BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-488D23.T7 (MSMg01no488_d23.b1) | MSMg01-488D23.TJ (MSMg01no488_d23.g1) |
ACC | AG567017 | AG567018 |
length | 707 | 771 |
length of high quality (start - end) | 649 (20 - 668) | 534 (75 - 608) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_d23.b1 PHD_FILE: MSMg01no488_d23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_d23.g1 PHD_FILE: MSMg01no488_d23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:06 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GACTCACTATATCGAGAGGATCCGCGGAATTCTCTGTTTTTCCCATACCC
CATTTTGATAGGGTTATTTGGTTTTCTGGAGTCTAACTTCTTGAGTTCTT
TGTATATTTTGTATATGAACCCTCTATTGGATGTAGGGATGGTAAAGGCC
TTTTCCCAATCTGTTGGCTGCTGTTTTGTCCTATTGACAGTGTCCTTTGC
CTTATAGAAGCTTTGCAATTTTATCAGGTCTTATTTGTTAACTGTTGATT
TTAGAGCATGAGCCATTGGTGTTCTGTTCAGGAAATTTTCCACTGTGCCA
GTGTGTTTGAGATTCTTTCCTACTTTCTCTTTGATTAGATTCATTGTACC
TGGCTTTATATGTGGGTTCTTAATCCACTTGGACTTGAACTTTGTACAAG
GAGATAAGAATAGATCAATTTGCATTCTTCTACATGCCAACTGAGGGTTG
AACCAGCACCGTTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTCCCACTGGATGGTTT
TGTCTTTTTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGAATTGTTTCT
GGGTCTTCAATTCTATTCCATTGATCTACCTTCCTGTCTCTGTACCAATA
CCATGTGATTTCTATCACTATTACTCTCGGAGATCCCAATGGGAGAGAAA
GGCAAAGGACTGAAGGATCAGAGGGAGATTGCAACCCCATAGAAAAAAAC
AGTATCA
| CATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAACTGTGTTCTTGGCCAGATTTAC
AGTACAAGCCATGTGTTTCTTTCTGTGAAAGAAGTCTTAAATACAACCAG
CAGACTTTTTTATACCTACCCTTGCACCTAAAACTTTTGGAAACTTCTTT
TTGCAGATTTGACACAGTGGAACATCTGTTTTAACTAAAGAATTTCCTTT
AATACTTCTTAAGATTCTGATTGCCTTTTTTTCCCTTAGTTCCCCCCCCA
CTAGATAGAATTATAAGCTGACAGGGTTTAATATTTTTATTTTTAAAATT
TGTTTTATTTTTCATTATGTGTATATATTTATCTACCACCACTTTGCTAG
AGTAGGTTAATTTCTAATTACATCCTAAGTCTTATCCTTATATACACAGA
TAAATGAAGCTATCATCCTATATTAAAGAGTCTTCTCTTTGTAGCAAATG
GAAAGCATCAGAGAAAACTACAGCTGGAACTGGCACCAGTGGGAAGATCA
TAACTCATGCACCTATGGCTCAGAGAGCATTGCAGAAGTGGGAATGGAAA
GACTGTAAGAACCAGAACACCAGGAAGTCTGCAGTGAAACAGTCTCTCAT
GGAAATAGTGGTAGAAAAGCCAGCAGCCAGTTCAGCCAGCCAGGACCATA
CCTGCCCATGCTCTGCTAGGNCATACCCTTCTGAGGACCACGAAGATGTC
TGTTGCCCATGTGCCATCAAA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 21 19 20 20 20 21 19 9 8 8 8 8 9 9 11 14 14 20 20 24 27 48 48 48 36 36 30 30 31 31 59 59 59 59 33 25 15 9 10 10 10 19 19 33 33 59 33 33
36 36 50 36 59 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 57 68 48 48 46 46 46 48 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52
52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 50 50 50 48 48 48 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 43 59 41 47 43 48 48 50 44 41 41 41 41 34 34 37 31 32 43 41 44 41 47 47 41 43 43 43 43 43 47 48 59 59 59
59 59 47 47 43 40 40 41 31 31 39 39 39 47 47 59 41 48 48 48 48 57 59 48 48 48 57 48 48 48 48 59 59 59 59 48 48 46 59 59 59 47 41 37 29 29 32 37 37 39
41 41 40 43 40 40 40 43 43 48 57 48 48 48 59 48 48 48 57 48 48 48 57 48 48 43 43 36 34 34 17 17 14 21 17 30 28 25 25 32 30 32 34 30 30 30 30 30 37 37
34 32 37 32 32 31 29 29 33 37 37 32 28 24 20 18 24 24 22 12 12 10 12 12 25 21 24 20 22 16 22 15 18 19 25 27 34 15 14 12 12 8 7 9 9 9 19 16 15 19
14 17 17 19 24 15 15 | Open.Hide. 6 8 8 8 8 6 6 8 10 15 25 37 44 41 41 44 44 44 37 37 37 37 37 32 32 41 41 37 25 25 11 9 9 10 10 9 15 10 11 11 23 19 30 28 29 30 30 30 30 30
33 33 39 50 50 50 47 27 27 10 10 10 10 16 17 28 37 37 28 28 28 28 28 35 36 36 50 57 50 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 50 50 42 42 42 51 68 68 51 51 42
42 50 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68
68 68 68 59 59 57 57 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 59 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 54 54 54 59 47 37 41 30 32 29 43 43 48 48 43 43 43 43 43 43 57 57 43 57 48 39 37 37 37 37 37 41 39 37 37 39 35 41 40 59 30 33 24 24 24 37
37 48 48 57 57 48 48 43 43 39 39 39 40 47 48 48 57 48 43 28 30 12 12 11 16 16 32 32 43 47 48 32 32 24 24 34 34 34 37 36 36 37 37 37 32 31 31 41 43 37
37 30 28 24 24 19 23 28 25 20 16 14 13 11 12 21 19 22 28 19 14 12 12 21 22 23 32 35 28 29 24 13 13 18 18 20 20 20 19 19 15 19 19 13 21 19 23 20 26 21
20 19 14 14 10 10 10 17 19 22 19 20 20 19 17 24 26 14 14 15 19 22 28 33 32 34 32 20 28 28 29 22 28 23 28 30 17 21 12 11 11 17 12 17 11 11 12 18 18 23
24 22 32 30 22 22 18 16 18 14 14 14 24 26 18 18 20 20 14 3 0 3 16 12 15 12 12 12 15 18 20 17 19 14 10 10 11 11 9 9 9 9 9 10 16 10 11 11 15 16
23 23 22 22 14 14 15 9 8 8 8 11 8 8 9 9 10 9 9 9 9 |