BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-496O05.T7 (MSMg01no496_o05.b1) | MSMg01-496O05.TJ (MSMg01no496_o05.g1) |
ACC | AG573587 | AG573588 |
length | 742 | 1,444 |
length of high quality (start - end) | 230 (87 - 316) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no496_o05.b1 PHD_FILE: MSMg01no496_o05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no496_o05.g1 PHD_FILE: MSMg01no496_o05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:22:22 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ACGGCATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCATGAGTCGAG
CCGCGGAATTCAGCAGTACTATAAAAAGGCTTTGGNGGAGAAAGCATGGC
AGTGTCCTTAGGATAACCGTACAAAACACAAAATACAGTGGACAGTGTAA
CCTGTCATCATCACCATCGTTCTGGTGCAATGAACAATCTTTACTAATTT
GCTTACAATAACAAAATGAAAGTAAGCCGGACGTGGTGGCGCACGCCTTT
AATTTTTCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCAAGGCCA
GCCTGGTCTACCGAGTGTTTTTCTTTACAGCCAAGGCTACACAAAGAAAC
CCTGGCTCATAATAACCAAATTAAAAAAATAAAATGAAAGTAATGAAGAT
GCATACTGATACTAGCAACCACTAATTTAAATGTGACAAAGTTCAATTGG
CACAAAATAAATGAATAGACAGATATGTAATATAGCAAAACAAATAATAT
AACACAGCATGAATGTCCATGTTTGACAATTAGGAAGAAATAATTGGGAA
CATTAAAAAAAAGTGGCTAGTGGACACAAATAATCATATATGATTGACTG
AAAAGGAAGAAAAAGATATTGAACATTGCAAGAAGATCCTTTAATTACAA
TTTTATATTAAGCTTCACAGGTAAGCTCTCTTTAAGCTGTGGTTAGGCAA
GGCTTTATGAAGAACTAACAATGATAAATATATTTAGACACT
| TTAGACACTACAATCAGAGNGTTGTGTTGTTTGTGCACNGGGCGCGGGTG
GCCTCCCTATCCTCCACAGATGATGGGAGANTAGANGAGATCTCTTATCA
CTCTTCTCTCTCCCGGAGCGTATTGTACGCGTCTCCCGCGGAACGTGGCG
CGCAGTTATCAATGTACAGGAAATAATATATTAATCTATGACGGGAGTGG
AGGTGACGTGGATACAGACGCAAGGTCGGGCGCGAGTGCGATAGGCGAGC
GCAGAAGTGGTATGAGATAAAGACATAACGTACATAAAATAACTAAGCGG
ACTAGACACACGTCTCTGCTATACGACACGCGCATGCGTATAGTNCGACG
CCGCCGCNCGCGCCGCGTCATATAGTATAATGTACAGATACTATGCGCAG
TTTNATCGGCNCTAGACGTCGTGGGCGACAGGGCGATACAGATATAGCGG
GTTTGTGCGGTGGGCAGGGGNCCGCGCGCGCACTATATTACTCAAACTAA
ACACAAAAACACAAGTAAACACTATACTATGTGAGTCCTGACGTACGCGC
GATCACTAATATTGACGGACACCTATCCATACTCTGCCGTATGATTAACT
GAGTGAACGGATATATCAAAGATGTGTTAGTGATATACCTANTACTGCTT
ACACGGATAGGAACGTACTGCCGTCTACAATATATCGAGATATTATATGC
GAAGAAAGTAGTCGGCGACGGCGGGGGCGCGCGCCGGCCGCCAGTGCTGT
TACGTTGAGCGGAAGGCGGTGCGCGCGAAGATAATCGTGAATATGATTTC
GCGCGTGCGGTAGTTAGTGAGTCGCGTGTTAGTTGTGTAGAGCAGATCGG
CNGACGTGCCGCTCGTTGTAGTGTACTGTCGATGTGGCTAGTATAGATCG
CAAACGAATGACGCGCGGGCGACGCGGCGATCGCATCACGTGTATCTCAT
ATGTCGCNAGTAATGCCCGCGCAGCGATATTGCGAGCGTCGGCGCCACTC
CACTCTTCGCACGCGCGGCGGTGTGATAGGAACCGCAGCGCGAGGAGCAG
GTGTGCCGATCGGCGCGATATGCGGACGTGCCGACGCCTGCGACTATATG
CGAAGTACTCTAGCGTCGGGACGACGGACTCGGCGGTGCGCATGAGCGGA
GAATAAAAAATATATAGACGCGCCGCGCACGAGCGCGCGCGGACACCAGA
AATTCTGGCCGAGAGTGATGTATCTGAGCACGAGCCGTGATGCGACATAC
CGAGGAGACGATGAAGAGACGCGCACTCGGTTATACATAGCCAATGCGGG
NGACCACGATCACACGACACGAGATGATGATGCCGCACGTGATGTGTGAC
ATTGATAATACAGCGACAGGGCGCGCGCGAGGGAGACAAGTATGATATAC
GAGTGTGCGGCNCGCGGCGCCGTGTGAGATGAATGATAGTAAAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 8 8 7 9 12 12 16 22 19 19 22 29 37 32 26 15 14 14 14 24 24 19 16 16 16 28 18 36 20 19 19 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 10 9
10 15 18 33 37 31 31 31 31 30 21 21 9 9 9 7 7 7 6 6 7 7 7 8 9 9 9 9 9 10 21 28 27 29 3 0 3 27 27 44 47 47 50 50 50 50 50 50 50 50
50 50 57 59 48 48 59 59 59 59 50 50 50 50 50 48 59 30 30 15 15 14 15 17 23 23 28 36 37 48 48 54 54 54 48 47 48 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 44 44 35 35 32 32 36 43 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 48 37 36
17 17 11 18 16 12 12 12 12 30 30 47 47 42 48 50 53 53 57 48 43 57 43 37 43 39 43 43 43 43 48 48 48 53 53 57 57 57 48 48 57 57 57 57 48 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 47 44 27 23 9 6 6 7 7 7 6 6 6 7 12 11 11 20 27 37 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 47 44
44 19 9 9 9 9 17 15 12 11 11 11 11 11 22 24 28 25 25 25 28 28 37 39 48 59 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 50 57 54 54 54 54 54 43 46 39 39 46 34
34 47 48 48 48 48 54 54 54 54 57 44 44 27 24 11 11 15 15 15 12 13 26 32 57 44 48 39 37 37 37 37 39 39 57 57 57 47 47 43 47 47 57 57 57 57 57 50 43 43
44 44 43 43 43 47 47 48 48 48 48 54 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 59 59 41 41 41 41 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54
54 54 43 34 28 14 14 28 34 47 48 40 43 30 25 25 43 40 48 48 57 57 57 50 47 57 48 48 37 28 25 12 12 13 25 21 28 24 31 37 37 29 30 31 31 31 43 43 48 48
57 57 57 57 43 43 43 43 43 40 40 39 40 43 43 48 48 48 48 48 43 42 30 30 37 40 37 43 36 39 39 40 43 43 43 43 37 43 43 43 43 39 37 37 43 43 43 43 39 39
36 28 31 20 20 15 22 14 14 15 24 24 20 17 18 18 30 30 41 41 34 34 24 24 24 29 27 31 22 18 18 22 26 28 23 23 21 21 20 21 22 19 16 12 12 12 15 18 20 37
37 28 30 13 11 9 8 8 10 8 7 9 9 23 23 30 24 24 19 11 11 11 10 10 12 17 21 10 9 9 15 12 15 8 8 8 15 15 8 8 8 8 12 14 17 33 36 32 18 18
16 15 18 24 22 17 15 8 8 8 9 9 17 19 23 31 24 18 24 15 15 14 23 23 24 20 18 22 28 31 34 37 31 27 23 14 13 13 19 19 18 14 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 8 10 8 7 8 6 6 8 8 10 3 0 3 8 8 8 6 8 7 6 6 6 8
6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 6 6 3 0 3 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 10 9 9 8 8 6 6 6 6 6 7 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 7 6 8 8 8 6 10 6 6 6 6 8 6 8 9 8 10
6 8 7 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 7 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8
8 8 10 10 6 6 6 8 8 8 9 25 19 9 10 10 10 10 10 8 8 10 10 8 8 10 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6
8 6 6 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 10 10 13 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 13 10 6 6 6 6 6 6 8 8 10
8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 7 7 7 8 8 8 9 11 9 9 9 10 11 3 0 3 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 9 8 6 7 6 6 6 9 8 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 15 12 11 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10 10 8 8
6 6 3 0 3 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 7 9 9 11 8 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8
8 8 6 6 6 8 6 8 6 7 7 9 12 6 8 8 8 8 8 3 0 3 11 11 10 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 7 6 9 7 7 8
8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 9 10 11 10 10 12 10 6 7 6 8 8 9 6 8 8 7 8 8 11 11 11 10 10
10 10 10 10 9 9 9 10 9 9 10 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 9 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 6 6 6 8 8 3 0 3 6 8 6 7 9 10 9
9 7 10 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 7 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 9 9 10 8 8 8 9 9
10 10 9 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 9 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 6 6 6 6 8 6 6 10
8 10 9 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 7 6 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 6 8 6 6 8 6 6 6 7 6 6 8
7 7 7 7 10 12 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 8 7 6 8 8 6 6 6
3 0 3 8 6 8 8 8 10 8 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 10
10 12 9 9 9 9 10 9 9 9 12 11 12 6 6 6 6 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 11 12 15 12 14 12 10 9 9 9 9 9 10 7 7 6 6
8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 11 16 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8
6 6 8 8 8 8 8 6 8 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 6 6 6 6 7 10 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7
7 6 8 8 12 10 10 10 10 11 11 12 11 10 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 9 7 8 8 8 8 8 6 11 10 7 8 8 8 17 8 6 6
6 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 7 9 12 10 9 9 9 9 10 17 16 11 11 11 9 10 8 8 9 12 8
8 11 8 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 7
6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 10 9 10 8 8 8 8 10 10 11 10 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 17 8 8 8 12 8 8 8 8 8 9 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 3
0 3 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8
6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 12 11 11 8 8 6 6 8 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 13 13 22 28 13 13 8 10
7 7 7 7 8 8 8 13 12 10 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 13 11 8 9 9 9 9 12 11 10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 |