BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114K14
Chromosome11 (Build37)
Map Location 81,499,773 - 81,608,343
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAccn1
Upstream geneMyo1d, Tmem98, Spaca3, 1700071K01Rik
Downstream gene5530401A14Rik, Ccl2, Ccl7, Ccl11, Ccl12, Ccl8, Ccl1, Tmem132e, Cct6b, Ccdc16, Lig3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114K14.bB6Ng01-114K14.g
ACCDH920129DH920130
length1,1871,147
definitionDH920129|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114K14, 5' end.DH920130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(81,607,140 - 81,608,343)(81,499,773 - 81,500,936)
sequence
gaattcaatataagaagtttagataatttcgtcagctaggtacctggcag
acattgtatcgaattatagtattacagaggcagctgccgtggaaagcatc
actattccttgggctaagaaaggatagagaattgtgggcatgaagaagat
gcagaagcctgaagggtgatggtgtccagctggagtcagtgtctctgagc
ctcagcagcaaccccatagggcctcagaggccagtgagaagagatagccg
tgggcactctgtatcttaggagatttacacagctggatctgcagttgttg
agaagaccacacaccaacttcagctgcagttttagaaaaggaactgcctt
ttcagacacacaggagcagaatcaagagcacgccattggaaggaagctag
aagtcccttttcctccagcatcatgaaagtctggtgtctcttattggcag
aacattacagagaccagctagccaacccagggtttctaggtctagcacga
caaagccacacagagaagggcaggcttgacactcaatgatgataagctgt
aacaagcagtcatggggcatcccctctactttgaggcctgggaaaggact
ggctggagggtatttttggaaagatcttggtgttagaggcagtggatcac
atctatggctgattatgacataactattcaagccaccaacacttgtgtct
ccagcttccaatttgtccagtgaggacagtatgtctggacctcattctct
gttaatatagtgcatgagacaacattacgctgtgtcccttgcatcagaga
tccaagggagtaagctggaaatcagcagtggctccctccactacaaaaag
ccttgctgtatttcatgctgtgagcatcttcataaaccaccgatcccctt
ggtgcccttggctgctccttttagccacagaacacactaggctgtgtcag
agagcttccccgacacatgacacatatgaaagaaagcaagccagtctctg
ttgcataagtgcctcaaatagcctcagacaaaacactctcagctctggca
gaggggaaggggggaagtcataggaggaggctgctctgtctaggactaca
cccagggctagcagcctcttcccaacttaattgaagccactttacagctc
tgcctggcatggaggtgggagttaagacaagccttgt
gaattctcatgtgatttttggaggtgaattaacacaaatagcatgagaac
caatcacttatcagtccatgctgggactcagaatccttctccacttatgg
tcaagaggaggcccataactatcagaatgccacagagacacctcccttga
taaccagtactggggggtacatgtaggtccttgcttgtgttagccagatt
gtctgccatgcagcaaagcccctagcccacaaacacagtttcaagcatct
gaggtggctttcaagccctagtctcataaatttcaaaattgataattttt
acttttctggttttaaaaattaattagtattttaattacatgttatatga
tatatttttgatcatattcttttcccccaagtcctccttactatcaacca
gctctacattctcccctcacaaaataaaaatccttcaagacaataaaaag
aatcaaaatcaaaacaaataattgaaaaattaagacaaaataaacaaaaa
atttttaaatgtagtcagtgttgtgttatccaactgctcctgggcatggg
gccttccctgaagtatggttggtttactcaaggtacacgcctttggagaa
cacatattttttttttctttaccaagaagttattatttacaaatatcttc
ctggttaggagtgggactttgtgtccacatcaccgtctctatgctgggat
tgtgtctggattgaacctgtgcaggtctgtgtgctgtcacagtgtctgtg
gattcatatgtgcatccatcctgttgagtctggatggcactgttttcttg
aagtcatcacaacccctagctcttacaatctgtctgcatcctcttccatg
tagatccctgagccttgacgggaggagtttgataaaggcatctcttctag
gcctgggtgctccaaatcctctcctgtgcatgttgtccagatatgggtct
ctgtgttaattcccactatggcaagaagtttctctgatgagggttgagcc
gtagtctggtcttatgggtgtacacatgacattggggattatttgtatta
tgtctgttgttgacttcattgtactattaaactcaccaatcctccccaaa
tgatttcatcaatgcccttttatgatttcacagtttctagtactgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_81607140_81608343
seq2: B6Ng01-114K14.b_45_1231 (reverse)

seq1  ACAAGGCTGTGTC-TAACACCCA-CACCATGCCA-GCAGAGCTGTAAATG  47
      |||||||| |||| |||| |||| | |||||||| |||||||||||||  
seq2  ACAAGGCT-TGTCTTAACTCCCACCTCCATGCCAGGCAGAGCTGTAAAGT  49

seq1  TGCCTCAAAATTAGGTATGGGAAAGAGCTTTGCTAGCCCTGGTTGATGGT  97
       || ||  ||||| || ||||||   ||  |||||||||||| || | ||
seq2  GGCTTC--AATTAAGT-TGGGAAGAGGC--TGCTAGCCCTGGGTG-TAGT  93

seq1  CCCTAAGGACAAGAGCAGCCTCCTTCCTATGACTTCCCCACCTCCCCCTC  147
       ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||
seq2  -CCTA--GAC-AGAGCAGCCTCC-TCCTATGACTTCCCC-CCTTCCCCTC  137

seq1  TGCCAGGAAGCTGAGAGTGTTTTGTCTGAGGCTATTTGAGGCACCTTATG  197
      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGCCAG--AGCTGAGAGTGTTTTGTCTGAGGCTATTTGAGGCA-CTTATG  184

seq1  CAACAGAGACTGGCTTGCTTTCTTTCATATTGTGTTCATGTTGTCGGGGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||
seq2  CAACAGAGACTGGCTTGCTTTCTTTCATA-TGTG-TCATG-TGTCGGGGA  231

seq1  AGCTTCTCTGACACAGCCTAGTGTGTTCTGTGGCTTAAAAGGAGCAGCCA  297
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGC-TCTCTGACACAGCCTAGTGTGTTCTGTGGC-TAAAAGGAGCAGCCA  279

seq1  AGGGCACCAAGGGGATCGGTGGTTTATGAAGATGCTCACAGCATGAAATA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACCAAGGGGATCGGTGGTTTATGAAGATGCTCACAGCATGAAATA  329

seq1  CAGCAAGGCTTTTTGTAGTGGAGGGAGCCACTGCTGATTTCCAGCTTACT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGGCTTTTTGTAGTGGAGGGAGCCACTGCTGATTTCCAGCTTACT  379

seq1  CCCTTGGATCTCTGATGCAAGGGACACAGCGTAATGTTGTCTCATGCACT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGGATCTCTGATGCAAGGGACACAGCGTAATGTTGTCTCATGCACT  429

seq1  ATATTAACAGAGAATGAGGTCCAGACATACTGTCCTCACTGGACAAATTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAACAGAGAATGAGGTCCAGACATACTGTCCTCACTGGACAAATTG  479

seq1  GAAGCTGGAGACACAAGTGTTGGTGGCTTGAATAGTTATGTCATAATCAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGGAGACACAAGTGTTGGTGGCTTGAATAGTTATGTCATAATCAG  529

seq1  CCATAGATGTGATCCACTGCCTCTAACACCAAGATCTTTCCAAAAATACC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGATGTGATCCACTGCCTCTAACACCAAGATCTTTCCAAAAATACC  579

seq1  CTCCAGCCAGTCCTTTCCCAGGCCTCAAAGTAGAGGGGATGCCCCATGAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGCCAGTCCTTTCCCAGGCCTCAAAGTAGAGGGGATGCCCCATGAC  629

seq1  TGCTTGTTACAGCTTATCATCATTGAGTGTCAAGCCTGCCCTTCTCTGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTTACAGCTTATCATCATTGAGTGTCAAGCCTGCCCTTCTCTGTG  679

seq1  TGGCTTTGTCGTGCTAGACCTAGAAACCCTGGGTTGGCTAGCTGGTCTCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTGTCGTGCTAGACCTAGAAACCCTGGGTTGGCTAGCTGGTCTCT  729

seq1  GTAATGTTCTGCCAATAAGAGACACCAGACTTTCATGATGCTGGAGGAAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGTTCTGCCAATAAGAGACACCAGACTTTCATGATGCTGGAGGAAA  779

seq1  AGGGACTTCTAGCTTCCTTCCAATGGCGTGCTCTTGATTCTGCTCCTGTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACTTCTAGCTTCCTTCCAATGGCGTGCTCTTGATTCTGCTCCTGTG  829

seq1  TGTCTGAAAAGGCAGTTCCTTTTCTAAAACTGCAGCTGAAGTTGGTGTGT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGAAAAGGCAGTTCCTTTTCTAAAACTGCAGCTGAAGTTGGTGTGT  879

seq1  GGTCTTCTCAACAACTGCAGATCCAGCTGTGTAAATCTCCTAAGATACAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTCTCAACAACTGCAGATCCAGCTGTGTAAATCTCCTAAGATACAG  929

seq1  AGTGCCCACGGCTATCTCTTCTCACTGGCCTCTGAGGCCCTATGGGGTTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCACGGCTATCTCTTCTCACTGGCCTCTGAGGCCCTATGGGGTTG  979

seq1  CTGCTGAGGCTCAGAGACACTGACTCCAGCTGGACACCATCACCCTTCAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGGCTCAGAGACACTGACTCCAGCTGGACACCATCACCCTTCAG  1029

seq1  GCTTCTGCATCTTCTTCATGCCCACAATTCTCTATCCTTTCTTAGCCCAA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGCATCTTCTTCATGCCCACAATTCTCTATCCTTTCTTAGCCCAA  1079

seq1  GGAATAGTGATGCTTTCCACGGCAGCTGCCTCTGTAATACTATAATTCGA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAGTGATGCTTTCCACGGCAGCTGCCTCTGTAATACTATAATTCGA  1129

seq1  TACAATGTCTGCCAGGTACCTAGCTGAC-AAATTATCTAAACTTCTTATA  1196
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGTCTGCCAGGTACCTAGCTGACGAAATTATCTAAACTTCTTATA  1179

seq1  TTGAATTC  1204
      ||||||||
seq2  TTGAATTC  1187

seq1: chr11_81499773_81500936
seq2: B6Ng01-114K14.g_68_1214

seq1  GAATTCTCATGTGATTTTTGGAGGTGAATTAACACAAATAGCATGAGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATGTGATTTTTGGAGGTGAATTAACACAAATAGCATGAGAAC  50

seq1  CAATCACTTATCAGTCCATGCTGGGACTCAGAATCCTTCTCCACTTATGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCACTTATCAGTCCATGCTGGGACTCAGAATCCTTCTCCACTTATGG  100

seq1  TCAAGAGGAGGCCCATAACTATCAGAATGCCACAGAGACACCTCCCTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAGGAGGCCCATAACTATCAGAATGCCACAGAGACACCTCCCTTGA  150

seq1  TAACCAGTACTGGGGGGTACATGTAGGTCCTTGCTTGTGTTAGCCAGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCAGTACTGGGGGGTACATGTAGGTCCTTGCTTGTGTTAGCCAGATT  200

seq1  GTCTGCCATGCAGCAAAGCCCCTAGCCCACAAACACAGTTTCAAGCATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCCATGCAGCAAAGCCCCTAGCCCACAAACACAGTTTCAAGCATCT  250

seq1  GAGGTGGCTTTCAAGCCCTAGTCTCATAAATTTCAAAATTGATAATTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGGCTTTCAAGCCCTAGTCTCATAAATTTCAAAATTGATAATTTTT  300

seq1  ACTTTTCTGGTTTTAAAAATTAATTAGTATTTTAATTACATGTTATATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTCTGGTTTTAAAAATTAATTAGTATTTTAATTACATGTTATATGA  350

seq1  TATATTTTTGATCATATTCTTTTCCCCCAAGTCCTCCTTACTATCAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTTTGATCATATTCTTTTCCCCCAAGTCCTCCTTACTATCAACCA  400

seq1  GCTCTACATTCTCCCCTCACAAAATAAAAATCCTTCAAGACAATAAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTACATTCTCCCCTCACAAAATAAAAATCCTTCAAGACAATAAAAAG  450

seq1  AATCAAAATCAAAACAAATAATTGAAAAATTAAGACAAAATAAACAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAAATCAAAACAAATAATTGAAAAATTAAGACAAAATAAACAAAAA  500

seq1  ATTTTTAAATGTAGTCAGTGTTGTGTTATCCAACTGCTCCTGGGCATGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAAATGTAGTCAGTGTTGTGTTATCCAACTGCTCCTGGGCATGGG  550

seq1  GCCTTCCCTGAAGTATGGTTGGTTTACTCAAGGTACACGCCTTTGGAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCCTGAAGTATGGTTGGTTTACTCAAGGTACACGCCTTTGGAGAA  600

seq1  CACATATTTTTTTTTTCTTTACCAAGAAGTTATTATTTACAAATATCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATTTTTTTTTTCTTTACCAAGAAGTTATTATTTACAAATATCTTC  650

seq1  CTGGTTAGGAGTGGGACTTTGTGTCCACATCACCGTCTCTATGCTGGGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTAGGAGTGGGACTTTGTGTCCACATCACCGTCTCTATGCTGGGAT  700

seq1  TGTGTCTGGATTGAACCTGTGCAGGTCTGTGTGCTGTCACAGTGTCTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTGGATTGAACCTGTGCAGGTCTGTGTGCTGTCACAGTGTCTGTG  750

seq1  GATTCATATGTGCATCCATCCTGTTGAGTCTGGATGGCACTGTTTTCTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCATATGTGCATCCATCCTGTTGAGTCTGGATGGCACTGTTTTCTTG  800

seq1  AAGTCATCACAACCCCTAGCTCTTACAATCTGTCTGCATCCTCTTCCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCATCACAACCCCTAGCTCTTACAATCTGTCTGCATCCTCTTCCATG  850

seq1  TAGATCCCTGAGCCTTGACGGGAGGAGTTTGATAAAGGCATCTCTTCTAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCCCTGAGCCTTGACGGGAGGAGTTTGATAAAGGCATCTCTTCTAG  900

seq1  GCCTGGGTGCTCCAAATCCTCTCCTGTGCATGTTGTCCAGATATGGGTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGGTGCTCCAAATCCTCTCCTGTGCATGTTGTCCAGATATGGGTCT  950

seq1  CTGTGTTAATTCCCAACTATGGCAAGAAGTTTCTCTGATGAGGGTTGAGC  1000
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTAATTCCC-ACTATGGCAAGAAGTTTCTCTGATGAGGGTTGAGC  999

seq1  CGTAGTCTGGTC-TATGGGTGTACAACATGACATTGGGAATTATTTTGTT  1049
      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |
seq2  CGTAGTCTGGTCTTATGGGTGTAC-ACATGACATTGGGGATTATTT--GT  1046

seq1  ATTATGTTCTGTTGGTTTGACTTCCATTGTACTATTAAAACTCACCAATC  1099
      |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATTATG-TCTGTTG--TTGACTT-CATTGTACTATT-AAACTCACCAATC  1091

seq1  CTCCCCCAAATGATATTTCCATCATTGCCCTTTTATTGAATGTTCACAGT  1149
      || ||||||||||   || ||||| |||||||||| |||   ||||||| 
seq2  CT-CCCCAAATGA---TTTCATCAATGCCCTTTTA-TGA--TTTCACAG-  1133

seq1  TTTCTAGTTACTGTG  1164
      ||||||| |||||||
seq2  TTTCTAG-TACTGTG  1147