seq1: chr11_4877595_4877692
seq2: B6Ng01-030N20.b_45_142
seq1 ATTCCTGTGTGTGTGTGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCTTTCTTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTCCTGTGTGTGTGTGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCTTTCTTTT 50
seq1 TCTTTTTCTTTTTTTTGGGGGGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGGTTT 98
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2 TCTTTTTCTTTTTTTTGGGGGGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGGATT 98
| seq1: chr11_5017601_5018561
seq2: B6Ng01-030N20.g_68_1025 (reverse)
seq1 AGTAGGAGACAAGGAATTTAAACATCCATGTCGGGGCTGGAGAGATGGCT 50
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2 AGTAGGAAACAAGGAATTTAAACATCCATGTTCGGGCTGGAGAGATGG-T 49
seq1 CAGTGCTTAAGAGCACTGGATGCTCCCACAGGGAACCCAAGTTCAATTCT 100
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2 CAGTGC-TAAGAGCACTGGATGCTCCCACAGGGAACCCAAGTTCAA-TCT 97
seq1 CAGCACCCACATGGAAGACCACAACCATCTGTAACTCCAGTTTCAGGGAA 150
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCACCCACATGAAAGACCACAACCATCTGTAACTCCAGTTTCAGGGAA 147
seq1 TCTGACACCCTCTTCCGACCTCTGCAGGCAGCAAGCAGGCTTGCATGTGG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTGACACCCTCTTCCGACCTCTGCAGGCAGCAAGCAGGCTTGCATGTGG 197
seq1 TGCACAGACATACATGCAGGCAAAACACTCATATGCATAAAAAGAAGCTG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGCACAGACATACATGCAGGCAAAACACTCATATGCATAAAAAGAAGCTG 247
seq1 TAAAAAATTAATAAAATATCTATGACAGATATTCTGGACCATGAGATGGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAAAATTAATAAAATATCTATGACAGATATTCTGGACCATGAGATGGT 297
seq1 TCAGCAAACCTGGCCAAGTGGGTCCCGGAACCCACAGTGGGAGGAGAGAG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGCAAACCTGGCCAAGTGGGTCCCGGAACCCACAGTGGGAGGAGAGAG 347
seq1 CTGAACTGTGCCCTGTCTTTCACACATGCTCCCATCACTAAATACACAAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGAACTGTGCCCTGTCTTTCACACATGCTCCCATCACTAAATACACAAT 397
seq1 AACAGTAAATAAAATAAAAAAACCTAAACATTTCCTAAAGATTAAAAAGC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACAGTAAATAAAATAAAAAAACCTAAACATTTCCTAAAGATTAAAAAGC 447
seq1 TGTTTTTTAAAGACTATGAGCACATGAGTGTAGACTCCAATAGAGGCCCC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTTTTTTAAAGACTATGAGCACATGAGTGTAGACTCCAATAGAGGCCCC 497
seq1 AGAGCTGGGGTTGCAGGTGGCTGTGAGCCATCTAAAATGGGTACTGGAAA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGCTGGGGTTGCAGGTGGCTGTGAGCCATCTAAAATGGGTACTGGAAA 547
seq1 CTGAACTCAAGTCCTCAGAGGGAGCAGTTATGCACTTAACCACTGAGCCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGAACTCAAGTCCTCAGAGGGAGCAGTTATGCACTTAACCACTGAGCCA 597
seq1 TTTCTTCAGCTCCCTAAAAGAATGTTTTAAAAGAATCAGTGGGGGAGGGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTCTTCAGCTCCCTAAAAGAATGTTTTAAAAGAATCAGTGGGGGAGGGG 647
seq1 GAGGTTAGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGCCTGCTCTTCCAGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGGTTAGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGCCTGCTCTTCCAGA 697
seq1 GGTCCTGAGTTCAGTTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAGCCATCTGT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTCCTGAGTTCAGTTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAGCCATCTGT 747
seq1 GATGGGATCCGACGCCCTCTTCTGGCATGCAAGCACACATGAATTACAGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATGGGATCCGACGCCCTCTTCTGGCATGCAAGCACACATGAATTACAGA 797
seq1 ACACTGTATATATAACACAATAAAGAAATCTTTAAAACCAGAATGATTCA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACTGTATATATAACACAATAAAGAAATCTTTAAAACCAGAATGATTCA 847
seq1 GGCTAGACCGTCTAGTGATGCATGCCTGTAACCCAAGCTTTGGGGAGGCC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCTAGACCGTCTAGTGATGCATGCCTGTAACCCAAGCTTTGGGGAGGCC 897
seq1 AAGGCACATGGGTTGCCTGTTATGAATTCAAGGCCAGCCTAAGTTAGCTA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGGCACATGGGTTGCCTGTTATGAATTCAAGGCCAGCCTAAGTTAGCTA 947
seq1 GATAAGAATTC 961
|||||||||||
seq2 GATAAGAATTC 958
|