BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-142E13
Chromosome11 (Build37)
Map Location 91,432,157 - 91,549,893
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKif2b
Upstream geneStxbp4, LOC100039267, Cox11, Tom1l1, LOC638903, EG664976
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-142E13.bB6Ng01-142E13.g
ACCDH940518DH940519
length1,0361,134
definitionDH940518|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142E13, 5' end.DH940519|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142E13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,432,157 - 91,433,197)(91,548,765 - 91,549,893)
sequence
gaattcctggaaaatatacattcatattcatatatatgtgtatgggtgtg
tgtgtgtgctacatccacatgcaaaattatacatataataatagcatgat
acatttgtaccatctattgattgactaaaaattgtaggtgaaattgctgt
caggagtttgcttcgattttcgatgggtttttgactttgaatttcattag
caaattactattatgatacaaaatattaatattaattatacaaactatta
aatgtttacttacacgtcccggtctctgcagttcttgctgcccgcggaga
caggaacgacatggacaccaaatcgggttcacgcagcaactttacttcag
gctttttcttttacagctctcttccccagcagcttcttagggcaagggct
aaaactactcctattacaacagctcctcttcttctacttctactcacggc
aagggctaaaactactctattcactaccactggcttctacctagggcaag
ggctaaacaacaactcctcactactcaaactgactcacctccttctagct
ccacctcacctcatccaatcagaatccacacacgctccaggcatgagctc
aggtcgttcacagataggctgacaggtcctgatcaggaggaacagtccag
cctggcaggaagcccatgaatgcagcctcactgcgcatgctcgggcaagg
cagtaaagtgggtttcaaggggcctgcggccacacccgcttcccacactt
ccatacatacacatatacatacatacatacatacatacatacatacatac
atacatacatgtactgtactttgattgtgttcccctttattttttcaatt
ttatcatttaaaatgtttttaaagttgttttagttttaggctgtgcaatg
gtggtacatgcctttaactcagcactcagaaagcagagcaagtagatgtc
ggttaaatgccagcctggtctttagatcatgcccttggacagtcgggcta
tacagataaaacttgtggggttttttgtttttgttt
gaattcagacacatgccttctcttcctgacctgatagtgaaaaggtacgc
agcccattataatcaaattataataatcaactctgccctgctggaattcc
ctagaatgtaatgaagttacagagtgacaaggaaatcatctttgacacaa
actccttcctctggccaccagcatttgctaccagatgtttggatccccga
gatggagggagagcattctcaggcaaggcagactattacttattctctgg
gtgaggttgactgtgctacttcatatatgtattttgttatttcattttct
tcgtctgttagatattgcagaatattcctcagcttactgagtctctgtga
ctacagtgccaggtaagtttctgatgctcagtgaacactatgttcccttg
cacaagtgagcacggactaggaatagttctgcacctgggttatagtgggg
cagaagaaaatgaagctgggataatgtcccaagatgtcatttctgacata
tcttagccttagaacatttttttttggagttcagtgttttcatatacaaa
catgtacattctttaagtgtcataaatttcttttcaggtgttcagagttt
tgagtgagctaaggtccaggaaaatttcaaattaggaaacgtttaggtgc
taaatctcatccacacctcggcatagtcatgattcttgaataattggaac
attaagatgtgacccacaaagaagagcacacatttatcttaatctttaaa
cacagagatatcttttgctgtgagcaaaatatgatgaacagatgggctaa
gttttgctcacatattgtgtttgaaataatggtgggaaatgttttcaaaa
tgtttaaaatggaagatatactttttatagagacttatatttgcatgcat
aaaaggaacatctttttaacagagcagcagcatttagattggcccatggg
ttacctagtgtatatctactttccatatttgattcagcatacctaaggct
gatttattatttacaatgtttctggctagtggcagctcagttaggcggtc
ctgattgggcatacaggttagctagcatactgttactatatgatggaacc
attcccctacacaggactaaagggaatctctcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_91432157_91433197
seq2: B6Ng01-142E13.b_47_1082

seq1  GAATTCCTGGAAAATATACATTCATATTCATATATATGTGTATGGGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGAAAATATACATTCATATTCATATATATGTGTATGGGTGTG  50

seq1  TGTGTGTGCTACATCCACATGCAAAATTATACATATAATAATAGCATGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGCTACATCCACATGCAAAATTATACATATAATAATAGCATGAT  100

seq1  ACATTTGTACCATCTATTGATTGACTAAAAATTGTAGGTGAAATTGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGTACCATCTATTGATTGACTAAAAATTGTAGGTGAAATTGCTGT  150

seq1  CAGGAGTTTGCTTCGATTTTCGATGGGTTTTTGACTTTGAATTTCATTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGTTTGCTTCGATTTTCGATGGGTTTTTGACTTTGAATTTCATTAG  200

seq1  CAAATTACTATTATGATACAAAATATTAATATTAATTATACAAACTATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTACTATTATGATACAAAATATTAATATTAATTATACAAACTATTA  250

seq1  AATGTTTACTTACACGTCCCGGTCTCTGCAGTTCTTGCTGCCCGCGGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTACTTACACGTCCCGGTCTCTGCAGTTCTTGCTGCCCGCGGAGA  300

seq1  CAGGAACGACATGGACACCAAATCGGGTTCACGCAGCAACTTTACTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACGACATGGACACCAAATCGGGTTCACGCAGCAACTTTACTTCAG  350

seq1  GCTTTTTCTTTTACAGCTCTCTTCCCCAGCAGCTTCTTAGGGCAAGGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTTCTTTTACAGCTCTCTTCCCCAGCAGCTTCTTAGGGCAAGGGCT  400

seq1  AAAACTACTCCTATTACAACAGCTCCTCTTCTTCTACTTCTACTCACGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTACTCCTATTACAACAGCTCCTCTTCTTCTACTTCTACTCACGGC  450

seq1  AAGGGCTAAAACTACTCTATTCACTACCACTGGCTTCTACCTAGGGCAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTAAAACTACTCTATTCACTACCACTGGCTTCTACCTAGGGCAAG  500

seq1  GGCTAAACAACAACTCCTCACTACTCAAACTGACTCACCTCCTTCTAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAAACAACAACTCCTCACTACTCAAACTGACTCACCTCCTTCTAGCT  550

seq1  CCACCTCACCTCATCCAATCAGAATCCACACACGCTCCAGGCATGAGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTCACCTCATCCAATCAGAATCCACACACGCTCCAGGCATGAGCTC  600

seq1  AGGTCGTTCACAGATAGGCTGACAGGTCCTGATCAGGAGGAACAGTCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCGTTCACAGATAGGCTGACAGGTCCTGATCAGGAGGAACAGTCCAG  650

seq1  CCTGGCAGGAAGCCCATGAATGCAGCCTCACTGCGCATGCTCGGGCAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCAGGAAGCCCATGAATGCAGCCTCACTGCGCATGCTCGGGCAAGG  700

seq1  CAGTAAAGTGGGTTTCAAGGGGCCTGCGGCCACACCCGCTTCCCACACTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAAGTGGGTTTCAAGGGGCCTGCGGCCACACCCGCTTCCCACACTT  750

seq1  CCATACATACACATATACATACATACATACATACATACATACATACATAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACATACACATATACATACATACATACATACATACATACATACATAC  800

seq1  ATACATACATGTACTGTACTTTGATTGTGTTCCCCTTTATTTTTTCAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATGTACTGTACTTTGATTGTGTTCCCCTTTATTTTTTCAATT  850

seq1  TTATCATTTAAAAATGTTTTTAAAGTTGTTTTAAGTTTTAGGCTGTGCAA  900
      ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTATCATTT-AAAATGTTTTTAAAGTTGTTTT-AGTTTTAGGCTGTGCAA  898

seq1  TGGTGGTACATGCCTTTAACTCCAGCACTCAGAAAGCAGAGCAAGGTAGA  950
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGGTGGTACATGCCTTTAACT-CAGCACTCAGAAAGCAGAGCAA-GTAGA  946

seq1  TGTCGGTTAAATGCCAGCCTGGTCTATAGATCATGCCCTTGGACAGTCGG  1000
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTCGGTTAAATGCCAGCCTGGTCTTTAGATCATGCCCTTGGACAGTC-G  995

seq1  GGCTATACAGATAAAACTTGTGGGGTTTTTTGTTTTTGTTT  1041
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATACAGATAAAACTTGTGGGGTTTTTTGTTTTTGTTT  1036

seq1: chr11_91548765_91549893
seq2: B6Ng01-142E13.g_69_1202 (reverse)

seq1  GTGA-AGATT-CTTTTAGTCCTGGTGTA-GGGAATGGGTTCATCATATAG  47
      |||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||
seq2  GTGAGAGATTCCCTTTAGTCCT-GTGTAGGGGAATGGTTCCATCATATAG  49

seq1  TAACAGTATGCTAGCTAA-CTGTATAGCACATCAGGAACCGCTAACTGAG  96
      |||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||| |  |||||||||
seq2  TAACAGTATGCTAGCTAACCTGTATGCCCAATCAGGACCGCCTAACTGAG  99

seq1  CTGCCAACTAGCCAGAAACATTGTAAATAATAAATCAGCTTTAGGTTATG  146
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  CTGCC-ACTAGCCAGAAACATTGTAAATAATAAATCAGCCTTAGG-TATG  147

seq1  CTGAATCAAATATTGAAAGTAGATATACACTAGGTAAACCATGGGCCAAT  196
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTGAATCAAATATGGAAAGTAGATATACACTAGGTAACCCATGGGCCAAT  197

seq1  CTAAATGCTGCTGCTCTGTT-AAAAGATGTTCCTTTTATGCATGCAAATA  245
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATGCTGCTGCTCTGTTAAAAAGATGTTCCTTTTATGCATGCAAATA  247

seq1  TAAGTCTCTAT-AAAAGTATATCTTCCATTTTAAACATTTTGAAAACATT  294
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCTCTATAAAAAGTATATCTTCCATTTTAAACATTTTGAAAACATT  297

seq1  T-CCAACATTATTTCAAACACAATATGTGAGCAAAACTTAGCCCATCTGT  343
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACCATTATTTCAAACACAATATGTGAGCAAAACTTAGCCCATCTGT  347

seq1  TCATCATATTTTGCTCACAGCAAAAGATATCTCTGTGTTT-AAGATTAAG  392
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCATCATATTTTGCTCACAGCAAAAGATATCTCTGTGTTTAAAGATTAAG  397

seq1  ATAAATGTGTGCTCTTCTTTGTGGGTCACATCTTAATGTTCCAATTATTC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTGTGCTCTTCTTTGTGGGTCACATCTTAATGTTCCAATTATTC  447

seq1  AAGAATCATGACTATGCCGAGGTGTGGATGAGATTTAGCACCTAAACGTT  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATCATGACTATGCCGAGGTGTGGATGAGATTTAGCACCTAAACGTT  497

seq1  TCCTAATTTGAAATTTTCCTGGACCTTAGCTCACTCAAAACTCTGAACAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAATTTGAAATTTTCCTGGACCTTAGCTCACTCAAAACTCTGAACAC  547

seq1  CTGAAAAGAAATTTATGACACTTAAAGAATGTACATGTTTGTATATGAAA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAAGAAATTTATGACACTTAAAGAATGTACATGTTTGTATATGAAA  597

seq1  ACACTGAACTCCAAAAAAAAATGTTCTAAGGCTAAGATATGTCAGAAATG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGAACTCCAAAAAAAAATGTTCTAAGGCTAAGATATGTCAGAAATG  647

seq1  ACATCTTGGGACATTATCCCAGCTTCATTTTCTTCTGCCCCACTATAACC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTGGGACATTATCCCAGCTTCATTTTCTTCTGCCCCACTATAACC  697

seq1  CAGGTGCAGAACTATTCCTAGTCCGTGCTCACTTGTGCAAGGGAACATAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGCAGAACTATTCCTAGTCCGTGCTCACTTGTGCAAGGGAACATAG  747

seq1  TGTTCACTGAGCATCAGAAACTTACCTGGCACTGTAGTCACAGAGACTCA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCACTGAGCATCAGAAACTTACCTGGCACTGTAGTCACAGAGACTCA  797

seq1  GTAAGCTGAGGAATATTCTGCAATATCTAACAGACGAAGAAAATGAAATA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTGAGGAATATTCTGCAATATCTAACAGACGAAGAAAATGAAATA  847

seq1  ACAAAATACATATATGAAGTAGCACAGTCAACCTCACCCAGAGAATAAGT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATACATATATGAAGTAGCACAGTCAACCTCACCCAGAGAATAAGT  897

seq1  AATAGTCTGCCTTGCCTGAGAATGCTCTCCCTCCATCTCGGGGATCCAAA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTCTGCCTTGCCTGAGAATGCTCTCCCTCCATCTCGGGGATCCAAA  947

seq1  CATCTGGTAGCAAATGCTGGTGGCCAGAGGAAGGAGTTTGTGTCAAAGAT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGTAGCAAATGCTGGTGGCCAGAGGAAGGAGTTTGTGTCAAAGAT  997

seq1  GATTTCCTTGTCACTCTGTAACTTCATTACATTCTAGGGAATTCCAGCAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCCTTGTCACTCTGTAACTTCATTACATTCTAGGGAATTCCAGCAG  1047

seq1  GGCAGAGTTGATTATTATAATTTGATTATAATGGGCTGCGTACCTTTTCA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGTTGATTATTATAATTTGATTATAATGGGCTGCGTACCTTTTCA  1097

seq1  CTATCAGGTCAGGAAGAGAAGGCATGTGTCTGAATTC  1129
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCAGGTCAGGAAGAGAAGGCATGTGTCTGAATTC  1134