BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145E22
Chromosome11 (Build37)
Map Location 67,319,571 - 67,448,980
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGas7
Upstream geneGm879, LOC668323, A530088H08Rik, 9130409J20Rik, A730055C05Rik, 2310004I24Rik, Sco1, Myh3, Myh2, Myh1, Myh4, Myh8, Myh13
Downstream geneRcvrn, Glp2r, LOC544792, Dhrs7c, LOC100041899, Usp43, Wdr16, Stx8, Ntn1, Pik3r5, BB220380, BC024997, Ccdc42
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145E22.bB6Ng01-145E22.g
ACCDH942745DH942746
length6771,065
definitionDH942745|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145E22, 5' end.DH942746|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145E22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,319,571 - 67,320,243)(67,447,909 - 67,448,980)
sequence
gaattccagtggggagtgagccaggactttgagcctcttcaaatcttcag
gagcagaagtttcatggctgtcagagggtgacagacaagtactggcccca
tgaagtcacccagcacccagtggtactgacagatccctctggatctgtga
aggcgcaatgagatggtgaccactgttagccctttgtttttagctctatg
tctgcaggactgctctggaagcaaaggggacagagtagcagactggagtc
actgctgttttctaccatgatgactttcaatgtcccacctccagcatctc
cagttgtggtggtttgagtatgcctaacccagggagtgccactatttgga
gatgtggccttggagtaggtgtgccactgtgggcttgggctttaaaaccc
tggaaaccagtcctcggctagctgccttcagatgaagaggtagaactctc
agctcctcctacaccatgcctgcctagactctaccatgctcctgccatga
tgataatggacctaacctctgaacctctaaaccagcttcaattaaatgtt
atctttataagagttgccttggtcatggtgtctgttcacagcagtaaaac
cctaactgagacaccagtgatactcccattccacagccactttgtcctct
ttatagggaacatctttaagtgcctat
gaattcagagtccccctgaggctttccggaagagtagttttaaagaatga
ccgcttgttccagaaacttctgtctggccagttggtccttactgtatgtc
ttggctgtctagtatgtagattgtgttcccaaagatgaagttcatggtgc
attttctcctatggctgtgatcgggtgaaagcctaggacagcatggtggg
aatcagactcttcaaacaacaggatcacaggttctaaaggctttgcagcc
ccatttcacaagggagcaccatactctcccccgctgacgacaactgggag
gtctcatttaggttgtggagcaggcttccagccttactactttctagtcc
gtgatgtacgagagccctgctcccgaggggcagagggacctagagttccc
tgacctatggctgagcttgagggctcgggttggaaccctgcaagggcctc
tgctcaggggagacatagctgtctgctacatattctccagatttacttct
tctcaggctcctcccaaatcctggcaggtcctaggtaatcctgggcatgt
cccctgcacctggatccccttagtcttccagagacttaaagatgacccct
aatttggcccaatccttaaggctggcaaagtctgtccttaaaccctattt
tcccaaacactctcacctacgccctaccagggcaggctttgtaaatggta
gggaaccccttgtaaatggtaggtgttcccatctttaggaaaaacagcag
ctcagtgcagagcccaggtccagaggctccggagttgctccttcagtaca
gttgctctgttagactgcagctcagtggcagagggctcatctcgcatact
tgaggccctgggtcccatgtccaatgccaccattccctttccccaaactg
aattgaaagaaaggtgtacagtgacttgctccactatttttttcttgttt
gtaagcataaaattgctccaaagatttctaaagtaataaattaaagtggg
ttaaaattttagtttcccagaactactaattcacacaagagacaaatggc
ccatggcctcagttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr11_67319571_67320243
seq2: B6Ng01-145E22.b_45_721

seq1  GAATTCCAGTGGGGAGTGAGCCAGGACTTTGAGCCTCTTCAAATCTTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTGGGGAGTGAGCCAGGACTTTGAGCCTCTTCAAATCTTCAG  50

seq1  GAGCAGAAGTTTCATGGCTGTCAGAGGGTGACAGACAAGTACTGGCCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAAGTTTCATGGCTGTCAGAGGGTGACAGACAAGTACTGGCCCCA  100

seq1  TGAAGTCACCCAGCACCCAGTGGTACTGACAGATCCCTCTGGATCTGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCACCCAGCACCCAGTGGTACTGACAGATCCCTCTGGATCTGTGA  150

seq1  AGGCGCAATGAGATGGTGACCACTGTTAGCCCTTTGTTTTTAGCTCTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGCAATGAGATGGTGACCACTGTTAGCCCTTTGTTTTTAGCTCTATG  200

seq1  TCTGCAGGACTGCTCTGGAAGCAAAGGGGACAGAGTAGCAGACTGGAGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGGACTGCTCTGGAAGCAAAGGGGACAGAGTAGCAGACTGGAGTC  250

seq1  ACTGCTGTTTTCTACCATGATGACTTTCAATGTCCCACCTCCAGCATCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTGTTTTCTACCATGATGACTTTCAATGTCCCACCTCCAGCATCTC  300

seq1  CAGTTGTGGTGGTTTGAGTATGCCTAACCCAGGGAGTGCCACTATTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGTGGTGGTTTGAGTATGCCTAACCCAGGGAGTGCCACTATTTGGA  350

seq1  GATGTGGCCTTGGAGTAGGTGTGCCACTGTGGGCTTGGGCTTTAAAACCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGCCTTGGAGTAGGTGTGCCACTGTGGGCTTGGGCTTTAAAACCC  400

seq1  TGGAAACCAGTCCTCGGCTAGCTGCCTTCAGATGAAGAGGTAGAACTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAACCAGTCCTCGGCTAGCTGCCTTCAGATGAAGAGGTAGAACTCTC  450

seq1  AGCTCCTCCTACACCATGCCTGCCTAGACTCTACCATGCTCCTGCCATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCTCCTACACCATGCCTGCCTAGACTCTACCATGCTCCTGCCATGA  500

seq1  TGATAATGGACCTAACCTCTGAACCTCTAAACCAGCTTCAATTAAATGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAATGGACCTAACCTCTGAACCTCTAAACCAGCTTCAATTAAATGTT  550

seq1  ATCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTGTTCACAGCAGTAAAAC  600

seq1  CCTAACTGAGACACCAGTGATACTCCCATTCCACAGCCAC-TTGTCCTC-  648
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  CCTAACTGAGACACCAGTGATACTCCCATTCCACAGCCACTTTGTCCTCT  650

seq1  TTATA-GGAACATCTTT-AGTGCCTAT  673
      ||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  TTATAGGGAACATCTTTAAGTGCCTAT  677

seq1: chr11_67447909_67448980
seq2: B6Ng01-145E22.g_68_1132 (reverse)

seq1  GAACTGAGGCCAATGGCCATTTGTGCTTCTTGTGTG-ACTAGTATGTCTG  49
      ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| | |||||  ||||
seq2  GAACTGAGGCCATGGGCCATTTGT--CTCTTGTGTGAATTAGTAGTTCTG  48

seq1  GGAAACTAAAATTTTAACCCACTTTAATTTAATAACTTTAGAAATCTTTT  99
      |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||
seq2  GGAAACTAAAATTTTAACCCACTTTAATTT-ATTACTTTAGAAATC-TTT  96

seq1  GGAGCAATTTTATGCTTACAAACAAGAAGAAAAATAGTGGAGCAAGTCCC  149
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
seq2  GGAGCAATTTTATGCTTACAAACAAGAA-AAAAATAGTGGAGCAAGTCAC  145

seq1  TGTACACCCTTTCTTTTCAAATTCAGTTTGGGGGAAGGGAATGGTGGCAT  199
      |||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGTACA-CCTTTCTTT--CAATTCAGTTTGGGGAAAGGGAATGGTGGCAT  192

seq1  TGGACATGGGACCCAGGGCCTCATGTATGCGAGATGAGCCCTCTGCCACT  249
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATGGGACCCAGGGCCTCAAGTATGCGAGATGAGCCCTCTGCCACT  242

seq1  GAGCTGCAGTCTAACAGAGCAACTGTACTGAAGGAGCAACTCCGGAGCCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCAGTCTAACAGAGCAACTGTACTGAAGGAGCAACTCCGGAGCCT  292

seq1  CTGGACCTGGGCTCTGCACTGAGCTGCTGTTTTTCCTAAAGATGGGAACA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCTGGGCTCTGCACTGAGCTGCTGTTTTTCCTAAAGATGGGAACA  342

seq1  CCTACCATTTACAAGGGGTTCCCTACCATTTACAAAGCCTGCCCTGGTAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCATTTACAAGGGGTTCCCTACCATTTACAAAGCCTGCCCTGGTAG  392

seq1  GGCGTAGGTGAGAGTGTTTGGGAAAATAGGGTTTAAGGACAGACTTTGCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGTAGGTGAGAGTGTTTGGGAAAATAGGGTTTAAGGACAGACTTTGCC  442

seq1  AGCCTTAAGGATTGGGCCAAATTAGGGGTCATCTTTAAGTCTCTGGAAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTAAGGATTGGGCCAAATTAGGGGTCATCTTTAAGTCTCTGGAAGA  492

seq1  CTAAGGGGATCCAGGTGCAGGGGACATGCCCAGGATTACCTAGGACCTGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGGATCCAGGTGCAGGGGACATGCCCAGGATTACCTAGGACCTGC  542

seq1  CAGGATTTGGGAGGAGCCTGAGAAGAAGTAAATCTGGAGAATATGTAGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTTGGGAGGAGCCTGAGAAGAAGTAAATCTGGAGAATATGTAGCA  592

seq1  GACAGCTATGTCTCCCCTGAGCAGAGGCCCTTGCAGGGTTCCAACCCGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCTATGTCTCCCCTGAGCAGAGGCCCTTGCAGGGTTCCAACCCGAG  642

seq1  CCCTCAAGCTCAGCCATAGGTCAGGGAACTCTAGGTCCCTCTGCCCCTCG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAAGCTCAGCCATAGGTCAGGGAACTCTAGGTCCCTCTGCCCCTCG  692

seq1  GGAGCAGGGCTCTCGTACATCACGGACTAGAAAGTAGTAAGGCTGGAAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAGGGCTCTCGTACATCACGGACTAGAAAGTAGTAAGGCTGGAAGC  742

seq1  CTGCTCCACAACCTAAATGAGACCTCCCAGTTGTCGTCAGCGGGGGAGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCCACAACCTAAATGAGACCTCCCAGTTGTCGTCAGCGGGGGAGAG  792

seq1  TATGGTGCTCCCTTGTGAAATGGGGCTGCAAAGCCTTTAGAACCTGTGAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTGCTCCCTTGTGAAATGGGGCTGCAAAGCCTTTAGAACCTGTGAT  842

seq1  CCTGTTGTTTGAAGAGTCTGATTCCCACCATGCTGTCCTAGGCTTTCACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTGTTTGAAGAGTCTGATTCCCACCATGCTGTCCTAGGCTTTCACC  892

seq1  CGATCACAGCCATAGGAGAAAATGCACCATGAACTTCATCTTTGGGAACA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCACAGCCATAGGAGAAAATGCACCATGAACTTCATCTTTGGGAACA  942

seq1  CAATCTACATACTAGACAGCCAAGACATACAGTAAGGACCAACTGGCCAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTACATACTAGACAGCCAAGACATACAGTAAGGACCAACTGGCCAG  992

seq1  ACAGAAGTTTCTGGAACAAGCGGTCATTCTTTAAAACTACTCTTCCGGAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGTTTCTGGAACAAGCGGTCATTCTTTAAAACTACTCTTCCGGAA  1042

seq1  AGCCTCAGGGGGACTCTGAATTC  1072
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCAGGGGGACTCTGAATTC  1065