seq1: chr11_3936010_3937095
seq2: B6Ng01-138M06.b_48_1136 (reverse)
seq1 CCTCCGCCTCCGCCTCCGCC-TCTGCCTCCC--AAGTTTTGGGATTACAC 47
||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || || ||||
seq2 CCTCCGCCT-----TCCGCCTTCTGCCTCCCCAAAGTTTGGGAATAACAC 45
seq1 GTGAGCTATTA-CAGAGGTGCTAGGATATGAACTAGTCTTTGTGCTTGTG 96
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2 GTGAGCTATTACCAGAGGTGCTAGGATATGAACTAGTC-TTGTGCTTGTG 94
seq1 TGGCAACACGTCACTGAGCCA-TCT-CCCTAGTTCTGACCTTTCCT-CAA 143
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||
seq2 TGGCAACACGTCACTGAGCCATTCTCCCCTAGTTCTGACCTTTCCTCCAA 144
seq1 TCTGTCAGT-CAGAA-CCTGAGAACCTGAAGCCTGG-CCCCAGTGACTTG 190
||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||
seq2 TCTGTCAGTCCAGAACCCTGAGAACCTAAAGCCTGGCCCCCAGTGAC-TG 193
seq1 TGGTTTCTTATGCAAACACTAGAGCCCAACTCCAAAGGAACTATGTGTCC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTTTCTTATGCAAACACTAGAGCCCAACTCCAAAGGAACTATGTGTCC 243
seq1 CTCTCCTAATGGTCAGTCTCAAGAAAACCAACTGGTTCTGTAAAATCTGC 290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCCTAATGGTCAGTCTCAAGAAAACCAACTGGTTCTGTAAAATCTGC 293
seq1 TACTTTGTAAGTAGCCTGCTGTTCTGTCCAGATATGGAGGCCAGGTGGAC 340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACTTTGTAAGTAGCCTGCTGTTCTGTCCAGATATGGAGGCCAGGTGGAC 343
seq1 AACTAAGTAACTCCCCTTATCTCTAATGAAAACCTAACTCCCGTTGTTTC 390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACTAAGTAACTCCCCTTATCTCTAATGAAAACCTAACTCCCGTTGTTTC 393
seq1 CTCTCAGGGGACAACTGCTCCTCTCTCAGAGCTGTTCACCTTCTGTTTCT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCAGGGGACAACTGCTCCTCTCTCAGAGCTGTTCACCTTCTGTTTCT 443
seq1 ACTAACCATGTGTTTTCTTTAATGAGTCTGTTCTTTGTCTGTCCGAGTCT 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTAACCATGTGTTTTCTTTAATGAGTCTGTTCTTTGTCTGTCCGAGTCT 493
seq1 TCTAATACTTTTACCGCAGTGTCTTTGGCTTCAGCAGACCCCAGGGCCTC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTAATACTTTTACCGCAGTGTCTTTGGCTTCAGCAGACCCCAGGGCCTC 543
seq1 CCCAGCTTGGCCTTGAACACTATCTTTAGAACTTGGTTTCAACTTCAGTC 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCAGCTTGGCCTTGAACACTATCTTTAGAACTTGGTTTCAACTTCAGTC 593
seq1 CCCTGGGGGTATTGAACAAACACAAAGAATGAGCTGAAGTTAATGGTAGA 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCTGGGGGTATTGAACAAACACAAAGAATGAGCTGAAGTTAATGGTAGA 643
seq1 GAAGGGGCTTCTCGTAGAAGTCACAGAAGTCTGGAGAAGTAATACCAGAA 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGGGGCTTCTCGTAGAAGTCACAGAAGTCTGGAGAAGTAATACCAGAA 693
seq1 ATGGCACAGGGCTTGGTGGATGGGGAAATGATTTTAGCTCACAGGATAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGGCACAGGGCTTGGTGGATGGGGAAATGATTTTAGCTCACAGGATAGA 743
seq1 GTTTGTATTTTGGGTAAGTCATTCCAGAATGTGGGCACAAGGTGCCTGGT 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTGTATTTTGGGTAAGTCATTCCAGAATGTGGGCACAAGGTGCCTGGT 793
seq1 TTAAATAGTTGTCAGCAAGACAGGCTTGTGAGTCCCCACTCCACACGTGC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 TTAAATAGTTGTCAGCAAGACAGGCTTGTGAGTCCCCACTCCACATGTGC 843
seq1 TGGCACAGTCCTGGCGAAAAGCTGGCCTGTGTTGTGGGCAGGGCCATGGT 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGCACAGTCCTGGCGAAAAGCTGGCCTGTGTTGTGGGCAGGGCCATGGT 893
seq1 CTCTGTCTTCAAGATGCTGAGTTAAAGATGAGGCCATGAGGCCTACACGC 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTGTCTTCAAGATGCTGAGTTAAAGATGAGGCCATGAGGCCTACACGC 943
seq1 AGGAAGCCTGTCCCGGAGGCTGCTCCTCGCTTCAGTTCTCTCTGTGCTTT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAAGCCTGTCCCGGAGGCTGCTCCTCGCTTCAGTTCTCTCTGTGCTTT 993
seq1 TTAAAAACCAGTTTTAGAAACTTTATTTTAAAAACAGTTATAGGTTTTCA 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAAAAACCAGTTTTAGAAACTTTATTTTAAAAACAGTTATAGGTTTTCA 1043
seq1 GAAAGAAAAAAAAATCCCAGGGGATCAACAAAAACTTGTAGAATTC 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAAGAAAAAAAAATCCCAGGGGATCAACAAAAACTTGTAGAATTC 1089
| seq1: chr11_3783315_3783488
seq2: B6Ng01-138M06.g_74_247
seq1 AGGAGTTGTGATTTTTTTAGAGGAGTCCTCCTGCCTTGCTCTTGGGTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAGTTGTGATTTTTTTAGAGGAGTCCTCCTGCCTTGCTCTTGGGTTTC 50
seq1 CATGTTGTGGTTTGTGCTGTGGCTGATTTGGGTAGCTCTTCCGTCTTCAT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATGTTGTGGTTTGTGCTGTGGCTGATTTGGGTAGCTCTTCCGTCTTCAT 100
seq1 CAGGACATCTTAGGGAGCAGCTCGCTCTCAGGGGCTAAATCACCATCACC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGACATCTTAGGGAGCAGCTCGCTCTCAGGGGCTAAATCACCATCACC 150
seq1 ATTGGGGTGCGGGGCGGGGGGGGG 174
||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTGGGGTGCGGGGCGGGGGGGGG 174
|