BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073H03
Chromosome11 (Build37)
Map Location 64,084,685 - 64,198,210
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG544785
Upstream geneLOC100042799, LOC100041690, LOC654442, LOC668297, Hs3st3b1, Cox10, 2810001G20Rik
Downstream geneHs3st3a1, LOC626959, Elac2, AU040829, 1700086D15Rik, LOC100041790, Myocd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073H03.bB6Ng01-073H03.g
ACCDH890576DH890577
length8591,111
definitionDH890576|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073H03, 5' end.DH890577|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073H03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,084,685 - 64,085,543)(64,197,093 - 64,198,210)
sequence
gaattctgggctcctcctgactgttggcgggcagaagttccagctccatg
tgtggtctccacaaagactggcctgcagaagtgatgtcttagtacttatc
tggactttctgcacagcctcactgggagggaatgtccatgttccccctca
gtccctgctgctgcccacggggactgcttcctatgttttctggttgacat
agaacagttactgccataaacgtttccctcctgctctttgcccctccttt
tacatggctgtgccgtgtgagcttctcagagaggccaggttgttgttgtt
gttgttgatgtttcaggcaattggtattctctggctttgagccttactct
atataaaactaaaaaggtcagggaacagctcatgagcatgctacttttca
agccccaagatgcctgggcaattggtcttcgcttcacctcccagttttat
gccccgagtccagggcctctcttttgcacctgaatgcggtgtgtgacgtc
tttgtggggctggtgctgattaccaggcaactgctcttttcacttagcac
tgtgattctgagagccatcctgttgatagctgaaggctgggttctagctt
agttttaagagcttgctcagtacttgtcacttgtccggtcaattttctac
tgactctttcaaaggaagctccatctcaaatggcacaagacaagaaactc
aaagcaccattcagtcagtcactcagcagcagcattgagatgcaagtctt
ggcacattttgctcttcaagataactgcagtagctaaggcctcacacaca
gagaagagggaatctctcatgctctctctctctctctctctccctctctc
tctctctct
gaattcctcctgaatttatttacaaatatcagataaggagaagttcttgg
aaaacacggacattttgccacagaagttagtttgtgcagccacagcacag
cagatgctacactaggggccaggcacttcatcccttgtgtgctcagccta
tgtatttgtaaaatgagagtgttaaactgaaataacagacttcccagctc
tgtcattcaaggcttccatggttttagtatttgttgatgttttaaataat
actatttcattcccacaggcccccctggtctgccctacctctctctccag
attcctctacaaataaatagttccaggtgggattcgtttagatttattag
tattattttaatagctaccatatatccagcactcgctatgtacagaatat
atattatctgacataatccatatgcaacccaagtattagcttcagctttc
cttgctctgttctttgcagagagggagtttgtgctgaagtattcatcgat
cccctggcagctgcacctccatgtggtaccctttgcctcctttgcttttg
gtttcgtcttgagccctatatcccccactgtcatcagtcaccactgaaaa
cttctgccctgtgaccacattaagggtcatgctgcttctaccatggaggc
atctgaaagtggagagggacgcgtgtcttttctttgttatggtttggatc
ttaaaggtccctggtatcagttagagttgctattgctgtgctgaaatacc
atgacaaaatgtaacttgagaggaaagggtttatttggcttgcatatccg
aatcacagttgtattaatttgaatagtttggcctctatagattcgcatgc
ttgaaagcttggcctataggaagtggtgctattaggaggtgtggcctctt
tggagtagtgtggccttgttgaaggaagtgtgtcactgtgtctgtgggct
ttgaagtctcctgtgctccagctctgcccagtgggaatccagtctcctga
atgctttcaaatcaaaatttagaattcttagtccttccagcacatgtcct
gcttgatgatatgactaaacctctgactctgtagccagctccaattaaat
gtccttataaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_64084685_64085543
seq2: B6Ng01-073H03.b_29_887

seq1  GAATTCTGGGCTCCTCCTGACTGTTGGCGGGCAGAAGTTCCAGCTCCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCTCCTCCTGACTGTTGGCGGGCAGAAGTTCCAGCTCCATG  50

seq1  TGTGGTCTCCACAAAGACTGGCCTGCAGAAGTGATGTCTTAGTACTTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCTCCACAAAGACTGGCCTGCAGAAGTGATGTCTTAGTACTTATC  100

seq1  TGGACTTTCTGCACAGCCTCACTGGGAGGGAATGTCCATGTTCCCCCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTTTCTGCACAGCCTCACTGGGAGGGAATGTCCATGTTCCCCCTCA  150

seq1  GTCCCTGCTGCTGCCCACGGGGACTGCTTCCTATGTTTTCTGGTTGACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTGCTGCTGCCCACGGGGACTGCTTCCTATGTTTTCTGGTTGACAT  200

seq1  AGAACAGTTACTGCCATAAACGTTTCCCTCCTGCTCTTTGCCCCTCCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGTTACTGCCATAAACGTTTCCCTCCTGCTCTTTGCCCCTCCTTT  250

seq1  TACATGGCTGTGCCGTGTGAGCTTCTCAGAGAGGCCAGGTTGTTGTTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGGCTGTGCCGTGTGAGCTTCTCAGAGAGGCCAGGTTGTTGTTGTT  300

seq1  GTTGTTGATGTTTCAGGCAATTGGTATTCTCTGGCTTTGAGCCTTACTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTGATGTTTCAGGCAATTGGTATTCTCTGGCTTTGAGCCTTACTCT  350

seq1  ATATAAAACTAAAAAGGTCAGGGAACAGCTCATGAGCATGCTACTTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAACTAAAAAGGTCAGGGAACAGCTCATGAGCATGCTACTTTTCA  400

seq1  AGCCCCAAGATGCCTGGGCAATTGGTCTTCGCTTCACCTCCCAGTTTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAAGATGCCTGGGCAATTGGTCTTCGCTTCACCTCCCAGTTTTAT  450

seq1  GCCCCGAGTCCAGGGCCTCTCTTTTGCACCTGAATGCGGTGTGTGACGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCGAGTCCAGGGCCTCTCTTTTGCACCTGAATGCGGTGTGTGACGTC  500

seq1  TTTGTGGGGCTGGTGCTGATTACCAGGCAACTGCTCTTTTCACTTAGCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGGGGCTGGTGCTGATTACCAGGCAACTGCTCTTTTCACTTAGCAC  550

seq1  TGTGATTCTGAGAGCCATCCTGTTGATAGCTGAAGGCTGGGTTCTAGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTCTGAGAGCCATCCTGTTGATAGCTGAAGGCTGGGTTCTAGCTT  600

seq1  AGTTTTAAGAGCTTGCTCAGTACTTGTCACTTGTCCGGTCAATTTTCTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTAAGAGCTTGCTCAGTACTTGTCACTTGTCCGGTCAATTTTCTAC  650

seq1  TGACTCTTTCAAAGGAAGCTCCATCTCAAATGGCACAAGACAAGAAACTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCTTTCAAAGGAAGCTCCATCTCAAATGGCACAAGACAAGAAACTC  700

seq1  AAAGCACCATTCAGTCAGTCACTCAGCAGCAGCATTGAGATGCAAGTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACCATTCAGTCAGTCACTCAGCAGCAGCATTGAGATGCAAGTCTT  750

seq1  GGCACATTTTGCTCTTCAAGATAACTGCAGTAGCTAAGGCCTCACACACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACATTTTGCTCTTCAAGATAACTGCAGTAGCTAAGGCCTCACACACA  800

seq1  GAGAAGAGGGAATCTCTCATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAGGGAATCTCTCATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTC  850

seq1  TCTCTCTCT  859
      |||||||||
seq2  TCTCTCTCT  859

seq1: chr11_64197093_64198210
seq2: B6Ng01-073H03.g_67_1177 (reverse)

seq1  TTTATAAGGACATTTAATTGGAGCTGGCTAACAGAGTCAGAGGTTTAGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAAGGACATTTAATTGGAGCTGGCT-ACAGAGTCAGAGGTTTAGTC  49

seq1  CATTATCATTCAGGCA-GACATGGTGCTGGAAGAACTAAGAATTCTACAT  99
         ||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||
seq2  --ATATCA-TCAAGCAGGACAT-GTGCTGGAAGGACTAAGAATTCTAAAT  95

seq1  TTTGATTTGAAAGCATTCAGGAGACTGGATTCCCCACTGGGCAGAGCTGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTTGAAAGCATTCAGGAGACTGGATT-CCCACTGGGCAGAGCTGG  144

seq1  AGCACAGGAGACTTCAAAGCCCACAGACACAGTGACACACTTCCTTCAAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGAGACTTCAAAGCCCACAGACACAGTGACACACTTCCTTCAAC  194

seq1  AAGGCCACACCTACTCCAAAGAGGCCACACCTCCTAATAGCACCACTTCC  249
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCACA-CTACTCCAAAGAGGCCACACCTCCTAATAGCACCACTTCC  243

seq1  TATAGGCCAAGCTTTCAAGCATGCGAATCTATAGAGGCCAAACCTATTCA  299
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TATAGGCCAAGCTTTCAAGCATGCGAATCTATAGAGGCCAAA-CTATTCA  292

seq1  AATTAATACAACTGTGATTCGGATATGCAAGCCAAATAAACCCTTTCCTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATACAACTGTGATTCGGATATGCAAGCCAAATAAACCCTTTCCTC  342

seq1  TCAAGTTACATTTTGTCATGGTATTTCAGCACAGCAATAGCAACTCTAAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTACATTTTGTCATGGTATTTCAGCACAGCAATAGCAACTCTAAC  392

seq1  TGATACCAGGGACCTTTAAGATCCAAACCATAACAAAGAAAAGACACGCG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACCAGGGACCTTTAAGATCCAAACCATAACAAAGAAAAGACACGCG  442

seq1  TCCCTCTCCACTTTCAGATGCCTCCATGGTAGAAGCAGCATGACCCTTAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTCCACTTTCAGATGCCTCCATGGTAGAAGCAGCATGACCCTTAA  492

seq1  TGTGGTCACAGGGCAGAAGTTTTCAGTGGTGACTGATGACAGTGGGGGAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCACAGGGCAGAAGTTTTCAGTGGTGACTGATGACAGTGGGGGAT  542

seq1  ATAGGGCTCAAGACGAAACCAAAAGCAAAGGAGGCAAAGGGTACCACATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGCTCAAGACGAAACCAAAAGCAAAGGAGGCAAAGGGTACCACATG  592

seq1  GAGGTGCAGCTGCCAGGGGATCGATGAATACTTCAGCACAAACTCCCTCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGCAGCTGCCAGGGGATCGATGAATACTTCAGCACAAACTCCCTCT  642

seq1  CTGCAAAGAACAGAGCAAGGAAAGCTGAAGCTAATACTTGGGTTGCATAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAAAGAACAGAGCAAGGAAAGCTGAAGCTAATACTTGGGTTGCATAT  692

seq1  GGATTATGTCAGATAATATATATTCTGTACATAGCGAGTGCTGGATATAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTATGTCAGATAATATATATTCTGTACATAGCGAGTGCTGGATATAT  742

seq1  GGTAGCTATTAAAATAATACTAATAAATCTAAACGAATCCCACCTGGAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGCTATTAAAATAATACTAATAAATCTAAACGAATCCCACCTGGAAC  792

seq1  TATTTATTTGTAGAGGAATCTGGAGAGAGAGGTAGGGCAGACCAGGGGGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTTGTAGAGGAATCTGGAGAGAGAGGTAGGGCAGACCAGGGGGG  842

seq1  CCTGTGGGAATGAAATAGTATTATTTAAAACATCAACAAATACTAAAACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGGAATGAAATAGTATTATTTAAAACATCAACAAATACTAAAACC  892

seq1  ATGGAAGCCTTGAATGACAGAGCTGGGAAGTCTGTTATTTCAGTTTAACA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGCCTTGAATGACAGAGCTGGGAAGTCTGTTATTTCAGTTTAACA  942

seq1  CTCTCATTTTACAAATACATAGGCTGAGCACACAAGGGATGAAGTGCCTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCATTTTACAAATACATAGGCTGAGCACACAAGGGATGAAGTGCCTG  992

seq1  GCCCCTAGTGTAGCATCTGCTGTGCTGTGGCTGCACAAACTAACTTCTGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTAGTGTAGCATCTGCTGTGCTGTGGCTGCACAAACTAACTTCTGT  1042

seq1  GGCAAAATGTCCGTGTTTTCCAAGAACTTCTCCTTATCTGATATTTGTAA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAATGTCCGTGTTTTCCAAGAACTTCTCCTTATCTGATATTTGTAA  1092

seq1  ATAAATTCAGGAGGAATTC  1118
      |||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTCAGGAGGAATTC  1111