seq1: chr11_3757778_3758877
seq2: B6Ng01-035O06.b_47_1111
seq1 GAATTCTTCCCTAATTTCATTTTATTAAATGTTCTCTGTGAGTCAAGAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTCCCTAATTTCATTTTATTAAATGTTCTCTGTGAGTCAAGAGG 50
seq1 TAAGAACGAAATGCTTACAACAGGAACGAACAACGACAACAACAAACTGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAGAACGAAATGCTTACAACAGGAACGAACAACGACAACAACAAACTGG 100
seq1 CGTGCGAAGCTGTGTTCCTGGGCAGTATCAGAGGAGACGCGTACTTAGGG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGTGCGAAGCTGTGTTCCTGGGCAGTATCAGAGGAGACGCGTACTTAGGG 150
seq1 ATGCTAGGCATCCTCAGCCTCCATCTTGTATCTTACCACATCGTTGGAAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGCTAGGCATCCTCAGCCTCCATCTTGTATCTTACCACATCGTTGGAAA 200
seq1 GAAGTAAAACTGTGCACAGTGACCCATGCCTCCCAGAAACACCACTGACA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGTAAAACTGTGCACAGTGACCCATGCCTCCCAGAAACACCACTGACA 250
seq1 CGTGACAGTATTCACAAATAGCATCCTTTGACTCCTGCTAACAGGAATGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGTGACAGTATTCACAAATAGCATCCTTTGACTCCTGCTAACAGGAATGT 300
seq1 CGCTGGACCCATCTGTTGACTGTGAGGTACAAAACAGGCTGATGGGATGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGCTGGACCCATCTGTTGACTGTGAGGTACAAAACAGGCTGATGGGATGG 350
seq1 CCAGGCTGCCTCACAGGCCCATGGGAAAAGCCAGTGCTTGCTGTTGGAAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGGCTGCCTCACAGGCCCATGGGAAAAGCCAGTGCTTGCTGTTGGAAC 400
seq1 CAGACCCTGACATTCAAACCAAGACTGGAGAGTGCAGAACCCCTATTTCT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGACCCTGACATTCAAACCAAGACTGGAGAGTGCAGAACCCCTATTTCT 450
seq1 ATTTTCATGCTGTCATTGCTGGTCCCCAAGATTCCCTCTTTGGGGCAGAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTTTCATGCTGTCATTGCTGGTCCCCAAGATTCCCTCTTTGGGGCAGAG 500
seq1 ACTTTTGAGGTTGAGCTCTTCCTTCCAGAATACCCAAGGGAGACACCTCA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTTTTGAGGTTGAGCTCTTCCTTCCAGAATACCCAAGGGAGACACCTCA 550
seq1 ACTCTATTCTGTGACCACAGTTCGCAGGGGGGCATCCCCAGCCATGACCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTCTATTCTGTGACCACAGTTCGCAGGGGGGCATCCCCAGCCATGACCA 600
seq1 GGTCCACAGAGGAGATAATTCAGCAAGGTAAGAATGAGTCAGGTATGGGA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2 GGTCCACAGAGGAGATAATTCAGCAAGGTAAGAATGAGTCACGTATGGGA 650
seq1 GTCTGAATGGTGGAAGTCTTGTAGCTTGACTGACTGGCAGTCAGAATGCT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCTGAATGGTGGAAGTCTTGTAGCTTGACTGACTGGCAGTCAGAATGCT 700
seq1 TCTTTATTTAAACAGAACTCAGTAGGCAGGGATAGATTCATGTTGTCCCA 750
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTTATTT-AACAGAACTCAGTAGGCAGGGATAGATTCATGTTGTCCCA 749
seq1 AAACAGAAATCCTATCATTTTTATCCCTAGACACAATGGCCTCTTGGTCA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACAGAAATCCTATCATTTTTATCCCTAGACACAATGGCCTCTTGGTCA 799
seq1 TAAGTTTAGTTTACCATTGATAAACAGTGACAGAGCAGTTATCTTTTATA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAGTTTAGTTTACCATTGATAAACAGTGACAGAGCAGTTATCTTTTATA 849
seq1 ATCATTTTCCATCATCAACTCCATAGCCCAACTTTTAAGAATCTAGCAGC 900
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||
seq2 ATCATTTTCCATCATCAACTCCATAGCCC-ACTTT--AG-ATCTAGCAGC 895
seq1 ATACTTTGCCAAAGCATGATAGCACATTCTCAGGCTGGTAGCAGAAAATC 950
|||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||
seq2 ATACTTTG-CAAAGCATGATAGCACA-TCTCA-GCT-GTAGCAG-AAATC 940
seq1 TCCAAGCCAGCCTGGGCTGGTTGCTAATTGTCATTAGGCCCAAGGAAAAA 1000
| |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||
seq2 T-CAAG-CAGCCT-GGCTG--TGCT-ATTGTCAT--AGCCCA---GAAAA 979
seq1 AATCTTCAGGCCAAAGCTGCTGCAGTTATTATTCAATTTTTGGCATGAAA 1050
||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2 AATCTTCAG--CCAAGCTGCTGCAG-TATTATTCA--TTTTGGCATGAAA 1024
seq1 ATGTTTATACTTTTGTAGAATTTATTTGTGTGTCTAATCTTGGTATTTTT 1100
| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||
seq2 ---TGTATAC-TTTGTAGA--TTA-TTGTG-GTC-AATCTTGGAATTTTT 1065
| seq1: chr11_3948913_3949138
seq2: B6Ng01-035O06.g_73_298 (reverse)
seq1 TCCTCCTTCTCCTTCTCCTGTTTTTCCTTTCCCTCTCTCCTGTTGGGAGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCTCCTTCTCCTTCTCCTGTTTTTCCTTTCCCTCTCTCCTGTTGGGAGC 50
seq1 CGCGCCCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGCGCCCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGT 100
seq1 GGTAAACAAATAATCTGCGCATGTGCCAAGGGTATCTTATGACTACTTGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTAAACAAATAATCTGCGCATGTGCCAAGGGTATCTTATGACTACTTGT 150
seq1 GCTCTGCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTCTGCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCA 200
seq1 GGGAGTGACACGTCCGAGGCGAAGGA 226
||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGAGTGACACGTCCGAGGCGAAGGA 226
|