 57 57 57 48 48 48 43 43 43 59 59 59 59 57 47 47 41 41 39 41
47 41 39 39 39 39 39 39 37 39 39 39 39 39 39 30 39 39 41 43 47 43 59 41 41 31 36 35 37 37 41 59 59 59 48 48 48 44 43 48 48 48 34 34 28 28 17 30 30 36
34 41 41 37 37 41 37 37 43 59 59 44 41 41 41 59 39 34 24 29 22 20 25 32 37 41 47 47 42 40 40 40 40 39 37 23 23 12 12 12 23 25 31 31 35 37 37 28 30 14
14 14 26 24 30 36 37 32 32 37 37 32 39 39 37 37 44 59 59 59 28 28 20 32 32 39 39 30 25 25 39 39 41 47 41 23 25 3 0 3 15 15 20 29 32 31 27 32 31 35
31 32 36 43 59 47 47 34 25 25 16 11 15 19 23 30 25 37 28 27 19 15 15 21 25 32 29 29 32 35 37 32 37 30 30 24 25 13 12 12 18 12 15 11 11 11 21 23 25 21
19 19 19 16 16 16 16 24 19 16 17 16 10 11 17 15 18 12 12 13 10 12 12 12 12 19 15 14 10 10 10 10 11 11 11 11 22 22 30 30 27 21 24 20 18 18 26 19 15 10
9 9 9 10 10 10 10 10 12 9 9 9 8 9 8 8 8 8 11 9 9 9 13 9 15 10 9 9 9 9 9 9 18 15 18 15 13 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 13
15 17 16 13 14 12 10 10 11 11 8 10 6 6 8 6 9 10 16 9 10 9 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 9 9 10 10 8 13 10 10 8 9 13 11 11 10 11 14 13 12
13 10 9 9 7 7 6 6 6 7 10 8 9 9 13 17 21 11 11 11 9 9 9 9 8 6 7 7 8 8 8 8 9 11 11 17 14 10 10 9 9 9 10 12 15 13 13 8 8 6
8 6 6 7 9 9 9 10 10 10 12 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 9 19 12 10 10 11 11 11 11
11 10 8 8 8 8 8 12 20 18 14 8 13 8 8 8 8 8 8 8 10 13 14 14 10 8 8 9 8 8 10 10 10 11 16 16 9 9 9 10 12 12 14 13 15 10 11 12 10 9
8 6 6 6 7 10 7 6 8 8 8 8 8 10 13 15 13 9 11 10 8 9 9 12 8 6 6 11 10 12 9 9 10 8 6 6 8 10 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8
7 7 11 6 6 8 8 8 8 8 10 11 11 9 9 8 8 8 10 8 6 7 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 19 13 13 9 9 6 6 7 7 13 9 18 14 21 15 8 8
6 6 6 8 9 10 12 8 8 8 6 6 8 15 15 18 18 17 16 12 12 8 8 8 8 9 13 15 29 29 26 23 17 9 9 9 9 8 8 6 6 8 6 8 8 13 8 7 10 8
8 8 6 6 10 8 10 8 6 6 10 10 10 8 6 3 0 3 3 | Open.Hide.12 12 9 9 8 8 10 9 9 3 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 8 11 8 8 8 11 8 8 9 9 16 12 19 23 20 22 30 30 29 28 19 19
10 10 22 26 35 35 37 37 37 37 35 35 35 35 36 36 36 50 50 50 50 47 41 27 27 9 9 9 9 10 10 9 7 7 7 6 6 8 10 13 26 31 59 37 30 21 21 3 0 3
21 21 33 30 31 31 37 41 41 41 41 37 50 42 30 21 19 9 9 9 15 12 11 11 11 13 16 21 21 26 30 32 33 53 53 38 38 42 42 42 50 59 57 57 57 57 59 59 59 57
53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 47 47 42 40 40 53 59 59 50 53 57 57 53 53 50 50 50 53 53 44 59 50 50 47 37 37 21 21 12 11 11 12 25 30 59
50 50 50 50 50 50 50 50 53 50 37 43 32 32 35 43 43 50 50 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 54 54 54 54 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 51 68 51 51 51 51 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 44 50 50 44 44 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 48 57 54 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
50 50 50 50 59 59 59 31 26 18 11 8 8 8 9 9 10 11 16 30 30 59 59 59 59 59 48 48 48 50 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 43 36 28 33 32 39 32 32 28 25 23 28 23 21 17 12 10 8 8 8 8 8 9 14 21 30 59 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 59 59 68 68 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 41 32 14 14 14 32 32 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
48 48 59 59 59 59 59 59 33 24 16 12 12 19 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 50 48 47 42 42 47 59 44 44 41 41 43 43 41 41 46 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 32 32 32 37 37 37 59
59 59 59 59 48 48 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 57 48 43 27 28 11 11 19 24 39 46 43 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 54 59 59 46 46 48 57
57 57 57 57 59 59 59 43 39 35 35 35 39 39 48 37 37 32 32 20 32 32 41 47 43 41 31 31 41 41 37 37 41 41 41 41 41 37 37 37 37 30 18 14 14 14 14 14 14 32
25 27 11 11 11 28 28 41 41 41 39 32 31 25 30 25 39 31 23 20 13 13 12 21 19 24 24 34 37 25 25 11 11 11 19 23 25 32 29 25 30 28 28 28 25 21 30 22 22 23
32 32 37 39 31 22 28 18 18 18 32 29 31 28 24 24 24 30 25 18 21 15 21 17 19 24 21 25 28 28 17 17 10 10 10 17 16 25 31 20 17 14 13 13 17 16 19 10 10 10
10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 18 15 18 18 19 18 9 11 9 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 12 10 10 9 10 10 15 10 10 10 11 11 20 11 10 9 9 9 13 13
11 12 11 12 12 13 11 11 8 8 8 10 8 8 10 9 10 9 10 9 9 11 10 10 8 8 8 9 17 12 9 8 8 8 8 9 8 7 6 6 6 6 6 10 8 9 11 8 6 6
6 6 8 8 10 10 9 7 9 9 9 10 9 6 10 6 6 6 8 17 13 10 11 7 6 8 8 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 9 9 9 9 9 12 10 11 12 9
9 10 13 8 8 7 8 8 8 8 11 11 8 9 9 9 12 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 9 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 9 13 8 6 8 8 9
9 9 16 12 15 20 12 10 6 6 6 8 12 12 12 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 17 17 12 12 12 11 11 11 10 10 13 9
9 9 9 8 8 8 8 9 12 14 14 12 10 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 12 12 15 13 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 11 13 11 9 9
10 12 8 8 6 6 8 10 10 6 6 8 8 11 17 11 10 9 9 12 13 13 15 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 7 12 13 15 13 12 10
16 8 10 8 8 8 8 10 23 11 8 8 8 13 13 15 14 10 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 9 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 6 6 10 7 8
8 7 |