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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-105H18
Chromosome	11 (Build37)
Map Location	119,694,423 - 119,823,151
singlet/doublet	doublet
Overlap gene	4932417H02Rik, Chmp6, Baiap2
Upstream gene	D11Bwg0517e, Enpp7, Cbx2, Cbx8, Cbx4, Tbc1d16, Ccdc40, Gaa, Eif4a3, Card14, Sgsh, Slc26a11, LOC672511, Rnf213, A730011L01Rik, Nptx1
Downstream gene	Aatk, Azi1, 2410002I01Rik, 1810043H04Rik, 1810073N04Rik, 2810410L24Rik, LOC100042332, LOC100043384, LOC100043389, Bahcc1, Actg1, Fscn2, 2310003H01Rik, Nploc4, Tspan10, Pde6g, 1810049H13Rik, 3110023B02Rik, 2600005N12Rik, Hgs, Mrpl12, Slc25a10, LOC667716, Gcgr, BC003940, Dysfip1, P4hb, Arhgdia, LOC100042371, Thoc4, Anapc11, Npb, Pcyt2, Sirt7, Mafg, Pycr1, 1110012N22Rik, 5730593N15Rik, Aspscr1, Stra13, Lrrc45, Rac3, Dcxr, Cbr2, Hmga1-rs1, LOC667778, Rfng, Gps1, Dus1l, Fasn, Ccdc57, LOC100043454, Slc16a3, Csnk1d
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-105H18.b	B6Ng01-105H18.g
ACC	DH913496	DH913497
length	1,126	1,100
definition	DH913496\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105H18, 5' end.	DH913497\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105H18, 3' end.
singlet/doublet	doublet	doublet
BLAST hit	unique	unique
Map location.	(119,822,024 - 119,823,151)	(119,694,423 - 119,695,523)
sequence	gaattccttagcataaagttaaaaagaagagacagcatgaacctgccttc cagactcttggaagccaacagcacatggaagggagcagctgactgagcgg gagccgtgggcagggagggggtgggtaacagggctgacttatttttaaag caaagcagtgctgctttaatacagactccaaccgtttgctctaacaactc cactcccaggtatttgcccaagagaaatgaaatgtaagcccacaccagta cttcacactcctgctcaaggcagcagtattcacagcaatcagagcagaag ccactccaatgtccactggcagatgaactggccaggtgtggtgacacttg gctgtaattgcaacactaaagagaaaagttggagctagataaagagaatg ggaagaaactcacaatagacaaagcaagcccagtgaatccttcactttca gtggtgaaacgcacaccaacaagcctactggtgagagaaaaagacctgcg tctttgcctgcaagccatggtacaaaggagacaagtctgagaaccagaat tagcatatgcataaagaaattcagttctaaccaggggtggtgacactggt ctttaatcccagcactagggagacactggcaagtgtatctctgtgtgttc cagaccagcctggtctacagagctagttacaaaatagccaggactagaca gagaaaccctgacttcttgttagtttaggggagctactggttcccaaacc ccactgcctgggtttctcagaacatctttctgcttccttctgagcacatc tacccggggaccacatcctggaatggtccccaaaagggaggcatctatgg ctaggccagatgcagaagtctgtcctcagtgctcatggctagtgaaacca ggcccgagagctgcagataaacaaaagggctgcacgccacagcctacctc atagcccaacatccctgtgagggacaggagacctcaaccacatagcacca catcttggctcagaaaaccaggaaaagctaggtctctaaagcccagcttg cacatcagctcagagagcccatgtaaaacataggcggcataagaataaag accactttggaaggtcttacgttcca	gaattcccagagaatggatttgtggttatggaagaaaatgtcctttttgt taacaatatttcggggcagggtgcacatgtatacagaggccagaagccaa tgttagatcaaggtaagagtaggttagtattctgtgctattatataatat gtggtctttatccctttgccccactaagggcttgttcactcccccatctt gtgggttctttctagtttcctgacactccaaattaaacacacaaccccag aaacttgaagctaagatccaagtgtgagaaaggacatgcttgcttggttt taataagtttcccaagttgttgttatcatctgtctctctgctaattaaca agaataagggagggaggcagttaattaaggactggtgtaagctgggttcc agctaattgagggtttttttcatagacagaattaatgtgcaattcaggca gaccttccaaattacagttaataaagttttatttatagcaccactgggga acatcaagggcacaatgtcaaggaatgtgggaaaacactctgaattggta ttgatgggataatccaaagtcaggcatacaaacaggcataccacaggaag agcttccatggacaaagacaacagggaaggaggtgggatttttttcttcg gcccctacaacctgtgtatcctttgcagcttcccagtgtctggttcctcc gcaaacagattcttctctgaataaatttgatcaggtactcagcctaacct ctcttgctccgcattttgcctcttcacgtacacaaagctcagttggaaga gagttcaatgtcggcctcttctctatgggtcagcattgttgagcatctcc ctgttctgctgcccaccgtggggctgctctaggagaattgcagactgcct ctatctagaacccgtgcttcctgccctgctaagctttgctttgggggata gctctagggttacggaatctgagtggacagtggagcccgacccagtttcc tgttgtttgaagccacctcatggaaccagtgagaacttgtgtttcgtgct ggtttggttgctttaccttaaccagtgcacattctggtgtcaccatcagg
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\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACCAGTAGGCTTGTTGGTGTGCGTTTCACCACTGAAAGTGAAGGATTCA 693 seq1 CTGGGCTTGCTTTGTCTATTGTGAGTTTCTTCCCATTCTCTTTATCTAGC 745 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTGGGCTTGCTTTGTCTATTGTGAGTTTCTTCCCATTCTCTTTATCTAGC 743 seq1 TCCAACTTTTCTCTTTAGTGTTGCAATTACAGCCAAGTGTCACCACACCT 795 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCAACTTTTCTCTTTAGTGTTGCAATTACAGCCAAGTGTCACCACACCT 793 seq1 GGCCAGTTCATCTGCCAGTGGACATTGGAGTGGCTTCTGCTCTGATTGCT 845 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCCAGTTCATCTGCCAGTGGACATTGGAGTGGCTTCTGCTCTGATTGCT 843 seq1 GTGAATACTGCTGCCTTGAGCAGGAGTGTGAAGTACTGGTGTGGGCTTAC 895 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGAATACTGCTGCCTTGAGCAGGAGTGTGAAGTACTGGTGTGGGCTTAC 893 seq1 ATTTCATTTCTCTTGGGCAAATACCTGGGAGTGGAGTTGTTAGAGCAAAC 945 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTTCATTTCTCTTGGGCAAATACCTGGGAGTGGAGTTGTTAGAGCAAAC 943 seq1 GGTTGGAGTCTGTATTAAAGCAGCACTGCTTTGCTTTAAAAATAAGTCAG 995 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTTGGAGTCTGTATTAAAGCAGCACTGCTTTGCTTTAAAAATAAGTCAG 993 seq1 CCCTGTTACCCACCCCCTCCCTGCCCACGGCTCCCGCTCAGTCAGCTGCT 1045 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTGTTACCCACCCCCTCCCTGCCCACGGCTCCCGCTCAGTCAGCTGCT 1043 seq1 CCCTTCCATGTGCTGTTGGCTTCCAAGAGTCTGGAAGGCAGGTTCATGCT 1095 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTTCCATGTGCTGTTGGCTTCCAAGAGTCTGGAAGGCAGGTTCATGCT 1093 seq1 GTCTCTTCTTTTTAACTTTATGCTAAGGAATTC 1128 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTCTCTTCTTTTTAACTTTATGCTAAGGAATTC 1126	seq1: chr11_119694423_119695523 seq2: B6Ng01-105H18.g_71_1170 seq1 GAATTCCCAGAGAATGGATTTGTGGTTATGGAAGAAAATGTCCTTTTTGT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCCCAGAGAATGGATTTGTGGTTATGGAAGAAAATGTCCTTTTTGT 50 seq1 TAACAATATTTCGGGGCAGGGTGCACATGTATACAGAGGCCAGAAGCCAA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAACAATATTTCGGGGCAGGGTGCACATGTATACAGAGGCCAGAAGCCAA 100 seq1 TGTTAGATCAAGGTAAGAGTAGGTTAGTATTCTGTGCTATTATATAATAT 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTTAGATCAAGGTAAGAGTAGGTTAGTATTCTGTGCTATTATATAATAT 150 seq1 GTGGTCTTTATCCCTTTGCCCCACTAAGGGCTTGTTCACTCCCCCATCTT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGGTCTTTATCCCTTTGCCCCACTAAGGGCTTGTTCACTCCCCCATCTT 200 seq1 GTGGGTTCTTTCTAGTTTCCTGACACTCCAAATTAAACACACAACCCCAG 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGGGTTCTTTCTAGTTTCCTGACACTCCAAATTAAACACACAACCCCAG 250 seq1 AAACTTGAAGCTAAGATCCAAGTGTGAGAAAGGACATGCTTGCTTGGTTT 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAACTTGAAGCTAAGATCCAAGTGTGAGAAAGGACATGCTTGCTTGGTTT 300 seq1 TAATAAGTTTCCCAAGTTGTTGTTATCATCTGTCTCTCTGCTAATTAACA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAATAAGTTTCCCAAGTTGTTGTTATCATCTGTCTCTCTGCTAATTAACA 350 seq1 AGAATAAGGGAGGGAGGCAGTTAATTAAGGACTGGTGTAAGCTGGGTTCC 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAATAAGGGAGGGAGGCAGTTAATTAAGGACTGGTGTAAGCTGGGTTCC 400 seq1 AGCTAATTGAGGGTTTTTTTCATAGACAGAATTAATGTGCAATTCAGGCA 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCTAATTGAGGGTTTTTTTCATAGACAGAATTAATGTGCAATTCAGGCA 450 seq1 GACCTTCCAAATTACAGTTAATAAAGTTTTATTTATAGCACCACTGGGGA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GACCTTCCAAATTACAGTTAATAAAGTTTTATTTATAGCACCACTGGGGA 500 seq1 ACATCAAGGGCACAATGTCAAGGAATGTGGGAAAACACTCTGAATTGGTA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACATCAAGGGCACAATGTCAAGGAATGTGGGAAAACACTCTGAATTGGTA 550 seq1 TTGATGGGATAATCCAAAGTCAGGCATACAAACAGGCATACCACAGGAAG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGATGGGATAATCCAAAGTCAGGCATACAAACAGGCATACCACAGGAAG 600 seq1 AGCTTCCATGGACAAAGACAACAGGGAAGGAGGTGGGATTTTTTTCTTCG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCTTCCATGGACAAAGACAACAGGGAAGGAGGTGGGATTTTTTTCTTCG 650 seq1 GCCCCTACAACCTGTGTATCCTTTGCAGCTTCCCAGTGTCTGGTTCCTCC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCCCTACAACCTGTGTATCCTTTGCAGCTTCCCAGTGTCTGGTTCCTCC 700 seq1 GCAAACAGATTCTTCTCTGAATAAATTTGATCAGGTACTCAGCCTAACCT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCAAACAGATTCTTCTCTGAATAAATTTGATCAGGTACTCAGCCTAACCT 750 seq1 CTCTTGCTCCGCATTTTGCCTCTTCACGTACACAAAGCTCAGTTGGAAGA 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCTTGCTCCGCATTTTGCCTCTTCACGTACACAAAGCTCAGTTGGAAGA 800 seq1 GAGTTCAATGTCGGCCTCTTCTCTATGGGTCAGGCATTGTTGAGCATCCT 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| seq2 GAGTTCAATGTCGGCCTCTTCTCTATGGGTCA-GCATTGTTGAGCAT-CT 848 seq1 CCCTGTTCTGCTGGCCCACCGTGGGGCTGCTCTAGGAGGAATGCAGACTG 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTGTTCTGCT-GCCCACCGTGGGGCTGCTCTAGGAGAATTGCAGACTG 897 seq1 CCTCTATCTAGATACCCGTGCTTCCTG-CCTGCTAAGCTTTGCTTTGGGG 949 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTCTATCTAGA-ACCCGTGCTTCCTGCCCTGCTAAGCTTTGCTTTGGGG 946 seq1 GATAGCTCTAGGTTTACAGAAATCTGAGGTGACAGTGGAGCCCGCCCCAG 999 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| seq2 GATAGCTCTAGGGTTAC-GGAATCTGAGTGGACAGTGGAGCCCGACCCAG 995 seq1 TTTCCTG-TGTCTG-AGGCACCTCAGTGGACACAGTGAG-ACCTGTGTTC 1046 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\| seq2 TTTCCTGTTGTTTGAAGCCACCTCA-TGGAACCAGTGAGAACTTGTGTTT 1044 seq1 CTGTGCCGGTT--GGTGCCTTACCTTAACCAGCTGCACCATTCTGGTG-C 1093 \| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| seq2 C-GTGCTGGTTTGGTTGCTTTACCTTAACCAG-TGCA-CATTCTGGTGTC 1091 seq1 ACCA-CAGG 1101 \|\|\|\| \|\|\|\| seq2 ACCATCAGG 1100

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr11_119822024_119823151
seq2: B6Ng01-105H18.b_49_1174 (reverse)

seq1  TGGAACGT-AGA-CTTCCCAAGTGGTCTTTATTCTTATGCCGCCTATGTT  48
      |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACGTAAGACCTTCCAAAGTGGTCTTTATTCTTATGCCGCCTATGTT  50

seq1  TTACATGGGCTCCTCTGAGCTGATGTTGCAAGCTGGGCTTTAGAGGAACC  98
      ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||
seq2  TTACATGGGCT-CTCTGAGCTGATG-TGCAAGCTGGGCTTTAGAG--ACC  96

seq1  TAGCTTTTCTTGGTTTTCCTGAGCCAAGATGTGGGTGCTATGTGGTTGAG  148
      ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTTCCTGGTTTT-CTGAGCCAAGATGT-GGTGCTATGTGGTTGAG  144

seq1  GTCTCCTGTCCCTCACAGGGATGTTGGGCTATGAGGTAGGCTGTGGCGTG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTGTCCCTCACAGGGATGTTGGGCTATGAGGTAGGCTGTGGCGTG  194

seq1  CAGCCC-TTTGTTTATCTGCAGCTCTCGGG-CTGGTTTCACTAGCCATGA  246
      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCTTTTGTTTATCTGCAGCTCTCGGGCCTGGTTTCACTAGCCATGA  244

seq1  GCACTGAGGACAGACTTCTGCATCTGGCCTTAGCCATAGATGCCTCCC-T  295
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  GCACTGAGGACAGACTTCTGCATCTGGCC-TAGCCATAGATGCCTCCCTT  293

seq1  TTGGGGACCATTCCAGGATGTGGTCCCCGGGTAGATGTGCTCAGAAGGAA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGACCATTCCAGGATGTGGTCCCCGGGTAGATGTGCTCAGAAGGAA  343

seq1  GCAGAAAGATGTTCTGAGAAACCCAGGCAGTGGGGTTTGGGAACCAGTAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAAGATGTTCTGAGAAACCCAGGCAGTGGGGTTTGGGAACCAGTAG  393

seq1  CTCCCCTAAACTAACAAGAAGTCAGGGTTTCTCTGTCTAGTCCTGGCTAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCTAAACTAACAAGAAGTCAGGGTTTCTCTGTCTAGTCCTGGCTAT  443

seq1  TTTGTAACTAGCTCTGTAGACCAGGCTGGTCTGGAACACACAGAGATACA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAACTAGCTCTGTAGACCAGGCTGGTCTGGAACACACAGAGATACA  493

seq1  CTTGCCAGTGTCTCCCTAGTGCTGGGATTAAAGACCAGTGTCACCACCCC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCAGTGTCTCCCTAGTGCTGGGATTAAAGACCAGTGTCACCACCCC  543

seq1  TGGTTAGAACTGAATTTCTTTATGCATATGCTAATTCTGGTTCTCAGACT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAGAACTGAATTTCTTTATGCATATGCTAATTCTGGTTCTCAGACT  593

seq1  TGTCTCCTTTGTACCATGGCTTGCAGGCAAAGACGCAGGTCTTTTTCTCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCTTTGTACCATGGCTTGCAGGCAAAGACGCAGGTCTTTTTCTCT  643

seq1  CACCAGTAGGCTTGTTGGTGTGCGTTTCACCACTGAAAGTGAAGGATTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGTAGGCTTGTTGGTGTGCGTTTCACCACTGAAAGTGAAGGATTCA  693

seq1  CTGGGCTTGCTTTGTCTATTGTGAGTTTCTTCCCATTCTCTTTATCTAGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTTGCTTTGTCTATTGTGAGTTTCTTCCCATTCTCTTTATCTAGC  743

seq1  TCCAACTTTTCTCTTTAGTGTTGCAATTACAGCCAAGTGTCACCACACCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACTTTTCTCTTTAGTGTTGCAATTACAGCCAAGTGTCACCACACCT  793

seq1  GGCCAGTTCATCTGCCAGTGGACATTGGAGTGGCTTCTGCTCTGATTGCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGTTCATCTGCCAGTGGACATTGGAGTGGCTTCTGCTCTGATTGCT  843

seq1  GTGAATACTGCTGCCTTGAGCAGGAGTGTGAAGTACTGGTGTGGGCTTAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATACTGCTGCCTTGAGCAGGAGTGTGAAGTACTGGTGTGGGCTTAC  893

seq1  ATTTCATTTCTCTTGGGCAAATACCTGGGAGTGGAGTTGTTAGAGCAAAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATTTCTCTTGGGCAAATACCTGGGAGTGGAGTTGTTAGAGCAAAC  943

seq1  GGTTGGAGTCTGTATTAAAGCAGCACTGCTTTGCTTTAAAAATAAGTCAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGAGTCTGTATTAAAGCAGCACTGCTTTGCTTTAAAAATAAGTCAG  993

seq1  CCCTGTTACCCACCCCCTCCCTGCCCACGGCTCCCGCTCAGTCAGCTGCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTTACCCACCCCCTCCCTGCCCACGGCTCCCGCTCAGTCAGCTGCT  1043

seq1  CCCTTCCATGTGCTGTTGGCTTCCAAGAGTCTGGAAGGCAGGTTCATGCT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCATGTGCTGTTGGCTTCCAAGAGTCTGGAAGGCAGGTTCATGCT  1093

seq1  GTCTCTTCTTTTTAACTTTATGCTAAGGAATTC  1128
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTCTTTTTAACTTTATGCTAAGGAATTC  1126

seq1: chr11_119694423_119695523
seq2: B6Ng01-105H18.g_71_1170

seq1  GAATTCCCAGAGAATGGATTTGTGGTTATGGAAGAAAATGTCCTTTTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGAGAATGGATTTGTGGTTATGGAAGAAAATGTCCTTTTTGT  50

seq1  TAACAATATTTCGGGGCAGGGTGCACATGTATACAGAGGCCAGAAGCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAATATTTCGGGGCAGGGTGCACATGTATACAGAGGCCAGAAGCCAA  100

seq1  TGTTAGATCAAGGTAAGAGTAGGTTAGTATTCTGTGCTATTATATAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGATCAAGGTAAGAGTAGGTTAGTATTCTGTGCTATTATATAATAT  150

seq1  GTGGTCTTTATCCCTTTGCCCCACTAAGGGCTTGTTCACTCCCCCATCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCTTTATCCCTTTGCCCCACTAAGGGCTTGTTCACTCCCCCATCTT  200

seq1  GTGGGTTCTTTCTAGTTTCCTGACACTCCAAATTAAACACACAACCCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTCTTTCTAGTTTCCTGACACTCCAAATTAAACACACAACCCCAG  250

seq1  AAACTTGAAGCTAAGATCCAAGTGTGAGAAAGGACATGCTTGCTTGGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTGAAGCTAAGATCCAAGTGTGAGAAAGGACATGCTTGCTTGGTTT  300

seq1  TAATAAGTTTCCCAAGTTGTTGTTATCATCTGTCTCTCTGCTAATTAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAGTTTCCCAAGTTGTTGTTATCATCTGTCTCTCTGCTAATTAACA  350

seq1  AGAATAAGGGAGGGAGGCAGTTAATTAAGGACTGGTGTAAGCTGGGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAGGGAGGGAGGCAGTTAATTAAGGACTGGTGTAAGCTGGGTTCC  400

seq1  AGCTAATTGAGGGTTTTTTTCATAGACAGAATTAATGTGCAATTCAGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAATTGAGGGTTTTTTTCATAGACAGAATTAATGTGCAATTCAGGCA  450

seq1  GACCTTCCAAATTACAGTTAATAAAGTTTTATTTATAGCACCACTGGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTCCAAATTACAGTTAATAAAGTTTTATTTATAGCACCACTGGGGA  500

seq1  ACATCAAGGGCACAATGTCAAGGAATGTGGGAAAACACTCTGAATTGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAAGGGCACAATGTCAAGGAATGTGGGAAAACACTCTGAATTGGTA  550

seq1  TTGATGGGATAATCCAAAGTCAGGCATACAAACAGGCATACCACAGGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGGATAATCCAAAGTCAGGCATACAAACAGGCATACCACAGGAAG  600

seq1  AGCTTCCATGGACAAAGACAACAGGGAAGGAGGTGGGATTTTTTTCTTCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCATGGACAAAGACAACAGGGAAGGAGGTGGGATTTTTTTCTTCG  650

seq1  GCCCCTACAACCTGTGTATCCTTTGCAGCTTCCCAGTGTCTGGTTCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTACAACCTGTGTATCCTTTGCAGCTTCCCAGTGTCTGGTTCCTCC  700

seq1  GCAAACAGATTCTTCTCTGAATAAATTTGATCAGGTACTCAGCCTAACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACAGATTCTTCTCTGAATAAATTTGATCAGGTACTCAGCCTAACCT  750

seq1  CTCTTGCTCCGCATTTTGCCTCTTCACGTACACAAAGCTCAGTTGGAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGCTCCGCATTTTGCCTCTTCACGTACACAAAGCTCAGTTGGAAGA  800

seq1  GAGTTCAATGTCGGCCTCTTCTCTATGGGTCAGGCATTGTTGAGCATCCT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  GAGTTCAATGTCGGCCTCTTCTCTATGGGTCA-GCATTGTTGAGCAT-CT  848

seq1  CCCTGTTCTGCTGGCCCACCGTGGGGCTGCTCTAGGAGGAATGCAGACTG  900
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
seq2  CCCTGTTCTGCT-GCCCACCGTGGGGCTGCTCTAGGAGAATTGCAGACTG  897

seq1  CCTCTATCTAGATACCCGTGCTTCCTG-CCTGCTAAGCTTTGCTTTGGGG  949
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTATCTAGA-ACCCGTGCTTCCTGCCCTGCTAAGCTTTGCTTTGGGG  946

seq1  GATAGCTCTAGGTTTACAGAAATCTGAGGTGACAGTGGAGCCCGCCCCAG  999
      |||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||
seq2  GATAGCTCTAGGGTTAC-GGAATCTGAGTGGACAGTGGAGCCCGACCCAG  995

seq1  TTTCCTG-TGTCTG-AGGCACCTCAGTGGACACAGTGAG-ACCTGTGTTC  1046
      ||||||| ||| || || ||||||| ||||  ||||||| || |||||| 
seq2  TTTCCTGTTGTTTGAAGCCACCTCA-TGGAACCAGTGAGAACTTGTGTTT  1044

seq1  CTGTGCCGGTT--GGTGCCTTACCTTAACCAGCTGCACCATTCTGGTG-C  1093
      | |||| ||||  | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |
seq2  C-GTGCTGGTTTGGTTGCTTTACCTTAACCAG-TGCA-CATTCTGGTGTC  1091

seq1  ACCA-CAGG  1101
      |||| ||||
seq2  ACCATCAGG  1100

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