BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-420K01.T7 (MSMg01no420_k01.b1) | MSMg01-420K01.TJ (MSMg01no420_k01.g1) |
ACC | AG515449 | AG515450 |
length | 714 | 731 |
length of high quality (start - end) | 124 (75 - 198) | 584 (71 - 654) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no420_k01.b1 PHD_FILE: MSMg01no420_k01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:40:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no420_k01.g1 PHD_FILE: MSMg01no420_k01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:40:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGAAAACTGACTGGCACGCGGGAGANGNCAANGNNCNAGAAGGGGAACTC
ANTNNAAAAATTCTTTCCACCACATTTAGTGAGTGGGAGGATTCTTTTAT
ATTTGAGAGGGAGGTGGTTTCCCATAAATGCTATTATTTTGGGATAGCAC
TGAGAAAATATTCCAGCCACTTCTGTGGAAGCCAGATGAGAATAATATCC
TTTTTGCAAGCACTGCAAAATTAATCTCTTACTTCATAACATACCACTCT
TGTAATGGATTGACTGTTTCGTCGATTCCACTTTTGNTGNAAACACAGCC
CAGAGGTCCTTGCACCCACACATCTCCAGGGAGACCAAGAATGTTCAGCA
GGCAGGATTGCCTTTCCAATAGGCAAGATGTACAACCTGTTCTTCCATCT
AGAAAGCTGGGAATCAGAGTTGATTAGTATGGGCTGGAGATATGACTCAG
TGGTTAAGAGCATTGACTGCTCTCCCAAAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAG
CAACCACCTGGTGGTTCACAACCATCTGTAATGCCTCATACACATAAAAT
TAATGAATTATTTTCTTTACAAATTAAGTAAATAATTTAAAAGCAAACTA
AGTGAAAAGAAAATATTTTTTGTTTAGCAGGCCAGGGGACTATTTTTATC
TGTGTGGGCCAGGCCATTATCAGGCCCCCTAAAATCAAGAACCAGAAGTG
GCTAAGTTATTAAA
| CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAG
CACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAA
AACAACCCTGAGATTCCACCTCACAGCAGTCAGAATGTCTAAGATCAAAA
ATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTC
CTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCTGT
CTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGTACATAGTACTACTGGAGGATCCAGCA
ATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGA
CACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCT
GGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGG
TACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTAT
GAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGG
TAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTAGA
TATTAGCCCATAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATACCATTTCCTAAA
CACATGAAACTCACGAAAATGAATCATTGAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 8 7 7 7 7 6 6 6 6 10 8 9 11 11 3 0 3 0 3 21 3 0 3 0 0 3 0 3 21 21 24 9 9 9 9 19 23 37 23 23
3 0 3 0 0 3 29 19 24 7 8 6 6 6 12 10 10 9 7 7 7 7 9 15 23 27 25 23 29 29 31 33 36 36 38 38 57 59 50 50 42 42 47 40 50 50 57 57 57 57
57 57 46 43 43 43 43 43 47 59 59 46 41 41 39 39 32 37 37 39 39 48 48 48 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 41 47 47 47 47 57 57 57
57 57 54 54 57 50 50 50 50 50 50 47 47 50 50 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 47 41 44 39 37 37 26 23 12 11 12
11 16 12 11 9 11 15 22 32 43 43 46 48 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 57 50 54 54 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
50 48 48 48 53 53 53 44 44 39 37 37 35 35 19 12 9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 9 20 27 37 47 27 27 3 0 3 3 0 3 27 27 59 59 59 59 59 59 59
59 48 48 48 30 27 24 12 18 15 23 15 13 13 26 30 25 23 12 11 11 11 15 19 28 30 37 37 48 48 48 47 47 47 48 48 48 48 48 43 43 43 36 36 42 42 42 39 39 39
36 33 39 39 30 36 39 39 47 36 43 43 43 37 29 33 33 27 23 23 18 13 13 12 12 12 19 19 23 15 14 23 23 37 37 37 32 32 28 28 30 34 24 25 25 30 30 43 39 39
35 35 35 39 47 48 48 43 43 40 39 39 37 29 24 16 18 17 17 17 24 30 34 28 28 14 10 8 8 8 8 12 19 28 28 32 37 37 37 39 33 33 28 30 20 22 15 15 19 19
28 14 11 11 11 18 20 30 37 37 30 33 33 28 29 28 33 33 33 36 28 32 23 19 18 15 15 32 32 26 20 23 20 20 24 24 28 34 22 19 8 8 10 19 22 23 21 19 19 19
19 15 13 12 12 10 10 10 10 15 12 25 28 30 33 32 26 26 15 18 12 17 17 32 34 34 31 28 25 20 11 21 11 11 10 11 8 8 7 7 7 9 9 11 11 11 13 15 15 13
12 12 13 12 12 17 12 15 15 12 8 8 8 8 6 6 10 10 13 15 15 24 22 28 20 20 15 18 13 13 13 16 15 15 15 12 12 12 12 13 9 7 8 7 6 8 8 11 7 9
8 10 6 6 11 8 10 8 8 7 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 9 9 9 26 22 22 23 16
16 6 6 6 6 6 6 9 10 10 15 17 13 12 11 6 8 7 6 8 8 8 11 11 18 13 6 6 6 7 8 6 8 8 9 17 19 17 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
12 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 8 7 7 9 9 14 16 31 29 41 41 44 44 44 44 44 44 41 41 43 39 28 25 14 9 9 9 9 10 11 15 10 16 16 28 23 37 37 37 37 39 36 36 36 36 37 42 53
53 53 53 43 34 21 11 18 16 20 19 15 15 26 21 41 42 42 42 50 50 50 50 50 50 53 68 68 68 50 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 57 51 50 50 50 51
57 68 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 39 39 39 39 12 10 10 10 33 33 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57
57 54 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 54 59 68 68 57 57 54 59 57 57 57 57 57 57 50 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 41 44 44
44 41 41 44 59 47 59 47 47 41 37 37 32 29 29 37 43 37 37 39 39 37 37 41 37 31 37 31 31 37 37 39 41 39 39 39 43 48 48 48 57 48 43 43 43 43 43 37 37 30
37 37 37 37 43 40 46 34 34 25 25 28 32 32 43 43 39 34 34 37 37 36 36 30 27 22 20 20 29 37 27 28 28 28 29 29 25 25 25 30 30 28 22 21 26 24 30 32 28 15
18 18 16 16 11 13 24 17 22 9 9 9 22 17 27 32 28 22 25 28 28 25 21 27 24 29 21 25 16 19 19 24 19 20 34 23 22 16 10 9 8 8 8 14 17 18 23 19 20 20
13 13 13 11 11 21 13 16 17 18 15 13 11 11 10 15 12 19 11 10 10 10 8 8 7 7 7 9 11 11 11 |